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狗牙根诱变后代生长速度评价及DNA指纹图谱构建
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作者 陈静波 张笑笑 +4 位作者 李丹丹 李建建 王浩然 刘建秀 郭海林 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期419-425,共7页
狗牙根(Cynodon dactylon)是一种常见的暖季型草,利用诱变技术处理现有品种进行改良,是快速选育优良新品种的一种途径。本研究以国审品种‘阳江’狗牙根通过60Co-γ辐射处理获得的12个诱变后代为材料,进行生长速度评价和基于序列相关的... 狗牙根(Cynodon dactylon)是一种常见的暖季型草,利用诱变技术处理现有品种进行改良,是快速选育优良新品种的一种途径。本研究以国审品种‘阳江’狗牙根通过60Co-γ辐射处理获得的12个诱变后代为材料,进行生长速度评价和基于序列相关的扩增多态性(SRAP)分子标记技术的DNA指纹图谱构建。结果表明,诱变后代间匍匐茎总长度、地上部分干重、匍匐茎数量、地下部分干重等4个指标均存在显著的变异。对这4个指标进行隶属函数分析,对诱变后代的生长速度进行综合评价,认为其生长速度由快到慢依次为M37>M16>M1>M25>M10>M18>M28>M29>M26>‘阳江’>M22>M31>M4。利用12对SRAP引物对12个诱变后代和6个狗牙根主栽品种进行指纹图谱构建,其中7对引物组合可以直接对18份参试材料进行准确鉴定。本研究为进一步国产狗牙根新品种的选育和保护提供了可靠的实验依据。 展开更多
关键词 狗牙根 60Co-γ辐射诱变 生长速度 SRAP 指纹图谱
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石斛兰杂交后代SRAP鉴定与遗传多样性分析
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作者 林榕燕 陈艺荃 +3 位作者 孔兰 钟淮钦 林兵 叶秀仙 《北方园艺》 CAS 北大核心 2024年第15期46-52,共7页
以麝香石斛、檀香石斛及麝香石斛×檀香石斛的100个杂交后代株系为试材,采用SRAP分子标记的方法,研究了杂交后代的真实性及亲本与杂交后代群体的遗传多样性,以期为加速石斛兰新品种的选育提供参考依据。结果表明:综合6对SRAP引物组... 以麝香石斛、檀香石斛及麝香石斛×檀香石斛的100个杂交后代株系为试材,采用SRAP分子标记的方法,研究了杂交后代的真实性及亲本与杂交后代群体的遗传多样性,以期为加速石斛兰新品种的选育提供参考依据。结果表明:综合6对SRAP引物组合的扩增情况,共鉴定出100个杂交后代为真杂种,鉴定效率达100%;6对SRAP引物组合的多态性比例达97.26%,多态性信息含量均值为0.85;由聚类分析可知,92%的杂交后代在亲缘关系上与父本聚为一类;由遗传相似系数分析可知,杂交后代与父本间的遗传相似系数平均值大于母本。综上所述,供试的麝香石斛×檀香石斛杂交后代均为真杂种,且表现为偏父本遗传,SRAP分子标记可作为石斛兰杂交后代早期鉴定的有效手段。 展开更多
关键词 石斛兰 SRAP标记 杂交后代鉴定 遗传多样性
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基于SRAP分子标记构建云南旱冬瓜核心种质
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作者 邹广权 王晓丽 +3 位作者 曹现富 李艳 张新洛 曹子林 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期49-55,共7页
【目的】通过对比不同抽样比例构建的旱冬瓜种质子集的有效性和代表性,筛选出旱冬瓜核心种质适宜的构建策略。【方法】以旱冬瓜优树同胞子代为试材,设10%、15%、25%、35%、45%和55%共6个抽样比例,采用Nei’s遗传距离和改进的最小距离逐... 【目的】通过对比不同抽样比例构建的旱冬瓜种质子集的有效性和代表性,筛选出旱冬瓜核心种质适宜的构建策略。【方法】以旱冬瓜优树同胞子代为试材,设10%、15%、25%、35%、45%和55%共6个抽样比例,采用Nei’s遗传距离和改进的最小距离逐步取样法取样,采用4个遗传多样性指数分析种质子集对原种质的代表性,通过均值t检验和方差F检验分析种质子集与原种质集变异是否同质,利用相关系数分析种质子集与原种质集的相关性,通过遗传距离比较和聚类分析确认核心种质。【结果】25%抽样比例构建的种质子集的多态位点数、多态位点百分率、观测等位基因数和等位基因保留率与原种质集一致,其余4个评价指数皆显著大于原种质集,均值和方差与原种质的相关系数均接近或者等于1,平均遗传距离较原种质提高16.82%,因此认为在25%抽样比例构建的种质子集能很好地代表原种质。【结论】综合考虑核心种质的有效性、实用性、费用和工作量等,认为25%抽样比例构建的旱冬瓜核心种质能充分代表原种质的遗传多样性。 展开更多
