藏族和夏尔巴人15个常染色体STRs的遗传多态性

为了探究生活在西藏自治区的藏族人和夏尔巴人的亲缘关系,选取西藏日喀则地区的藏族人225例和夏尔巴人181例,对他们的15个常染色体遗传标记短串联重复序列(short tandem repeat,STRs)进行基因分型,将二者与一些高原人群及世界其他人群进行比对.采用Cervus3.0、Arlequin3.5、Structure2.3.4、R3.0.3、Distruct1.1等统计分析软件,对高原人群的遗传多态性进行分析.在藏族人群中共检测出141个等位基因,频率分布在0.0022~0.6222之间;在夏尔巴人群中共检测出139个等位基因,频率分布在0.0028~0.5691之间.15个位点中,藏族人群的TPOX、D3S1358、TH01位点和夏尔巴人群的D18S51、FGA位点的多态性不高,其余位点均属于高度多态性遗传标记.在STRs遗传结构上,藏族人和夏尔巴人与东亚人群最为接近,与非洲人和欧洲白人相似程度较低.由此认为,藏族人和夏尔巴人都属于东亚人群的一员,高原人群与东亚人群有着共同的遗传结构.

皖南牛Y-STRs与Y-SNPs遗传多样性研究

[目的]从分子水平探究皖南牛的遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[方法]利用PCR产物直接测序、荧光微卫星分型方法,选择2个Y-SNPs标记(UTY-19和ZFY-10)和2个Y-STRs位点(INRA189和BM861)对35头皖南公牛进行遗传多样性检测。[结果]发现35头皖南公牛包含Y1、Y2和Y3 3种单倍型组,其频率分别为2.86%、8.56%和88.58%。普通牛Y1单倍型组只有1种单倍型(Y1-98-158),普通牛Y2单倍型组有3种单倍型(Y2-102-158、Y2-104-158和Y2-106-158),瘤牛Y3单倍型组只有1种单倍型(Y3-88-156),皖南牛Y染色体单倍型多样度为0.2185±0.0924,表明皖南牛有普通牛与瘤牛2个父系起源,遗传多样性较低。[结论]皖南牛属于南方黄牛类型,以瘤牛的种质特性为主。

链霉菌Strs-2产木聚糖酶的条件及部分性质研究

通过碳氮源对链霉菌Strs- 2产胞外木聚糖酶活性的影响 ,得出其适宜培养基为 (g/L) :含半纤维素 2 0 ,(NH4) 2 SO44.0 ,KH2 PO41.0 ,MgSO4·7H2 O 0 .5 ,NaCl0 .3,CaCO3 1.0。用DNS法研究了该酶的性质结果表明其最适pH值为 6 .5 ,最适反应温度为5 5℃ ;Na+ 、K+ 、Ca2 + 、Mg2 + 等离子对酶有激活作用 ,而Zn2 + 、Ag+ 、Fe3 + 和Cu2 +

短串联重复序列扫描技术对无特定病原体新西兰兔遗传结构的分析

应用STR扫描技术,对广东省医学实验动物中心SPF级新西兰兔进行遗传检测和分析,以掌握该兔群体遗传结构,为制定繁殖育种方案提供依据,并为兔遗传分析方法提供参考。试验采集33只种兔耳静脉血,提取基因组DNA,选用多态丰富的23个微卫星位点对基因组DNA进行PCR扩增,扩增产物进行STR扫描,扫描结果运用popgene32软件分析群体观察等位基因数、有效等位基因数、香隆指数和有效杂合度等遗传结构信息。结果显示,全部23个微卫星位点PCR扩增良好,兔群体平均观测等位基因数为1.5217,平均有效等位基因数为1.2786,平均香隆指数为0.2442,平均有效杂合度为0.1564。初步掌握了该SPF级新西兰兔群体遗传结构。结果表明,STR扫描技术及选用的23个微卫星位点适用于兔群体遗传结构检测和分析,将为兔遗传分析方法提供参考和依据。

应用STR荧光标记分析烟台地区菊花种质资源遗传多样性

【目的】探明烟台地区菊花种质资源的遗传多样性,为烟台地区菊花种质的分类鉴别、资源保护及品种培育提供依据。【方法】应用荧光STR分子标记和毛细管电泳检测技术分析烟台地区非洲菊、秋菊、洋甘菊等12份菊花种质,结合主要表型性状观察进行聚类分析并构建分子身份证。【结果】10对引物共检测到103个STR等位基因位点,平均每对引物的位点数10.3个,扩增片段长度在118~376 bp之间,引物多态性信息(PIC)平均0.795 8。聚类分析依照遗传相似系数将12份菊花种质分为四大类,其中,Ⅰ类群包括秋菊、雏菊、野菊(1)、杭菊(白)、杭菊(黄)、翠菊、野菊(2)共7份种质,占总数的58.3%,含大菊1份、小菊6份,平瓣2份、匙瓣3份、管瓣2份;Ⅱ类群包括非洲菊、洋甘菊2份种质,占总数的16.7%,花瓣类型均为平瓣;Ⅲ类群仅杭菊(紫)1份种质,占总数的8.3%;Ⅳ类群包括一年蓬、野菊(3)2份种质,占总数的16.7%,均为小菊、平瓣花。不同花色、花序大小、花瓣类型的种质存在交叉聚集现象。【结论】烟台地区菊花种质具有较好的遗传多样性,STR荧光标记可有效分析该类种质资源,基于STR分子手段构建了12份菊花种质资源的分子身份证。

