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威宁黄牛STAM1基因SNPs及其与生长性状关联研究
1
作者
龚俞
杨忠诚
+1 位作者
杨永强
刘若余
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第20期136-140,共5页
为研究STAM1基因多态性与贵州地方黄牛品种威宁黄牛生长性状关联性,选择106头威宁黄牛为对象,利用PCR-SSCP、DNA测序方法分析STAM1基因SNP与不同个体生长性状的相关性。结果表明:在STAM1基因第3内含子区存在1个SNP位点,命名为G+31122A。...
为研究STAM1基因多态性与贵州地方黄牛品种威宁黄牛生长性状关联性,选择106头威宁黄牛为对象,利用PCR-SSCP、DNA测序方法分析STAM1基因SNP与不同个体生长性状的相关性。结果表明:在STAM1基因第3内含子区存在1个SNP位点,命名为G+31122A。G+31122A位点在威宁黄牛中有不同分型,在威宁黄牛公畜中,G+31122A位点与胸围、坐骨端宽极显著相关,AA型个体胸围均值极显著低于GA型和GG型个体。而在母畜中,该位点对体直长的影响达到显著性水平,GG型个体体直长均值显著高于AA型个体。说明G+31122A突变与威宁黄牛生长性状有一定关联。
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关键词
stam1
SNP
外显子
内含子
威宁黄牛
下载PDF
职称材料
DNA池快速筛查牛STAM1基因SNPs及估算等位基因频率
被引量:
2
2
作者
杨永强
焦仁刚
+2 位作者
龚俞
惠嫣婷
刘若余
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期57-60,共4页
目的:旨在对不同牛种STAM1基因进行SNPs筛查,为地方牛种选种选育提供一定理论依据。方法:选取生长发育性状明显差异的务川黑牛和贵州荷斯坦奶牛2个牛种构建DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种STAM1基因第14外显子序列总长898bp。切胶回...
目的:旨在对不同牛种STAM1基因进行SNPs筛查,为地方牛种选种选育提供一定理论依据。方法:选取生长发育性状明显差异的务川黑牛和贵州荷斯坦奶牛2个牛种构建DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种STAM1基因第14外显子序列总长898bp。切胶回收后对PCR产物进行双向测序。结果:在牛STAM1基因中快速筛查到5个SNPs:A33C、C66G、C356T、T523A、T652C,其中A33C(Tyr→Ser)、C66G(Pro→Arg)、C356T(Glu→Lys)为错义突变,T523A为同义突变,T652C位于内含子区。贵州荷斯坦奶牛在T523A和T652C两个位点基因频率为1.000 0,而务川黑牛分别为0.673 0和0.810 6。生物信息学分析表明:突变前后STAM1的RNA二级结构和蛋白质二级、三级结构均有明显改变。结论:DNA池结合测序技术可快速筛选SNP位点,检测到STAM1基因第14外显子5个SNPs。
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关键词
stam1
DNA池
务川黑牛
贵州荷斯坦奶牛
SNPS
JAK/STAT
原文传递
LncRNA ATB/miR-107/STAMBPL1轴调控前列腺癌增殖、转移和侵袭的作用机制
被引量:
2
3
作者
滕若冰
余鹏
高漓
《重庆医学》
CAS
2019年第23期3965-3969,共5页
目的 探讨转化生长因子β活化的长链非编码RNA ATB(lncRNA ATB)在前列腺癌中的表达,以及通过调控miR-107/STAM结合蛋白水平1(STAMBPL1)通路在前列腺癌PC3细胞中对增殖、转移和侵袭的影响。方法 反转录PCR(RT-PCR)法检测58例前列腺癌组...
目的 探讨转化生长因子β活化的长链非编码RNA ATB(lncRNA ATB)在前列腺癌中的表达,以及通过调控miR-107/STAM结合蛋白水平1(STAMBPL1)通路在前列腺癌PC3细胞中对增殖、转移和侵袭的影响。方法 反转录PCR(RT-PCR)法检测58例前列腺癌组织及相应癌旁正常组织临床样本中lncRNA ATB mRNA的表达水平。siRNA干扰PC3细胞lncRNA ATB基因的表达,四甲基偶氮唑蓝(MTT)实验、划痕实验和Transwell实验分别观察PC3细胞增殖、迁移和侵袭能力的改变;采用RT-PCR和Western blot法分别测定miR-107mRNA及STAMBPL1mRNA、蛋白的表达变化。结果 与癌旁正常组织比较,lncRNA ATB mRNA在前列腺癌组织中表达水平明显增加(P<0.05)。沉默lncRNA ATB基因的PC3细胞较正常PC3细胞可显著减少细胞中增殖、迁移和侵袭能力,miR-107mRNA表达水平增高,STAMBPL1mRNA和蛋白表达水平降低(P<0.05)。结论 LncRNA ATB在前列腺癌中高表达,其可能通过调控miR-107/STAMBPL1通路改变前列腺癌PC3细胞增殖、转移和侵袭的能力。
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关键词
前列腺肿瘤
RNA
长链非编码
微RNA-107
STAM结合蛋白水平1
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职称材料
题名
威宁黄牛STAM1基因SNPs及其与生长性状关联研究
1
作者
龚俞
杨忠诚
杨永强
刘若余
机构
贵州省畜禽遗传资源管理站
贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室
出处