关键词 旱冬瓜 SRAP标记数据 核心种质
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基于SRAP分子标记的郁金香遗传多样性分析
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作者 秦斗文 刘伟强 +2 位作者 田吉婷 唐楠 巨秀婷 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期783-792,共10页
为探究郁金香(Tulipa gesneriana)种质资源的遗传背景,精准评价和筛选优异种质用于郁金香遗传改良,该研究采用SRAP分子标记分析40个郁金香品种的遗传背景,明晰遗传多样性和亲缘关系。结果表明:在43对SRAP引物中可用于郁金香遗传多样性... 为探究郁金香(Tulipa gesneriana)种质资源的遗传背景,精准评价和筛选优异种质用于郁金香遗传改良,该研究采用SRAP分子标记分析40个郁金香品种的遗传背景,明晰遗传多样性和亲缘关系。结果表明:在43对SRAP引物中可用于郁金香遗传多样性研究的多态性引物共21对,在40个品种中共扩增出249条清晰稳定的条带,其中多态性条带245条,多态性比率为98.39%。供试的40个品种遗传相似性指数为0.5020~0.8675,遗传多样性参数等位基因数(N*a)、有效等位基因数(N*e)、Nei’s基因多样性指数(H*)、Shannon’s信息指数(I*)和多态性信息含量分别为1.9810、1.5149、0.3042、0.4603和0.3212,供试材料遗传多样性丰富。聚类结果和主坐标分析将40个郁金香品种分为两大类,其中‘Christmas Magical’‘Banja Luka’‘Madame Lefeber’与其他品种亲缘关系较远,在遗传背景上具有一定差异。 展开更多
关键词 郁金香 SRAP 遗传多样性 聚类分析
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基于SCAR标记和DNA条形码技术的苍术基原鉴别研究
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作者 陈研 冯露露 +1 位作者 黄荣 齐伟辰 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2024年第2期490-501,共12页
目的开发出能同时鉴别北苍术和关苍术的分子标记方法,并探究不同种质资源苍术的遗传进化关系。方法对不同地区北苍术Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz及关苍术A.japonica Koidz.ex Kitam基因组DNA的差异片段进行测序,结合SRAP、ISSR... 目的开发出能同时鉴别北苍术和关苍术的分子标记方法,并探究不同种质资源苍术的遗传进化关系。方法对不同地区北苍术Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz及关苍术A.japonica Koidz.ex Kitam基因组DNA的差异片段进行测序,结合SRAP、ISSR、DAMD分子标记方法,优化PCR反应体系,筛选并转换成特异性标记,同时,采用条形码方法分析种间序列差异。结果通过SRAP、ISSR、DAMD三种分子标记方法的PCR扩增,共筛选出198对能稳定扩增且重现性好的引物,转换出7对能稳定、快速鉴别北苍术和关苍术的SCAR引物。条形码方法检测出北苍术ITS2序列长度为454 bp,关苍术ITS2序列长度为453 bp,与其他苍术属植物之间遗传距离较远。NJ树结果显示,北苍术、关苍术及其他苍术属植物均各自聚为一支,表现出良好的单系性。依据ITS2二级结构,4种苍术属植物在螺旋区的茎环数目、大小、位置均有明显差异,可以直观地进行区分。结论所开发的特异性SCAR标记为苍术属植物优良品种的筛选提供了新方法,DNA条形码能稳定、准确鉴别北苍术。 展开更多
关键词 北苍术 关苍术 Internal transcribed spacer 2(ITS2) Sequence-related amplified polymorphism(SRAP) Inter-simple sequence repeat(ISSR) Direct amplification of minisatellite region DNA(DAMD) Sequence characterized amplified regions(SCAR)
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番石榴杂交F_(1)代基于SRAP标记的鉴定及果实性状的遗传倾向分析
