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SULT1C2在肝癌中表达及其与预后关系生信分析 被引量:1
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作者 闫伟华 赵树超 +3 位作者 张敏 时维平 周璇 马晓军 《青岛大学学报(医学版)》 CAS 2023年第5期687-692,共6页
目的研究磺基转移酶1C2(SULT1C2)基因在肝癌中的表达情况及其与病人临床预后的关系,探讨SULT1C2基因在肝癌中作用的分子机制。方法从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库下载泛癌和肝癌原始RNA测序数据及病人的临床资料,利用... 目的研究磺基转移酶1C2(SULT1C2)基因在肝癌中的表达情况及其与病人临床预后的关系,探讨SULT1C2基因在肝癌中作用的分子机制。方法从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库下载泛癌和肝癌原始RNA测序数据及病人的临床资料,利用R4.0.2提取SULT1C2基因表达值并在肝癌分子图谱数据库(HCCDB)和肝癌组织中验证,结合临床肝癌样本分析SULT1C2基因在肝癌组织中表达及其与病人预后的关系。通过基因富集分析(GSEA)分析SULT1C2基因相关的生物学功能和信号通路,采用Pearson相关性分析检验SULT1C2与信号通路间的相关性。结果TCGA、GEO和HCCDB数据集以及临床肝癌样本检测结果显示,SULT1C2在泛癌和肝癌组织中表达水平显著上调(P<0.05);Kapalan-Meier生存分析显示,SULT1C2表达与病人不良预后相关(P<0.05)。GSEA分析显示,SULT1C2在不同肿瘤中发挥抑癌或促癌的双重作用。在肝癌组织中,SULT1C2表达的同时可激活转录因子E2因子(E2F)、G2M检查点和MYC信号通路。结论SULT1C2基因在肝癌中高表达,它可能通过激活E2F、G2M检查点和MYC信号通路诱导肝癌病人的不良预后,有望成为肝癌潜在的诊断和治疗新靶点。 展开更多
关键词 磺基转移酶1C2 肝肿瘤 预后 细胞周期检查点 基因 myc 计算生物学
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