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The Detection of STAT1 Gene Influencing Milk Related Traits in Turkish Holstein and Jersey Cows
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作者 Ozden Cobanoglu Eser Kemal Gurcan +2 位作者 Soner Cankaya Ertugrul Kul Hasan Samet Abaci 《Journal of Agricultural Science and Technology(A)》 2016年第4期261-269,共9页
The main purpose of this study was to detect an association of cytoplasmic signal transducers and activators of transcription-1 (STAT1) with milk production traits in 472 Holstein and 283 Jersey cattle breeds of Tur... The main purpose of this study was to detect an association of cytoplasmic signal transducers and activators of transcription-1 (STAT1) with milk production traits in 472 Holstein and 283 Jersey cattle breeds of Turkey. This gene, located on chromosome 2, was chosen due to its role on development of mammary gland. A polymorphism of selected 314 bp allele fragment was detected by the restriction fragment length polymorphism analysis of polymerase chain reaction-amplified fragments (PCR-RFLP) method and also confirmed by DNA sequencing. The association tests were conducted between STAT1 genotypes and some economically important dairy traits. The genotypes for C/T as a single nucleotide polymorphism (SNP) were identified at interval 60 cM to 63 cM. The effects of STAT1 gene on milk production traits were not significant in Holstein cows, although animals with CT genotypes showed fairly close to significant value for the corrected 305 d milk yield. However, Jersey cows with/7" genotype were 2.07 kg higher for test-day milk yield (P 〈 0.05), 0.13 kg for fat yield (P 〈 0.01) and 0.07 kg for protein yield (P 〈 0.05) compared with animals having CC and CT genotypes. Definitely, the further research should be conducted to search this gene intensively with larger samples to identify polymorphism and any association between the economically important traits and genotypic class in Holstein cows. Finally, based on the findings, it was concluded that STATI gene might be used as a potential candidate gene to improve milk yield and milk fat and protein contents in dairy cows breeding programs. 展开更多
关键词 stat1 gene dairy cattle PCR-RFLP milk production milk content.
