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丹参通络解毒汤含药血清调控MALAT1对缺氧/复氧大鼠心肌微血管内皮细胞的保护作用及机制研究 被引量:2
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作者 夏旭婷 李昇聪 +2 位作者 李鑫辉 蒋啸 李彩云 《中国中医药信息杂志》 CAS CSCD 2024年第1期110-116,共7页
目的研究丹参通络解毒汤含药血清调控转移相关肺腺癌转录本1(MALAT1)对缺氧/复氧大鼠心肌微血管内皮细胞(CMECs)的保护作用及机制。方法体外培养大鼠CMECs,构建缺氧/复氧损伤细胞模型,转染过表达/沉默空白MALAT1慢病毒,将细胞分为过表... 目的研究丹参通络解毒汤含药血清调控转移相关肺腺癌转录本1(MALAT1)对缺氧/复氧大鼠心肌微血管内皮细胞(CMECs)的保护作用及机制。方法体外培养大鼠CMECs,构建缺氧/复氧损伤细胞模型,转染过表达/沉默空白MALAT1慢病毒,将细胞分为过表达空白+中药组、过表达MALAT1+中药组、过表达MALAT1组、沉默空白+中药组、沉默MALAT1组、沉默MALAT1+中药组,分别予相应血清培养,免疫荧光染色检测Beclin-1蛋白表达,Western blot检测丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(SRPK1)、丝氨酸丰富剪接因子1(SRSF1)、血管内皮生长因子(VEGF)及Bax蛋白表达,RT-PCR检测MALAT1、SRPK1、SRSF1 mRNA表达。结果与过表达空白+中药组比较,过表达MALAT1+中药组Beclin-1蛋白表达升高,SRPK1、SRSF1、Bax蛋白表达显著升高(P<0.05,P<0.01),VEGF蛋白表达显著降低(P<0.01),MALAT1、SRPK1、SRSF1 mRNA表达显著升高(P<0.05,P<0.01);与过表达MALAT1组比较,过表达MALAT1+中药组Beclin-1蛋白表达降低,SRPK1、SRSF1、Bax蛋白表达显著降低(P<0.01,P<0.05),VEGF蛋白表达显著升高(P<0.01),MALAT1、SRPK1、SRSF1 mRNA表达显著降低(P<0.05);与沉默空白+中药组比较,沉默MALAT1+中药组Beclin-1蛋白表达降低,SRPK1、SRSF1、Bax蛋白表达显著降低(P<0.01),VEGF蛋白表达显著升高(P<0.01),MALAT1、SRPK1、SRSF1 mRNA表达显著降低(P<0.01);与沉默MALAT1组比较,沉默MALAT1+中药组Beclin-1蛋白表达降低,SRPK1、SRSF1、Bax蛋白表达显著降低(P<0.05),VEGF表达显著升高(P<0.01),MALAT1、SRPK1、SRSF1 mRNA表达显著降低(P<0.01,P<0.05)。结论上调MALAT1表达可促进缺氧/复氧损伤模型CMECs自噬,丹参通络解毒汤含药血清能通过抑制MALAT1表达抑制自噬、促进血管新生,其机制可能与下调SRPK1、SRSF1表达有关。 展开更多
关键词 丹参通络解毒汤 缺氧/复氧 心肌微血管内皮细胞 自噬 MALAT1 SRPK1 SRSF1
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SRSF1调控RBBP6发生可变剪接事件对多发性骨髓瘤细胞增殖的影响
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作者 张维敏 宋莎 +1 位作者 庄文卓 李炳宗 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1738-1743,共6页
目的:探讨剪接因子SRSF1介导RBBP6发生可变剪接后,其不同剪接体对多发性骨髓瘤(MM)细胞增殖的影响。方法:通过RT-PCR检测SRSF1调控RBBP6不同剪接体mRNA的表达水平。利用GEO数据库分析RBBP6同源异构体(isoform)1在浆细胞疾病进展中的变化... 目的:探讨剪接因子SRSF1介导RBBP6发生可变剪接后,其不同剪接体对多发性骨髓瘤(MM)细胞增殖的影响。方法:通过RT-PCR检测SRSF1调控RBBP6不同剪接体mRNA的表达水平。利用GEO数据库分析RBBP6同源异构体(isoform)1在浆细胞疾病进展中的变化,通过生存分析评价该基因在MM患者预后中的价值。在体外功能缺失和功能获得实验中,将对照siRNA、RBBP6 isoform 1 siRNA、空载体(EV)、OE-RBBP6 isoform 3转染至MM.1S细胞中,用实时荧光定量PCR检测RBBP6 isoform 1、RBBP6 isoform 3 mRNA表达水平,Western blot检测蛋白表达,CCK-8法检测细胞增殖。结果:敲除SRSF1增加了RBBP6 isoform 3的表达,降低了RBBP6 isoform 1的表达。其中,RBBP6 isoform 1与浆细胞疾病的进展密切相关,RBBP6 isoform 1高表达组MM患者预后较差。下调RBBP6 isoform 1的表达和过表达RBBP6 isoform 3均能降低MM细胞的增殖能力;并且下调RBBP6 isoform 1的表达后,MM细胞中p53蛋白水平明显增高(P<0.05)。结论:在MM中,剪接因子SRSF1可导致RBBP6发生可变剪接异常,其中RBBP6 isoform 1促进MM细胞增殖,RBBP6 isoform 3抑制MM细胞增殖,并且其机制可能与调控p53途径相关。 展开更多
