国家基因库野生大豆微核心样本遗传变异性的SSR标记分析

用70对SSR引物对96份野生大豆微核心种质样本进行了遗传多样性分析。结果检测出1278个等位变异,平均每个位点有18.3个。地理区域群体水平显示,遗传信息指数(PIC)和特异等位基因变异数(NUA)以东北地区最高,长江流域次之,华南地区最低。在地理区域个体水平,遗传多样性的特征值以华南地区最高,依次由南向北降低,东北最低。我国华南野生大豆和东北野生大豆有显著的遗传分化。聚类分析结果显示,国家基因库野生大豆保存样本中的典型野生大豆和半野生大豆之间存在明显的遗传差异;地理上,种质的地理遗传分组表现弱的地域性。本研究中半野生大豆杂合性明显高于典型野生型的结果,支持关于这个类型起源于栽培和野生大豆天然杂交的假说,栽培大豆的基因可能已经流入到野生种内,某些百粒重小于3g的种质可能也是来源于野生和栽培大豆的天然杂交后代分离。

马尾松种子园交配系统的时间动态变异

以马尾松种子园不同时期(建园初期、丰产期及衰老期)产出的子代为材料,采用SSR标记分析其遗传多样性,并结合子代测定数据分析交配系统对子代遗传品质的影响。研究结果表明,建园初期与丰产期的子代家系的Shannon多样性指数(I)较高,同为0.53,衰老期的子代家系则为0.47。观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)均以建园初期子代群体为最高,丰产期子代次之,衰老期最低。马尾松种子园建园初期与丰产期的子代均具有较高的遗传多样性。丰产期参与繁殖的父本数量最多,近交水平较低,从而保证了种子的品质。而种子园衰老期子代的遗传多样性明显下降,说明种子园的老化不仅影响种子产量,而且影响种子遗传品质。在亲本分析中,种子园建园初期、丰产期及衰老期的子代均未检测到自交情况。由此可进一步证实马尾松是典型的异交树种。

利用SSR标记分析茄镰孢豌豆专化型的遗传多样性

由茄镰孢豌豆专化型(Fusarium solani f.sp.pisi,Fsp)引起的根腐病是豌豆(Pisum sativum)最重要的病害之一。研究不同地理来源Fsp的遗传多样性,对了解该菌的遗传背景及防治病害具有重要意义。本研究从血红丛赤壳交配群VI(Nectria haematococca MPVI)全基因组序列中筛选SSR位点,选取107个SSR位点设计引物,获得24对多态性引物。用24对多态性引物对不同地理来源的96个Fsp分离物进行遗传多样性分析,结果表明,24对引物共扩增出132个等位基因,变异范围为3-15,平均为5.5。基因多样性指数范围为0.4855-0.8264,平均为0.7038。供试的96个Fsp分离物可分为93个基因型。聚类分析表明,在相似性系数为0.8时,96个Fsp分离物被划分为10个组群。Fsp分离物的地理来源或致病性与SSR聚类结果无关。分子方差分析(AMOVA)结果表明,Fsp遗传变异主要存在于群体内,地理条件和生态区环境对Fsp遗传分化有显著影响。