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STAT1过表达慢病毒载体的构建及其在MHCC97L细胞中的表达 被引量:4
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作者 丁治国 何蓓 +3 位作者 陈晓珩 汪唐顺 高翔 李乃卿 《中国现代普通外科进展》 CAS 2013年第12期931-934,共4页
目的:构建STAT1基因过表达慢病毒载体并实现其在人肝癌细胞MHCC97L中的表达。方法:根据人STAT1基因mRNA序列,全基因合成STAT1基因,构建至过表达载体并转化至感受态细胞DH5α,进行测序验证。在脂质体介导下转染293T细胞,包装生产慢病毒... 目的:构建STAT1基因过表达慢病毒载体并实现其在人肝癌细胞MHCC97L中的表达。方法:根据人STAT1基因mRNA序列,全基因合成STAT1基因,构建至过表达载体并转化至感受态细胞DH5α,进行测序验证。在脂质体介导下转染293T细胞,包装生产慢病毒。慢病毒载体转染人肝癌细胞MHCC97L,用荧光定量PCR和Western blot检测原始细胞株(MHCC97L),稳转细胞株(MHCC97-stat1)中STAT1的表达情况,确定STAT1过表达的有效性。结果:测序证实STAT1基因过表达载体构建成功。过表达慢病毒包装成功。慢病毒转染人肝癌细胞MHCC97L 48 h后,STAT1基因在mRNA水平和蛋白质水平上表达显著增加。结论:STAT1基因过表达慢病毒载体构建成功,并实现其在人肝癌细胞MHCC97L中的表达。 展开更多
关键词 肝肿瘤 MHCC97L细胞 stat1基因 慢病毒载体
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水牛STAT1基因多态与产奶性状关联分析 被引量:2
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作者 邓廷贤 庞春英 +4 位作者 朱鹏 段安琴 陆杏蓉 杨炳壮 梁贤威 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期48-54,共7页
本研究旨在检测水牛STAT1基因的单核苷酸多态性(SNP),探究中国水牛多态性位点的群体遗传特征,寻找与产奶性状相关的分子标记。采用PCR和测序法筛选水牛STAT1基因序列的SNPs,以357头水牛为研究对象,采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱... 本研究旨在检测水牛STAT1基因的单核苷酸多态性(SNP),探究中国水牛多态性位点的群体遗传特征,寻找与产奶性状相关的分子标记。采用PCR和测序法筛选水牛STAT1基因序列的SNPs,以357头水牛为研究对象,采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱法(MALDI-TOF-MS)对群体进行了基因型检测,运用SAS(9.3)软件一般线性模型(GLM)对STAT1基因型与产奶性状的关联程度进行统计分析。结果表明,在水牛STAT1基因中检测出3个突变位点,分别位于5′UTR(g.68G>A)、外显子10(g.986G>T)和3′UTR(g.2881C>A)。关联分析结果显示,水牛STAT1基因g.986G>T位点与305天产奶量和乳脂率显著关联(P<0.05)。Bonferroni t检验多重比较结果显示,基因型TT和GG个体的305天产奶量显著高于GT基因型(P<0.05),基因型TT个体的乳脂率显著高于GG和GT基因型(P<0.05),且305天的产奶量随着胎次的增加呈现上升趋势,直到第3或4胎次时达到最大值,表明胎次是影响水牛产奶量的重要环境因素之一。本研究表明,水牛STAT1基因的g.986G>T位点可能是影响其产奶性状的候选分子遗传标记,为今后建立中国水牛标记辅助选择育种研究奠定基础。 展开更多
关键词 水牛 stat1基因 产奶性状 飞行时间质谱 关联分析
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STAT1基因单核苷酸多态性与中国荷斯坦奶牛产奶性状的相关性研究 被引量:3
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作者 褚敏 昝林森 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期309-314,共6页