6
作者 黄婉莉 张冬敏 +2 位作者 符喜喜 陈心怡 张朝坤 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1731-1745,共15页
【目的】通过鉴定番石榴杂交F_(1)代真实性以及探究其果实主要性状的遗传倾向,丰富番石榴遗传规律研究,以期为番石榴杂交育种亲本选配提供参考依据。【方法】以母本红香1号番石榴、父本帝王番石榴及其104个杂交F_(1)代单株为研究材料,应... 【目的】通过鉴定番石榴杂交F_(1)代真实性以及探究其果实主要性状的遗传倾向,丰富番石榴遗传规律研究,以期为番石榴杂交育种亲本选配提供参考依据。【方法】以母本红香1号番石榴、父本帝王番石榴及其104个杂交F_(1)代单株为研究材料,应用SRAP分子标记鉴定杂种的真实性,并对亲本与F_(1)代群体遗传多样性、遗传关系和果实品质的遗传倾向进行分析。【结果】利用SRAP标记对杂交F_(1)代群体进行鉴定,真杂种率为98.08%。聚类分析图谱显示,在0.90阈值处可将父母本及杂交F_(1)代群体分为6类;杂交F_(1)代单果质量、果实纵径、横径、果形指数、果心直径、果肉厚度、果实可滴定酸(TA)含量和可溶性固形物(TSS)含量等8个性状都表现为较典型的正态分布,属于由多个基因控制的数量性状;杂交F_(1)代单果质量、果实纵径、横径、果形指数和TSS含量呈增大变异的遗传趋势,果实TA含量呈现趋小变异的遗传趋势;杂交F_(1)代果实6个质量性状果实形状、果面质地、果皮颜色、果肉颜色、果肉质地以及果实香气离散幅度较大,多样性指数较高。6种质量性状受不同的基因控制,其中果实形状、果面质地、果皮颜色、果肉颜色受父本影响较大,果肉质地和果实香气主要受母本影响。【结论】番石榴8个数量性状中,单果质量、果实纵径、横径和果形指数超亲优势明显,表明番石榴果实大小的遗传受加性效应的影响;番石榴6个质量性状中,果实形状、果面质地、果皮颜色、果肉颜色受父本影响较大,果肉质地和果实香气主要受母本影响。 展开更多
关键词 番石榴 杂交后代 SRAP分子标记 果实品质 遗传规律
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89份香蕉种质资源SRAP分子标记亲缘关系分析
7
作者 周海琪 夏玲 +7 位作者 吕顺 曾莉莎 王芳 黄晓彦 陈东仪 刘文清 梁少丽 刘丽琴 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期703-711,共9页
香蕉分类是一个难题,利用形态学特征进行分类已无法满足需要。分子标记技术逐渐被应用到香蕉品种(系)的种群鉴定与分类、亲缘关系分析和遗传多样性研究等方面。本研究采用SRAP分子标记技术对89份香蕉种质资源的亲缘关系进行分析。利用1... 香蕉分类是一个难题,利用形态学特征进行分类已无法满足需要。分子标记技术逐渐被应用到香蕉品种(系)的种群鉴定与分类、亲缘关系分析和遗传多样性研究等方面。本研究采用SRAP分子标记技术对89份香蕉种质资源的亲缘关系进行分析。利用10对正反引物两两组合成100对引物组合,从中筛选出扩增条带易于识别、带型清晰、多态性高的13对SRAP引物,共扩增出170条可辨认条带,平均每对引物扩增13.08条,其中表现出多态性的条带有140条,多态性比率为79.00%。89份香蕉种质资源的相似系数的变化范围在0.241~1.000之间,遗传多样性非常丰富,来源于同一个地方或者来源不同地方的同一类型的野生蕉的相似性系数较高。当相似性系数为0.49时可以将这89份香蕉资源分成六大类,包括香牙蕉、贡蕉和龙牙蕉为主的第一大类(AAA、AA、AAB基因型),粉大蕉、粉蕉和BB类野蕉为主的第二大类(ABB、BB基因型),大蕉、阿宽蕉类野蕉为主的第三大类,以及红花蕉、地涌金莲、蝎尾蕉分别所属的第四、五、六类群。其结果与现行的经典分类结论基本一致,只有部分香蕉种质分类地位有差异,说明用SRAP标记对香蕉种质资源进行分类是可行的。同时,栽培类香牙蕉、贡蕉和龙牙蕉具有相同的祖先,与AA基因型野蕉亲缘关系近,粉蕉、粉大蕉与BB基因型的野蕉亲缘关系较近,不同基因组的香蕉种质资源聚到一起,说明香蕉种质资源的起源影响后代的亲缘关系,单一的分类方法无法将香蕉种质资源完全区分。此外,大蕉与阿宽蕉亲缘关系较近,但是无法分辨大蕉是否含有A和B基因组,因此大蕉基因型和遗传背景有待进一步研究。 展开更多
关键词 香蕉 SRAP 聚类分析 亲缘关系
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白及不同地理群体的分子遗传学评价
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作者 桂腾琴 张思平 +3 位作者 武忠亮 李春艳 韦燕 苗贵东 《北方园艺》 CAS 北大核心 2024年第10期105-111,共7页