关键词 多发性骨髓瘤 可变剪接 剪接因子SRSF1 RBBP6
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SRSFs mediate the function of AR in the ovarian granulosa cells of patients with PCOS
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作者 Jing Luo Hong Ye +4 位作者 Lijuan Hao Yixuan Sun Ruohan Li Yanxi Li Zhu Yang 《Genes & Diseases》 SCIE 2021年第1期94-109,共16页
Ovarian hyperandrogenism is one of the characteristics of polycystic ovary syndrome(PCOS)and androgen receptor(AR)in ovarian granulosa cells(GCs)functions as an important element to the accumulation of androgens.This ... Ovarian hyperandrogenism is one of the characteristics of polycystic ovary syndrome(PCOS)and androgen receptor(AR)in ovarian granulosa cells(GCs)functions as an important element to the accumulation of androgens.This study verified the existence of alternative splicing variant of AR(AR-SVs)in the GCs of PCOS patients and found that the function of AR decreased significantly in the presence of AR-SVs.And compared to the normal individuals,the expression of Serine/arginine-rich splicing factor 2(SRSF2)was higher and the expression of SRSF3 was lower in the GCs of patients with AR-SVs.More importantly,we found that the expression of SRSF2 was inhibited and that the expression of AR was decreased after the successful upregulation of miRNA-183,and testostrone(T)concentrations in the culture medium were increased.The results also showed that the expression of SRSF3 decreased when miRNA-124 was successfully upregulated,while the expression of AR significantly increased;however,the function of AR was also inhibited when T concentration in the culture medium was increased.This study has proved that SRSFs are regulated by corresponding miRNAs,and the altered expression of SRSFs interferenced the alternative splicing process of AR and ultimately decreased the function of AR,leading to the accumulation of androgens in the ovary. 展开更多
关键词 Androgen receptor Granulosa cells HYPERANDROGENISM MIRNAS PCOS srsfs
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结肠癌组织中SRSF1蛋白的表达及其临床意义 被引量:1
4
作者 王姝昊 常肖璐 +4 位作者 赵磊 孙紫洋 朴俊杰 林贞花 金爱花 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2023年第2期146-151,共6页
