威宁黄牛STAM1基因SNPs及其与生长性状关联研究

为研究STAM1基因多态性与贵州地方黄牛品种威宁黄牛生长性状关联性,选择106头威宁黄牛为对象,利用PCR-SSCP、DNA测序方法分析STAM1基因SNP与不同个体生长性状的相关性。结果表明:在STAM1基因第3内含子区存在1个SNP位点,命名为G+31122A。G+31122A位点在威宁黄牛中有不同分型,在威宁黄牛公畜中,G+31122A位点与胸围、坐骨端宽极显著相关,AA型个体胸围均值极显著低于GA型和GG型个体。而在母畜中,该位点对体直长的影响达到显著性水平,GG型个体体直长均值显著高于AA型个体。说明G+31122A突变与威宁黄牛生长性状有一定关联。

DNA池快速筛查牛STAM1基因SNPs及估算等位基因频率

目的:旨在对不同牛种STAM1基因进行SNPs筛查,为地方牛种选种选育提供一定理论依据。方法:选取生长发育性状明显差异的务川黑牛和贵州荷斯坦奶牛2个牛种构建DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种STAM1基因第14外显子序列总长898bp。切胶回收后对PCR产物进行双向测序。结果:在牛STAM1基因中快速筛查到5个SNPs:A33C、C66G、C356T、T523A、T652C,其中A33C(Tyr→Ser)、C66G(Pro→Arg)、C356T(Glu→Lys)为错义突变,T523A为同义突变,T652C位于内含子区。贵州荷斯坦奶牛在T523A和T652C两个位点基因频率为1.000 0,而务川黑牛分别为0.673 0和0.810 6。生物信息学分析表明:突变前后STAM1的RNA二级结构和蛋白质二级、三级结构均有明显改变。结论:DNA池结合测序技术可快速筛选SNP位点,检测到STAM1基因第14外显子5个SNPs。

LncRNA ATB/miR-107/STAMBPL1轴调控前列腺癌增殖、转移和侵袭的作用机制

目的 探讨转化生长因子β活化的长链非编码RNA ATB(lncRNA ATB)在前列腺癌中的表达,以及通过调控miR-107/STAM结合蛋白水平1(STAMBPL1)通路在前列腺癌PC3细胞中对增殖、转移和侵袭的影响。方法 反转录PCR(RT-PCR)法检测58例前列腺癌组织及相应癌旁正常组织临床样本中lncRNA ATB mRNA的表达水平。siRNA干扰PC3细胞lncRNA ATB基因的表达,四甲基偶氮唑蓝(MTT)实验、划痕实验和Transwell实验分别观察PC3细胞增殖、迁移和侵袭能力的改变;采用RT-PCR和Western blot法分别测定miR-107mRNA及STAMBPL1mRNA、蛋白的表达变化。结果 与癌旁正常组织比较,lncRNA ATB mRNA在前列腺癌组织中表达水平明显增加(P<0.05)。沉默lncRNA ATB基因的PC3细胞较正常PC3细胞可显著减少细胞中增殖、迁移和侵袭能力,miR-107mRNA表达水平增高,STAMBPL1mRNA和蛋白表达水平降低(P<0.05)。结论 LncRNA ATB在前列腺癌中高表达,其可能通过调控miR-107/STAMBPL1通路改变前列腺癌PC3细胞增殖、转移和侵袭的能力。