采用PCR-SSCP方法检测199头中国荷斯坦奶牛STAT1基因内含子11、19、25及3-′UTR 4个位点的单核苷酸多态性,并将其与3个胎次的产奶性状进行相关性分析。结果在内含子11和3-′UTR 2个位点发现多态性,在内含子11中发现2个单核苷酸连锁突变... 采用PCR-SSCP方法检测199头中国荷斯坦奶牛STAT1基因内含子11、19、25及3-′UTR 4个位点的单核苷酸多态性,并将其与3个胎次的产奶性状进行相关性分析。结果在内含子11和3-′UTR 2个位点发现多态性,在内含子11中发现2个单核苷酸连锁突变,分别为28739碱基处发生的G→A转换,28873碱基处发生的G→C颠换;在3-′UTR 141930碱基处发现C→T突变。利用最小二乘分析研究3个位点不同基因型对中国荷斯坦奶牛3个胎次305天产奶量,乳脂率及乳蛋白率的影响。结果表明,在内含子11中,BB基因型个体第一、二胎次乳蛋白率均显著高于AA和AB基因型个体(P<0.05);3种基因型对各胎次产奶量及乳脂率的影响均未达到显著水平(P>0.05),但呈现出BB>AB>AA的趋势。在3-′UTR中,CC、CT基因型个体的第一、二胎次产奶量均显著高于TT基因型个体(P<0.05);CC基因型个体的第一、三胎次乳蛋白率均显著高于TT基因型个体(P<0.05),3种基因型对3个胎次乳脂率的影响差异均不显著(P>0.05),但呈现出CC>CT>TT的趋势。 展开更多
关键词 stat1基因 PCR-SSCP 荷斯坦奶牛 产奶性状
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STAT1干扰慢病毒载体的构建及其基因沉默效应测定 被引量:2
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作者 丁治国 何蓓 +5 位作者 陈晓珩 李会龙 高翔 张韬 王鑫 李乃卿 《中国现代普通外科进展》 CAS 2015年第11期841-844,共4页
目的 :构建STAT1基因RNA干扰(RNAi)慢病毒载体并测定其基因沉默效应。方法 :根据人STAT1基因序列,设计干扰序列,将Oligo退火成双链并连接穿梭载体p LKO-1-EGFP-puro-sh RNA,构建sh RNA慢病毒载体质粒,并转化至感受态细胞DH5α,进行测序... 目的 :构建STAT1基因RNA干扰(RNAi)慢病毒载体并测定其基因沉默效应。方法 :根据人STAT1基因序列,设计干扰序列,将Oligo退火成双链并连接穿梭载体p LKO-1-EGFP-puro-sh RNA,构建sh RNA慢病毒载体质粒,并转化至感受态细胞DH5α,进行测序验证。在脂质体介导下转染293T细胞,包装生产慢病毒。慢病毒载体转染人肝癌细胞MHCC97L的STAT1过表达瘤株(MHCC97L-stat1),用Real-time PCR和Western Blot检测RNAi组(MHCC97L-stat1-sh RNA-1)和对照组(MHCC97L-stat1)中STAT1基因的表达情况,确定其干扰STAT1表达的有效性。结果:测序证实慢STAT1基因RNAi病毒载体质粒构建成功;慢病毒载体经293T细胞包装成功;慢病毒载体转染人肝癌细胞MHCC97L-stat1瘤株48 h后,STAT1基因在m RNA水平和蛋白质水平上表达明显降低。结论:STAT1基因RNAi慢病毒载体构建成功,能够在人肝癌细胞MHCC97L-stat1瘤株中表达,并具有显著的基因沉默效果。 展开更多
关键词 stat1基因 慢病毒载体 RNA干扰 MHCC97L细胞
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针对人STAT1基因的RNA干扰有效靶点的设计与筛选 被引量:1
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作者 丁治国 何蓓 +5 位作者 陈晓珩 李会龙 高翔 张韬 王鑫 李乃卿 《中国现代普通外科进展》 CAS 2015年第12期925-928,共4页
目的:设计并筛选针对人STAT1基因有效的RNA干扰靶点。方法:根据人STAT1基因序列,设计3个干扰序列,将oligo退火成双链并连接穿梭载体pLKO-1-EGFP-puro-shRNA,构建shRNA慢病毒载体质粒,并转化至感受态细胞DH5a,进行测序验证。在脂质体介... 目的:设计并筛选针对人STAT1基因有效的RNA干扰靶点。方法:根据人STAT1基因序列,设计3个干扰序列,将oligo退火成双链并连接穿梭载体pLKO-1-EGFP-puro-shRNA,构建shRNA慢病毒载体质粒,并转化至感受态细胞DH5a,进行测序验证。在脂质体介导下转染293T细胞,包装生产慢病毒。慢病毒载体转染人肝癌细胞MHCC97L的STAT1过表达瘤株(MHCC97L-stat1),用Real-timePCR检测干扰效果。结果:测序证实3个STAT1基因RNAi病毒载体质粒构建成功;慢病毒载体经293T细胞包装成功;3个慢病毒载体转染人肝癌细胞MHCC97L-stat1瘤株48h后,STAT1基因在mRNA水平表达均受到抑制,其中MHCC9-L-stat1-shRNA-1序列效果最佳,对STAT1基因表达的干扰效率可达81.4%。结论:成功构建并筛选了人STAT1基因RNAi慢病毒载体及有效靶点,为进一步深入研究STAT1基因与抗肿瘤药物药效关系奠定基础。 展开更多
关键词 stat1基因 慢病毒载体 RNA干扰 MHCC97L细胞
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改建型STAT1-CC基因慢病毒载体的构建及其在肺癌A549细胞中的表达 被引量:3
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作者 陈俊杰 胡建军 +3 位作者 陈成水 张洁 王梦怡 蒋磊 《温州医学院学报》 CAS 2012年第3期209-213,共5页
