基于GEO数据库联合网络药理学研究川芎-赤芍药对治疗动脉粥样硬化的药理过程及分子机制

目的:探讨活血化瘀中药药对川芎-赤芍拮抗动脉粥样硬化的潜在分子机制及药理过程。方法:使用R语言Limma包分析GEO数据库GSE43292数据集,对有表达差异的动脉粥样硬化基因进行筛选和提取。川芎-赤芍药对所含的化学活性组分及靶点通过中药系统药理学数据库与分析平台检索。合并差异基因和药物作用靶点以获得共同的靶点。利用在线分析工具STRING和Cytoscape构建药物和靶点的调控网络以及靶点间的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。然后利用R语言注释靶点基因的基因本体(GO)功能,分析京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路,再进行基因集富集分析(GSEA)以验证KEGG的通路和富集的情况,确定靶点基因的调控功能和参与基因调控功能的信号转导通道。结果:共筛选出动脉粥样硬化差异基因1244个,川芎-赤芍药对含36个生物活性成分,其中靶点为环加氧酶1、肾上腺素受体、过氧化物酶体增殖物激活受体-γ、激酶插入域受体、孕激素受体、基质金属蛋白酶9、CXC趋化因子配体8、蛋白激酶Cβ、白细胞介素6、CD14、二肽基肽酶-4、PIK3CG、肾上腺素受体α1B、微管相关蛋白2、尿激酶纤溶酶原激活剂和单胺氧化酶B。靶点在GO中主要富集在合成DNA过程的调控、DNA生物合成的过程、含胶原的细胞外基质、细胞外基质、蛋白酶结合、细胞迁移、血管形成过程、膜筏结构、转录的调节等与动脉粥样硬化炎症、脂肪代谢及血管生成相关的生物学注释。脂质与动脉粥样硬化通路和核因子κB信号通路与动脉粥样硬化关系最为密切,并且在KEGG信号通路和GSEA均显示出富集。结论:川芎-赤芍药对通过潜在的13个活性成分作用于可能的16个靶点调控相关信号转导通路,通过抗炎、调脂和保护血管等方式产生抗动脉粥样硬化的作用。

档案学视角下高校网络舆情数据库的构建研究

近年来,高校舆情频现,特别是一些关于意识形态、师德师风、校园日常管理的舆情,由本校大学生通过微信、微博、抖音等社交媒体自发传播,被网友转发而引起社会关注,严重影响了高校教育教学环境甚至会波及社会的和谐稳定。在学生自发传播校园新闻的过程中,拥有众多粉丝的“大学生网络意见领袖”的评论态度对青年大学生群体具有重要的参考性和引导性。建设高校网络舆情数据库,做好重点人群社交媒体档案信息的收集、整理、分析、研判和归档,为高校舆情智能化治理提供支持,是新媒体时代创新档案信息资源开发利用的有益探索。

计算机网络与数据库的安全技术优化

随着信息技术的飞速发展,计算机网络已经成为现代社会生活、工作的重要支撑。与此同时,数据库作为信息存储和处理的核心组件,其安全性愈发受到关注。针对计算机网络和数据库的安全问题,本文通过分析数据库安全的重要性,指出计算机网络与数据库安全管理中存在的问题,并提出通过身份认证、数据库加密操作、数据信息备份及修复、审计追踪等安全技术优化措施,旨在为提升我国网络数据库安全提供一些有益的参考。

基于GEO数据库结合网络药理学及分子对接逆向挖掘干预肝癌的中药

基于GEO(gene expression omnibus)数据库结合网络药理学及分子对接,从分子水平逆向挖掘具有抗肝癌活性的中药。通过GEO、GeneCards、OMIM和TTD等疾病靶点数据库获取肝癌的重要靶点。利用STRING平台获取核心靶点,结合TCMIP(integrative pharmacology-based research platform of traditonal Chinese medicine)和TCMID(traditional Chinese medicine integraive database)数据库筛选核心成分,采用TCMSP(traditonal Chinese medicine system pharmacology database and analysis platform)数据库筛选核心中药,通过分子对接和细胞实验验证筛选结果。从疾病靶点数据库得到398个肝癌的重要靶点,进一步筛选出8个核心靶点、11个核心成分和1味核心中药葛根;分子对接结果表明葛根的3个核心成分(槲皮素、黄岑素、豆甾醇)可以与部分核心靶点(CDK1、CDC20)自发地结合;细胞实验结果表明葛根提取物可以有效抑制肝癌细胞HepG2的增殖。该结果可以为葛根的研究与开发提供参考,为葛根抗肝癌活性成分的挖掘提供理论依据。

