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Salinivibrio sp.YH4胞外丝氨酸蛋白酶EYHS耐盐性及生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
武翠玲
宋英达
+2 位作者
高慧芳
张廉芸
任晨霞
《盐湖研究》
CAS
CSCD
2021年第1期105-110,共6页
为探讨菌株Salinivibrio sp.YH4分泌的丝氨酸蛋白酶EYHS的耐盐性及结构特征,采用明胶底物酶谱法分析EYHS的耐盐性,并应用生物信息学手段对EYHS及6种耐盐的S8家族丝氨酸蛋白酶结构特征进行分析。结果表明EYHS在4 mol/L的NaCl溶液中仍具...
为探讨菌株Salinivibrio sp.YH4分泌的丝氨酸蛋白酶EYHS的耐盐性及结构特征,采用明胶底物酶谱法分析EYHS的耐盐性,并应用生物信息学手段对EYHS及6种耐盐的S8家族丝氨酸蛋白酶结构特征进行分析。结果表明EYHS在4 mol/L的NaCl溶液中仍具有活性,属于耐盐蛋白酶。EYHS及6种S8家族丝氨酸蛋白酶分子表面的loop区等无规则卷曲所占比例较高,α-螺旋与β-片层则主要位于酶分子内部。EYHS分子表面酸性氨基酸含量较高,且具有弱疏水内核。多序列比对发现蛋白酶的催化三联体两侧存在高度保守的基序和保守的极性氨基酸及芳香族氨基酸,并存在多个保守的Gly与Ala。同源模建和表面电荷分布显示,α螺旋和β片层围成了蛋白酶的催化腔,EYHS活性中心包含由Asp32、His65与Ser215组成的催化三联体,且催化位点区域表面静电势为负。上述结构特征可能有助于耐盐丝氨酸蛋白酶EYHS在高盐环境下维持其稳定性和适度柔性,并有助于其催化功能的发挥,为深入研究耐盐丝氨酸蛋白酶的高盐环境适应性提供了一定的理论依据。
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关键词
salinivibrio
sp
.YH4
丝氨酸蛋白酶
耐盐蛋白酶
生物信息学
下载PDF
职称材料
Salinivibrio sp.YH4胞外蛋白酶EYHⅠ的分离纯化、酶学性质及基因克隆
被引量:
3
2
作者
武翠玲
刘丹
+5 位作者
杨兴昊
吴日帮
黄嘉丰
张姜
伦梓丰
何海伦
《山东大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期36-42,共7页
从中度嗜盐菌Salinivibrio sp.YH4发酵的粗酶液中分离纯化出蛋白酶EYHⅠ,对其进行酶学性质分析、串联质谱鉴定及全基因克隆。结果表明,EYHⅠ属于金属蛋白酶,最适温度55℃,热稳定性较好。最适p H为9.0,碱性条件下较稳定;在4 mol/L的Na C...
从中度嗜盐菌Salinivibrio sp.YH4发酵的粗酶液中分离纯化出蛋白酶EYHⅠ,对其进行酶学性质分析、串联质谱鉴定及全基因克隆。结果表明,EYHⅠ属于金属蛋白酶,最适温度55℃,热稳定性较好。最适p H为9.0,碱性条件下较稳定;在4 mol/L的Na Cl溶液中EYHⅠ仍保持较高活性,EYHⅠ全基因序列共1 836 bp,蛋白序列共611个氨基酸。比对发现EYHⅠ氨基酸序列与Salinivibrio sp.AF-2004所产Zn金属蛋白酶前体(ABI93183)同源性最高(96%)。结构分析表明,EYHⅠ由一个FTP结构域,一个Pep SY结构域,一个M4中性蛋白酶和一个PPC结构域组成。本研究为嗜盐菌及其胞外蛋白酶的生产和应用奠定了理论基础。
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关键词
salinivibrio
sp
.YH4
蛋白酶
分离纯化
酶学性质
基因克隆
原文传递
题名
Salinivibrio sp.YH4胞外丝氨酸蛋白酶EYHS耐盐性及生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
武翠玲
宋英达
高慧芳
张廉芸
任晨霞
机构
长治医学院
出处
《盐湖研究》
CAS
CSCD
2021年第1期105-110,共6页
基金
