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SEC23B基因突变引起的罕见继发性血色病一例 被引量:2
1
作者 姚承杰 刘凌 贾长库 《肝胆胰外科杂志》 CAS 2023年第6期377-379,384,共4页
血色病是人体内铁代谢异常导致血色素沉着,进而引发多器官功能障碍的一种代谢性疾病。其常见突变基因包括HAMP、HFE2、HFE、SLC40A1、TFR2等。浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院肝胆胰外科收治1例罕见的由SEC23B基因突变引起的继发... 血色病是人体内铁代谢异常导致血色素沉着,进而引发多器官功能障碍的一种代谢性疾病。其常见突变基因包括HAMP、HFE2、HFE、SLC40A1、TFR2等。浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院肝胆胰外科收治1例罕见的由SEC23B基因突变引起的继发性血色病,现报道如下。 展开更多
关键词 继发性血色病 肝脏 先天性红细胞生成性贫血 sec23B基因
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凡纳滨对虾内质网膜转运通道蛋白基因Sec61γ的克隆及表达分析 被引量:1
2
作者 熊建华 盛小伟 +3 位作者 高永华 李文兰 杨彦豪 陈晓汉 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期446-451,共6页
以生长性状为指标分离凡纳滨对虾Litopenaeus vannamei家系的肌肉组织,构建凡纳滨对虾生长性状差减cDNA文库,进行斑点杂交筛选获得内质网膜转运通道蛋白基因Sec61γ基因,克隆获得cDNA全长编码序列及部分非编码序列。序列包含270 bp的开... 以生长性状为指标分离凡纳滨对虾Litopenaeus vannamei家系的肌肉组织,构建凡纳滨对虾生长性状差减cDNA文库,进行斑点杂交筛选获得内质网膜转运通道蛋白基因Sec61γ基因,克隆获得cDNA全长编码序列及部分非编码序列。序列包含270 bp的开放阅读框,推测编码的蛋白质为89个氨基酸,预测的相对分子质量为10 300,理论等电点为10.58。通过荧光定量PCR的方法研究了Sec61γ基因在对虾不同组织和不同生长期肌肉组织中的表达情况,结果表明:Sec61γ基因在对虾的血液以及心脏、肝胰腺、肌肉、胃、肠、眼柄等器官或组织中都有表达,其中在肌肉组织中表达量最高,在肠中表达量最低;在对虾不同生长期肌肉中的表达量各不相同,在10日龄的对虾肌肉组织中表达量最高,为45日龄的对虾肌肉组织中表达量的27.6倍。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 sec61γ基因 抑制性差减杂交 荧光定量PCR
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SEC11基因的HIGS表达载体构建及转基因水稻的抗病性分析 被引量:1
3
作者 唐喆 王光辉 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第12期2572-2579,共8页
【目的】为克服传统抗病水稻材料抗病性易于丧失的缺点。【方法】利用寄主诱导基因沉默(HIGS)技术创制水稻抗稻瘟菌的新材料。【结果】首先,选取稻瘟菌信号肽复合物中的关键亚基SEC11为靶基因,利用Gateway基因重组技术将稻瘟菌SEC11基... 【目的】为克服传统抗病水稻材料抗病性易于丧失的缺点。【方法】利用寄主诱导基因沉默(HIGS)技术创制水稻抗稻瘟菌的新材料。【结果】首先,选取稻瘟菌信号肽复合物中的关键亚基SEC11为靶基因,利用Gateway基因重组技术将稻瘟菌SEC11基因的干扰片段构建到pBDL03载体上获得HIGS表达载体。通过农杆菌介导的转化法,成功将SEC11基因的HIGS载体导入水稻品种日本晴中获得阳性转基因水稻植株。最后,通过水稻叶片喷雾接种试验,证明以稻瘟菌SEC11基因为靶标的HIGS转基因水稻对稻瘟菌具有显著的抗病性。【结论】本研究创制了新的抗稻瘟病水稻材料,将HIGS技术应用于抗稻瘟病分子育种提供了科学依据。 展开更多
关键词 稻瘟病 寄主诱导的基因沉默 水稻 抗病性 GATEWAY技术 sec11基因
