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Effect of RNA interference on WD101 gene of Schistosoma japonicum
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作者 Peng Zhang Gang Feng +2 位作者 Wei-Na Zhang Ying-Ying Zhang Chun-Sheng Liu 《Asian Pacific Journal of Tropical Medicine》 SCIE CAS 2018年第2期136-140,共5页
Objective: To study the effect of RNA interference(RNAi) on WD101 gene and its effect on the expression of WD101 mRNA and protein in Schistosoma japonicum.Methods: Doublestranded RNA(dsRNA) WD101 gene and control gene... Objective: To study the effect of RNA interference(RNAi) on WD101 gene and its effect on the expression of WD101 mRNA and protein in Schistosoma japonicum.Methods: Doublestranded RNA(dsRNA) WD101 gene and control gene(lacZ) were generated by in vitrotranscription and transfected into mechanically transformed schistosomula.The total RNA and protein were isolated simultaneously using TRIzol reagent.The expression levels of mRNA and the protein were determined by quantitative real-time PCR(qPCR) and Western blotting, respectively.After injected dsRNA-electroporated schistosomula into BALB/c mouse six weeks, the male and female reproductive organs were observed and measured under the confocal laser scanning microscope.Results: After 1, 3 and 5 d of RNAi, WD101 mRNA level was decreased by 15%, 39%, and 58% in experiment group compared to that in control group; meanwhile, WD101 protein level was decreased by 11%, 28%, and 43% in experiment group compared to that in control group.There were significantly more sperms in testicular lobes in experiment group than that in control group, while there were no significant differences in terms of ovary and vitelline glands between two groups.Conclusions: The ds WD101-RNAi can effectively induce suppression of WD101 gene expression at both mRNA and protein levels.WD101 gene might be a reproduction-related gene in Schistosoma japonicum. 展开更多
关键词 schistosoma japonicum rna interference WD101
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日本血吸虫成虫RNA CHOMCZYNSKI法快速分离纯化 被引量:6