目的 探讨SRSF1在结肠癌中的表达及其与临床病理特征、预后的关系。方法 应用癌症基因组图谱(TCGA)和GEO数据库分析SRSF1 mRNA在结肠癌、正常结肠组织中的表达。采用免疫组化法检测SRSF1蛋白在94例结肠癌和86例癌旁正常组织中的表达,分... 目的 探讨SRSF1在结肠癌中的表达及其与临床病理特征、预后的关系。方法 应用癌症基因组图谱(TCGA)和GEO数据库分析SRSF1 mRNA在结肠癌、正常结肠组织中的表达。采用免疫组化法检测SRSF1蛋白在94例结肠癌和86例癌旁正常组织中的表达,分析其表达与结肠癌临床病理特征的关系。应用Kaplan-Meier生存法分析SRSF1蛋白表达与结肠癌患者生存时间的相关性;采用Cox回归模型分析SRSF1在结肠癌风险预测中的评估价值。结果 TCGA和GEO数据库结果显示SRSF1 mRNA在结肠癌中高表达(P<0.05)。免疫组化检测显示SRSF1蛋白在结肠癌组织中的阳性率和高表达率分别为92.6%(87/94)和67.0%(63/94),显著高于癌旁正常组织(57.0%、11.6%)。χ^(2)=检验结果显示SRSF1表达水平与结肠癌患者临床分期相关(P=0.028)。Kaplan-Meier生存分析表明:SRSF1蛋白高表达结肠癌患者的总生存期低于SRSF1蛋白低表达患者(P=0.040)。Cox单因素回归分析表明:淋巴结转移(HR:3.638,95%CI=1.913~6.917,P<0.001)、临床肿瘤分期(HR:4.313,95%CI=2.228~8.348,P<0.001)和SRSF1蛋白高表达(HR:2.130,95%CI=1.010~4.492,P=0.047)是影响结肠癌患者预后的独立风险因素。结论 SRSF1表达与结肠癌的发生、发展及预后密切相关,可作为结肠癌预后评估的潜在标志物。 展开更多
关键词 结肠肿瘤 SRSF1 免疫组织化学 生存分析 预后
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Serine and arginine rich splicing factor 1:a potential target for neuroprotection and other diseases
5
作者 Ana M.Sandoval-Castellanos Anushka Bhargava +2 位作者 Min Zhao Jun Xu Ke Ning 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2023年第7期1411-1416,共6页
Alternative splicing is the process of producing variably spliced mRNAs by choosing distinct combinations of splice sites within a messenger RNA precursor.This splicing enables mRNA from a single gene to synthesize di... Alternative splicing is the process of producing variably spliced mRNAs by choosing distinct combinations of splice sites within a messenger RNA precursor.This splicing enables mRNA from a single gene to synthesize different proteins,which have different cellular properties and functions and yet arise from the same single gene.A family of splicing factors,Serine-arginine rich proteins,are needed to initiate the assembly and activation of the spliceosome.Serine and arginine rich splicing factor 1,part of the arginine/serine-rich splicing factor protein family,can either activate or inhibit the splicing of mRNAs,depending on the phosphorylation status of the protein and its interaction partners.Considering that serine and arginine rich splicing factor 1 is either an activator or an inhibitor,this protein has been studied widely to identify its various roles in different diseases.Research has found that serine and arginine rich splicing factor 1 is a key target for neuroprotection,showing its promising potential use in therapeutics for neurodegenerative disorders.Furthermore,serine