目的 :构建携带STAT1基因和突变型STAT1-CC基因的慢病毒表达载体,转染肺癌A549细胞并检测STAT1和STAT1-CC基因在肺癌A549细胞内的表达。方法:采用PCR技术从质粒模板中扩增得到目的基因STAT1和STAT1-CC,将其接入含有CMV启动子和绿色荧光... 目的 :构建携带STAT1基因和突变型STAT1-CC基因的慢病毒表达载体,转染肺癌A549细胞并检测STAT1和STAT1-CC基因在肺癌A549细胞内的表达。方法:采用PCR技术从质粒模板中扩增得到目的基因STAT1和STAT1-CC,将其接入含有CMV启动子和绿色荧光蛋白(EGFP)的慢病毒载体中,构建慢病毒载体表达载体Lenti-STAT1和Lenti-STAT1-CC,双酶切和测序鉴定。分别将重组子Lenti-STAT1、Lenti-STAT1-CC和包装质粒共转染293T细胞,包装产生慢病毒颗粒,感染非小细胞肺癌细胞株A549。荧光显微镜观察A549细胞EGFP表达,Western Blotting验证STAT1在A549细胞株中的表达。结果:酶切及测序结果显示成功构建重组慢病毒表达载体Lenti-STAT1和Lenti-STAT1-CC,将慢病毒颗粒感染A549细胞48 h后,观察到宿主细胞内EGFP表达,Western Blotting证实STAT1蛋白在A549细胞中过表达。结论:本实验成功构建了携带STAT1基因和STAT1-CC基因的慢病毒表达载体,并在A549细胞中过表达STAT1基因。 展开更多
关键词 stat1 慢病毒载体 A549细胞 肺肿瘤 基因
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STAT1特异性siRNA真核表达载体的构建及体外转染优化 被引量:1
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作者 贾晓琴 熊瑛 +1 位作者 王宋平 李平 《泸州医学院学报》 2009年第2期116-121,共6页
目的:构建STAT1特异性siRNA真核表达载体,并转染人气道上皮细胞(16HBE)。方法:根据GeneBank数据库提供的STAT1基因两种变异体的共同核苷酸序列,按照Tuschl设计原则,选择设计双链siRNA,再转化为能表达其小发卡结构RNA(small hairpin RNA,... 目的:构建STAT1特异性siRNA真核表达载体,并转染人气道上皮细胞(16HBE)。方法:根据GeneBank数据库提供的STAT1基因两种变异体的共同核苷酸序列,按照Tuschl设计原则,选择设计双链siRNA,再转化为能表达其小发卡结构RNA(small hairpin RNA,shRNA)的DNA序列,并将其连接到带有卡那霉素抗性和增强绿色荧光蛋白的pGenesil-1.1真核表达载体上,将其转染至气道上皮(16HBE)细胞中,观察荧光表达,鉴定其转染效率。结果:通过酶切鉴定和序列测定,成功地构建了二条表达小干扰RNA的质粒及其阴性对照质粒,并成功转染到(16HBE)细胞株中,质粒/脂质体为1μg:2μl条件,能有效地转染细胞,转染效率达到50%以上。结论:成功构建siRNA真核表达载体并能成功体外转染,为下一步气道炎症性疾病的基因沉默研究奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 stat1基因 小干扰RNA 小发卡结构RNA 转染 RNA干扰
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STAT1和STAT3在脑胶质瘤中作用的研究进展与展望 被引量:6
9
作者 胡新龙 林超 +2 位作者 鞠海涛 万方 窦长武 《现代肿瘤医学》 CAS 2019年第23期4315-4319,共5页
脑胶质瘤是常见的中枢神经系统肿瘤,约占颅内肿瘤半数以上。信号转导与转录激活因子(signal transducer and activator of transcription,STAT)是一种信号传导和转录活化因子蛋白,可以从各个角度调节细胞的生长、分化、存活和凋亡。STAT... 脑胶质瘤是常见的中枢神经系统肿瘤,约占颅内肿瘤半数以上。信号转导与转录激活因子(signal transducer and activator of transcription,STAT)是一种信号传导和转录活化因子蛋白,可以从各个角度调节细胞的生长、分化、存活和凋亡。STAT1目前被普遍认为是一种肿瘤抑制因子,而STAT3目前被定义为致癌基因。本文就STAT1和STAT3在脑胶质瘤发生发展中的作用及其潜在的交叉调控机制进行阐述,并期望共表达质粒STAT3-siRNA-STAT1可能为脑胶质瘤的治疗提供新思路。 展开更多
关键词 stat1基因 STAT3基因 脑胶质瘤
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STAT1对hsp90α基因表达的负调控作用
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作者 陈雪松 吴宁华 沈珝琲 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期356-360,共5页