2
作者 陈伟 裘丽姝 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 1993年第2期135-137,共3页
应用异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法抽提日本血吸虫成虫RNA,能够在数小时内抽提出完整的成虫RNA。此法对于分离数量很少的寄生虫材料中的RNA尤为有效。通过对日本血吸虫成虫RNA变性琼脂糖凝胶电泳分析,发现其核糖体大亚基RNA(L-rRNA)体内切口... 应用异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法抽提日本血吸虫成虫RNA,能够在数小时内抽提出完整的成虫RNA。此法对于分离数量很少的寄生虫材料中的RNA尤为有效。通过对日本血吸虫成虫RNA变性琼脂糖凝胶电泳分析,发现其核糖体大亚基RNA(L-rRNA)体内切口(in vivo nick)现象的存在。并随核糖体小亚基RNA(S-rRNA)一道电泳迁移。反映了L-rRNA的后转录加工。 展开更多
关键词 日本血吸虫 rna 分离 纯化
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肺吸虫和血吸虫总RNA的提取及电泳分析 被引量:3
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作者 吴宜琴 倪忠耘 张耀娟 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1999年第4期291-292,共2页
目的为构建肺吸虫cDNA文库,获得目的重组抗原,用以肺吸虫病的诊断,而制备卫氏肺吸虫的总RNA。方法采用改进的一步法(A和B)提取了卫氏肺吸虫成虫的总RNA,同时提取了日本血吸虫成虫及其虫卵、小鼠肝脏的总RNA。结果... 目的为构建肺吸虫cDNA文库,获得目的重组抗原,用以肺吸虫病的诊断,而制备卫氏肺吸虫的总RNA。方法采用改进的一步法(A和B)提取了卫氏肺吸虫成虫的总RNA,同时提取了日本血吸虫成虫及其虫卵、小鼠肝脏的总RNA。结果人睾丸组织的总RNA经琼脂糖凝胶电泳,观察到方法A所提取的肺吸虫、血吸虫及其虫卵的总RNA在凝胶上只有一条略大于18S的条带。用方法B提取的肺吸虫以及血吸虫的总RNA则出现2条条带,其中1条色淡,并略小于28S,另1条色深,并略大于18S。结论肺吸虫的L-rRNA中也存在切口现象。 展开更多
关键词 肺吸虫 日本血吸虫 虫卵 凝胶电泳 PNA
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日本血吸虫虫卵及其总RNA的快速分离与纯化 被引量:1
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作者 刘兰英 余新炳 +1 位作者 罗树红 方建民 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 1997年第2期17-19,共3页
本文采用匀浆──分级过滤──中速低温离心──反复洗涤法,在3个小时内从感染免肝组织中分离、纯化具有生物活性的高纯度日本血吸虫虫卵。该虫卵用改进的异硫氰酸胍──酚──氯仿一步法抽提,可在一个半小时内提取出分子完整的RNA。... 本文采用匀浆──分级过滤──中速低温离心──反复洗涤法,在3个小时内从感染免肝组织中分离、纯化具有生物活性的高纯度日本血吸虫虫卵。该虫卵用改进的异硫氰酸胍──酚──氯仿一步法抽提,可在一个半小时内提取出分子完整的RNA。此两种方法经济简便,快速易行,效率高。 展开更多
关键词 日本血吸虫 虫卵 rna 纯化
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日本血吸虫小热休克蛋白Sjp40的RNA干扰效应 被引量:3
5
作者 陈敏芳 麦荣嘉 +1 位作者 莫倩珍 周晓红 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期456-461,共6页