基于网络药理学与GEO数据库探讨心瘅方治疗病毒性心肌炎的机制

目的:基于网络药理学与GEO数据库探讨心瘅方治疗病毒性心肌炎的microRNA-mRNA调控机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选心瘅方中药物活性成分及其靶基因;利用GEO数据库筛选病毒性心肌炎与健康人的差异microRNA;利用FunRich3.1.3对差异microRNA进行mRNA富集,并与药物靶基因取交集基因;通过蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interactions,PPI)以及cytoNCA筛选出核心基因;运用R软件对核心基因进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果:心瘅方中药物活性成分共199个,潜在作用靶点490个,GEO数据库Series GSE148153符合要求,通过筛选得到差异microRNA 438个,50个microRNA与核心基因有对应关系,上调基因45个,下调基因5个;筛选得到交集基因207个,其中33个为核心基因;GO功能注释主要富集在肌细胞增殖、MAP激酶活性等生物学过程,并且主要富集在PI3K/Akt、人巨细胞病毒感染、白细胞介素17等信号通路。结论:心瘅方调控microRNA-mRNA过程治疗病毒性心肌炎与中药成分干预肌细胞增殖、MAP激酶活性等生物学过程和PI3K/Akt、人巨细胞病毒感染、肿瘤坏死因子信号通路等有关,此过程可能涉及hsa-miR-15b-5p和hsa-miR-21-5p等外泌体的表达。

基于GEO数据库和转录因子调控网络的结核病药物作用靶点筛选及其作用机制

目的基于GEO数据库和转录因子调控网络筛选抗结核病药物及药物作用靶点。方法通过NCBI的GEO数据库,筛选结核病患者和健康者之间差异表达的基因;通过AnimalTFDB 3.0数据库预测差异表达基因中的转录因子,并构建转录因子调控网络;通过调控网络中的关键基因筛选相关miRNA,并筛选关键节点,初步阐明结核病致病的分子机制。结果通过GEO数据库检索,筛选出的差异表达基因为784个;通过AnimalTFDB 3.0数据库筛选出23个转录因子和对应的790个靶基因,构建了转录因子-靶基因的调控网络;通过TargetScanHuman 7.2查询到关键节点对应的miRNA,构建“转录因子-靶基因-miRNA”调控网络,筛选出4个结核病药物靶点(EP300,CREBBP,ELAVL1,HSP90AA1),阐明了其与转录因子和miRNA之间的调控机制。结论通过构建结核“转录因子-靶基因-miRNA”网络,筛选出结核病新的潜在药物作用靶点——EP300、CREBBP、ELAVL1、HSP90AA1;同时发现,EP300、CREBBP、HSP90AA1通过激活转录因子STAT2,导致机体内炎症因子TNF-α水平增高,进而抑制了miR-9-5p的表达;而基因ELAVL1直接抑制miR-9-5p的表达,并且与NOD-like receptor signaling pathay通路密切相关,导致结核病的发生发展。

基于负数据库的隐私保护图神经网络推荐系统

图数据是一种特殊的数据形式,由节点和边组成.在这种数据中,实体被建模为节点,节点之间可能存在边,表示实体之间的关系.通过分析和挖掘这些数据,人们可以获得很多有价值的信息.因此,对于图中各个节点来说,它也带来了隐私信息泄露的风险.为了解决这个问题,提出了一种基于负数据库(NDB)的图数据发布方法.该方法将图数据的结构特征转换为负数据库的编码形式,基于此,设计出一种扰动图(NDB-Graph)的生成方法.由于NDB是一种保护隐私的技术,不显式存储原始数据且难以逆转,故发布的图数据能确保原始图数据的安全.此外,由于图神经网络在图数据中关系特征处理方面的高效性,被广泛应用于对图数据的各种任务处理建模,例如推荐系统,还提出了一种基于NDB技术的图神经网络的推荐系统来保护每个用户的图数据隐私.基于Karate和Facebook数据集上的实验表明,与PBCN发布方法相比,所提方法在大多数情况下表现更优秀.例如:在Facebook数据集上,度分布最小的L1误差仅为6,比同隐私等级下的PBCN方法低约2.6%;最坏情况约为1400,比同隐私等级下的PBCN方法低约46.5%.在基于LightGCN的协同过滤实验中也表明,所提出的隐私保护方法具有较高的精度.