目的 探讨转录因子STAT1对hsp90α 基因表达的调控作用。方法 将STAT1表达质粒转染Jurkat细胞,利用竞争性RT-PCR定量检测其内源性hsp90α 基因mRNA水平。共转染STAT1表达质粒和hsp90α基因上游调控区不同长度的片段驱动的氯霉素乙酰转... 目的 探讨转录因子STAT1对hsp90α 基因表达的调控作用。方法 将STAT1表达质粒转染Jurkat细胞,利用竞争性RT-PCR定量检测其内源性hsp90α 基因mRNA水平。共转染STAT1表达质粒和hsp90α基因上游调控区不同长度的片段驱动的氯霉素乙酰转移酶(CAT)报告基因质粒,利用定量RT-PCR检测CAT报告基因转录水平。用Western印迹分析方法检测42℃ 1 h热激前后Jurkat细胞中STAT1酪氨酸磷酸化状态,用电泳迁移率变更分析(EMSA)检测STAT1与hsp90α 5′基因上游调控区中含有STAT1特异结合元件的双链寡核苷酸片段特异性结合程度。结果 STAT1既可抑制Jurkat细胞hsp90α基因的表达,又能抑制hsp90α基因5′上游调控区驱动的CAT报告基因活性。热激以前Jurkat细胞中的STAT1 701位酪氨酸已有一定程度的磷酸化,热激以后其磷酸化程度明显升高,而且STAT1与hsp90α基因 5′上游调控区中的STAT1结合元件呈特异性结合。结论 STAT1对hsp90α基因的表达具有负调控作用。 展开更多
关键词 STA1 hsp90∝ 基因表达调控
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急性淋巴细胞白血病患儿miR-146a和STAT1表达水平与临床特征相关性分析 被引量:3
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作者 谭文敏 黄芬 +2 位作者 李国雄 吴洁 韩锋 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期821-827,共7页
目的:分析急性淋巴细胞白血病(ALL)患儿血清miR-146a和STAT1蛋白表达水平与临床特征的关系。方法:选择2014年6月至2016年6月本院确诊ALL儿童102例,分析患儿的临床特征并进行分组比较包括性别、患病年龄、外周血淋巴细胞分型、疾病危险... 目的:分析急性淋巴细胞白血病(ALL)患儿血清miR-146a和STAT1蛋白表达水平与临床特征的关系。方法:选择2014年6月至2016年6月本院确诊ALL儿童102例,分析患儿的临床特征并进行分组比较包括性别、患病年龄、外周血淋巴细胞分型、疾病危险度、化疗阶段、阳性基因突变。同时选择50例健康儿童作为对照组。反转录PCR法检测miR-146a及STAT1基因相对表达量,Western blot法检测STAT1蛋白相对水平。比较各临床指标及实验室指标间的miR-146a与STAT1蛋白表达水平差异。随访3年,比较miR-146a与STAT1蛋白表达水平不同的ALL患儿总生存期差异。结果:与对照组比较,ALL患儿血清miR-146a和STAT1 mRNA以及蛋白的表达水平明显升高(P<0.05),但ALL患儿在不同性别、年龄和淋巴细胞分型的分组中差异不明显(P>0.05),但在ALL患儿不同疾病危险度、化疗阶段、基因突变阳性与阴性间比较差异显著(P<0.05)。随访3年,miR-146a高表达及STAT1蛋白高表达的ALL患者OS均优于miR-146a低表达及STAT1蛋白低表达的ALL患者(P<0.05)。结论:血清miR-146a和STAT1蛋白表达上调可能参与ALL的发生和发展过程,其与ALL儿童多种临床特征如疾病危险度、化疗阶段、基因突变有密切联系。 展开更多
关键词 急性淋巴细胞白血病 MIR-146A stat1 临床特征 疾病危险度 化疗阶段 基因突变
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STAT1功能获得性突变3例临床特点及基因分析
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作者 方辉 张雷 +5 位作者 毛国顺 李桂涛 李利 赵晓峰 胡国生 朱影 《山西医科大学学报》 CAS 2021年第9期1237-1241,共5页
目的探讨3例慢性皮肤黏膜念珠菌病伴有自身免疫性疾病的信号传导与转录激活因子1(signal transducer and activator of transcription 1,STAT1)功能获得性突变(gain-of-function,GOF)的临床特征及基因特点。方法选取就诊阜阳市人民医院... 目的探讨3例慢性皮肤黏膜念珠菌病伴有自身免疫性疾病的信号传导与转录激活因子1(signal transducer and activator of transcription 1,STAT1)功能获得性突变(gain-of-function,GOF)的临床特征及基因特点。方法选取就诊阜阳市人民医院儿科的3例确诊为STAT1 GOF的患儿,对其临床特征进行分析总结,采集外周血样,运用高通量测序(high-throughput sequencing,NGS)进行基因检测,并同时进行父母的基因组DNA测序。结果3例患者均出现慢性皮肤黏膜念珠菌病、支气管扩张,并且伴有不同类型的自身免疫性疾病,基因检测证实均存在STAT1基因突变,有不同的突变位点,3个突变均属功能获得性突变,而父母基因均正常,为新发错义变异。结论STAT1 GOF新发突变易导致慢性皮肤黏膜念珠菌病合并自身免疫性疾病,并且在病程的不同时期STAT1基因突变可能伴随不同的自身免疫性疾病的表现,需定期观察,完善相关基因检测有助于早期诊断,避免漏诊及误诊。 展开更多