目的研究日本血吸虫小热休克蛋白(sHSP)Sjp40基因的RNA干扰效应及其干扰后日本血吸虫HSP60、HSP70、HSP90基因在mRNA水平出现的协同效应,观察各期虫体Sjp40、SjHSP60、SjHSP70、SjHSP90基因mRNA表达水平。方法以双链RNA(dsRNA)实现RNA... 目的研究日本血吸虫小热休克蛋白(sHSP)Sjp40基因的RNA干扰效应及其干扰后日本血吸虫HSP60、HSP70、HSP90基因在mRNA水平出现的协同效应,观察各期虫体Sjp40、SjHSP60、SjHSP70、SjHSP90基因mRNA表达水平。方法以双链RNA(dsRNA)实现RNA干扰。体外转录合成dsRNA,将Sjp40的dsRNA(dsSjp40)及阴性对照GFP的dsRNA(dsGFP)通过浸泡法转染到日本血吸虫成虫中,体外培养7 d后用TRIZOL法提取其总RNA及总蛋白,实时荧光定量PCR(qPCR)检测Sjp40基因及SjHSP60、SjHSP70、SjHSP90基因mRNA的表达,Western blot检测Sjp40蛋白表达产物。提取各期虫体总RNA,qPCR检测Sjp40、SjHSP60、SjHSP70、SjHSP90基因的mRNA表达。结果转染后Sjp40 dsRNA转染组目的基因的转录水平较阴性对照GFP dsRNA转染组下降了80%左右;蛋白质水平较空白对照及阴性对照组(dsGFP)出现明显降低,qPCR结果显示在Sjp40基因RNA干扰后SjHSP60、SjHSP70、SjHSP90基因的mRNA表达水平未发现明显变化。此四种HSPs在日本血吸虫生活史不同时期mRNA表达存在明显差异,Sjp40基因在虫卵期mRAN水平表达相对其他HSPs基因高。结论 dsSjp40 RNAi可特异性抑制Sjp40的表达,但对SjHSP60、SjHSP70、SjHSP90基因mRNA的表达没有明显的影响。 展开更多
关键词 日本血吸虫 小热休克蛋白 rna干扰 DSrna
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日本血吸虫成虫RNA的快速分离纯化 被引量:4
6
作者 李传明 石佑恩 《实用寄生虫病杂志》 CAS 1997年第4期165-167,共3页
应用异硫氨酸胍-酚-氯访一步法提取日本血吸虫总RNA,在1h左右即可提取纯度高、完整性较好的RNA。该方法简单易行,既经济又省时,对来源不易的少量组织尤为有效。通过对血吸虫成虫RNA变性琼脂糖凝胶电泳,观察到日本血吸虫大亚基rRNA... 应用异硫氨酸胍-酚-氯访一步法提取日本血吸虫总RNA,在1h左右即可提取纯度高、完整性较好的RNA。该方法简单易行,既经济又省时,对来源不易的少量组织尤为有效。通过对血吸虫成虫RNA变性琼脂糖凝胶电泳,观察到日本血吸虫大亚基rRNA存在体内缺口现象,随核糖体小亚基RNA一道电泳迁移。 展开更多
关键词 日本血吸虫 rna 纯化
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干扰日本血吸虫凋亡抑制因子最佳siRNA分子的筛选 被引量:1
7
作者 罗荣 赵江平 +1 位作者 胡超 程国锋 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期846-849,共4页
目的筛选干扰日本血吸虫凋亡抑制因子(Inhibitor of apoptosis protein of Schistosoma japonicum,SjIAP)较好的siRNA分子。方法应用生物信息学设计了针对SjIAP的3对siRNA分子。利用脂质体将每对siRNA分子和表达IAP的重组质粒传染到HEK2... 目的筛选干扰日本血吸虫凋亡抑制因子(Inhibitor of apoptosis protein of Schistosoma japonicum,SjIAP)较好的siRNA分子。方法应用生物信息学设计了针对SjIAP的3对siRNA分子。利用脂质体将每对siRNA分子和表达IAP的重组质粒传染到HEK293T细胞中,利用实时定量RT-PCR和免疫印迹检测IAP的表达。将siRNA分子与日本血吸虫童虫(12d)进行体外共培养,利用实时定量RT-PCR和免疫印迹检测虫体内的IAP表达。结果细胞转染实验的实时定量RTPCR和免疫印迹分析表明本研究获得了2个干扰SjIAP较好的siRNA分子,且其中1对siRNA分子可显著抑制日本血吸虫虫体内IAP蛋白的表达,同时虫体Caspase活性有所上升。结论本研究获得了2个干扰日本血吸虫IAP较好的siRNA分子,为进一步利用RNA干扰研究血吸虫IAP的功能奠定了前期基础。 展开更多
关键词 日本血吸虫 凋亡抑制因子 rna干扰 基因功能
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日本血吸虫RNA聚合酶转录因子SⅢ-p15真核正反义表达载体的构建和鉴定 被引量:5
8
作者 包俊英 吴忠道 +1 位作者 徐劲 余新炳 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 2002年第2期102-104,共3页
