肾型鸡传染性支气管炎病毒DQ株S_1基因结构分析

选用Trizol试剂抽提肾型鸡传染性支气管炎病毒 (IBV)DQ株基因组RNA ,采用特异性引物通过RT -PCR扩增其S1基因cDNA ,克隆入pBluescript质粒载体中 ,作测序分析。结果表明 ,DQ株S1基因全长为 1731nt ,编码一条 5 76个氨基酸组成的多肽 ,其核苷酸与IBV - 4 / 91,Gray ,D4 1,Bei jing ,ZJ971,Beaudette ,H12 0 ,M4 1毒株的同源性为 78.4 %～ 82 .73% ,氨基酸同源性为 74 .4 1%～ 78.96 %。DQ株不同于其它血清型IBV的主要特征为 :在S1基因核苷酸序列上 ,第 2 78- 2 99位之间插入了一段新的序列 ,第 4 2 3- 4 31位碱基缺失 ,有许多点突变 ;二级结构上表现为第 2 - 2 2位氨基酸区域、第 92 - 98位氨基酸区域亲水性增强 ,第 74 - 76位氨基酸区域疏水性增强 ,最大亲水峰改变。S1分子进化系统分析显示 ,DQ株与其它各毒株的亲缘关系较远。