以采自6个不同地理区域33份白及资源为试材,利用SRAP标记技术对白及资源进行分子遗传学评价研究,以期为白及品种资源的综合利用、野生资源的就地保护和迁地保护提供参考依据。结果表明:白及资源在物种水平遗传多样性比较丰富,白及居群... 以采自6个不同地理区域33份白及资源为试材,利用SRAP标记技术对白及资源进行分子遗传学评价研究,以期为白及品种资源的综合利用、野生资源的就地保护和迁地保护提供参考依据。结果表明:白及资源在物种水平遗传多样性比较丰富,白及居群的遗传多样性指数分别为Ht=0.3267,Hs=0.2356,Gst=0.2506,Nm=1.4952,说明白及居群间存在少量的基因交流,而且遗传变异主要发生在居群内。6个野生居群根据UPGMA聚类,可分为2个支系。居群结构分析结果表明,K=2时,样品分类效果最佳。Mantel test检测表明,白及居群间遗传距离越大居群之间地理距离就越远,呈显著正相关性(r=0.6246;P<0.001)。 展开更多
关键词 白及 地理群体 遗传多样性 遗传结构 SRAP
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基于表型和分子标记分析24份巴戟天遗传多样性
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作者 何磊 刘风民 +3 位作者 冯月燕 王梓鉴 陈纪言 张伟丽 《广东农业科学》 CAS 2024年第5期56-68,共13页
【目的】广东省德庆县是道地药材巴戟天的产地,该文对广东德庆不同地区的24份巴戟天进行了种质资源的遗传多样性分析。【方法】以德庆县各地收集来的24份巴戟天资源为研究对象,使用主成分分析和SRAP、CDDP两种分子标记方法对24份巴戟天... 【目的】广东省德庆县是道地药材巴戟天的产地,该文对广东德庆不同地区的24份巴戟天进行了种质资源的遗传多样性分析。【方法】以德庆县各地收集来的24份巴戟天资源为研究对象,使用主成分分析和SRAP、CDDP两种分子标记方法对24份巴戟天材料进行遗传多样性分析。【结果】在表型分析中,基于主成分分析的聚类图发现,官圩镇和高良镇、凤村镇和高良镇分别聚类至4个类群中。此外,18对SRAP引物组合和16条CDDP引物扩增后分别获得100条和98条总条带,其中SRAP多态性条带为50条,多态性比率达50%,平均遗传相似系数(GS)为0.87,遗传相似系数变化范围为0.71~0.97;CDDP多态性条带为80条,条带之间多态性比率达79.0%,各种质间遗传系数范围为0.71~0.96,平均遗传相似系数为0.86,且当系数为0.82时,两种分子标记结果均表明高良镇、官圩镇和凤村镇的种质之间具有一定的相似性。【结论】结合表型和分子标记聚类结果,高良镇和官圩镇、高良镇和凤村镇的亲缘关系最近,SRAP和CDDP两种分子标记方法对巴戟天遗传多样性的结果具有一定的差异,而联合分析可以更好地反映巴戟天遗传多样性研究及其资源的系统发育关系。 展开更多
关键词 巴戟天 主成分分析 SRAP分子标记 CDDP分子标记 遗传多样性
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基于SRAP标记的三十三份白及种质资源聚类分析及DNA指纹图谱的构建
10
作者 桂腾琴 武忠亮 +1 位作者 李春艳 韦燕 《北方园艺》 CAS 北大核心 2024年第5期97-103,共7页
以白及(BletillastriataRchb.f.)为试材,基于UPGMA法通过13对SRAP引物组合对6个野生居群的33份白及种质资源进行聚类分析并构建DNA指纹图谱,以期为白及品种鉴定和资源收集提供参考依据。结果表明:13对SRAP引物组合共扩增出182条条带(其... 以白及(BletillastriataRchb.f.)为试材,基于UPGMA法通过13对SRAP引物组合对6个野生居群的33份白及种质资源进行聚类分析并构建DNA指纹图谱,以期为白及品种鉴定和资源收集提供参考依据。结果表明:13对SRAP引物组合共扩增出182条条带(其中有152条为多态性条带),多态性比率为83.52%,平均Shannon’s信息指数(I)和Nei’s基因多样性指数(H)分别为0.4846和0.3243。6个野生居群根据UPGMA聚类,可分为2个支系。我国华南地区广东茂名、广西百色和华中地区湖南张家界3个白及居群聚为一支;西南地区贵州安龙、云南蒙自和四川峨眉山另外3个白及居群聚为另一支。Manteltest检测表明,物种遗传距离和地理距离间存在显著正相关性(r=0.6246;P<0.001)。4对SRAP核心引物组合构建了33份白及品种的DNA指纹图谱。 展开更多
关键词 SRAP标记 聚类分析 DNA指纹图谱 白及 种质资源
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黄精属植物SRAP分子标记遗传多样性分析