目的 构建日本血吸虫 RNA聚合酶 转录延长因子 S - p15真核正反义表达载体 ,为进一步鉴定该因子的生物学功能奠定基础。方法 采用表达序列标签法从日本血吸虫成虫 c DNA文库中获得了 1个 RNA聚合酶转录因子 (S - p15 )全长 c DNA序... 目的 构建日本血吸虫 RNA聚合酶 转录延长因子 S - p15真核正反义表达载体 ,为进一步鉴定该因子的生物学功能奠定基础。方法 采用表达序列标签法从日本血吸虫成虫 c DNA文库中获得了 1个 RNA聚合酶转录因子 (S - p15 )全长 c DNA序列 ,克隆及序列测定后 ,将该片段正向及反向插入到真核表达载体 pc DNA 3中。重组载体采用氨苄青霉素 L B培养基筛选、双酶切、PCR及测序鉴定。结果 经鉴定 ,S - p15 - pc DNA3真核正反义表达载体构建成功。结论 构建成功 S -p15 - pc DNA3真核正反义表达载体 ,为下一步鉴定其生物学功能奠定基础。 展开更多
关键词 日本血吸虫 转录延长因子SⅢ-p15 反义DNA 真核表达载体 聚合酶转录因子
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日本血吸虫反式剪接前导RNA的鉴定
9
作者 李锐 贺亮 郝力力 《中国农学通报》 CSCD 2012年第5期36-40,共5页
RNA反式剪接现象广泛存在于真核生物中,包括单细胞原虫以及低等脊索动物。为鉴定日本血吸虫中是否存在SLRNA介导的反式剪接,运用Race方法从成虫中克隆出了1个90nt的SLRNA基因,36nt的RNA前导序列正是来源于此90nt的无PolyA结构的SLRNA,... RNA反式剪接现象广泛存在于真核生物中,包括单细胞原虫以及低等脊索动物。为鉴定日本血吸虫中是否存在SLRNA介导的反式剪接,运用Race方法从成虫中克隆出了1个90nt的SLRNA基因,36nt的RNA前导序列正是来源于此90nt的无PolyA结构的SLRNA,并通过Northern进一步证实了该基因的存在。同时采用荧光定量和Southern对其拷贝数、基因组上的分布方式以及虫体不同阶段的表达量进行了鉴定,发现SLRNA具有55个拷贝并在基因组上呈散在分布;在虫卵和尾蚴时期SLRNA基因的转录丰度最高,雌虫阶段最低,雄虫、3天童虫以及14天童虫阶段无明显差别。结果表明,SLRNA介导的反式剪接可能是日本血吸虫基因转录后重要的调控机制之一。 展开更多
关键词 日本血吸虫 反式剪接 SLrna
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日本血吸虫醛糖还原酶基因RNA干扰效应的初步研究 被引量:4
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作者 王树奇 徐斌 +2 位作者 刘建 王吉鹏 胡薇 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期17-21,共5页
目的研究siRNA诱导的日本血吸虫醛糖还原酶(SjAR)基因转录本和蛋白水平的RNA干扰(RNAi)效应。方法设计并合成2条针对SjAR基因的siRNA(siRNA-1和siRNA-2)和1条阴性对照siRNA(siRNA-NC)。用日本血吸虫尾蚴感染4~6周龄雌性昆明鼠(800~1 000... 目的研究siRNA诱导的日本血吸虫醛糖还原酶(SjAR)基因转录本和蛋白水平的RNA干扰(RNAi)效应。方法设计并合成2条针对SjAR基因的siRNA(siRNA-1和siRNA-2)和1条阴性对照siRNA(siRNA-NC)。用日本血吸虫尾蚴感染4~6周龄雌性昆明鼠(800~1 000条/鼠),13 d后灌注小鼠肝门静脉收集童虫,每(120±10)条童虫为一组,分别采用电转法和浸泡法对各组童虫进行RNAi处理。电转处理法:向电击杯中分别加入5μg siRNA-1、siRNA-2、siRNA-NC或等体积的焦碳酸二乙酯(DEPC)水(空白对照),经125 V 20 ms方波脉冲电击童虫1次后,继续培养48 h;浸泡处理法:向童虫培养基中加入siRNA-1、siRNA-2或siRNA-NC溶液至siRNA浓度为200 nmol/L,第3天时更换一半新鲜培养基并补充siRNA,共培养5 d。每处理设3个平行对照组。干扰结束后,采用TRIzol法提取虫体RNA和可溶性总蛋白,将RNA反转录为cDNA,以SjGAPDH基因为内参,实时定量PCR检测SjAR转录本相对表达水平的变化,Western blotting分析SjAR蛋白水平的变化。