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拟南芥exocyst亚基SEC8基因在主根细胞程序性死亡中的功能 被引量:1
4
作者 李鹏祥 鲍依群 谭小云 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期228-234,共7页
[目的]exocyst是真核生物中普遍存在的囊泡拴系因子复合体。在模式植物拟南芥中,exocyst复合体参与多种重要的细胞生物学过程,如生长素运输、细胞极性生长、细胞板形成和细胞自噬等。探索exocyst复合体更多的生物学功能,对于了解exocys... [目的]exocyst是真核生物中普遍存在的囊泡拴系因子复合体。在模式植物拟南芥中,exocyst复合体参与多种重要的细胞生物学过程,如生长素运输、细胞极性生长、细胞板形成和细胞自噬等。探索exocyst复合体更多的生物学功能,对于了解exocyst复合体作用的分子机制具有重要意义。[方法]以exocyst复合体亚基SEC8基因花粉拯救的孢子体突变体PRsec8m1为材料,通过台盼蓝、DAPI、DHCF-DC等染料染色,结合遗传学试验分析其主根发育表型。[结果]发现exocyst复合体亚基SEC8基因突变导致主根细胞程序性死亡(PCD),阻断水杨酸信号传递途径不能缓解这种PCD表型。[结论]exocyst复合体亚基SEC8基因在主根发育过程中起关键作用,其突变导致主根细胞程序性死亡,这种细胞程序性死亡过程可能不依赖于水杨酸信号途径。 展开更多
关键词 exocyst复合体 sec8基因 主根 细胞程序性死亡
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小麦Sec24基因的不同亚型在不同组织中的初步表达分析
5
作者 张杰钰 刘思农 +2 位作者 洪思丹 伏欢 冉莉萍 《绿色科技》 2019年第10期251-253,共3页
指出了小麦胚乳贮藏蛋白以蛋白体的形式在胚乳细胞中积累,其组分和积累量直接决定小麦的加工品质。细胞质中包被蛋白复合体II的内衣被蛋白组分Sec24作为关键调控因子参与了蛋白质的运输和分选。前期研究发现小麦Sec24基因有3个亚型,分别... 指出了小麦胚乳贮藏蛋白以蛋白体的形式在胚乳细胞中积累,其组分和积累量直接决定小麦的加工品质。细胞质中包被蛋白复合体II的内衣被蛋白组分Sec24作为关键调控因子参与了蛋白质的运输和分选。前期研究发现小麦Sec24基因有3个亚型,分别是Sec24a、Sec24b和Sec24c,其中Sec24a受氮素影响显著,它的表达水平与蛋白含量呈正相关。研究通过半定量RT-PCR和实时荧光定量PCR对扬麦158的根、幼叶、叶鞘、成熟叶、小穗和籽粒等组织中Sec24基因的3个亚型的表达量差异进行了初步分析,结果显示3个亚型均不是组织特异性表达的基因,它们在不同组织中的表达量不一致;Sec24a在各器官中的相对表达量要低于Sec24b和Sec24c;三个亚型均在根中的表达量最高,旗叶中的表达量最低。研究结果可为后续探明Sec24a基因对胚乳蛋白体发育和贮藏蛋白积累的分子调控奠定理论基础。 展开更多
关键词 小麦 贮藏蛋白 sec24基因 蛋白体 加工品质
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细菌Ⅲ型分泌系统 被引量:7
6
作者 王健 赵立平 《生命的化学》 CAS CSCD 2001年第2期147-149,共3页
关键词 Ⅲ型分泌系统 sec基因 细菌
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大肠杆菌周质和外膜蛋白的定位 被引量:2
7
作者 葛高翔 林其谁 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2000年第6期597-601,共5页
大肠杆菌周质和外膜蛋白发挥功能必须首先到达其特定亚细胞分区 .大肠杆菌通过一系列与蛋白质分泌有关的蛋白 (Sec蛋白 )将周质和外膜蛋白转运至内膜 .在切除了信号肽后 ,与周质蛋白的定位不同的是 ,外膜蛋白的最终定位还需要其他因子... 大肠杆菌周质和外膜蛋白发挥功能必须首先到达其特定亚细胞分区 .大肠杆菌通过一系列与蛋白质分泌有关的蛋白 (Sec蛋白 )将周质和外膜蛋白转运至内膜 .在切除了信号肽后 ,与周质蛋白的定位不同的是 ,外膜蛋白的最终定位还需要其他因子的协助 . 展开更多
关键词 蛋白质转位 sec基因 周质 外膜蛋白
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四个先天性红细胞生成异常性贫血家系的SEC23B基因变异分析