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作者 蒋小刚 王华 +2 位作者 由金文 张美德 周武先 《北方园艺》 CAS 北大核心 2024年第13期103-109,共7页
以34份黄精属种质资源(多花黄精、湘黄精、早花黄精、湖北黄精、滇黄精、玉竹)为试材,采用SRAP分子标记技术,研究其遗传多样性,以期为黄精属植物种质鉴别和分子育种提供参考依据。结果表明:筛选了12对SRAP多态性引物,共检测到106个位点... 以34份黄精属种质资源(多花黄精、湘黄精、早花黄精、湖北黄精、滇黄精、玉竹)为试材,采用SRAP分子标记技术,研究其遗传多样性,以期为黄精属植物种质鉴别和分子育种提供参考依据。结果表明:筛选了12对SRAP多态性引物,共检测到106个位点,多态性百分率为100.0%,Nei′s基因多样性指数(H)平均值为0.2858,Shannon多样性指数(I)平均值为0.4399,遗传分化系数Gst为0.5360,种质间基因流Nm为0.4328。34份种质间遗传相似系数为0.5000~0.9528,平均值为0.6698。湘黄精和滇黄精种质遗传差异最小,而多花黄精和滇黄精种质遗传差异最大。聚类分析可将34份黄精属种质划分为六大类,多花黄精、湘黄精、早花黄精、湖北黄精、滇黄精、玉竹分别聚为一类。该研究的12对多态性SRAP分子标记能有效鉴别黄精属不同种质,将为黄精属遗传多样性分析、种质鉴定、分子标记辅助育种等提供参考依据。 展开更多
关键词 黄精属 SRAP分子标记 种质资源 遗传多样性
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罂粟种质资源遗传多样性和亲缘关系的SRAP分析
12
作者 王玉红 王笑 +3 位作者 张兆萍 魏玉杰 苏毓杰 杨振华 《福建农业科技》 CAS 2024年第5期33-38,共6页
探明罂粟种质资源遗传多样性和亲缘关系,为罂粟遗传育种研究和种质指纹图谱奠定工作基础。利用形态标记和SRAP分子标记两种方法对25份罂粟资源的13个农艺性状进行测定、分析。结果表明:从12对SRAP引物中共筛选出11对多态性明显、条带清... 探明罂粟种质资源遗传多样性和亲缘关系,为罂粟遗传育种研究和种质指纹图谱奠定工作基础。利用形态标记和SRAP分子标记两种方法对25份罂粟资源的13个农艺性状进行测定、分析。结果表明:从12对SRAP引物中共筛选出11对多态性明显、条带清晰的引物组合,对25份供试材料基因组DNA分子进行扩增,共扩增出210条谱带,其中多态性条带81条,多态性比率为38.57%。SRAP聚类分析结果表明:25份罂粟材料的遗传相似系数在0.907~0.992,当相似系数在0.936处作切割线,可将25份供试材料分为5个大类和若干亚类。对供试罂粟材料的花色、叶形等农艺性状进行调查分析,当欧式距离为5.0时,可将所有罂粟材料可以分为12个大类和若干亚类。综上分析表明25份罂粟种质资源遗传多样性较丰富,形态标记和SRAP分子聚类可以用于研究罂粟种质资源遗传多样性和亲缘关系分析,研究结果可为罂粟遗传育种研究和种质指纹图谱奠定工作基础。 展开更多
关键词 罂粟 农艺性状 遗传多样性 SRAP标记
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西番莲种间杂交F1后代分子鉴定及遗传多样性分析
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作者 夏玲 杨梦飞 +1 位作者 梁昕景 王学林 《热带农业科学》 2024年第5期16-21,共6页
以红花西番莲为母本、大果西番莲为父本进行种间杂交,对杂交F1代群体植物学性状进行观察和调查,利用筛选出的5对扩增结果稳定且具多态性的SRAP引物,对杂交F1代群体进行杂种鉴定,并对亲本和杂交F1代群体的基因分离规律以及遗传多样性和... 以红花西番莲为母本、大果西番莲为父本进行种间杂交,对杂交F1代群体植物学性状进行观察和调查,利用筛选出的5对扩增结果稳定且具多态性的SRAP引物,对杂交F1代群体进行杂种鉴定,并对亲本和杂交F1代群体的基因分离规律以及遗传多样性和遗传关系进行分析。结果显示:杂交F1代29个单株的藤蔓形状、蜜腺位置以及叶片形状等均发生变化,表现出不同程度的多样性;SRAP分子鉴定结果表明,5对SRAP引物可以将29个杂交单株鉴定出来,说明这些单株为真杂种。采用UPGMA法构建系统聚类图,结果表明,在遗传相似系数0.60处可将父母本及29株杂交F1代植株分为3类,其中第1类与母本“hh”聚在一起,共有杂交F1代植株12株;第2类与父本“dg”聚在一起,共有杂交F1代植株11株;第3类有杂交F1代植株6株。综合分析结果表明:采用SRAP分子标记法可对西番莲的杂交F1代群体进行有效的杂种鉴定。 展开更多
关键词 西番莲 SRAP标记 杂种鉴定 遗传多样性
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利用SRAP标记鉴定结球甘蓝‘寒玉20’种子遗传纯度
