ST59型社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌毒力因子研究

了解ST59型社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(community-acquired methicillin-resistant Staphy-lococcus aureus,CA-MRSA)携带毒力因子的情况。用PCR方法扩增ST59型CA-MRSA PSMα、PVL、SEA、SEB、SEC、SED、SEE、TSST-1、ETA、ETB基因。5株CA-MRSA全部检出PSMα基因和PVL基因,均未检出SEA、SEB、SEC、SED、SEE、TSST-1、ETA、ETB基因。PSMα和PVL基因是ST59型社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌常见的毒力因子。

社区获得性ST59型MRSA HZW450的全基因组测序及分析

目的对1例脓疱疮患者脓液中分离的1株社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(CA-MRSA)HZW450菌株进行全基因组测序并对序列信息解析。方法使用三代测序PacBio技术对HZW450菌株进行全基因组测序,且使用SMRTanalysis v.R2.3.0对该序列进行序列拼接,上传NCBI进行基因功能注释,用RPSBLAST program进行直系同源簇(COG)注释以及毒力因子相关基因和耐药基因分析。同时比较国内其他地区发现的同一序列型(ST)的菌株毒力因子相关基因及耐药相关基因的差异,并比较HZW450菌株耐药基因型与表型的一致性。结果 HZW450菌株的基因组大小为2 831 958bp,GC占比32.9%,其基因组完成图序列已提交至NCBI GenBank数据库,登录号为CP020741。同时经过分析发现该菌株为ST59型,其基因组中含有许多与致病相关的毒力因子,以及含有耐药基因aph(3′)-III、ant(6)-Ia、mecA、norA、erm(B)和cat(pC233),毒力及耐药基因与ST59型其他菌株比较有差异。该菌株临床药敏结果与耐药基因比较分析发现,耐药表型与基因型存在差异。结论本研究报道了1株CA-MRSA(HZW450)菌株的全基因组序列。基因序列分析显示该菌株携带大量毒力基因,包括lukS-PV、lukF-PV、eta、fnbA、fnbB、sspB、sspC等,编码毒素、粘附、免疫逃逸等相关毒力因子,其毒力较强,致病性较高。

儿童医院相关性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染的临床特征和分离株分子特征

目的探讨儿童医院相关性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)感染的临床特征和分离株的分子特征。方法收集2010至2016年首都医科大学附属北京儿童医院符合医院相关感染MRSA感染的病例资料和致病分离株。分析其临床特点,采用PCR和测序对分离株进行多序列分型(MLST)和spa分型,采用多重PCR进行SCCmec分型,同时检测毒力基因携带,并对菌株的药物敏感性进行分析。结果共纳入150例,中位年龄为18个月。肺炎(55.3%)为最常见的疾病,其次为皮肤软组织感染(46.0%)。所有菌株共获得16种ST分型,其中ST239(46%)和ST59(28%)为最常见的克隆,共获得3种SCCmec分型,其中SCCmecⅢ最常见,占52. 7%;获得32种spa分型,最常见的是t030 (22. 0%)和t437(23.4%)。所有菌株、MRSA-ST59和MRSA-ST239分离株的多重耐药率分别为84.0%、78.6%和81.2%。结论医院相关性MRSA感染常见于1岁以内婴儿,菌株的遗传背景复杂,最常见的流行克隆是ST239-SCCmecⅢ-t030和ST59-SCCmecⅣ-t437,菌株的多重耐药率高。