全球产KPC肺炎克雷伯菌的KPC分布与序列分型分析

目的分析全球产肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶(KPC)的肺炎克雷伯菌的序列分型数据,探讨KPC-2、KPC-3与主要流行克隆之间的关系。方法从NCBI中下载全球肺炎克雷伯菌的基因组,分析KPC的分布情况。对产KPC肺炎克雷伯菌基因组进行多位点序列分析,确定其序列分型(sequence type,ST)。分析KPC在不同克隆菌株中的分布情况,以及在主要流行克隆ST11、ST258及ST512中KPC变异体KPC-2和KPC-3的流行率差异。结果全球肺炎克雷伯菌的基因组中产KPC 1943株,有KPC变异体14种,以KPC-2(959/1943,49.4%)和KPC-3(952/1943,49.0%)为主;有115种ST型,以ST258(996/1943,51.3%)、ST11(285/1943,14.7%)和ST512(259/1943,13.3%)为主。959株KPC-2菌株分布在87种ST中,以ST258(413/959,43.1%)和ST11(274/959,28.6%)为主;952株KPC-3菌株分布在45种ST中,以ST258(570/952,59.9%)和ST512(259/952,27.2%)为主。KPC-2在ST11菌株中的流行率(274/285,96.1%)显著高于在ST258中的流行率(414/996,41.6%),差异有统计学意义(χ^(2)=43.819,P=0.000);KPC-3在ST512中的流行率(259/259,100%)显著高于在ST258中的流行率(570/996,57.2%),差异有统计学意义(χ^(2)=206.645,P=0.000)。结论从全球范围来看,KPC的流行以KPC-2和KPC-3为主,KPC-2的流行克隆菌株以ST11和ST258为主,KPC-3的流行克隆菌株以ST258和ST512为主,加强该类细菌的监测对于预防院内感染控制具有重要作用。