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作者 曹婧 孙春青 +3 位作者 戴忠良 陈辉 山溪 陈波平 《现代园艺》 2024年第21期48-50,共3页
为鉴定结球甘蓝品种‘寒玉20’种子的遗传纯度,利用SRAP分子标记技术对结球甘蓝‘寒玉20’F1杂种DNA多态性进行分析;对280个随机引物组合进行了检测,共筛选出4个可用于鉴定结球甘蓝‘寒玉20’种子遗传纯度的引物组合;运用这些有效引物组... 为鉴定结球甘蓝品种‘寒玉20’种子的遗传纯度,利用SRAP分子标记技术对结球甘蓝‘寒玉20’F1杂种DNA多态性进行分析;对280个随机引物组合进行了检测,共筛选出4个可用于鉴定结球甘蓝‘寒玉20’种子遗传纯度的引物组合;运用这些有效引物组合,对甘蓝的192个单株进行遗传纯度检测,鉴定出此批甘蓝种子纯度约为91.93%。结果表明,SRAP分子标记技术能够在甘蓝基因组中产生较高的多态性位点且重复性好,可作为甘蓝新品种纯度鉴定的有效工具。 展开更多
关键词 结球甘蓝 种子 遗传纯度 SRAP
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基于形态标记与SRAP标记的莱豆种质资源遗传多样性分析 被引量:5
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作者 郭媛贞 黄强 +5 位作者 叶新如 陈芝 黄枝 陈海玲 颜墩炜 薛珠政 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期166-173,共8页
[目的]探明莱豆种质资源遗传多样性和亲缘关系,为莱豆种质资源优良基因深度发掘和新品种选育提供科学依据。[方法]利用形态标记和SRAP分子标记两种方法对22份莱豆资源的26个数量性状和18个质量性状进行测定、分析。[结果]筛选出的28对S... [目的]探明莱豆种质资源遗传多样性和亲缘关系,为莱豆种质资源优良基因深度发掘和新品种选育提供科学依据。[方法]利用形态标记和SRAP分子标记两种方法对22份莱豆资源的26个数量性状和18个质量性状进行测定、分析。[结果]筛选出的28对SRAP引物扩增多态性条带158条,平均多态性比率为77.75%。两种标记方法聚类结果显示,根据莱豆荚果大小可以将22份莱豆资源分为三大类群体。其中,“上横山10-2-6”和“下横山10-3-3”亲缘关系较近,推测可能存在频繁的基因交流。[结论]22份莱豆资源遗传多样性丰富,形态标记和SRAP分子标记两种聚类方法基本支持根据荚果大小划分莱豆资源,为莱豆种质资源的创新利用奠定基础。 展开更多
关键词 莱豆 形态标记 SRAP分子标记 遗传多样性 亲缘关系
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白及种质资源遗传多样性分析 被引量:2
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作者 王洁 朱锡彭 +4 位作者 王腾斐 朱建军 李文俊 邢丙聪 郑颖 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期321-329,共9页
【目的】采用简单重复序列间扩增(ISSR)和相关序列扩增多态性(SRAP)等2种标记技术分析不同种源白及Bletilla striata样本的遗传多样性水平和遗传关系,为白及种质的鉴定、分类、保护和开发提供理论依据。【方法】从100个ISSR引物和238对S... 【目的】采用简单重复序列间扩增(ISSR)和相关序列扩增多态性(SRAP)等2种标记技术分析不同种源白及Bletilla striata样本的遗传多样性水平和遗传关系,为白及种质的鉴定、分类、保护和开发提供理论依据。【方法】从100个ISSR引物和238对SRAP引物组合中筛选出多态性高、扩增条带清晰、重复性好的引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,用Popgene 32.0计算来自浙江、云南、贵州和四川等省32个不同种源白及的遗传多样性参数和遗传距离,用NTSYS-pc 2.10e进行聚类分析。【结果】从100个ISSR引物中筛选出11个多态性较好的引物,共扩增出188个条带,平均每个引物扩增出17.09个条带,其中多态性位点174个,占总扩增片段的92.20%;从238对SRAP引物组合中筛选出11对多态性较好的引物组合,共扩增出216个条带,平均每个引物扩增出19.64个条带,其中多态性位点202个,占总扩增片段的93.52%。综合ISSR和SRAP的标记结果发现:四川白及种源的遗传多样性水平最高,贵州最低;非加权组平均法(UPGMA聚类)和主坐标分析(PCoA分析)结果显示:聚为一类的白及种源大多来自同一省份,云南省与四川省白及种源的遗传距离较近,浙江省和贵州省白及种源的遗传距离较近,说明遗传距离与地理距离存在一定的重合,但并不呈正相关。【结论】本研究所选白及种源间具有较高的遗传多样性,ISSR和SRAP标记技术均可有效揭示白及的遗传多样性和亲缘关系。 展开更多