一种网络安全数据库在植保机系统中的应用

针对我国现有植保机只能进行农药喷洒,并不能对病虫害进行预警而解决农作物病虫害的问题,对网络安全数据库在植保机系统的应用进行了研究。所设计的植保机DNN门户内容管理系统主要包括3层,分别为客户端、网络服务端和数据库端。为了使植保机系统可以根据数据库的数据对病虫害进行预警,同时保证数据库数据的安全,建立了粗糙集和BP神经网络的预警模型,包括采用粗糙集进行数据的预处理,并采用BP神经网络建立预警模型。为了验证植保机的DNN门户内容管理系统的有效性,利用采集到的样本对系统的运行进行了训练、验证和测试,结果表明:系统可以有效地对植物病虫害问题进行预警。

基于基因表达综合数据库芯片挖掘结合网络药理学与分子对接探讨芒果苷治疗口腔黏膜下纤维化的机制研究

目的基于基因表达综合(GEO)数据库芯片挖掘、网络药理学及分子对接技术探讨芒果苷(MF)治疗口腔黏膜下纤维化(OSF)的核心作用靶标及潜在作用机制。方法基于GEO芯片挖掘OSF的潜在治疗靶点,利用数据库预测MF潜在作用靶标和收集OSF疾病靶标,使用EVenn平台绘制维恩图,STRING数据库绘制蛋白质互作(PPI)网络,DAVID平台进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,Cytoscape 3.10.1软件绘制药物—靶标—通路—疾病网络图,AutoDocktools 1.5.6软件进行分子对接分析及可视化。结果从多种数据库挖掘得到MF潜在靶标356个,OSF疾病靶标360个,选取PPI网络中排名前15个关键靶蛋白,GO功能及KEGG通路富集分析结果显示,MF治疗OSF主要涉及高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)、表皮生长因子受体(EGFR)等信号通路。分子对接显示,MF与丝氨酸蛋白激酶(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)等核心靶点有较佳结合活性。结论MF可能通过多靶点、多途径的方式对OSF发挥治疗作用。

JSP网络数据库连接技术应用研究

JSP是动态网页技术的一种标准,其以Java为基础的站点开发语言,稳定性强、安全性好、移植性高,且具有较强的开放性。利用JSP进行数据库之间的交互,可以提高数据库连接、管理的性能,从而提高整个应用程序的健壮性、伸缩性。在JSP与网络数据库连接过程中,常用的技术包括JDBC、数据库连接池等。文章主要针对JSP网络数据库连接技术的具体应用进行探讨。

基于人工智能技术的数字图书馆数据库网络安全的探讨

信息时代,人工智能技术得到快速发展,进一步提高了信息技术的应用层次。在大数据、物联网等技术的支持下,人工智能技术与产品越来越多,为各行各业发展都注入了新活力。得益于互联网的发展,图书馆数字化建设水平也越来越高,但数字图书馆数据库网络安全问题成为图书馆数字化建设需要考虑的重要问题。本文探讨数字图书馆数据库网络安全建设中人工智能技术的必要性,分析数字图书馆数据库网络安全保护存在的问题,提出人工智能技术下数字图书馆数据库网络安全保护措施,以供参考。

基于基因表达综合数据库和网络药理学探讨香参丸治疗溃疡性结肠炎的分子机制

目的采用生物信息学和网络药理学分析香参丸对溃疡性结肠炎(UC)的分子机制。方法2023年1―5月通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集香参丸的有效成分及其相关靶点,利用基因表达综合(GEO)数据库筛选UC相关靶点,将香参丸与UC的交集靶点信息上传至STRING并通过Cytoscape 3.7.2可视化蛋白质相互作用(PPI)网络。使用Metascape数据库进行KEGG与GO通路富集分析并预测香参丸作用UC的相关通路,并绘制“中药-成分-疾病-靶点-通路”网络,利用Autodock进行分子对接。结果结果显示共筛选得到香参丸主要成分136个、靶点243个,UC相关靶点1750个,香参丸与UC交集靶点37个,筛选出关键成分槲皮素、刺芒柄花素、木犀草素以及山柰酚等,关键靶点如NOS2、PPARG、IL1B、MMP2以及ICAM1等。分子对接结果提示核心成分与核心靶点结合稳定,平均最低结合能为−5.5986 kCal/mol。KEGG与GO通路富集分析显示香参丸参与多种分子功能和生物过程,其涉及的主要通路有TNF信号通路、Toll样受体信号通路、HIF-1信号通路以及MAPK信号通路等。结论香参丸可通过多靶点、多通路改善UC症状,其主要成分槲皮素、刺芒柄花素、木犀草素以及山柰酚等可能通过TNF信号通路、Toll样受体信号通路、HIF-1信号通路以及MAPK信号通路等作用于NOS2、PPARG、IL1B、MMP2等关键靶点。

聚焦网络安全的数据库课程改革实践

为了提高学生实践操作能力和实际应用能力以及提升非网安方向学生网络安全意识,本文提出了一种基于OBE教学模型的新型数据库教学改革模式。该模式改变传统数据教学中以知识灌溉为主、以单纯的数据整理等基础训练为辅的模式,通过以互联网时代数据安全和个人隐私漏洞为背景,以虚拟靶机训练为教学辅助手段,兼顾知识传授和动手能力培养,能够为非网安方向学生后续学习和研究Web安全防护提供一定的参考。