关键词 慢性皮肤黏膜念珠菌病 自身免疫性疾病 信号转导与转录激活因子1(stat1)功能获得性突变 新发突变
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利用CRISPR/Cas9技术建立STAT1敲除细胞系及其功能验证
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作者 张俊梅 王芳 +3 位作者 应旗康 冯文杰 古天乐 吴兴安 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期519-527,共9页
信号转导和转录活化因子1(Signal transducer and activator of transcription 1,STAT1)是干扰素信号通路中的关键分子,在对抗病毒和其他病原体的免疫反应中发挥重要作用,构建STAT1敲除细胞系有助于研究其在病毒感染过程中的作用与机制... 信号转导和转录活化因子1(Signal transducer and activator of transcription 1,STAT1)是干扰素信号通路中的关键分子,在对抗病毒和其他病原体的免疫反应中发挥重要作用,构建STAT1敲除细胞系有助于研究其在病毒感染过程中的作用与机制。本研究利用CRISPR/Cas9(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats-Cas9)基因编辑技术构建STAT1基因敲除细胞系。首先构建STAT1基因特异性打靶载体,后通过慢病毒转导人非小细胞肺癌细胞系(Human non-small cell lung cancer cells,A549),嘌呤霉素筛选稳定转导的细胞后进行单克隆化,最后对获取的单克隆细胞在分子水平上进行敲除及敲除回补验证,成功构建一株STAT1基因敲除(STAT1 gene knockout,STAT1-KO)的A549细胞,且该细胞系可维持正常细胞活性与增殖能力。以汉滩病毒(Hantaan virus,HTNV)感染验证,发现在该细胞系中病毒复制水平明显升高。本研究成功构建了一株STAT1-KO A549细胞,可为抗病毒药物和干扰素信号通路研究提供有力工具。 展开更多
关键词 信号转导和转录活化因子1 CRISPR/Cas9 基因敲除 汉滩病毒
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水牛信号转导子和转录激活子1基因电子克隆及序列分析 被引量:8
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作者 邓廷贤 庞春英 +3 位作者 陈明棠 王建 杨炳壮 梁贤威 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第8期9-13,共5页
本研究运用生物信息学方法对水牛信号转导子和转录激活子1(signal transduction and activators of transcription1,STAT1)基因进行电子克隆及其序列分析。以牛STAT1基因序列作为探针电子克隆了水牛STAT1基因完整的编码序列并进行了RT-... 本研究运用生物信息学方法对水牛信号转导子和转录激活子1(signal transduction and activators of transcription1,STAT1)基因进行电子克隆及其序列分析。以牛STAT1基因序列作为探针电子克隆了水牛STAT1基因完整的编码序列并进行了RT-PCR验证。序列分析结果表明,水牛的STAT1基因序列长3437bp,包含1个2244bp的开发阅读框,共编码747个氨基酸。该基因cDNA编码区序列与普通牛、绵羊、人、猪、大鼠、小鼠和山羊同源性比对结果表明,其相似性分别为99%、98%、89%、93%、86%、85%和87%。经聚类分析结果表明,水牛与普通牛的分子进化关系最近。 展开更多
关键词 水牛 信号转导子和转录激活子1基因 电子克隆 生物信息学
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基于GEO数据库分析前列腺癌生化复发相关基因及通路 被引量:2
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作者 陈志军 关翰 +2 位作者 汪盛 许斌 陈明 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期17-25,共9页