结果实时定量PCR结果显示,采用siRNA-1、siRNA-2和siRNA-NC电转后,虫体SjAR转录本水平分别为(90.6±16.2)%、(84.2±7.3)%和(105.9±10.3)%,与空白对照组[(100.9±16.8)%]的差异均无统计学意义(P>0.05);使用siRNA-1、siRNA-2浸泡后,SjAR转录本水平为(48.6±8.2)%和(73.4±4.7)%,均较空白对照组[(100.0±3.3%)]显著下降(P<0.01),而阴性对照siRNA-NC浸泡后的虫体SjAR转录本的表达水平为(101.43±14.33)%,与空白对照组比较表达差异无统计学意义(P>0.05)。Western blotting分析和条带定量结果显示,以空白对照组为标准,使用siRNA-1、siRNA-2和siRNA-NC浸泡后,SjAR蛋白水平分别为79.0%、97.8%和103.2%。结论使用浸泡法对日本血吸虫童虫SjAR进行RNAi处理可降低靶基因转录本和蛋白的表达水平。 展开更多
关键词 日本血吸虫 醛糖还原酶 rna干扰
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兔感染日本血吸虫后血浆中宿主源循环microRNAs变化研究 被引量:1
11
作者 王宇清 刀金威 +5 位作者 朱丽慧 杜晓利 陆珂 李浩 刘金明 程国锋 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2015年第5期58-64,共7页
循环性microRNAs不仅参与生命体的重要活动调控,还有望成为某些疾病诊断的新型标志分子。为深入探讨宿主与血吸虫之间的相互作用机制并发现新型诊断标志分子,我们对前期获得的感染和未感染新西兰大白兔血浆小RNA的Solexia测序结果进行... 循环性microRNAs不仅参与生命体的重要活动调控,还有望成为某些疾病诊断的新型标志分子。为深入探讨宿主与血吸虫之间的相互作用机制并发现新型诊断标志分子,我们对前期获得的感染和未感染新西兰大白兔血浆小RNA的Solexia测序结果进行生物信息学分析,对差异表达的microRNAs用实时定量PCR进行验证,同时对这些差异表达的microRNAs的靶基因进行了分析。在剔除虫源性序列后,我们发现了感染和未感染日本血吸虫的新西兰大白兔体内的循环性宿主源microRNAs 173条,选取了10个差异表达的microRNAs利用实时定量PCR进行验证分析,结果表明所选取的10个microRNAs表达与Solex测序结果一致。靶基因的预测与分析结果表明感染血吸虫兔血浆中差异表达microRNAs的靶基因主要参与细胞进程、代谢调控、生命调控、发育进程等生命进程调控。本研究结果为深入开展日本血吸虫与宿主的互作及其寄生的分子机理提供了基础。 展开更多
关键词 日本血吸虫 循环MICROrna 靶基因 功能分析
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日本血吸虫非编码小RNA研究进展 被引量:2
12
作者 阳青兰 肖建华 《微生物学免疫学进展》 2016年第2期93-97,共5页
非编码小RNA是一类通过调节基因的表达从而影响生命活动的小分子,主要包括微小RNA、内源性小干扰RNA、Piwi蛋白相互作用的RNA及竞争性内源RNA。研究发现日本血吸虫感染动物后,宿主和虫体的非编码小RNA的表达水平均发生了改变。宿主源的... 非编码小RNA是一类通过调节基因的表达从而影响生命活动的小分子,主要包括微小RNA、内源性小干扰RNA、Piwi蛋白相互作用的RNA及竞争性内源RNA。研究发现日本血吸虫感染动物后,宿主和虫体的非编码小RNA的表达水平均发生了改变。宿主源的非编码小RNA主要为微小RNA,其中miR-454和miR-203与日本血吸虫病发生发展有关,miR-223和miR-451与日本血吸虫自身生长发育有关;日本血吸虫非编码小RNA包括微小RNA、内源性小干扰RNA,这些非编码小RNA在日本血吸虫的生长、发育、性成熟及产卵中发挥着重要作用,如sjalet-7、sja-bantam,而且像sja-miR-3479和sja-miR-0001还可以诊断日本血吸虫病。就日本血吸虫非编码小RNA的研究进展进行综述,为日本血吸虫病的防治提供参考。 展开更多
关键词 非编码小rna 微小rna 日本血吸虫 生长 发育
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日本血吸虫平衡型核苷转运蛋白3基因(SjENT3)的RNA干扰研究
13
作者 吴洛滨 任雨琪 +2 位作者 秦芳林 刘金明 金亚美 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期111-117,共7页