8
作者 冯银 时盼来 +1 位作者 刘宁 孔祥东 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2021年第8期727-730,共4页
目的分析4例不明原因的溶血性贫血患者的基因变异类型。方法采集4例以溶血性贫血为表型的患者及其家系成员外周静脉血,提取基因组DNA。应用高通量测序方法对4例患者红系相关疾病基因进行筛查,并用Sanger测序验证患者及其家系成员可疑变... 目的分析4例不明原因的溶血性贫血患者的基因变异类型。方法采集4例以溶血性贫血为表型的患者及其家系成员外周静脉血,提取基因组DNA。应用高通量测序方法对4例患者红系相关疾病基因进行筛查,并用Sanger测序验证患者及其家系成员可疑变异位点。结果4个先证者在SEC23B基因上均检测到2个复合杂合变异,分别来自其父母,为先天性红细胞生成异常性贫血(congenital dyserythropoietic anemia,CDA)Ⅱ型患者。先证者1携带SEC23B基因第15外显子c.1727T>C(p.Phe576Ser)和第16外显子c.1831C>T(p.Arg611Trp)复合杂合变异;先证者2携带第2外显子c.74C>A(p.Pro25His)和第14外显子c.1588C>T(p.Arg530Trp)复合杂合变异;先证者3携带第2外显子c.74C>A(p.Pro25His)和第16外显子c.1831C>T(p.Arg611Trp)复合杂合变异;先证者4及其弟携带第14外显子c.1571C>T(p.Ala524Val)和第19外显子c.2149G>T(p.Ala717Ser)复合杂合变异;检出的6个变异中,c.1727T>C(p.Phe576Ser)和c.2149G>T(p.Ala717Ser)为未见报道过的新变异。同时检测到先证者4其PIEZO1基因上存在c.4608_4615del(p.Gly1537Glufs*82)杂合变异。结论高通量测序技术可快速准确地对CDAⅡ型患者进行基因变异分析,是传统诊断方法的有效补充手段,其中新发现的变异位点丰富了SEC23B基因的变异数据库。 展开更多
关键词 高通量测序 溶血性贫血 先天性红细胞生成异常 sec23B基因
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基于Oncomine和GEO数据库分析SEC24D基因在乳腺癌中的表达意义及穿心莲内酯的干预研究 被引量:3
9
作者 余涛 李丹 +3 位作者 邹小娟 丁凤敏 王文龙 陈家旭 《中华中医药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期1703-1707,共5页
目的:通过挖掘Oncomine和GEO基因芯片数据库中的相关数据,分析SEC24D基因在乳腺癌中的表达及临床意义,并探讨穿心莲内酯对乳腺癌细胞中SEC24D基因的干预作用。方法:检索Oncomine和GEO数据库中有关乳腺癌和穿心莲内酯干预乳腺癌的数据集... 目的:通过挖掘Oncomine和GEO基因芯片数据库中的相关数据,分析SEC24D基因在乳腺癌中的表达及临床意义,并探讨穿心莲内酯对乳腺癌细胞中SEC24D基因的干预作用。方法:检索Oncomine和GEO数据库中有关乳腺癌和穿心莲内酯干预乳腺癌的数据集,对所获取的数据资料进行数据挖掘,并结合文献资料综合分析。结果:对Oncomine数据库中共收集的9项关于乳腺癌和乳腺正常组织SEC24D基因有差异表达的研究数据进行分析,发现乳腺癌组织中SEC24D基因的表达显著高于乳腺正常组织(P<0.05)。通过生存分析发现高表达SEC24D基因的乳腺癌患者无病生存期明显差于低表达者,低表达患者的预后更好(P<0.05)。通过挖掘GEO数据库中的数据集GSE85871发现穿心莲内酯能够下调乳腺癌细胞SEC24D基因的表达(P<0.05)。结论:SEC24D基因在乳腺癌组织中呈现高表达,并与乳腺癌患者的预后相关,该基因可能是穿心莲内酯干预乳腺癌细胞的一个新靶点。 展开更多
关键词 穿心莲内酯 乳腺癌 sec24D基因 数据挖掘
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一个先天性红细胞生成异常性贫血家系SEC23B及HFE2基因突变研究 被引量:4
10
作者 王璐 刘罡 +4 位作者 张倩 蔡昊 牛诗雯 韩冰 聂广军 《中华血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期704-708,共5页