国家自然科学基金青年基金资助(31900038)
山西省青年科学基金资助(201801D221284)。
文摘
为探讨菌株Salinivibrio sp.YH4分泌的丝氨酸蛋白酶EYHS的耐盐性及结构特征,采用明胶底物酶谱法分析EYHS的耐盐性,并应用生物信息学手段对EYHS及6种耐盐的S8家族丝氨酸蛋白酶结构特征进行分析。结果表明EYHS在4 mol/L的NaCl溶液中仍具有活性,属于耐盐蛋白酶。EYHS及6种S8家族丝氨酸蛋白酶分子表面的loop区等无规则卷曲所占比例较高,α-螺旋与β-片层则主要位于酶分子内部。EYHS分子表面酸性氨基酸含量较高,且具有弱疏水内核。多序列比对发现蛋白酶的催化三联体两侧存在高度保守的基序和保守的极性氨基酸及芳香族氨基酸,并存在多个保守的Gly与Ala。同源模建和表面电荷分布显示,α螺旋和β片层围成了蛋白酶的催化腔,EYHS活性中心包含由Asp32、His65与Ser215组成的催化三联体,且催化位点区域表面静电势为负。上述结构特征可能有助于耐盐丝氨酸蛋白酶EYHS在高盐环境下维持其稳定性和适度柔性,并有助于其催化功能的发挥,为深入研究耐盐丝氨酸蛋白酶的高盐环境适应性提供了一定的理论依据。
关键词
salinivibrio
sp
.YH4
丝氨酸蛋白酶
耐盐蛋白酶
生物信息学
Keywords
salinivibrio sp
.YH4
Serine protease
Salt-tolerant protease
Bioinformatics
分类号
S154.3 [农业科学—土壤学]
下载PDF
职称材料
题名
Salinivibrio sp.YH4胞外蛋白酶EYHⅠ的分离纯化、酶学性质及基因克隆
被引量:
3
2
作者
武翠玲
刘丹
杨兴昊
吴日帮
黄嘉丰
张姜
伦梓丰
何海伦
机构
中南大学生命科学学院医学遗传学国家重点实验室
长治医学院生物化学教研室
出处
《山东大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期36-42,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(31370104)
国家星火计划面上项目(2013GA770009)
长治医学院科研启动基金项目(QDZ201517)
文摘
从中度嗜盐菌Salinivibrio sp.YH4发酵的粗酶液中分离纯化出蛋白酶EYHⅠ,对其进行酶学性质分析、串联质谱鉴定及全基因克隆。结果表明,EYHⅠ属于金属蛋白酶,最适温度55℃,热稳定性较好。最适p H为9.0,碱性条件下较稳定;在4 mol/L的Na Cl溶液中EYHⅠ仍保持较高活性,EYHⅠ全基因序列共1 836 bp,蛋白序列共611个氨基酸。比对发现EYHⅠ氨基酸序列与Salinivibrio sp.AF-2004所产Zn金属蛋白酶前体(ABI93183)同源性最高(96%)。结构分析表明,EYHⅠ由一个FTP结构域,一个Pep SY结构域,一个M4中性蛋白酶和一个PPC结构域组成。本研究为嗜盐菌及其胞外蛋白酶的生产和应用奠定了理论基础。
关键词
salinivibrio
sp
.YH4
蛋白酶
分离纯化
酶学性质
基因克隆
Keywords
salinivibrio sp
proteases
purification
enzymic properties
gene cloning
分类号
Q936 [生物学—微生物学]
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Salinivibrio sp.YH4胞外丝氨酸蛋白酶EYHS耐盐性及生物信息学分析
武翠玲
宋英达
高慧芳
张廉芸
任晨霞
《盐湖研究》
CAS
CSCD
2021
1
下载PDF
职称材料
2
Salinivibrio sp.YH4胞外蛋白酶EYHⅠ的分离纯化、酶学性质及基因克隆
武翠玲
刘丹
杨兴昊
吴日帮
黄嘉丰
张姜
伦梓丰
何海伦
《山东大学学报(理学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016
3
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