科学网络数据库中CRISPR和食品安全关联研究领域文献的可视化分析

为了解CRISPR技术在食品安全领域的发展动态,本文以主题词“CRISPR”和“Food safety or Food security”(食品安全)在科学网络核心合集中进行检索,得到发表于2011—2023年间的415篇相关文献,通过CiteSpace软件,对415篇文献的发表时间、发文国家、发文机构、来源出版物、关键词以及参考文献等进行详细分析。结果表明:CRISPR和食品安全关联研究领域的论文主要发表于2017—2022年,论文数量逐年递增,且在2020—2022年的增速最快。中国的发文量最大,中国农业科学院、浙江大学、印度农业研究理事会这3个机构具有较强的学术影响力;发文量最大的期刊是Frontiers in Plant Science。在该关联领域中,基因编辑、CRISPR-Cas9、抗性、干扰、产量、诱变和核酸内切酶等是热点关键词,有关食源性病原体、非生物胁迫、作物育种和抗病性的研究是研究前沿。CRISPR技术在食品安全领域的应用对保障人们的身体健康和提高农业生产力产生了深远影响,在未来依然具有巨大的发展潜力。

网络安全视角下医院信息管理计算机数据库技术分析

在科学技术不断发展的背景下,医疗卫生整体水平不断提高,医院计算机信息系统管理面临着挑战。因此,本文对医院信息管理的重要性进行分析,提出医院信息管理中的问题,并且从计算机数据库技术的应用等方面分析网络安全视角下如何加强医院信息管理的效果。

基于SDN技术的网络数据库安全加密技术

随着信息化时代的发展,数据库安全防护已成为亟须解决的问题。通过对软件定义网络(software defined network,SDN)技术构建的网络数据库安全体系的研究,探讨数据库内容的加密传输、访问控制、网络流量监控与安全策略动态调整等关键技术。仿真实验验证,所提出的安全体系能有效提升数据库资料的保密性和完整性,提高抗攻击能力,同时确保性能开销在可接受的范围内。该体系集成了灵活而高效的动态安全管理机制,为应对复杂网络环境和多样化威胁提供了新的解决方案。

网络会计信息系统数据库的安全控制及性能优化

随着信息技术发展和企业数字化转型推进,网络会计信息系统已经成为企业进行财务管理和决策的重要工具。网络会计信息系统数据库作为其核心组成部分,承载着大量财务数据和敏感信息,但数据库安全和性能问题一直是企业面临的挑战。安全控制是防止未经授权的访问和数据泄露的关键,而性能优化则可以提高系统的响应速度和处理效率。

基于网络数据库的TFEB泛癌分析

目的:研究转录因子EB(TFEB)基因在人肿瘤组织中的表达、预后相关性及免疫浸润等情况,进而探究其临床意义。方法:使用TIMER2.0、GEPIA2分析各类肿瘤组织中TFEB的表达情况及其与患者预后的相关性,使用TIME2.0分析TFEB在肿瘤中与免疫浸润水平的相关性。结果:肾上腺皮质癌、宫颈癌、胰腺腺癌等肿瘤组织中TFEB高表达与预后相关,且与免疫浸润水平呈正相关。结论:TFEB表达与多种恶性肿瘤患者临床预后及免疫浸润水平相关,可作为肾上腺皮质癌、宫颈癌、胰腺腺癌等恶性肿瘤新的生物标志物。

高可靠性移动通信网络数据库跨域安全检索研究

高可靠性移动通信网络数据库在跨域检索过程中容易被攻击者修改数据,导致数据检索精度与效率下降,因而研究高可靠性移动通信网络数据库跨域安全检索方法。通过主密钥对和用户私钥、公钥确定密文索引,结合密文获取安全查询索引,提取安全查询索引关键词。通过改进TF-IDF权值方法确定索引关键词相关度分数,结合相关度分数对检索结果进行排名和过滤,将检索结果返回给数据使用者,完成跨域安全检索。实验结果表明,这种方法的检索结果的查全率、查准率、效率均较高,检索效果好。

网络空间安全专业数据库应用技术课程教学设计与实践探索

数据库应用技术作为网络空间安全专业的一门基础课程,着重阐述数据库的基本概念、具体操作方法和相关的应用,具有较强的实践性,对学生了解数据库系统和信息安全体系具有重要意义。为了适应网络和大数据技术的快速发展和加强学生实践动手能力,对数据库应用技术课程教学进行改革,探讨如何使课程教学的内容、基本技能与实际相结合,同时拓展数据库安全性知识,以满足网络空间安全专业应用型人才培养的要求。