and arginine rich splicing factor 1 might be used to regulate cancer development and autoimmune diseases.In this review,we highlight how serine and arginine rich splicing factor 1 has been studied concerning neuroprotection.In addition,we draw attention to how serine and arginine rich splicing factor 1 is being studied in cancer and immunological disorders,as well as how serine and arginine rich splicing factor 1 acts outside the central or peripheral nervous system. 展开更多
关键词 alternative splicing autoimmune disorders cancer HYPERTENSION mRNA NEUROPROTECTION splicing factors SRSF1
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基于生物信息学分析剪接因子SRSF11在胃癌中的表达及临床意义
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作者 喻莹 刘玉婷 +2 位作者 黎桂珍 梁景皓 李彬彬 《中国医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第4期294-300,307,共8页
目的基于数据库分析剪接因子SRSF11在胃癌中的表达及其与临床病理特征、预后的关系,并探讨相关机制。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)、基因表达综合(GEO)数据库分析SRSF11在胃癌中的表达情况;利用UALCAN、KM Plotter评估SRSF11表达与临... 目的基于数据库分析剪接因子SRSF11在胃癌中的表达及其与临床病理特征、预后的关系,并探讨相关机制。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)、基因表达综合(GEO)数据库分析SRSF11在胃癌中的表达情况;利用UALCAN、KM Plotter评估SRSF11表达与临床病理特征、预后的关系;利用TIMER工具分析SRSF11表达对肿瘤微环境免疫细胞浸润的影响;结合TCGA spliceSeq中可变剪接数据和RNA-seq数据分析SRSF11调控的可变剪接事件和基因,并对靶基因进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果胃癌组织中SRSF11表达明显上调(P<0.05),且与患者淋巴结转移和TP53基因突变有关(P<0.05);SRSF11高表达与胃癌患者预后不良相关(P<0.001);SRSF11表达可影响胃癌中多种免疫细胞的浸润水平,巨噬细胞高浸润量与患者预后不良相关(P<0.05);靶基因KEGG富集分析显示主要参与病毒感染、溶酶体、三磷酸腺苷结合盒转运体和肿瘤相关信号通路等。结论SRSF11在胃癌组织中呈现高表达,且与不良预后和免疫浸润相关。SRSF11有望成为胃癌诊断、预后评估和治疗的新靶点。 展开更多
关键词 胃癌 SRSF11 可变剪接 生物信息学
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骨髓增生异常综合征向急性髓系白血病转化相关基因的研究进展 被引量:9
7
作者 朱晨 马燕 许小平 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期873-878,共6页
骨髓增生异常综合征(MDS)是一组起源于造血干细胞的高度异质性、高风险向急性髓系白血病转化的恶性克隆性疾病。随着分子生物学技术的不断发展,发现了多种基因与MDS向急性髓系白血病转化(转白)密切相关。SRSF2是与RNA剪接相关的基因,该... 骨髓增生异常综合征(MDS)是一组起源于造血干细胞的高度异质性、高风险向急性髓系白血病转化的恶性克隆性疾病。随着分子生物学技术的不断发展,发现了多种基因与MDS向急性髓系白血病转化(转白)密切相关。SRSF2是与RNA剪接相关的基因,该基因突变提示患者可能预后不良,并较未突变者有更高向AML转化的几率;与DNA甲基化密切相关的DNMT3A,其突变多预示较差的总生存率,并可能更快地向AML转化;调节组蛋白合成的ASXL1,其框移突变是预后不良的分子标志,并且较无突变者有更快向AML转化的现象;与三羧酸循环密切相关的IDH又可分为IDH1与IDH2,前者多提示较短的生存时间以及较高的转白率,而有部分报道发现后者在低危组患者中提示不良的预后;另一与DNA甲基化状态密切相关的基因TET2,是目前MDS中最常见的基因突变,有学者认为它可能是一种抑癌基因,但目前其对MDS患者预后影响的观点尚未统一,有报道提示其突变与MDS较快向AML转化有明显关联。因为研究对象人种、地域、临床特点等众多因素的不同,各家报道结果仍存在差异。本文就这五个基因进行综述。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征(MDS) 急性髓系白血病(AML) SRSF2 DNMT3A ASXL1 IDH TET2