血吸虫以雌雄合抱的方式生存,雌虫在合抱后才能发育成熟,雄虫通过某种非精子传递的机制调控血吸虫雌虫的生长发育,而成熟雌虫所产大量虫卵是血吸虫导致宿主严重病理损害和疾病再传播的根源,因此,了解雄虫对雌虫发育的调控对血吸虫的致... 血吸虫以雌雄合抱的方式生存,雌虫在合抱后才能发育成熟,雄虫通过某种非精子传递的机制调控血吸虫雌虫的生长发育,而成熟雌虫所产大量虫卵是血吸虫导致宿主严重病理损害和疾病再传播的根源,因此,了解雄虫对雌虫发育的调控对血吸虫的致病和传播具有重要意义.本实验室前期蛋白质组学研究结果显示日本血吸虫ENT3蛋白(SjENT3)在两性感染的合抱雄虫体内的表达高于其在单性感染雄虫体内的表达.本研究通过qRT-PCR发现SjENT3基因在日本血吸虫虫体各个检测时间点均转录,从7d到21d逐渐升高,在21d转录水平达到最高,随后逐渐下降;SjENT3基因在18,21,25,28,35,42d在合抱雄虫体内转录水平明显高于合抱雌虫;对合抱雄虫与单性感染雄虫转录水平分析发现其在21d,23d,25d 3个检测时间点与蛋白质组学结果一致,在合抱雄虫体内高表达.利用筛选出效果较好的siRNA对SjENT3在血吸虫体内的转录进行长期干扰,结果发现:特异siRNA干扰显著影响SjENT3转录水平,和NC对照组相比,干扰引起宿主虫荷率下降24.44%(P<0.05),宿主肝脏荷卵率下降57.47%(P<0.01),干扰后雌虫肝产卵能力下降42.28%(P<0.01).本研究结果初步表明SjENT3基因参与日本血吸虫尤其是雄虫的生长发育,并可能与血吸虫雌雄虫合抱及其相互间信息传递有一定的关系. 展开更多
关键词 日本血吸虫 SjENT3基因 QRT-PCR rna干扰
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日本血吸虫成虫的非编码RNA高通量测序分析 被引量:4
14
作者 喻祎哲 杨杰 +2 位作者 曾凡胜 王红梅 秦志强 《热带病与寄生虫学》 2017年第1期31-35,共5页
目的通过对日本血吸虫成虫做高通量测序分析,鉴定已知miRNA的表达水平,预测新miRNA的序列结构及生物学功能。方法首先提取日本血吸虫成虫miRNA进行深度测序,其次对miRNA做数据分析、统计长度分布与比对注释,鉴定已知miRNA表达水平,最后... 目的通过对日本血吸虫成虫做高通量测序分析,鉴定已知miRNA的表达水平,预测新miRNA的序列结构及生物学功能。方法首先提取日本血吸虫成虫miRNA进行深度测序,其次对miRNA做数据分析、统计长度分布与比对注释,鉴定已知miRNA表达水平,最后对发现的新miRNA序列进行结构和功能的预测。结果将构建文库中日本血吸虫表达的miRNA与最新Sanger miRBase数据库中的miRNA比对。结果显示,在鉴定的miRNA中,sja-mir-125b是表达量最高的miRNA,另外sjabantam,sja-mir-10,sja-mir-71a,sja-mir-36,sja-mir-61的表达量也较高,上述六种miRNA表达量占到已知miRNA表达量的94.6%。本研究发现了十种在日本血吸虫表达量最高的新miRNA,并对新miRNA进行序列及结构的预测。结论日本血吸虫成虫新miRNAs例如sja-mir-125b的发现将为深入研究其在血吸虫发育与致病的生物学功能打下基础。 展开更多
关键词 非编码核糖核酸 mirna 高通量测序 日本血吸虫病 成虫
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日本血吸虫感染小鼠慢性致病阶段肝脏中差异表达长非编码RNA筛选及功能分析
15
作者 李银龙 李琴 +5 位作者 林伟娜 冯婷 秦志强 曹淳力 李石柱 许静 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期137-147,共11页
目的 筛选日本血吸虫感染小鼠慢性致病阶段肝脏中差异表达长非编码RNA(long non-coding RNA, lnc RNA)并进行功能分析,为探索lnc RNA在日本血吸虫感染所致肝脏病变中的作用提供参考。方法 20只6周龄C57BL/6小鼠随机分为2组,每组10只。... 目的 筛选日本血吸虫感染小鼠慢性致病阶段肝脏中差异表达长非编码RNA(long non-coding RNA, lnc RNA)并进行功能分析,为探索lnc RNA在日本血吸虫感染所致肝脏病变中的作用提供参考。方法 20只6周龄C57BL/6小鼠随机分为2组,每组10只。实验组每只小鼠采用腹部贴片法感染(15±2)条日本血吸虫尾蚴建立日本血吸虫慢性感染小鼠模型,以蒸馏水作为对照组。