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第20期136-140,共5页
基金
贵州省重大科技专项(黔科合重大专项字[2011]6009号)
文摘
为研究STAM1基因多态性与贵州地方黄牛品种威宁黄牛生长性状关联性,选择106头威宁黄牛为对象,利用PCR-SSCP、DNA测序方法分析STAM1基因SNP与不同个体生长性状的相关性。结果表明:在STAM1基因第3内含子区存在1个SNP位点,命名为G+31122A。G+31122A位点在威宁黄牛中有不同分型,在威宁黄牛公畜中,G+31122A位点与胸围、坐骨端宽极显著相关,AA型个体胸围均值极显著低于GA型和GG型个体。而在母畜中,该位点对体直长的影响达到显著性水平,GG型个体体直长均值显著高于AA型个体。说明G+31122A突变与威宁黄牛生长性状有一定关联。
关键词
stam1
SNP
外显子
内含子
威宁黄牛
Keywords
stam1
SNP
exon
intron
Weining cattle
分类号
S823.81 [农业科学—畜牧学]
Q343.15 [生物学—遗传学]
下载PDF
职称材料
题名
DNA池快速筛查牛STAM1基因SNPs及估算等位基因频率
被引量:
2
2
作者
杨永强
焦仁刚
龚俞
惠嫣婷
刘若余
机构
贵州大学动物科学学院
贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室
贵州省畜牧技术推广站
出处
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第5期57-60,共4页
基金
贵州省重大科技专项计划项目("牛羊基因定位及标记辅助选择研究"
黔科合重大专项字[2011]6009号)资助
文摘
目的:旨在对不同牛种STAM1基因进行SNPs筛查,为地方牛种选种选育提供一定理论依据。方法:选取生长发育性状明显差异的务川黑牛和贵州荷斯坦奶牛2个牛种构建DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种STAM1基因第14外显子序列总长898bp。切胶回收后对PCR产物进行双向测序。结果:在牛STAM1基因中快速筛查到5个SNPs:A33C、C66G、C356T、T523A、T652C,其中A33C(Tyr→Ser)、C66G(Pro→Arg)、C356T(Glu→Lys)为错义突变,T523A为同义突变,T652C位于内含子区。贵州荷斯坦奶牛在T523A和T652C两个位点基因频率为1.000 0,而务川黑牛分别为0.673 0和0.810 6。生物信息学分析表明:突变前后STAM1的RNA二级结构和蛋白质二级、三级结构均有明显改变。结论:DNA池结合测序技术可快速筛选SNP位点,检测到STAM1基因第14外显子5个SNPs。
关键词
stam1
DNA池
务川黑牛
贵州荷斯坦奶牛
SNPS
JAK/STAT
Keywords
stam1
DNA pooling
Wuchuan Black Cattle
Guizhou Holstein
SNPs
JAK- STAT
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
LncRNA ATB/miR-107/STAMBPL1轴调控前列腺癌增殖、转移和侵袭的作用机制
被引量:
2
3
作者
滕若冰
余鹏
高漓
机构
桂林医学院附属医院生殖医学中心
桂林医学院附属医院泌尿外科
出处
《重庆医学》
CAS
2019年第23期3965-3969,共5页
基金
国家自然科学基金项目(81660425)
文摘
目的 探讨转化生长因子β活化的长链非编码RNA ATB(lncRNA ATB)在前列腺癌中的表达,以及通过调控miR-107/STAM结合蛋白水平1(STAMBPL1)通路在前列腺癌PC3细胞中对增殖、转移和侵袭的影响。方法 反转录PCR(RT-PCR)法检测58例前列腺癌组织及相应癌旁正常组织临床样本中lncRNA ATB mRNA的表达水平。siRNA干扰PC3细胞lncRNA ATB基因的表达,四甲基偶氮唑蓝(MTT)实验、划痕实验和Transwell实验分别观察PC3细胞增殖、迁移和侵袭能力的改变;采用RT-PCR和Western blot法分别测定miR-107mRNA及STAMBPL1mRNA、蛋白的表达变化。结果 与癌旁正常组织比较,lncRNA ATB mRNA在前列腺癌组织中表达水平明显增加(P<0.05)。沉默lncRNA ATB基因的PC3细胞较正常PC3细胞可显著减少细胞中增殖、迁移和侵袭能力,miR-107mRNA表达水平增高,STAMBPL1mRNA和蛋白表达水平降低(P<0.05)。结论 LncRNA ATB在前列腺癌中高表达,其可能通过调控miR-107/STAMBPL1通路改变前列腺癌PC3细胞增殖、转移和侵袭的能力。
关键词
前列腺肿瘤
RNA
长链非编码
微RNA-107
STAM结合蛋白水平1
Keywords
prostatic neoplasm
RNA
long noncoding
microRNA-107
STAMBPL1
分类号
R737.25 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
威宁黄牛STAM1基因SNPs及其与生长性状关联研究
龚俞
杨忠诚
杨永强
刘若余
《广东农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2014
0
下载PDF
职称材料
2
DNA池快速筛查牛STAM1基因SNPs及估算等位基因频率
杨永强
焦仁刚
龚俞
惠嫣婷
刘若余
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2012
2
原文传递
3
LncRNA ATB/miR-107/STAMBPL1轴调控前列腺癌增殖、转移和侵袭的作用机制
滕若冰
余鹏
高漓
《重庆医学》
CAS
2019
2
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