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SRSF1和Caspase-3在膀胱尿路上皮癌中的表达及其临床意义 被引量:6
8
作者 祝兴旺 李永智 刘屹立 《现代肿瘤医学》 CAS 2017年第3期412-415,共4页
目的:探讨SRSF1和Caspase-3在膀胱尿路上皮细胞癌的表达及其临床意义。方法:应用免疫组化方法检测45例膀胱尿路上皮癌及10例正常膀胱尿路上皮中SRSF1及Caspase-3的表达情况,并探讨二者的相关性。结果:SRSF1在膀胱尿路上皮细胞癌中高表达... 目的:探讨SRSF1和Caspase-3在膀胱尿路上皮细胞癌的表达及其临床意义。方法:应用免疫组化方法检测45例膀胱尿路上皮癌及10例正常膀胱尿路上皮中SRSF1及Caspase-3的表达情况,并探讨二者的相关性。结果:SRSF1在膀胱尿路上皮细胞癌中高表达,并且与肿瘤的初发和复发、是否转移显著相关。Caspase-3在膀胱尿路上皮癌中低表达,与临床及病理指标均无关。相关性分析表明,膀胱尿路上皮癌中SRSF1表达与Caspase-3表达呈负相关。结论:SRSF1与膀胱尿路上皮癌的发生、复发及转移密切相关,其可能通过抑制凋亡相关蛋白Caspase-3来调控细胞周期及凋亡,参与肿瘤的发生及发展。SRSF1的高表达和Caspase-3蛋白的低表达在膀胱尿路上皮癌的发生发展起着重要作用。 展开更多
关键词 凋亡 膀胱尿路上皮癌 SRSF1 CASPASE
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剪接异常在骨髓增生异常综合征发病机制中的作用 被引量:3
9
作者 李璘 肖志坚 孙雪梅 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期617-621,共5页
近年来应用高通量测序技术较全面地揭示了骨髓增生异常综合征(MDS)的基因突变谱系,但对这些基因突变在MDS发生、发展中的作用知之甚少。剪接因子突变是MDS这组异质性疾病中最常见的分子学异常。在最近研究中发现了SF3B1、SRSF2、U2AF1... 近年来应用高通量测序技术较全面地揭示了骨髓增生异常综合征(MDS)的基因突变谱系,但对这些基因突变在MDS发生、发展中的作用知之甚少。剪接因子突变是MDS这组异质性疾病中最常见的分子学异常。在最近研究中发现了SF3B1、SRSF2、U2AF1突变以及端粒酶功能异常导致的剪接因子失调而影响前体mRNA剪接的具体机制,揭示了可能的下游靶基因,初步阐释了剪接异常对造血功能的影响及其在MDS发病机制中的作用,并建立了相应的动物模型,对寻找MDS新的治疗靶点具有重要意义。本文就剪接异常在骨髓增生异常综合征发病机制中的作用进行了综述。 展开更多
关键词 SF3B1 SRSF2 U2AF1 端粒酶 骨髓增生异常综合征
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高分辨率熔解分析检测急性髓系白血病SRSF2基因突变 被引量:1
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作者 姚冬明 杨静 +5 位作者 钱震 杨磊 肖高飞 林江 郭竑 钱军 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2016年第7期1169-1172,共4页
目的:应用高分辨率熔解分析(high-resolution melting curve analysis,HRMA)检测急性髓系白血病(AML)患者丝氨酸丰富剪接因子2(SRSF2)基因突变。方法:针对SRSF2基因热点突变位点P95,建立PCR-HRMA方法对140例AML患者骨髓标本进行突变检测... 目的:应用高分辨率熔解分析(high-resolution melting curve analysis,HRMA)检测急性髓系白血病(AML)患者丝氨酸丰富剪接因子2(SRSF2)基因突变。方法:针对SRSF2基因热点突变位点P95,建立PCR-HRMA方法对140例AML患者骨髓标本进行突变检测及DNA测序验证。结果 :HRMA分析发现140例初诊AML患者中7例(5%)检出SRSF2突变,经测序结果验证为1例P95R杂合子突变、2例P95L杂合子突变和4例P95H杂合子突变;HRMA技术检测SRSF2基因突变的灵敏度为10%;SRSF2基因突变组与非突变组在性别、年龄及血象之间均无显著性差异(P>0.05);AML患者中突变组的总体生存时间(OS)明显短于非突变组(P=0.016)。结论:HRMA分析是一种简便、快速、特异和高通量的SRSF2基因突变筛查技术,SRSF2突变的AML患者预后不良。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 高分辨率熔解分析 SRSF2突变 预后
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SRSF1在肿瘤中的研究进展 被引量:2
