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甘蔗独脚金内酯生物合成关键基因ScD27的克隆与表达分析
被引量:
9
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作者
吴转娣
刘新龙
+8 位作者
刘家勇
昝逢刚
李旭娟
刘洪博
林秀琴
陈学宽
苏火生
赵培方
吴才文
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期31-41,共11页
独脚金内酯(strigolactones,SLs)是一类新型植物激素,D27基因是独脚金内酯生物合成途径中最上游的调控基因,且该基因调控SLs的合成是一个可逆的过程。本研究根据水稻、玉米、高粱、二穗短柄草4种禾本科作物的D27基因核苷酸序列保守区域...
独脚金内酯(strigolactones,SLs)是一类新型植物激素,D27基因是独脚金内酯生物合成途径中最上游的调控基因,且该基因调控SLs的合成是一个可逆的过程。本研究根据水稻、玉米、高粱、二穗短柄草4种禾本科作物的D27基因核苷酸序列保守区域设计引物,以甘蔗品种ROC22的c DNA为模板,利用RT-PCR和RACE技术,从甘蔗中克隆出D27基因的c DNA全长序列,命名为Sc D27,Gen Bank登录号为KP987221.1。该基因序列全长1379 bp,包含一个867 bp的完整开放阅读框(ORF),编码288个氨基酸残基。Sc D27编码的蛋白质分子量为71.58 k D,理论等电点为5.04,是一种非分泌性蛋白,主要分布于叶绿体上,该蛋白的保守区可能具有2个锌指蛋白结构域(Zn F_TAZ和Zn F_A20),且不存在信号肽;该基因编码的氨基酸序列具有较高的保守性,与高粱、谷子、大麦、短穗二柄草等禾本科植物的D27氨基酸序列相似性在70%以上;Sc D27基因在甘蔗各组织部位均有表达,其中茎尖和腋芽中表达量较高,叶、茎和根中的表达较低。此外,Sc D27基因在甘蔗茎尖中的表达受PEG、盐胁迫、磷缺乏和营养缺乏的诱导,推测Sc D27基因是甘蔗独脚金内酯生物合成途径中响应非生物胁迫的关键基因。
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关键词
甘蔗
scd27
同源克隆
生物信息学
Q-PCR
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职称材料
题名
甘蔗独脚金内酯生物合成关键基因ScD27的克隆与表达分析
被引量:
9
1
作者
吴转娣
刘新龙
刘家勇
昝逢刚
李旭娟
刘洪博
林秀琴
陈学宽
苏火生
赵培方
吴才文
机构
云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期31-41,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31360359)
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-20-1-1)
+3 种基金
云南省中青年学术技术带头人后备人才(2014HB038)
云南省应用基础研究计划项目(2016FB071)
重大科技专项-生物(2015ZA001)
科技创新人才计划(2014HC015)资助~~
文摘
独脚金内酯(strigolactones,SLs)是一类新型植物激素,D27基因是独脚金内酯生物合成途径中最上游的调控基因,且该基因调控SLs的合成是一个可逆的过程。本研究根据水稻、玉米、高粱、二穗短柄草4种禾本科作物的D27基因核苷酸序列保守区域设计引物,以甘蔗品种ROC22的c DNA为模板,利用RT-PCR和RACE技术,从甘蔗中克隆出D27基因的c DNA全长序列,命名为Sc D27,Gen Bank登录号为KP987221.1。该基因序列全长1379 bp,包含一个867 bp的完整开放阅读框(ORF),编码288个氨基酸残基。Sc D27编码的蛋白质分子量为71.58 k D,理论等电点为5.04,是一种非分泌性蛋白,主要分布于叶绿体上,该蛋白的保守区可能具有2个锌指蛋白结构域(Zn F_TAZ和Zn F_A20),且不存在信号肽;该基因编码的氨基酸序列具有较高的保守性,与高粱、谷子、大麦、短穗二柄草等禾本科植物的D27氨基酸序列相似性在70%以上;Sc D27基因在甘蔗各组织部位均有表达,其中茎尖和腋芽中表达量较高,叶、茎和根中的表达较低。此外,Sc D27基因在甘蔗茎尖中的表达受PEG、盐胁迫、磷缺乏和营养缺乏的诱导,推测Sc D27基因是甘蔗独脚金内酯生物合成途径中响应非生物胁迫的关键基因。
关键词
甘蔗
scd27
同源克隆
生物信息学
Q-PCR
Keywords
Sugarcane
scd27
Homology cloning
Bioinformatics
q-PCR
分类号
S566.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
甘蔗独脚金内酯生物合成关键基因ScD27的克隆与表达分析
吴转娣
刘新龙
刘家勇
昝逢刚
李旭娟
刘洪博
林秀琴
陈学宽
苏火生
赵培方
吴才文
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
9
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