两组小鼠均于感染70 d后剖杀,获取小鼠肝脏组织样本,进行RNA抽提及文库构建。通过Illumina Nova Seq 6000测序平台对文库进行测序,采用fastp软件进行数据清洗,使用HISAT2软件进行参考基因组比对及基因表达量(FPKM)计算。采用CNIC、CPC、Pfam、PLEK软件对潜在lnc RNA序列进行编码潜能预测,筛选出潜在lnc RNA。采用DESeq2软件进行基因差异表达分析,筛选出差异表达lnc RNA。通过基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,挖掘差异表达lnc RNA靶基因参与的生物学过程和代谢途径。结果 共筛选出333个潜在lnc RNA,67个鉴定为差异表达lnc RNA,其中49个表达上调、18个表达下调。差异表达lnc RNA预测靶基因共53个,GO富集分析显示这些靶基因主要富集在生物学过程和分子功能;其中Sema7a、Arrb1、Ccl21b等基因可能是细胞外调节蛋白激酶1(extracellular regulated protein kinase,ERK1)和ERK2级联正调控生物学过程的关键靶基因,可能参与调控胶原蛋白表达。KEGG富集分析显示,差异表达lnc RNA靶基因主要参与细胞因子-细胞因子受体相互作用、病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体的相互作用、趋化因子信号通路和核因子κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)通路等信号通路。结论 本研究鉴定了日本血吸虫感染小鼠慢性致病阶段肝脏中差异表达lnc RNA及其靶基因的功能富集,其中上调表达的lnc RNA可能通过调控Sema7a、Arrb1、Ccl21b等靶基因影响ERK1/2级联等生物学过程以及趋化因子信号通路等,影响胶原蛋白表达及炎症相关信号通路,从而影响肝脏病变发展。 展开更多
关键词 日本血吸虫 长非编码rna 肝纤维化 细胞外调节蛋白激酶 小鼠
原文传递
日本血吸虫成虫核糖核酸提取方法的研究 被引量:8
16
作者 陈淑贞 蔡银龙 +1 位作者 张兆松 吴观陵 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 1993年第6期333-336,共4页
本文应用酸性异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法从日本血吸虫成虫提取核糖核酸(RNA),并与胍盐/热酚法、胍盐/氯化铯超速离心法的提取结果进行比较。3种方法所分离的RNA,在纯度及完整性上均较满意,但其得率以异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法为高,此法... 本文应用酸性异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法从日本血吸虫成虫提取核糖核酸(RNA),并与胍盐/热酚法、胍盐/氯化铯超速离心法的提取结果进行比较。3种方法所分离的RNA,在纯度及完整性上均较满意,但其得率以异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法为高,此法简单易行,既经济又省时,对来源不易的少量组织,尤为相宜。 展开更多
关键词 日本血吸虫 核糖核酸 纯化
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核糖核酸对家兔日本血吸虫性肝纤维化病理及超微结构变化的影响 被引量:5
17
作者 黄其通 彭雁忠 黄欣 《中国寄生虫病防治杂志》 CSCD 1996年第2期106-107,共2页
应用家兔日本血吸虫病模型,在不同阶段进行肝内核糖核酸含量的测定和光镜、电镜观察肝组织相应的变化。结果显示感染血吸虫后,肝内核糖核酸含量减少。光镜下肝细胞变性坏死程度与胶原纤维分布明显增多。经核糖核酸治疗后,肝内核糖核... 应用家兔日本血吸虫病模型,在不同阶段进行肝内核糖核酸含量的测定和光镜、电镜观察肝组织相应的变化。结果显示感染血吸虫后,肝内核糖核酸含量减少。光镜下肝细胞变性坏死程度与胶原纤维分布明显增多。经核糖核酸治疗后,肝内核糖核酸含量增加的同期,肝组织病变明显减轻。电镜观察在核糖核酸减少时,贮脂细胞、枯否氏细胞增多。胶原纤维分布广泛,经核糖核酸治疗后,上述细胞及胶原纤维相应减少。提示核糖核酸对血吸虫性肝纤维化的形成有直接影响,核糖核酸可以减轻病变程度,阻抑肝纤维化的进展。 展开更多
关键词 日本血吸虫 核糖核酸 肝纤维化 超微结构
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日本血吸虫虫卵核糖核酸的提取及鉴定 被引量:1