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作者 吕自兰 郭变琴 吴立翔 《检验医学与临床》 CAS 2016年第9期1278-1280,共3页
人类基因中约有94%发生选择性剪接,使同一前体 m R‐NA分子产生不同基因型,编码不同蛋白质,极大增加了基因表达复杂程度和蛋白质多样性[1]。不同组织出现疾病时显示特定模式剪接变异体,这些剪接模式依赖于剪接因子在细胞核中的... 人类基因中约有94%发生选择性剪接,使同一前体 m R‐NA分子产生不同基因型,编码不同蛋白质,极大增加了基因表达复杂程度和蛋白质多样性[1]。不同组织出现疾病时显示特定模式剪接变异体,这些剪接模式依赖于剪接因子在细胞核中的相对表达,包括表达量或翻译后修饰[2]。富含丝氨酸/精氨酸剪接因子1(SRSF1),是1个典型富含丝氨酸/精氨酸SR蛋白家族成员,参与基因组成性剪接和选择性剪接[3]。SRSF1通过调节基因选择性剪接参与肿瘤形成发展。 展开更多
关键词 富含丝氨酸/精氨酸剪接因子1(SRSF1) 选择性剪接 肿瘤
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顺铂处理后剪接因子SRSF12 mRNA异构体在多种细胞中的变化
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作者 马春霞 李明阳 +3 位作者 吴瀚欣 杨渊 杨梦莉 俞建昆 《昆明医科大学学报》 CAS 2018年第1期5-9,共5页
目的用梯度浓度顺铂处理多种细胞后检测剪接因子SRSF12的mRNA异构体并分析其变化.方法用梯度浓度顺铂处理肺癌细胞A549和H1299、人胚肾细胞293FT以及宫颈癌细胞系Si Ha、Ca Ski、C33A细胞后提取总RNA,利用半定量RT-PCR检测分析SRSF12基... 目的用梯度浓度顺铂处理多种细胞后检测剪接因子SRSF12的mRNA异构体并分析其变化.方法用梯度浓度顺铂处理肺癌细胞A549和H1299、人胚肾细胞293FT以及宫颈癌细胞系Si Ha、Ca Ski、C33A细胞后提取总RNA,利用半定量RT-PCR检测分析SRSF12基因mRNA异构体及相对水平的变化.结果在除Caski细胞外的5种细胞中检测到了2种异构体(Isoform-a、b),且随着处理顺铂浓度的增加,Isoform-a的比例有增加趋势,Isoform-b的比例变化在A549及293FT细胞中变化不明显,在H1299及C33A细胞中渐弱,在Siha细胞中表达较弱且2种异构体均有渐弱趋势.结论在顺铂处理后,SRSF12的表达不仅具有组织特异性还具有细胞特异性. 展开更多
关键词 顺铂 SRSF12 mRNA选择性剪接 组织特异性 细胞特异性
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血液肿瘤中的常见剪接体突变研究进展
13
作者 孙超 王婧 周新 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期925-929,共5页
近年来,随着全外显子/基因组测序技术在血液肿瘤中的应用,剪接体突变作为新的体细胞突变在多种血液肿瘤中被发现。因此,除外DNA甲基化、染色体修饰、转录调控、DNA修复和信号转导等机制外,剪接体突变为认识血液肿瘤的发病机制提供了新... 近年来,随着全外显子/基因组测序技术在血液肿瘤中的应用,剪接体突变作为新的体细胞突变在多种血液肿瘤中被发现。因此,除外DNA甲基化、染色体修饰、转录调控、DNA修复和信号转导等机制外,剪接体突变为认识血液肿瘤的发病机制提供了新的观点。本综述介绍了剪接体的结构和功能,同时讨论血液肿瘤中常见的剪接体突变基因(如SF3B1、U2AF35、SRSF2及ZRSR2等)的突变频率、突变类型、临床表型及其对疾病预后的影响。 展开更多
关键词 血液肿瘤 剪接体突变 SF3B1 U2AF35 SRSF2 ZRSR2
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SRSF2基因的生物信息学分析与蛋白质预测
14
作者 李明阳 马春霞 +3 位作者 吴翰欣 吴小海 杨渊 俞建昆 《生物技术通讯》 CAS 2017年第5期590-594,共5页
目的:分析富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子2(SRSF2)基因序列和表达产物的特征。方法:运用生物信息学相关软件分析和预测人类和小鼠SRSF2基因的同源区段、开放读框、启动子区域、转录因子结合位点、CpG岛分布情况,分析预测小鼠SRSF2基因蛋... 目的:分析富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子2(SRSF2)基因序列和表达产物的特征。方法:运用生物信息学相关软件分析和预测人类和小鼠SRSF2基因的同源区段、开放读框、启动子区域、转录因子结合位点、CpG岛分布情况,分析预测小鼠SRSF2基因蛋白产物的功能结构域以及与其他蛋白的相互作用。结果:人类和小鼠SRSF2基因共有3个同源区段、19个开放读框、4个相同的转录因子结合位点,2个基因的CpG岛各项参数基本一致;小鼠SRSF2蛋白会与至少10种其他蛋白因子发生相互作用。结论:SRSF2基因及其蛋白产物的生物信息学分析,为相关研究提供了重要的信息基础。 展开更多
