杂交水稻冈优527品种真实性和纯度的STR检测方法

本实验从 5 1对水稻微卫星引物中筛选出一对引物RM341,经过PCR扩增和 2 .0 %琼脂糖凝胶电泳可以有效地将冈优 5 2 7从 2 4个杂交稻品种中区分出来。对 4种常规稻的RM341位点进行PCR扩增 ,发现常规水稻的扩增产物为一条带 ,而所有 2 4种杂交稻的扩增产物都是两条带。掺杂实验证明 ,该位点可被用于冈优 5 2 7的品种真实性和纯度检测。本实验还采用ABI 310型DNA分析仪和荧光标记的引物来扩增STR位点 ,毛细管电泳分离产物并用相应分析软件进行分析。结果表明 ,将荧光系统用于杂交水稻品种真实性的STR检测比常规STR检测具有更高的灵敏度和可靠性 ,并且有利于高通量、自动化的操作。

分析STR基因位点检测技术在亲权鉴定中的应用

目的:研究短串联重复序列(STR)基因位点检测技术在亲权鉴定中的应用效果。方法:筛选2019年1月-2023年2月,本实验室接收的400份亲权鉴定血液样本,进行PCR复合扩增技术、五色荧光自动化检测技术检验。评估亲权鉴定结果。结果:400份检测样本,确定有亲权关系的有325份,有75份不符合亲权关系的鉴定。结论:STR基因位点检测技术可应用在亲权鉴定中,价值显著。

法庭科学STR检验的标准物质体系

在法庭科学领域推进相关有证标准物质的研制和应用,对建设DNA分析的标准化体系具有重要意义。当前不断涌现新的DNA检验方法,并迅速应用于刑事案件调查,现行方法的有效性和准确性需要标准物质开展认证与验证。DNA STR(short tandem repeat)分型检验是当前法庭科学进行个体身份识别和亲缘关系判断的主要依据,有证DNA标准物质是实现不同实验室间信息资源共享,保障STR分型结果准确可比的标尺。概述了STR检验技术及其过程中使用的国内外标准品和标准物质,并对我国构建STR检验的标准物质体系提出了建议和展望。

汗潜指印的STR分型检测

目的探索汗潜指印的荧光STR复合扩增检测的方法。方法采用Chelex-100和Microco-100浓缩柱,提取汗潜指印中DNA,STR复合扩增荧光电泳检测。结果 105例汗潜指纹STR分型可明确判读5个以上基因座的占30.3％,个体之间的差异、捺印指印时用力大小以及指印遗留在客体上时间的长短均影响检测成功率。结论该汗潜指印的DNA提取方法步骤简单,方法较为稳定,使单枚汗潜指印可望获得DNA分型。

Expressmarker 22 STR荧光检测试剂盒的法医学应用

目的验证Expressmarker 22 STR荧光检测试剂盒的法医学应用价值。方法取FTA卡、滤纸上保存的建库血样和各类涉案生物性检材1948份,用Expressmarker 22 STR荧光检测试剂盒进行STR分型检测,同时采用SinofilerTM、Identifiler、PowerPlex16试剂盒进行平行试验。对4个试剂盒相同基因座的分型进行比对,以确认Expressmarker 22 STR荧光检测试剂盒的灵敏度和准确性。结果 Expressmarker 22 STR荧光检测试剂盒的检测成功率为97.79%,同一样本在相同基因座与SinofilerTM、Identifiler、PowerPlex16试剂盒的STR分型结果相同。结论利用Expressmarker 22 STR荧光检测试剂盒进行STR分型,信息量大、结果准确可靠,可应用于法庭科学。

中国汉族人群8个STR位点荧光标记同步检测及其频率分布

目的 对血液等微量生物学检材进行 8个 STR多态性位点及一个性别鉴定位点的复合检测 ,并调查了 350名中国汉族无关个体上述基因位点等位基因分布情况。方法 所选位点为 vWA、 TH01、 TPOX、 CSF1PO、 D5S818、 D13S317、 D7S820、 D16S539及性别鉴定位点 Amelogenin,应用荧光染料标记引物，利用 PE－ 377 DNA片段分析仪对扩增产物进行基因分型。结果 共检出 63个等位基因及两个性别决定基因 ,总鉴别机率（ TDP）值达 99.999 999 98％，对法医学常见极微量生物学检材的检测获得成功， DNA模板需要量为 0.5～ 1.0ng，通过家系调查，证明上述位点遗传稳定，符合孟德尔遗传规律。结论 上述 8个 STR多态性位点具备了个体认定能力 ,是对微量生物学检材进行个体识别鉴定的理想方法。

广东地区人群41个STR基因座遗传多态性

目的调查广东地区人群41个STR基因座遗传多态性,为科学、客观地进行DNA鉴定并出具规范的法医学DNA鉴定文书提供基础数据。方法采集500个无关个体的口腔拭子样本,进行41个常染色体STR基因座的分型检测,统计其遗传多态性参数。结果研究显示,41个常染色体STR基因座的累积个体识别能力(CDP)为1-1.0755×10^(-45),累积非父排除率(CPE)为1-1.9895×10^(-17)。结论本文涉及的41个常染色体STR基因座有极高的鉴别能力,基本包含了目前行业内常用的常染色体STR基因座,对上述基因座多态性的研究为法医学个体识别和亲权鉴定提供了基础数据,尤其能较好地应用于二联体、双亲皆疑等类型的亲权鉴定中。

应用AGCU Mini STR试剂盒进行亲子鉴定1例

某日，在某地发现1具无法辨认的男性尸体。送检该尸体肌肉组织及某失踪者妻子及儿子的血样，经Identifiler试剂盒检测，不排除符合亲子关系。然而通过DNA实验室信息管理系统检索，发现当地数据库还有6人（其中3人分型为Profiler Plus扩增结果）与失踪者的妻、子不排除符合亲子关系。

