利用SSR分子标记技术鉴定和分析茄子杂种F_1的纯度

【目的】分析、鉴定茄子杂种F1纯度,为提高茄子杂交育种效率提供参考依据。【方法】在育苗期,采用SSR分子标记技术对栽培茄×栽培茄正、反杂交种和野生茄×栽培茄杂交种进行纯度鉴定及亲缘关系分析。【结果】从124对SSR引物中筛选出15对在亲本间存在差异、扩增稳定、条带清晰的引物;从210株杂种F1单株中共鉴定出208株真杂种,杂种纯度为99.0%,鉴定结果与田间性状调查结果一致;栽培茄×栽培茄正、反交组合的F1与亲本的亲缘关系均较近,遗传关系差别微小;野生茄×栽培茄组合的F1与父本的亲缘关系均较远,且表现出偏母本遗传。【结论】SSR分子标记技术能快速、准确鉴定茄子杂交后代的纯度,可作为分子标记辅助育种手段用于指导选择符合茄子育种目标的优良杂交品种选育。

SSR分子标记技术在茄子杂交种子纯度鉴定中的应用

利用SSR分子标记技术进行种子纯度鉴定是一种准确快速、简单高效的方法。试验选用100对引物在鄂茄子2号亲本间进行PCR扩增,从中筛选出的3对引物SM17、SM29、SM51在双亲本间能够扩增出差异互补的条带。利用这3对引物对鄂茄子2号杂种一代群体进行纯度鉴定,鉴定结果为97.1%;与同批次种子的田间鉴定结果(96.1%,鉴定地点海南岛)接近,说明应用SSR分子标记技术实施茄子杂种一代种子的纯度鉴定是可行的。

SSR分子标记技术在汉青一号萝卜种子纯度鉴定中的应用

选用120对引物在汉青一号萝卜(Raphanus sativus L.cv.Han Qing NO.1)亲本间进行PCR扩增,从中筛选出3对引物10、30、63,在双亲本间能够扩增出差异互补的条带,利用3对引物对汉青一号萝卜杂种1代群体进行纯度鉴定。鉴定结果纯度为95.1%,与同批次种子的田间鉴定结果 96.0%相近,说明应用SSR分子标记技术实施萝卜杂种1代种子的纯度鉴定是可行并可靠的。

利用SSR分子标记技术快速鉴定杂交油菜天禾油10号纯度

以甘蓝型油菜天禾油10号及其父母本为材料,利用SSR分子标记方法对天禾油10号杂交制种待测样品进行了鉴定分析。结果表明,利用引物CB10036、CN48鉴定待测样品144棵单株,纯度为67.08%,同批次待测样大田种植鉴定纯度为70.2%,两种方法鉴定结果基本一致,说明引物CB10036、CN48可用于天禾油10号的室内纯度快速鉴定。

基于SSR分子标记的茶树新品种‘戚家美铭’的亲缘关系分析

目的:探明茶树新品种‘戚家美铭’的亲缘关系。方法:以‘戚家美铭’和同其栽种于同一茶园的两个茶树品种‘鸠坑’和‘乌牛早’,以及叶片形状类似的近似品种‘嘉茗一号’作为研究对象,利用21对SSR引物对其进行聚类分析。结果:21对引物共扩增出102个条带,每个SSR位点的观测等位基因数为2~7个,平均值为4.857 1,多态性达到100%,Shannon多态性信息指数范围在1.906 2~0.693 1,平均值为1.449 5,‘戚家美铭’与‘鸠坑’的遗传距离为1.343 7、遗传相似系数为0.260 9。结论:确定‘戚家美铭’是‘鸠坑’的自然杂交后代。