关键词 富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子2(SRSF2) 生物信息学 蛋白质相互作用
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基于TCGA数据库分析、筛选并验证前列腺癌诊断或预后标志物
15
作者 贺倩 王亮 门剑龙 《天津医科大学学报》 2021年第2期127-132,共6页
目的:综合分析表达谱数据与DNA甲基化数据,探索新的前列腺癌诊断或预后的标志物。方法:在TCGA公共数据库下载前列腺癌的甲基化水平数据以及mRNA表达数据;利用R软件中的DESeq2包对表达谱数据进行差异表达分析,利用R软件中的limma包对DNA... 目的:综合分析表达谱数据与DNA甲基化数据,探索新的前列腺癌诊断或预后的标志物。方法:在TCGA公共数据库下载前列腺癌的甲基化水平数据以及mRNA表达数据;利用R软件中的DESeq2包对表达谱数据进行差异表达分析,利用R软件中的limma包对DNA甲基化芯片进行差异甲基化位点分析;采用美国国立卫生研究院的DAVID v6.7在线软件平台进行功能和通路的富集分析;对筛选出的基因进行Kaplan-Meier生存分析以及分子生物学实验验证。结果:差异表达分析得到1130个差异表达基因,其中759个表达下调,371个表达上调;差异甲基化位点分析获得375个差异甲基化位点,其中8个低甲基化位点,367个高甲基化位点;综合分析发现CBX5、NBPF13P、RARB、RCN1、SRSF5基因的异常甲基化与肿瘤复发风险密切相关;定量PCR显示前列腺癌患者SRSF5 mRNA水平升高(P<0.05),甲基化特异性PCR显示前列腺癌患者SRSF5甲基化水平降低(均P<0.05)。结论:SRSF5在前列腺癌患者中甲基化水平降低且mRNA表达水平升高,且其低甲基化水平与复发风险密切相关。 展开更多
关键词 前列腺癌 表达谱 DNA甲基化 SRSF5
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SRSF10对山羊肌内前体脂肪细胞分化的影响 被引量:4
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作者 刘珂含 王永 +5 位作者 李艳艳 王重洋 朱江江 熊燕 李安 林亚秋 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1768-1778,共11页
旨在克隆山羊SRSF10基因序列,明确其生物学特性,并通过过表达和干扰手段阐明SRSF10对山羊肌内脂肪细胞分化的影响。本研究以简州大耳羊(Capra hircus)为试验对象,利用RT-PCR技术克隆山羊SRSF10基因序列,并进行生物信息学分析;利用实时... 旨在克隆山羊SRSF10基因序列,明确其生物学特性,并通过过表达和干扰手段阐明SRSF10对山羊肌内脂肪细胞分化的影响。本研究以简州大耳羊(Capra hircus)为试验对象,利用RT-PCR技术克隆山羊SRSF10基因序列,并进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qPCR)技术研究其在成脂诱导分化不同阶段细胞中的表达水平;转染pcDNA3.1-SRSF10过表达载体和SRSF10-siRNA至山羊肌内前体脂肪细胞并诱导分化,通过油红O和Bodipy染色法从形态学上明确其对脂滴积聚的影响;通过qPCR方法检测脂肪细胞分化标志基因表达的变化。结果显示,获得山羊SRSF10基因序列为1026 bp,其中CDS区552 bp,共编码183个氨基酸;SRSF10在诱导分化96 h的肌内脂肪细胞中表达量最高;过表达和干扰山羊SRSF10分别促进和抑制了肌内脂肪细胞中的脂滴积聚;过表达后基因SREBP1、PPARγ和C/EBPα的相对表达量极显著上调(P<0.01),干扰后分化标志基因SREBP1、PPARγ和C/EBPα相对表达水平极显著降低(P<0.01)。结果表明,山羊SRSF10是肌内脂肪细胞分化的正调控作用因子,并且这种调控作用可能主要通过调节SREBP1、PPARγ和C/EBPα的表达来实现。 展开更多
关键词 山羊 SRSF10 基因克隆 表达特性 肌内前体脂肪细胞 细胞分化
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牦牛SRSF10基因克隆及生物信息学分析 被引量:5
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作者 李歆怡 黄纯 +5 位作者 马晓明 喇永福 郭宪 阎萍 潘和平 梁春年 《中国草食动物科学》 CAS 2022年第5期1-8,共8页