目的:本研究旨在发现影响前列腺癌根治性切除术后复发的潜在基因,为预测前列腺癌患者预后的方法提供新的可能。方法:从基因芯片公共数据库(GEO)下载GSE25136微阵列数据集,包括39例复发性前列腺癌和40例非复发性前列腺癌样本。利用Limma... 目的:本研究旨在发现影响前列腺癌根治性切除术后复发的潜在基因,为预测前列腺癌患者预后的方法提供新的可能。方法:从基因芯片公共数据库(GEO)下载GSE25136微阵列数据集,包括39例复发性前列腺癌和40例非复发性前列腺癌样本。利用Limma包识别差异表达基因,利用Pheatmap包进行表达层次聚类分析筛选差异表达基因。通过Cytoscape软件的ClueGO模块进行基因本体功能富集分析预测了差异化基因的潜在功能。利用String网站在Cytoscape软件中构建了差异基因的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,并使用CytoHubba进行模块分析,以了解这些差异基因之间的相互作用,并找出蛋白网络的关键基因。采用免疫组化染色的方法在前列腺癌及正常前列腺组织中进行验证。结果:复发性前列腺癌与非复发性前列腺癌的样本相比,共发现上调的差异基因167个,下调的差异基因91个(P≤0.05)。分别选取了上调、下调中表达显著的前50个基因,主要涉及的GO富集途径有大脑边缘系统的发育、干扰素-γ介导的信号通路等。并发现CASP3和STAT1为蛋白网络的关键基因,免疫组织化学染色验证了这2个关键基因在前列腺癌及前列腺增生组织中的差异表达。结论:非复发性前列腺癌向复发性前列腺癌进展的过程显示出强大的基因特征。大脑边缘系统的发育和干扰素-γ介导的信号通路与复发性前列腺癌的发生发展密切相关。此外,基因CASP3和STAT1作为关键基因可能在复发性前列腺癌的诊断和治疗中发挥重要作用。 展开更多
关键词 前列腺癌 复发 差异表达基因 生物信息学 stat1 CASP3
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HIV阴性儿童马尔尼菲篮状菌病2例临床分析并文献复习
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作者 范江花 罗海燕 +5 位作者 杨龙贵 王承娟 杨珍 黄康 王梦荧 肖政辉 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期754-758,共5页
目的总结2例人类免疫缺陷病毒(HIV)阴性儿童马尔尼菲篮状菌病(TSM)患儿的临床特征。方法分析某儿童医院收治的2例HIV阴性TSM患儿的临床特点及实验室资料、存在的基础疾病,并复习相关文献,总结TSM感染患儿的临床特征及诊治经验。结果2例... 目的总结2例人类免疫缺陷病毒(HIV)阴性儿童马尔尼菲篮状菌病(TSM)患儿的临床特征。方法分析某儿童医院收治的2例HIV阴性TSM患儿的临床特点及实验室资料、存在的基础疾病,并复习相关文献,总结TSM感染患儿的临床特征及诊治经验。结果2例HIV阴性TSM患儿中病例1以右下肢肿块为首发症状,1个月余后才出现发热及咳嗽,误诊为结核感染;病例2以发热、三系减少及肝脾、淋巴结大等表现起病。病例1行基因检测为STAT1基因突变,病例2有反复灰指甲及口腔溃疡病史,均行血、骨髓培养及淋巴结活检确诊。病例1先后予以伏立康唑、两性霉素B脂质体静脉滴注,伊曲康唑口服维持治疗,共治疗1年后停药;病例2一直予以伏立康唑治疗(先静脉滴注后口服),共7个月后停药,均无复发。结论TSM可发生在HIV阴性儿童,且可存在STAT1基因突变。对于治疗效果差的患儿,应尽早行培养或组织活检以明确诊断,并积极查找TSM可能存在的基础疾病,以到达早期诊断、早期治疗和改善预后的目的。 展开更多
关键词 马尔尼菲篮状菌 stat1基因突变 人类免疫缺陷病毒 儿童
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西妥昔单抗对非小细胞肺癌A549细胞的抗肿瘤效应及其机制探讨 被引量:1
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作者 李瑾昱 张国庆 +2 位作者 焦顺昌 温新宇 孙胜杰 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期738-742,共5页
目的探讨西妥昔单抗对K-ras突变的非小细胞肺癌A549细胞的体外生长抑制及凋亡诱导作用。方法采用CCK-8法及流式细胞仪分别检测西妥昔单抗对A549细胞的生长抑制作用及凋亡诱导情况;通过基因芯片检测技术比较西妥昔单抗作用组与对照组K-ra... 目的探讨西妥昔单抗对K-ras突变的非小细胞肺癌A549细胞的体外生长抑制及凋亡诱导作用。方法采用CCK-8法及流式细胞仪分别检测西妥昔单抗对A549细胞的生长抑制作用及凋亡诱导情况;通过基因芯片检测技术比较西妥昔单抗作用组与对照组K-ras突变的A549细胞肿瘤相关基因表达的差异。结果西妥昔单抗对K-ras突变的A549细胞具有生长抑制及凋亡诱导作用。西妥昔单抗作用后,有10个基因表达显著上调,9个基因表达显著下调。Real-timePCR检测验证西妥昔单抗作用后STAT1基因及IGFBP3基因表达显著上调。结论西妥昔单抗对K-ras基因突变的肺腺癌A549细胞具有生长抑制及凋亡诱导作用,STAT1和IGFBP3基因表达上调可能与西妥昔单抗对非小细胞肺癌的作用机制相关。 展开更多