应用STR荧光标记分析烟台地区草莓种质资源遗传多样性

本研究以烟台地区1份野生草莓种质和6份常规栽培品种为试材,选取已发表具有扩增多态性的11对STR荧光标记引物进行扩增,采用多重荧光毛细管电泳检测,分析了该地区草莓种质的遗传多样性,并构建了其分子身份证.结果表明,用这11对引物从7份草莓种质中共检测到60个STR等位基因位点,平均每对引物5.45个,扩增片段长度在90~270 bp之间,多态信息含量平均为0.676,可用于草莓种质的多态性检测.聚类分析显示7份草莓种质间的遗传相似系数为0.077~0.842,在遗传相似系数为0.257时,7份种质被分为3个类群,W1(野生草莓)与S2(丰香种质)同源性较高.对7份草莓种质进行不同等位基因编码,构建了分子身份证.本研究结果可为烟台地区草莓种质资源鉴定、保护和开发利用提供重要依据.

Microreader^(TM)23HS Plex ID System中23个常染色体STR基因座在中国北方汉族人群中多态性调查

目的评价Microreader^(TM)23HS Plex ID System试剂盒中包含的23个常染色体STR基因座在中国北方汉族人群中等位基因频率分布,获得群体遗传数据,探究其在法医学中的应用价值。方法使用Microreader^(TM)23HS Plex ID System试剂盒对中国北方汉族人群548例无关样本DNA进行检测,收集分型数据,计算各基因座的等位基因频率、样本的杂合度(heterozygosity,H)、这些常染色体STR基因座的多态信息含量(polymorphism information content,PIC)、个体识别力(power of discrimination,DP)和非父排除率(probability of paternity exclusion,PE)并使用统计软件对各基因座是否符合Hardy-Weinberg平衡进行检验;同时对Microreader^(TM)23HS Plex ID System的累积个体识别能力(CDP)和累积非父排除率(CPE)进行计算。结果在548例无关样本中23个STR基因座共计检出260个等位基因,等位基因频率为0.0009~0.5902,H为0.611~0.885,PIC为0.577~0.864,DP为0.815~0.973(平均DP为0.922),PE为0.089~0.406,CDP=1-3.663×10^(-27),CPE=1-2.668×10^(-16),所有基因座等位基因的分布符合Hardy-Weinberg平衡。结论Microreader^(TM)23HS Plex ID System的23个基因座在中国北方汉族人群中具有良好的多态性,在法医学个人识别、群体遗传学研究、亲子鉴定,特别是复杂亲缘关系鉴定中应用价值较高。

基于YOLOv5s网络改进的钢铁表面缺陷检测算法

针对目前钢铁表面缺陷检测算法存在检测精度低、检测速度慢和模型复杂度高等问题,提出基于YOLOv5s改进的钢铁表面缺陷检测算法。将SE通道注意力模块融入骨干网络中以增大缺陷特征通道权重,降低背景干扰,提高算法对缺陷特征的提取能力;在颈部网络融入STR多头自注意力模块,提高缺陷边缘纹理等细节特征的比重;改进损失函数为SIoU,缩短预测框回归收敛过程以提高算法检测速度。实验结果表明:改进算法在NEU-DET数据集上的mAP值为80.4%,较YOLOv5s提高5.5%,每秒处理帧数为100,算法体积降低约8.3%,算法计算量降低约4.3%,对比其他的目标检测算法,改进算法在检测精度、检测速度上均明显提升,模型复杂度降低明显。改进算法可满足实时钢铁表面缺陷检测需求。

Forensic investigation of 23 autosomal STRs and application in Han and Mongolia ethnic groups

