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低温胁迫下冬小麦东农冬麦1号分蘖节相关EST-SSR信息分析 被引量:1
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作者 苍晶 范博 +7 位作者 宋扬 许贺 牟永潮 于晶 张达 王军虹 孟婧 朱祥春 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期1-5,共5页
利用抑制消减杂交技术构建东农冬麦1号分蘖节低温胁迫相关基因的cDNA正反文库,获得表达序列标签EST(Expressed sequence tag),经分析和前期处理后拼接得到736条非重复序列(Unigenes)。运用生物信息学方法对低温胁迫下诱导的冬小麦东农冬... 利用抑制消减杂交技术构建东农冬麦1号分蘖节低温胁迫相关基因的cDNA正反文库,获得表达序列标签EST(Expressed sequence tag),经分析和前期处理后拼接得到736条非重复序列(Unigenes)。运用生物信息学方法对低温胁迫下诱导的冬小麦东农冬麦1号分蘖节相关EST-SSRs分布频率和碱基重复特点进行归纳分析。结果表明,736条Unigenes共检索到59个EST-SSRs,EST-SSRs出现频率为8.02%。EST-SSRs包括24种重复单元,其主要以三核苷酸和二核苷酸重复基元为主,二者分别占总SSRs 47.46%和44.07%,在EST中出现频率分别为3.80%和3.53%,其中以二核苷酸CA和AG重复基元为主,三核苷酸重复基元以AAC重复基元所占比例最高。为冬小麦EST资源开发和抗寒基因挖掘奠定基础。 展开更多
关键词 冬小麦 东农冬麦1号 低温胁迫 分蘖节 EST ssr
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基于关键简化集合的极化码SSRFSC翻转译码算法
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作者 郭锐 刘洋 +2 位作者 何美霖 刘兆霆 赵宜楠 《通信学报》 EI 2024年第10期95-106,共12页
为提高基于简化序列重复节点的快速串行抵消(SSRFSC)译码算法的译码性能,提出了基于关键简化集合(CSS)和简化序列重复(SSR)节点的CSS-SSR-Flip译码算法。所提算法首先选取SSR中最长重复(REP)节点的信息位作为候选比特(CB),从而构造了基... 为提高基于简化序列重复节点的快速串行抵消(SSRFSC)译码算法的译码性能,提出了基于关键简化集合(CSS)和简化序列重复(SSR)节点的CSS-SSR-Flip译码算法。所提算法首先选取SSR中最长重复(REP)节点的信息位作为候选比特(CB),从而构造了基于SSR的CSS;然后针对SSR节点的译码特点设计了相应的翻转度量和翻转准则,通过考虑SSR节点中重复序列和源节点对译码的影响来度量CB可靠性,在特定CB翻转时选择次优的重复序列完成SSR节点翻转操作。实验数据表明,当误帧率FER=10-3时,所提出的CSSSSR-Flip译码算法与传统的快速简化串行抵消翻转(Fast-SSC-Flip)译码算法相比能够获得超过0.1 dB的性能增益,且具有与新型Fast-SSC-Flip(New-Fast-SSC-Flip)译码算法相同的译码性能;与传统翻转集合大小K相比,CSS大小缩减最多达79.5%,与关键集合(CS)相比集合大小最多可缩减23.1%。 展开更多
关键词 极化码 快速简化串行抵消 简化序列重复节点 关键简化集合 翻转译码
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甜瓜结实花初花节位QTL分析 被引量:13
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作者 朱子成 高美玲 +1 位作者 高鹏 栾非时 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1753-1760,共8页
以WI998为母本(纯雌株、厚皮网纹甜瓜品系),TopMark为父本(雄全同株纯合品系),配置杂交组合,利用单粒传得到171个株系的重组自交系(F2S4)群体构建甜瓜SSR分子标记遗传连锁图谱。该连锁图谱包含19个连锁群,覆盖基因组长度为1414.2... 以WI998为母本(纯雌株、厚皮网纹甜瓜品系),TopMark为父本(雄全同株纯合品系),配置杂交组合,利用单粒传得到171个株系的重组自交系(F2S4)群体构建甜瓜SSR分子标记遗传连锁图谱。该连锁图谱包含19个连锁群,覆盖基因组长度为1414.2cM,标记间平均距离为10.2cM。对结实花初花节位开展QTL分析,共检测到9个QTL,分别分布在第1、9、10、11连锁群上,各QTL的LOD值在2.89~9.42之间,4个QTL贡献率超过10%。位于第9连锁群的QTLFp9.4贡献率最大,为18.57%(2010秋季LOD=9.17);位于第9连锁群的Fp9.3(2010春季8.64%,LOD=6.44;2010秋季17.99%,LOD=9.42),位于第10连锁群的Fp10.1(2010春季3.59%,LOD=2.89;2010秋季6.20%,LOD=3.43)在两季的位置都很稳定。获得与结实花初花节位紧密连锁(〈10cM)的8个特异标记(SSR01737、MU141991、TJ105、GCM206、SSR04910、MU173563、NR52、MU146331),为进一步开展QTL精细定位提供参考。 展开更多
关键词 甜瓜 ssr标记 遗传图谱 结实花节位 QTL
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