-
题名SULT1C2在肝癌中表达及其与预后关系生信分析
被引量:1
- 1
-
-
作者
闫伟华
赵树超
张敏
时维平
周璇
马晓军
-
机构
青岛大学附属医院病理科
青岛大学附属医院麻醉科
-
出处
《青岛大学学报(医学版)》
CAS
2023年第5期687-692,共6页
-
基金
山东省自然科学基金面上项目(ZR2022MH148)。
-
文摘
目的研究磺基转移酶1C2(SULT1C2)基因在肝癌中的表达情况及其与病人临床预后的关系,探讨SULT1C2基因在肝癌中作用的分子机制。方法从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库下载泛癌和肝癌原始RNA测序数据及病人的临床资料,利用R4.0.2提取SULT1C2基因表达值并在肝癌分子图谱数据库(HCCDB)和肝癌组织中验证,结合临床肝癌样本分析SULT1C2基因在肝癌组织中表达及其与病人预后的关系。通过基因富集分析(GSEA)分析SULT1C2基因相关的生物学功能和信号通路,采用Pearson相关性分析检验SULT1C2与信号通路间的相关性。结果TCGA、GEO和HCCDB数据集以及临床肝癌样本检测结果显示,SULT1C2在泛癌和肝癌组织中表达水平显著上调(P<0.05);Kapalan-Meier生存分析显示,SULT1C2表达与病人不良预后相关(P<0.05)。GSEA分析显示,SULT1C2在不同肿瘤中发挥抑癌或促癌的双重作用。在肝癌组织中,SULT1C2表达的同时可激活转录因子E2因子(E2F)、G2M检查点和MYC信号通路。结论SULT1C2基因在肝癌中高表达,它可能通过激活E2F、G2M检查点和MYC信号通路诱导肝癌病人的不良预后,有望成为肝癌潜在的诊断和治疗新靶点。
-
关键词
磺基转移酶1C2
肝肿瘤
预后
细胞周期检查点
基因
myc
计算生物学
-
Keywords
sult1c2
liver neoplasms
prognosis
cell cycle checkpoints
genes,myc
computational biology
-
分类号
R394.2
[医药卫生—医学遗传学]
R735.7
[医药卫生—肿瘤]
-