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作者 俞小淙 张耀娟 +3 位作者 吴宜琴 章子豪 吴观陵 赵慰先 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 1997年第5期287-288,共2页
本文采用异硫氰酸胍-酚-氯仿一步法成功地提取了日本血吸虫虫卵总RNA,琼脂糖电泳结果呈现18S一条主带,与日本血吸虫成虫RNA的电泳结果一致。日本血吸虫虫卵RNA的抽提成功为虫卵cDNA库的构建以及虫卵有效抗原的筛选奠定了基础。
关键词 日本血吸虫 虫卵 核糖核酸
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血吸虫种株间18S小亚基单位核糖体核酸基因的同源性及其PCR法检测单个尾蚴的敏感性 被引量:5
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作者 李洪军 梁幼生 +4 位作者 戴建荣 陶永辉 汪伟 曲国立 魏剑英 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 2008年第6期418-422,共5页
目的探索日本血吸虫中国大陆株、菲律宾株及曼氏血吸虫18S小亚基单位核糖体核酸基因(18S-rRNA)序列的同源性及采用该基因建立PCR法检测水体中低密度血吸虫尾蚴的可能性。方法提取日本血吸虫中国大陆株、菲律宾株及曼氏血吸虫基因组DNA,... 目的探索日本血吸虫中国大陆株、菲律宾株及曼氏血吸虫18S小亚基单位核糖体核酸基因(18S-rRNA)序列的同源性及采用该基因建立PCR法检测水体中低密度血吸虫尾蚴的可能性。方法提取日本血吸虫中国大陆株、菲律宾株及曼氏血吸虫基因组DNA,采用PCR方法检测上述基因组中同一目的DNA片段,比较其同源性;分别以经沸水加热处理、氨水处理及NaOH、HCl、乙醇沉淀处理和未经处理的单个尾蚴标本为模板,采用PCR法扩增,比较对单个尾蚴的检出率。结果以日本血吸虫中国大陆株、菲律宾株和曼氏血吸虫基因组DNA为模板,均能扩增出长度为469bp的DNA片段。经氨水处理和NaOH、HCl、乙醇沉淀法处理的单个尾蚴标本,PCR方法均能扩增到目的基因。在未经处理或沸水加热处理的单个尾蚴标本中,仅有50%标本能扩增到目的基因。结论血吸虫不同种株间18S-rRNA基因具有广泛同源性。经氨水处理或NaOH、HCl、乙醇沉淀法处理的标本,采用PCR法对低密度尾蚴的检出率高于未经处理或经沸水加热处理的标本。 展开更多
关键词 日本血吸虫 曼氏血吸虫 尾蚴 PCR 18S小亚基单位核糖体核酸基因 敏感性
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Sj Dad1反义核酸抗日本血吸虫感染的实验研究 被引量:1
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作者 李焱 吴忠道 +4 位作者 郑焕钦 曹爱莲 孟玮 彭寨玉 余新炳 《热带医学杂志》 CAS 2001年第1期22-24,共3页
目的 进一步鉴定已获得的日本血吸虫新基因 Sj Dad1的功能。方法 构建Sj Dad1反义(antisense)核酸载体PEGFP-N3-Sj Dad1和正义(sense)核酸载体 pEGFP-N3-Sj Ded1.BAL... 目的 进一步鉴定已获得的日本血吸虫新基因 Sj Dad1的功能。方法 构建Sj Dad1反义(antisense)核酸载体PEGFP-N3-Sj Dad1和正义(sense)核酸载体 pEGFP-N3-Sj Ded1.BALB/c小鼠感染日本血吸虫尾蚴后第 3天,通过小鼠尾静脉分别注射PEGFP-N3-Sj Dad1(antisense)、pEGFP-N3-Sj Dadl(sense)、空载体和生理盐水。45d后解剖实验小鼠进行保护性效果评价。结果 在PEGFP-N3-Sj Dad1(antisense)组、pEGFP-N3-Sj Dadl(sense)组以及pEGFP-N3组小鼠肺部冰冻切片检查发现在童虫周围有绿色荧光出现,而在生理盐水组则无此现象。但各实验组保护性效果无统计学差异(P> 0.05)。结论Sj Dad1反义核酸无明显的抗日本血吸虫感染的效果,尚需寻找其它方法对 Sj Dad1的疫苗候选基因价值作进一步的鉴定。 展开更多
关键词 日本血吸虫 Dad1基因 反义rna 抗感染 动物实验
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