关键词 西妥昔单抗 基因 K-ras 寡核苷酸序列分析 stat1转录因子 胰岛素样生长因子结合蛋白质3
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固本防哮饮对信号转导及转录激活因子1及哮喘易感基因ORMDL3的影响 被引量:3
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作者 董盈妹 王爱华 +3 位作者 陆远 凌昊 刘亚南 赵霞 《中国中医急症》 2016年第5期762-765,845,共5页
目的观察固本防哮饮对信号转导和转录因子1(STAT1)及哮喘易感基因血清类黏蛋白1样蛋白3(ORMDL3)的调控作用,分析其防治哮喘机制。方法利用白介素-4诱导人支气管上皮细胞建立哮喘细胞模型,固本防哮饮含药血清对其进行干预,采用实时荧光定... 目的观察固本防哮饮对信号转导和转录因子1(STAT1)及哮喘易感基因血清类黏蛋白1样蛋白3(ORMDL3)的调控作用,分析其防治哮喘机制。方法利用白介素-4诱导人支气管上皮细胞建立哮喘细胞模型,固本防哮饮含药血清对其进行干预,采用实时荧光定量-PCR(Real Time PCR)、免疫印迹法(Western blotting,WB)、免疫荧光法(IF)分别从基因、蛋白水平检测细胞中ORMDL3和STAT1的表达及亚细胞定位。结果与正常组比较,模型组ORMDL3、STAT1 m RNA含量升高,但差异无统计学意义(P>0.05),固本防哮饮可降低模型组细胞ORMDL3、STAT1 m RNA水平,差异无统计学意义(P>0.05);与正常组比较,模型组ORMDL3、STAT1蛋白表达显著增加(P<0.05或P<0.01),与模型组相比,固本防哮饮组ORMDL3及STAT1蛋白表达均显著(P<0.05)。结论固本防哮饮对STAT1及ORMDL3的表达有一定的调控作用,可能为固本防哮饮防治哮喘的内在机制。 展开更多
关键词 固本防哮饮 哮喘 易感基因 血清类黏蛋白1样蛋白3 信号转导和转录因子1
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STAT1基因突变引起的原发性免疫缺陷病研究进展 被引量:7
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作者 陈学梅 徐祺玲 +1 位作者 安云飞 赵晓东 《中国实用儿科杂志》 CSCD 北大核心 2019年第7期599-601,共3页
信号传导及转录激活因子(signal transducersand activators of transcription,STAT)1基因突变引起的原发性免疫缺陷病分为4型,分别为常染色体显性(autosomal dominant,AD)遗传的STAT1功能获得性(gain-of-function,GOF)免疫缺陷和功能... 信号传导及转录激活因子(signal transducersand activators of transcription,STAT)1基因突变引起的原发性免疫缺陷病分为4型,分别为常染色体显性(autosomal dominant,AD)遗传的STAT1功能获得性(gain-of-function,GOF)免疫缺陷和功能缺失性(loss-of-function,LOF)免疫缺陷,以及常染色体隐性(autosomal recessive,AR)遗传的STAT1部分LOF免疫缺陷和STAT1完全LOF免疫缺陷。 展开更多
关键词 stat1基因突变 遗传方式 疾病类型 诊断 治疗
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STAT1基因突变相关原发性免疫缺陷病
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作者 马文夏(综述) 蒋利萍(审校) 《国际儿科学杂志》 2013年第2期172-175,共4页
STAT1是细胞多种信号传导途径相交叉的枢纽,STAT1基因突变导致的原发性免疫缺陷病分为四类:(1)常染色体隐性遗传STAT1完全缺陷;(2)常染色体隐性遗传STAT1部分缺陷;(3)常染色体显性遗传STAT1缺陷;(4)常染色体显性遗传STATI... STAT1是细胞多种信号传导途径相交叉的枢纽,STAT1基因突变导致的原发性免疫缺陷病分为四类:(1)常染色体隐性遗传STAT1完全缺陷;(2)常染色体隐性遗传STAT1部分缺陷;(3)常染色体显性遗传STAT1缺陷;(4)常染色体显性遗传STATI功能增强性突变。其中前三种疾病发病机制主要与IFN-γ、IFN-α/β信号通路受损有关,而最后一种疾病发病机制可能与IFN-α/β信号通路增强有关。该文就STAT1基因突变相关原发性免疫缺陷病的发病机制、临床表现及诊断治疗进行综述。 展开更多
关键词 原发性免疫缺陷病 stat1基因突变 失功能 获功能
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