A forensic validation study of the Early Access HuaxiaTM Platinum Polymerase Chain Reaction (PCR) kit was completed to document the performance capabilities and limitations.The genotyping of DNA samples was consistent across a large range of template DNA concentrations,with complete profiles obtained at 0.125 ng;however,no more than 2 mm× 1.2 mm punches of samples would be recommended for direct amplification.The size precision and accuracy test revealed the genotyping ability;while consistent results were obtained when comparing the kit with other commercially available systems.In addition,the whole PCR amplification can finish within approximately 45 min,making the system suitable for fastdetection.However,only partial profiles may be obtained with challenging samples,including DNA stored on Foam-Tipped Applicators (FTA) cards or some case samples.For the forensic application in ethnic groups,a total of 282 and 229 alleles were obtained in Han and Mongolia,respectively.Since the 23 short tandem repeats were independent from each other,the cumulative power of exclusion in duos was 0.999999157188 and the cumulative power of exclusion in trios was 0.999999999859 in the Han group while the cumulative power of exclusion in duos (CPEduo) was 0.999 998 848 26 and cumulative power of exclusion in trios (CPEtrio) was 0.999 999 999 79 in the Mongolia group.And good internal consistency was found between the two investigated groups and the Sichuan Han,Hui,Tibetan and Uygur according to available reference data.

应用多种遗传标记分析同母异父双胞胎亲子鉴定1例

1案例1.1简要案情因诉讼需要,某法院委托本鉴定所对吴某(男,33岁)和双胞胎男孩(吴某郎与吴某易,均为3岁)进行有无亲生血缘关系的鉴定。据法院提供的两子户籍证明及出生证明信息,可明确两者为同母双胞胎。按《亲权鉴定技术规范》(GB/T37223—2018)要求对吴某、吴某郎与吴某易分别采集血样。1.2检验方法1.2.1 DNA提取使用Chelex法提取检材DNA。1.2.2检测过程常染色体STR基因座检测:分别应用Microreader^(TM) 21 ID System和Microreader^(TM) 23sp ID System(北京阅微基因技术股份有限公司)对检材DNA的39个STR基因座和性别基因座复合扩增。

温州地区中国汉族人群8个X-STRs的遗传多态性研究

目的研究X染色体8个STRs基因座在法医学亲权鉴定中的应用。方法试剂盒提取自愿者DNA,PCR法扩增GATA172D05、HPRTB、GATA31E08、DXS7423、DXS6803、DXS6800、DXS6809和DXS6807 8个STRs遗传标记位点,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染检测。结果在所检测的8个X-STRs基因座中,只有DXS6800具有中度多态性,其余均具有高度多态性(PIC>0.5,H>50),这8个X-STRs基因座在中国温州地区汉族群体中的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡,在女性群体和男性群体的累积个人识别率分别为0.99999999999995、0.999999992,非父排除率分别为0.9999997和0.99998。结论除DXS6800外的7个X-STRs基因座可以应用在法医学复杂亲权案件的鉴定上。

Comprehensive analyses for genetic diversities of 19 autosomal STRs in Chinese Kazak group and its phylogenetic relationships with other continental populations

Short tandem repeats(STRs)play an essential role in forensic genetics due to their high degree of polymorphisms,wide distributions and easy detection method.In this study,allelic frequencies and forensic statistical parameters of the 19 autosomal STR loci in a Kazak ethnic group were calculated,and its genetic relationships with reference populations were assessed in order to understand population structure better and enrich population genetic data for forensic practice in Chinese Kazak ethnic group.There were 226 identified alleles with the corresponding allelic frequencies ranging from 0.0008 to 0.5295 in the 628 unrelated healthy Kazak individuals in Xinjiang Uygur Autonomous Region.All autosomal STRs were conformed to the Hardy-Weinberg equilibrium after Bonferroni’s correction.The cumulative power of discrimination and the combined probability of exclusion of all the 19 autosomal STRs were 0.999999999999999999999997162 and 0.999999994484,respectively.Furthermore,the DA distances and Fixation index values of pairwise populations,principal component analysis,multidimensional scaling analysis,phylogenetic tree analysis and structure analysis were conducted to probe the genetic relationships between the Kazak group and other reference populations.The population genetic results showed that these 19 autosomal STR loci were characterised by high genetic diversities in the Kazak group.Furthermore,the studied Kazak group had close genetic relationships with the Uyghur group and the Uzbek group.The present results may facilitate understanding the genetic background of the Chinese Xinjiang Kazak group.