法医学难检样品的处理及检测方法研究

在法医物证检验中常常会遇到一些量微而保存条件差的检材,这类检材的成功分析对案件的调查和侦破常起着至关重要的作用,其关键在于能否正确提取和处理检材、并采用适当的分析方法进行检测。笔者结合多年的物证检验经验和研究,综述了常见的牙齿、烟头、毛发、微量血痕等检材的有效处理方法。

鲁西汉族人群19个常染色体STR基因座的遗传多态性研究

目的调查19个常染色体STR基因座在鲁西地区汉族中的等位基因分布,并研究其法医学应用价值。方法对鲁西地区汉族506例无血缘关系个体,采用GoldenEye试剂盒进行检测,电泳后使用Genemapper ID v3.2软件进行分析,获取其19个基因座的数据资料。结果 19个常染色体STR基因座的累积个体识别能力(CDP)为1-4.913 858×10-20,累积非父排除率(CPE)为1-7.619 621×10-9。结论 19个常染色体STR基因座在鲁西汉族人群中呈高度多态性,对法医学亲子关系鉴定具有较大价值,对法医物证检验与研究具应用价值。

温州地区畲族人群15个STR基因座遗传多态性

目的调查温州地区畲族人群15个STR基因座的遗传多态性,充实温州地区畲族人群群体遗传学数据。方法应用AmpFLSTR■ Identifiler■ Plus试剂盒对温州地区108名畲族无关个体血样进行PCR扩增,经3500xL型遗传分析仪电泳检测,用GeneMapperID-X软件进行等位基因分型。结果共检出134个等位基因,基因频率在0.005~0.546之间。除了D2S1338基因座外,其余基因座基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。温州畲族群体期望杂合度为0.599~0.886,个体识别率为0.762~0.968,多态信息含量为0.540~0.870,非父排除率为0.293~0.735;累积随机匹配概率为7.19×10^-17;累积个体识别力为0.99999999999999992807;累积非父排除概率为0.9999913。结论15个STR位点在温州畲族人群中具有较好的遗传多态性,可用于温州地区畲族群体的个体识别和亲权鉴定。

核酸探针及其应用

从基因工程技术-开始,就伴随着核酸探针的应用.在许多领域如基因研究、SNP检测、STR检测、肿瘤研究、药理学研究等方面,核酸探针都是一种强有力的工具.为了能更好的应用和发展核酸探针,有必要对核酸探针有一个系统的认识.

肝癌PDX模型F1代至F2代传代变异情况

本文通过选取40例肝癌肿瘤PDX模型对F1代和F2代进行短串联重复序列(Short tandem repeats,STR)检测又称微卫星DNA(Microsatellite DNA)或简单重复序列(Simple repeat sequence,SRS或SSR),发现有52.5%(21/40)的肿瘤组织发生了包括标记性染色体的基因座改变,常染色体基因座由纯合子突变成杂合子,两条染色体同时发生突变的遗传变异,这些数据可以提示我们在使用PDX模型进行研究时,要考虑PDX肿瘤组织传代过程中STR信息指标。STR信息的改变对肝癌药物筛选和治疗效果评价是否有影响还需要更深入研究。

亲代外周血造血干细胞移植成功治愈重型β-地中海贫血1例

目的 研究了亲代供者外周血造血干细胞移植治疗重型β-地中海贫血(简称地贫)的相关问题。方法 改进了预处理方案:采用生理反馈机制,即在预处理前进行了高频输注红细胞悬液,使Hb达13 0g/L以上,同时口服羟基脲抑制造血使术前地贫骨髓的富细胞性变成贫细胞性,使用抗胸腺细胞球蛋白(ATG)加强对宿主淋巴细胞的攻击力度,结合使用马利兰、氟达拉宾和环磷酰胺。预处理后输异基因外周血干细胞3次。三次输入MNC分别为3 5×10 9/kg ,4 8×10 8/kg及6 2×10 7/kg。结果 移植过程中出现Ⅱ°皮肤GVHD、出血性膀胱炎、霉菌感染等并发症,均得到有效控制。+ 16d(移植后为+ )外周血等位基因PCR -STR检测13位点证实10个不相同位点均转为供体型(供受者本身有三个位点相同) ,完全植入。并于移植后+ 70d复查证实仍为完全植入状态。目前患儿移植后已5月余,无cGVHD表现。已五个月未输血制品,白细胞正常,血小板维持在90G/L ,血红蛋白维持在110g/L。结论 亲代所供HLA一个亚型不相合的外周血造血干细胞移植治疗重症β-地中海贫血是简单。

基于切口酶的等温全基因组扩增体系的建立与应用

目的 建立依赖切口酶Nt.BstNBI的等温全基因组扩增体系,并对该体系的微量生物物证STR分型效能进行验证。方法 选用切口酶Nt.BstNBI(识别序列为GAGTC)和等温扩增的聚合酶Bst,建立切口酶依赖的扩增体系(NDA)。对DNA样本进行NDA并纯化NDA产物,对NDA前后的样本进行复合扩增和毛细管电泳,检测该方法的有效性、灵敏性。结果 007标准品12个常染色体基因座的扩增效率提高2倍以上,灵敏度约为3 pg/μL;19个Y染色体个基因座的扩增效率提高2倍以上,灵敏度约为6 pg/μL。8个人血样本扩增效率提高2倍以上的常染色体基因座与007标准品一致。结论 本文建立的NDA体系准确性好,能够对包含特定侧翼序列的STR基因座进行有效的线性扩增,对法医微量生物物证的高效扩增检测具有重要意义。