关键词 白及 遗传多样性 简单重复序列间扩增(ISSR)标记 相关序列扩增多态性(SRAP)标记
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利用SRAP分子标记分析谷瘟病菌遗传多样性
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作者 刘佳 张梦雅 +7 位作者 任世龙 王永芳 马继芳 全建章 刘磊 董志平 白辉 李志勇 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2023年第5期179-187,共9页
了解谷瘟病菌的变异和群体结构,为今后谷瘟病的防控及抗病品种培育提供理论基础。利用20对SRAP引物对采自9个地区的90株谷瘟病菌菌株进行了PCR扩增,利用NTSYSpc-2.11F软件进行数据分析,通过UPGMA方法进行聚类分析,使用Popgene 32软件计... 了解谷瘟病菌的变异和群体结构,为今后谷瘟病的防控及抗病品种培育提供理论基础。利用20对SRAP引物对采自9个地区的90株谷瘟病菌菌株进行了PCR扩增,利用NTSYSpc-2.11F软件进行数据分析,通过UPGMA方法进行聚类分析,使用Popgene 32软件计算各群体间的遗传多样性指数。结果表明,筛选出了8对引物用于谷瘟病菌的遗传多态性分析,这8对引物共扩增出条带1728条,其中多态性条带1492条,多态性比率为86.34%。对90株病原菌进行聚类分析,其相似性系数为0.77~0.85,遗传相似系数为0.802时,所有菌株被分为27个遗传宗谱(L1~L27),其中L1为绝对优势组群,共包含来自山东、河北、山西、河南和辽宁5个省份的29株谷瘟病菌,占总菌株的32.22%。经Popgene 32软件计算分析,9个地区谷瘟病菌的Nei′s遗传多样性指数(H)为0.1414~0.2881,Shannon′s信息指数(I)为0.1960~0.4416,河北夏谷区Nei′s遗传多样性指数和Shannon′s信息指数最高,遗传多样性最丰富,而海南群体遗传多样性最低。对不同地区谷瘟病菌群体比较,吉林群体与海南群体的遗传亲缘关系最远,而河北夏谷区群体与河北春谷区群体的亲缘关系最近。可见,不同地区谷瘟病菌的遗传多样性丰富,各菌株间存在遗传分化,但菌株间的遗传分化与地理来源无明显相关性。 展开更多
关键词 谷子 谷瘟病菌 SRAP 相似性系数 遗传多样性
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利用ISSR与SRAP分子标记分析金线莲种质资源遗传多样性 被引量:4
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作者 黄锦春 万思琦 +7 位作者 陈扬 李丽红 张自力 朱建军 吴梅 邢丙聪 邵清松 陆晨飞 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期22-29,共8页
【目的】研究浙江与福建等地引种、杂交与野生的金线莲Anoectochilus roxburghii样品间遗传多样性和亲缘关系,为金线莲种质资源鉴定及优良新品种(系)选育提供科学依据。【方法】以48份新鲜金线莲叶片为材料,分别采用简单重复序列扩增多... 【目的】研究浙江与福建等地引种、杂交与野生的金线莲Anoectochilus roxburghii样品间遗传多样性和亲缘关系,为金线莲种质资源鉴定及优良新品种(系)选育提供科学依据。【方法】以48份新鲜金线莲叶片为材料,分别采用简单重复序列扩增多态性(ISSR)与序列相关扩增多态性(SRAP)分子标记技术,各挑选11条(对)多态性好、扩增条带清晰的引物。经琼脂糖凝胶电泳成像后,统计其扩增条带数,运用NTSYS-PC 2.1和POPGENE 32软件进行非加权组平均法(UPGMA)聚类分析。【结果】ISSR分子标记技术共扩增出86条条带,其中多态性条带84条,多态位点百分率为97.67%;SRAP分子标记技术共扩增出88条条带,其中多态性条带86条,多态位点百分率为97.73%,ISSR和SRAP标记均表现出较高的多态性。不同样本间的遗传距离和遗传一致度表明:浙江省与福建省的金线莲种质混杂严重,而遗传多样性结果显示:福建省的金线莲种群遗传多样性更高。此外,基于ISSR和SRAP标记的UPGMA聚类结果显示:48份不同种源的金线莲依亲缘关系的远近可分为四大类,聚类的划分受到一定地域性的影响,但各地域的金线莲品种在这四大类中均互有混杂。【结论】金线莲在物种水平上遗传多样性较高,在各地区、各品种(系)间遗传交流频繁,ISSR与SRAP分子标记技术可以从分子水平上揭示浙江与福建等地金线莲的遗传多样性,且结合ISSR标记与SRAP标记的分析结果要优于单一的分子标记结果。 展开更多