基于3DE平台的水工钢闸门建模及工程量自动统计研究

当前水工钢闸门建模主要利用已完成的二维图纸,在三维软件中利用草图的功能进行实体建模,得到钢闸门三维模型,这种建模方式依赖详细的设计图纸,且翻模工作量巨大。基于达索公司3DExperenice(3DE)平台的STR、Quality Rules Reuse等模块,结合二次开发,实现了平面钢闸门无草图方式的建模及工程量自动统计,解决了实际生产中的难题,提高了设计效率,在水工金属结构数字化设计中具有参考价值。

广东汕尾汉族人群STR基因座遗传多态性分析

目的:分析研究广东汕尾汉族人群中,D3S1358、TH01、D21S11、D18S51、Penta E、D5S818、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、Penta D、vWA、D8S1179、TPOX、FGA、D19S433、D12S391、D6S1043、D2S1338、D1S1656等20个常染色体STR基因座的遗传多态性。方法:采集广东汕尾地区汉族人群418例无血缘关系个体的FTA血卡,采用HEALTH Gene STRtyper-21G Plus试剂盒扩增DNA与分型,用GeneMapper软件分析,用SPSS和Modified-Powerstates软件统计等位基因频率和群体遗传学参数。结果:20个STR基因座等位基因的频率分布为0.001~0.571,个体识别率为0.771~0.984,多态信息含量为0.527~0.904,应用于二联体非父排除率为0.275~0.790,应用于三联体非父排除率为0.400~0.842,观察杂合度为0.586~0.897,杂合度期望值为0.587~0.912。基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。结论:汕尾地区汉族人群的20个常染色体STR基因座具有较高多态性,在人类学和群体遗传学中有较大的研究和应用价值,同样在亲权鉴定和个体识别中有较大价值。

STR40090、STR50115B、STR-D4412、STRS6309、STR-S6545引脚功能及维修数据

1.STR40090引脚功能及维修数据主要功能:用在彩电开关电源稳压电路直接代换型号:IX0465CE、IX0512CE、HKD9509、IX0645CE、STR41090、56A246、STR51090、μPD51090 2.

Validation of a multiplex amplification system of 19 autosomal STRs and 27 Y-STRs

This article describes a newly devised autosomal short tandem repeat(STR)multiplex polymer-ase chain reaction(PCR)system for 19 autosomal loci(D12S391,D13S317,D16S539,D18S51,D19S433,D2S1338,D21S11,D3S1358,D5S818,D6S1043,D7S820,D8S1179,CSF1PO,FGA,TH01,TPOX,vWA,Penta D and Penta E),27 Y-chromosome STR loci(DYS19,DYS385,DYS3891,DYS38911,DYS390,DYS391,DYS392,DYS393,DYS437,DYS438,DYS439,DYS448,DYS449,DYS456,DYS458,DYS460,DYS481,DYS518,DYS533,DYS570,DYS576,DYS635,DYS627,YGATAH4 and DYF387S1)and amelogenin with six-colour fluorescent labelling.Various parameters were evaluated,such as its accuracy,sensitivity,specificity,stability,ability to ana-lysis of mixtures and effects of changes in the PCR-based procedures.All of the 47 selected STR loci were accurately and robustly amplified from 282 bloodstain samples.The species-spe-cificity was high and some ability to inhibit Hematin was identified.The lowest detectable DNA amount was ≥0.125 ng.All of the male loci of the secondary component were revealed precisely when the control DNA was mixed at male/female and male/male ratios of 1:4 or more.We conclude that the present 19-plex autosomal STR and 27 Y-STR assay is both accur-ate and sensitive.It constitutes an additional powerful tool for forensic applications.

贵州[亻革]家人19个STR基因座遗传多态性

目的:调查19个STR基因座在贵州[亻革]家人人群中的遗传多态性分布,为其民族识别提供生物学依据。方法:应用ABI9700型扩增仪和基点认知公司Goldeneye 20A荧光复合扩增系统对106个[亻革]家人无关个体19个STR基因座进行复合扩增,ABI3100型遗传分析仪进行毛细管电泳,GeneMapper ID3.2软件进行基因分型,Modified-Powerstates软件对有关群体遗传学数据进行统计分析。结果:19个STR基因座共检出173个等位基因和497种基因型,其分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05);杂合度(Heterozygotes,H)为0.585~0.906,亲权指数(typical paternity index,PI)为1.20~5.30,个体识别率(Power of Discrimination,DP)为0.747~0.964,非父排除率(power of exclusion,PE)为0.273~0.769,多态信息含量(polymorphism information content,PIC)为0.50~0.90。结论:19个STR基因座除CSF1PO、TPOX、TH01、D13S317、D7S820、D16S539外,其余具有高度多态性,并在法医学个体识别和亲权鉴定中具有较高的应用价值。

法庭科学STR检验的标准物质体系

在法庭科学领域推进相关有证标准物质的研制和应用,对建设DNA分析的标准化体系具有重要意义。当前不断涌现新的DNA检验方法,并迅速应用于刑事案件调查,现行方法的有效性和准确性需要标准物质开展认证与验证。DNA STR(short tandem repeat)分型检验是当前法庭科学进行个体身份识别和亲缘关系判断的主要依据,有证DNA标准物质是实现不同实验室间信息资源共享,保障STR分型结果准确可比的标尺。概述了STR检验技术及其过程中使用的国内外标准品和标准物质,并对我国构建STR检验的标准物质体系提出了建议和展望。