目的探讨先天性红细胞生成异常性贫血(cDA)的新基因突变。方法对一例以乏力及尿色加深起病的50岁男性CDA1I患者及其家系成员进行CDAI的CDAN1和CDA11的SEC23B基因检测,并采用质谱技术检测铁调素水平,结合文献进行复习。结果先证者的S... 目的探讨先天性红细胞生成异常性贫血(cDA)的新基因突变。方法对一例以乏力及尿色加深起病的50岁男性CDA1I患者及其家系成员进行CDAI的CDAN1和CDA11的SEC23B基因检测,并采用质谱技术检测铁调素水平,结合文献进行复习。结果先证者的SEC23B基因中检测到一个无义突变(c.71G〉A)及一个错义突变(c.74C〉A),在这例患者的健康直系亲属中还检测到HFE2基因的一个杂合突变(c.55A〉G)。同时,先证者血清铁调素水平低于检测下限(〈1nmol/L)。结论该家系中存在一个无义突变(c.71G〉A)及一个错义突变(c.74C〉A),这两个突变在东亚CDAⅡ患者中首次报道,且不同于先前广泛在欧洲患者特别是意大利患者中发现的基因突变类型,可能为东亚CDAII患者特有。 展开更多
关键词 贫血 红细胞生成障碍性 先天性 无效造血 突变 铁调素 基因 sec23B
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申克孢子丝菌Sec14基因相关功能和药物靶点分析
11
作者 吴晓雁 张静 +4 位作者 高文超 李玉哲 吴榕 陈三妹 黄怀球 《热带医学杂志》 CAS 2020年第4期436-440,F0002,共6页
目的初步了解申克孢子丝菌Sec14基因DNA、m RNA、蛋白的生物学特征及功能位点。方法生物信息学方法分析申克孢子丝菌Sec14基因DNA、m RNA、蛋白的生物学特征。结果申克孢子丝菌Sec14基因启动子可能位于其基因编码区起始位点前224~274 bp... 目的初步了解申克孢子丝菌Sec14基因DNA、m RNA、蛋白的生物学特征及功能位点。方法生物信息学方法分析申克孢子丝菌Sec14基因DNA、m RNA、蛋白的生物学特征。结果申克孢子丝菌Sec14基因启动子可能位于其基因编码区起始位点前224~274 bp处,包含转录起始位点-265 bp,该基因无内含子;Sec14 mRNA含有丰富转录调节元件,并含有microRNA结合位点;Sec14p样蛋白由351个氨基酸残基构成,分子量为39×10^3Mr,理论等电点为5.25,二级结构主要由α-螺旋和无规卷曲构成,Sec14p样蛋白的三级结构呈现典型的球状结构,包裹一个疏水性口袋,该区域含有磷脂分子结合区域,蛋白还分布着丰富的磷酸化位点及2个二分裂核定位信号。吡啶酰胺小分子化合物在磷脂分子结合区域与蛋白相作用,结合能为-6.5 kcal/mol,蛋白还具有丰富的抗原表位。Sec14p样蛋白序列在大部分真菌中一致性较好,同源性高。结论申克孢子丝菌Sec14基因具有典型真菌基因组基因特征,mRNA可变性高,其编码蛋白的磷脂分子结合位点可作为新型小分子的药物靶点。 展开更多
关键词 申克孢子丝菌 生物信息学分析 sec14基因 吡啶酰胺
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SEC23B基因突变诊断先天性红细胞生成异常性贫血Ⅱ型1例并文献复习
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作者 孙慧敏 姜中兴 王卫敏 《重庆医学》 CAS 2019年第9期1513-1515,1519,共4页
目的探讨分子生物学基因突变检测对于复杂、罕见遗传性疾病诊断的重要性,以提高对先天性红细胞生成异常性贫血(CDA)的认识。方法运用高通量二代测序技术对申请人进行血液系统疾病相关基因全外显子编码区及剪切区序列测定,在确定致病基因... 目的探讨分子生物学基因突变检测对于复杂、罕见遗传性疾病诊断的重要性,以提高对先天性红细胞生成异常性贫血(CDA)的认识。方法运用高通量二代测序技术对申请人进行血液系统疾病相关基因全外显子编码区及剪切区序列测定,在确定致病基因后,应用Sanger测序法进行验证,同时检测申请人父母的基因型。通过分析此病例资料并复习相关文献。