为研究牦牛SRSF10(Serine/argnine-rich splicing factor 10,SRSF10)基因的结构及功能,以美仁牦牛脂肪组织cDNA为模板,克隆牦牛SRSF10基因的编码区(Coding sequence,CDS)序列,并利用基因序列进行生物信息学分析及蛋白理化性质预测。结... 为研究牦牛SRSF10(Serine/argnine-rich splicing factor 10,SRSF10)基因的结构及功能,以美仁牦牛脂肪组织cDNA为模板,克隆牦牛SRSF10基因的编码区(Coding sequence,CDS)序列,并利用基因序列进行生物信息学分析及蛋白理化性质预测。结果表明,美仁牦牛SRSF10基因的CDS区全长789 bp,共编码262个氨基酸;同源性比对发现,牦牛与野牦牛、黄牛之间的SRSF10基因亲缘关系最近(100%),与北极狐最远(97%);牦牛SRSF10蛋白分析显示,SRSF10蛋白内存在2个糖基化位点,1个RRM结构域(74 aa),无跨膜结构域及信号肽区域,其氨基酸等电点11.26,不稳定系数(Ⅱ)101.36,GRAVY=-1.762,预测为稳定的亲水性分泌蛋白;亚细胞定位与核定位预测分析均显示,SRSF10位于细胞核(61.9%),蛋白内共有潜在磷酸化位点63个;SRSF10蛋白高级结构由无规则卷曲(58.02%)、α-螺旋(21.76%)、延伸链(10.69%)和β-转角(9.54%)相互连接而成,主要与同为丝氨酸和富含精氨酸剪接因子、RNA结合蛋白等相关蛋白相互作用。综上所述,SRSF10基因在牦牛脂肪组织中发挥重要作用,该研究结果可为SRSF10基因在牦牛脂肪沉积调控机制的研究提供理论依据,也可为牦牛的遗传育种提供参考。 展开更多
关键词 美仁牦牛 SRSF10基因 生物信息学 脂肪
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SRSF3调控口腔癌细胞中SPAG5外显子3的可变剪切的研究 被引量:3
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作者 刘佩琦 石黎明 贾荣 《口腔医学研究》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期8-11,共4页
目的:研究调控前体mRNA(pre-mRNA)可变剪切的原癌基因SRSF3对细胞有丝分裂的重要功能蛋白SPAG5的外显子3的可变剪切的调控作用。方法:在人口腔鳞状上皮细胞癌细胞系CAL 27中应用RNAi技术降低SRSF3的表达,通过逆转录PCR(RT-PCR)检测SPAG... 目的:研究调控前体mRNA(pre-mRNA)可变剪切的原癌基因SRSF3对细胞有丝分裂的重要功能蛋白SPAG5的外显子3的可变剪切的调控作用。方法:在人口腔鳞状上皮细胞癌细胞系CAL 27中应用RNAi技术降低SRSF3的表达,通过逆转录PCR(RT-PCR)检测SPAG5外显子3的可变剪切。结果:在CAL 27细胞中抑制SRSF3表达时,抑制了全长的SPAG5的表达,增加了较短的SPAG5的剪切异构体的表达。结论:SRSF3可以调控SPAG5外显子3的可变剪切,并可能影响了SPAG5蛋白的表达水平和有丝分裂。 展开更多
关键词 SRSF3 SPAG5 可变剪切 有丝分裂
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背面敏感SRSF传感器的研究 被引量:1
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作者 郑继雄 刘百勇 +2 位作者 郑学仁 李斌 关培勋 《华南理工大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 1995年第12期31-37,共7页
针对"传感器中毒"现象,在正面敏感的扩展电阻硅流量(SRSF)传感器的基础上,提出背面敏感的SRSF传感器,并设计出相应的表面贴装元件(SMC)封装形式。理论推导和测试结果表明:背面敏感的SRSF传感器的输出电压与流... 针对"传感器中毒"现象,在正面敏感的扩展电阻硅流量(SRSF)传感器的基础上,提出背面敏感的SRSF传感器,并设计出相应的表面贴装元件(SMC)封装形式。理论推导和测试结果表明:背面敏感的SRSF传感器的输出电压与流体流速、流向的关系可表述为:;芯片厚度对灵敏度影响很大,其最佳值为150μm。在最佳厚度下,背面敏感方式虽然牺牲了SRSF传感器的10%的灵敏度,但却能有效防止传感器中毒,SMC封装形式使背面敏感SRSF传感器的正、反流向对称性大大改善。 展开更多
关键词 扩展电阻 流量传感器 正面敏感 SRSF传感器
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集成扩展电阻硅流量传感器的研究 被引量:1
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作者 张寿远 李斌 +2 位作者 郑学仁 刘百勇 关培勋 《华南理工大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 1995年第12期18-22,共5页
提出了一种新型集成扩展电阻硅流量(SRSF)传感器。此结构的工作原理是基于热传导原理,即当流体流过加热芯片时,芯片两端的温差可以用于测量流体的速度。由于应用硅扩展电阻作温度敏感元,故SRSF传感器适用于测量温度较高的... 提出了一种新型集成扩展电阻硅流量(SRSF)传感器。此结构的工作原理是基于热传导原理,即当流体流过加热芯片时,芯片两端的温差可以用于测量流体的速度。由于应用硅扩展电阻作温度敏感元,故SRSF传感器适用于测量温度较高的流体。理论分析和实验研究结果表明,SRSF传感器具有如下特点:小流量时(v0<1m/s)灵敏度较高;有方向敏特性;与标准IC工艺兼容,可制成集成化流量传感器。 展开更多
关键词 扩展电阻 流量传感器 SRSF传感器
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