基于SSR标记的黑龙江省绿豆品种遗传多样性分析及指纹图谱构建

目的:为明确黑龙江地区绿豆品种遗传多样性水平并构建SSR指纹图谱,为绿豆育种研究及品种鉴定奠定基础。方法:基于SSR荧光标记技术,利用筛选得到的14对SSR引物对黑龙江地区35份绿豆品种进行遗传多样性分析及SSR指纹图谱构建。结果:14对SSR引物在35个绿豆品种中共检测到49个等位基因,每对引物检测到2~7个,平均3.5个;多态性信息含量PIC值介于0.106~0.761之间,平均为0.398。参试品种遗传相似系数变幅介于0.6966~1.0000之间,平均为0.894,其中在0.82~0.86之间的遗传相似系数占全部数据的51.2%。在遗传相似系数为0.83的阈值处可将参试材料分为三大类群。构建了35份具有品种特异性的绿豆SSR指纹图谱及分子身份证,具有唯一性,可用于绿豆品种鉴定。结论:黑龙江地区绿豆品种遗传多样性水平不够丰富,SSR指纹图谱具可应用于绿豆品种真伪鉴定。

基于成熟期的草莓品种遗传多样性SSR分析

利用SSR分子标记技术,结合PopGene软件对173份草莓品种进行了遗传多样性分析。结果显示:筛选出的13对引物一共扩增出了6个等位基因,其中EMFv006和FAC-001这2个引物扩增出来的等位基因最多。基于不同草莓群体的基因多样度,早熟类群草莓的有效等位基因最高为2.6668,晚熟类群最低为2.2137,5个类群中早熟类群信息指数最高为0.5968,而对于他们的观测杂合度最高值和最低值为0.1560和0.1302。该数据说明,实验所选用的173种草莓材料的遗传变异率低,在进化路径上分化并不大。而针对于5个不同的成熟期草莓类群分析,发现成熟期为早中熟的草莓类群等位基因频率数据接近中熟的草莓类群,所以推测这2个类群的亲缘关系相近。

玉米抗丝黑穗病基因SSR分析

[目的]筛选出能较好标记玉米抗丝黑穗病基因的SSR多态性引物。[方法]以5个玉米品种为试材,从玉米黄化苗提取基因组DNA后,对提取DNA浓度和质量进行检测后,选用85对引物进行抗丝黑穗病基因的SSR扩增。[结果]16对引物具有较好的多态性,共扩增出45条多态性谱带,其片段大小为50～1300bp。其中,引物Bnlg1755扩增出多态性谱带最多。引物Bnlg1246、Bnlg1194和Bnlg125在抗病材料和感病材料中表现出明显差异。[结论]引物Bnlg1246、Bnlg1194和Bnlg125可作为分析玉米抗丝黑穗病基因SSR标记的引物。

大豆遗传多样性SSR分析

以13份大豆品种为试验材料,采用改良的SDS法提取大豆DNA,通过PCR对大豆20个连锁群100对SSR标记进行扩增,筛选出扩增稳定且多态性较高的43对SSR标记,后通过对遗传相似系数的分析对83个主栽大豆品种遗传多样性进行研究。结果共鉴定出等位变异157个,每个位点2~7个,平均3.65个;品种间遗传相似系数为0.216~0.937,平均值0.638 4。

微卫星DNA在分析核桃遗传多样性上的应用

研究不同核桃品种的遗传多样性,为今后新品种的培育和种质创新提供理论依据,以西北农林科技大学资源苗圃的18个核桃品种（包括3个实生优系）嫩叶做材料,选用SSR分子标记技术对其进行了遗传多样性研究。建立了最适PCR反应体系,从27对引物中筛选出多态性强重复性好的12对引物,共检测出174条条带,其中91条呈现多态性,多态性条带的比例平均为67.82%,平均每条引物扩增出多态性位点9.8个。新疆2号与辽宁4号的相似系数最大（0.803 6）,青林和西林2号最小（0.159 4）。多态信息含量（PIC）变化范围在0.742 2～0.896 2,平均值为0.815 0,其值均大于0.500 0。基于遗传相似性系数的UPGMA聚类结果表明,在遗传相似系数阈值为0.39左右可将供试品种分成4大类。以上说明12条引物扩增的位点均表现出高度多态,同时表明供试样品遗传资源非常丰富,可作为育种来源。