关键词 金线莲 遗传多样性 分子标记 种质资源 ISSR SRAP
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基于SRAP标记的不同产区黄精的遗传多样性 被引量:5
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作者 李亚萍 戴惠明 +3 位作者 姜武 陈家栋 段晓婧 陶正明 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期658-664,共7页
【目的】研究不同产区黄精Polygonatum spp.的遗传多样性,为其资源保护及品种选育提供更多理论依据。【方法】使用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记技术,分析来自华东(浙江、福建、安徽、江西)、西北(河北、陕西)、华中(湖南)、西南(... 【目的】研究不同产区黄精Polygonatum spp.的遗传多样性,为其资源保护及品种选育提供更多理论依据。【方法】使用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记技术,分析来自华东(浙江、福建、安徽、江西)、西北(河北、陕西)、华中(湖南)、西南(四川、贵州、云南)等4个居群的47份黄精种质资源的遗传多样性。【结果】对88对SRAP引物进行筛选,有7对可用于黄精种质资源的SRAP-PCR分析,共得到159条扩增条带,其中多态性条带140条。物种水平上,多态性比率为88.05%,有效等位基因数(Ne)为1.600 6,Nei’s基因多样性指数(H)为0.204 1,Shannon信息指数(I)为0.308 0;居群水平上,多态性比率为42.14%~86.16%,H和I分别为0.188 1~0.259 1和0.238 2~0.399 4;4个居群的基因分化系数(G_(st))为0.194 1,表明有80.59%的遗传变异在种群内进行,基因流(N_(m))为2.075 4,表明居群间存在一定的基因流动;从非加权组平均法(UPGMA)聚类结果可知:当相似系数为0.66时,47份样品分成4组,Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ类的均为华东地区浙江种质资源,当相似系数为0.68时,Ⅱ类分成2支。西南与西北聚为一类,浙江庆元黄精聚类结果复杂,表明地理位置差异与亲缘关系远近没有特定关系。整体上华东居群遗传多样性丰富,而庆元黄精种质遗传多样性最丰富。【结论】黄精遗传多样性水平较高,居群间存在一定的基因交流,可为黄精新品种选育工作提供参考。图3表4参22。 展开更多
关键词 黄精 相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记 遗传多样性 产区
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不同产区白芷遗传多样性和品质特征 被引量:3
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作者 王丽赟 孙健 +6 位作者 陈梦莹 姚辉 周水灯 王海阁 王盼 徐凯玠 王志安 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期30-37,共8页
【目的】明确不同产区白芷Angelica dahurica种源遗传差异特征,分析具有遗传差异的白芷种源在同圃栽培条件下的品质特征差异。【方法】应用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记分析不同白芷种源的遗传组成,以同圃栽培的不同种源白芷为材料... 【目的】明确不同产区白芷Angelica dahurica种源遗传差异特征,分析具有遗传差异的白芷种源在同圃栽培条件下的品质特征差异。【方法】应用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记分析不同白芷种源的遗传组成,以同圃栽培的不同种源白芷为材料,应用高效液相色谱法(HPLC)测定7种香豆素类化学成分,构建HPLC指纹图谱,进而分析不同种源的品质特征。【结果】非加权组平均法(UPGMA)聚类分析显示:在遗传相似系数为0.84处,部分河北产区的白芷种源与南方产区的白芷种源产生分离。同圃栽培下,仅应用7种香豆素类化学成分不能明确区分不同白芷种源,应用HPLC指纹图谱进行主成分分析(PCA)后,具有遗传差异的种源之间出现品质特征的区分。【结论】不同产区白芷种源遗传相似度较大,同圃栽培的部分浙江白芷种源的药材可以应用HPLC指纹图谱与其他产地种源进行区分。 展开更多
关键词 白芷 SRAP 遗传 香豆素类 品质
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