结果申请人为年轻女性,成年后发现贫血、黄疸,脾大,胆囊结石,血象呈正细胞轻度贫血;血片可见6%球形红细胞;光镜下骨髓形态存在双核幼红细胞,以哑铃核、花核多见,偶见点彩,占有核红细胞的12%;申请人及其父母血液系统疾病基因筛查(高通量二代测序):申请人存在SEC23B基因c.74C>A(p.Pro25His)和c.1588C>T(p.Arg530Trp)复合杂合变异;其母存在SEC23B基因c.74C>A(p.Pro25His)杂合变异;其父存在SEC23B基因c.1588C>T(p.Arg530Trp)杂合变异。未行骨髓电镜、十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)检查。诊断为CDAⅡ型(CDAⅡ),因其未出现严重的铁过载等并发症,观察随访。结论 SEC23B基因c.74C>A(p.Pro25His)和c.1588C>T(p.Arg530Trp)复合杂合变异是本例CDAⅡ患者的可能分子发病机制,积极开展与该病相关的CDAN1、C150RF41、SEC23B、KIF23、KLF1和GATA1基因检测极为重要。 展开更多
关键词 贫血 红细胞生成障碍性 先天性 高通量二代测序 sec23B基因
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先天性红细胞生成异常性贫血Ⅱ型SEC23B基因新发突变位点一例报告及文献复习 被引量:1
13
作者 常丽贤 竺晓凡 +3 位作者 王永伟 董树旭 赵轼轩 茹永新 《中华血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期317-320,共4页
目的报道1例携带SEC23B新发突变位点并经异基因全相合造血干细胞移植成功治疗的先天性红细胞生成异常性贫血(congenital dyserythropoietic anemia, CDA)Ⅱ型病例,丰富此类疾病的基因突变位点及治疗经验。方法对1例血红蛋白降低3个月的... 目的报道1例携带SEC23B新发突变位点并经异基因全相合造血干细胞移植成功治疗的先天性红细胞生成异常性贫血(congenital dyserythropoietic anemia, CDA)Ⅱ型病例,丰富此类疾病的基因突变位点及治疗经验。方法对1例血红蛋白降低3个月的CDAⅡ型婴儿及其家系进行SEC23B基因检测,报道该例患儿临床诊疗过程并对相关文献进行复习。结果患儿,女性,5月龄,因"发现血红蛋白降低3个月"就诊。血常规示HGB 44 g/L,酸溶血试验(Ham试验)阳性。骨髓象示红系占0.690,以中晚幼红细胞为主,可见双核及奇数核红细胞,有核红细胞偶见核碎裂及核出芽;骨髓透射电镜可见有核红细胞典型的双层膜结构。SEC23B基因存在两个未报道的新发突变位点,分别为c.1504 G>C/wt、c. 2254-2255 insert A/wt,两个突变分别来源于患儿父亲与母亲。患儿接受异基因全相合造血干细胞移植治疗后原有突变转阴。结论该例患者为国内首次报道SEC23B基因插入突变CDAⅡ型病例,异基因全相合造血干细胞移植可作为CDAⅡ型的治疗选择。 展开更多
关键词 先天性红细胞生成异常性贫血 sec23B基因 造血干细胞移植
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独立型常染色体显性多囊肝家系的临床及遗传学分析
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作者 苏利沙 刘宁 孔祥东 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期935-939,共5页
目的对一个多囊肝家系进行临床及致病基因变异分析,明确其遗传学病因。方法收集先证者临床资料和家族史,应用全外显子组测序技术对先证者进行基因变异检测;针对筛选出的致病性基因变异对先证者及其家系成员进行荧光定量PCR验证。结果一... 目的对一个多囊肝家系进行临床及致病基因变异分析,明确其遗传学病因。方法收集先证者临床资料和家族史,应用全外显子组测序技术对先证者进行基因变异检测;针对筛选出的致病性基因变异对先证者及其家系成员进行荧光定量PCR验证。结果一男性先证者,18岁体检时发现肝脏多发囊肿,肝功能未见异常,其父亲和祖父肝脏均存在多发囊肿,无明显不适,余无特殊。全外显子组测序提示先证者SEC63基因第1外显子(Exon1)存在杂合缺失,实时荧光定量PCR证实先证者SEC63基因Exon1杂合缺失变异来自其父亲,其祖父检测到相同杂合缺失。根据美国医学遗传学与基因组学学会指南,该基因变异为致病变异,之前鲜见报道。结论明确了该常染色体显性多囊肝家系的遗传学病因,SEC63基因Exon1杂合缺失为新发现的基因变异,该变异拓宽了SEC63基因变异谱。 展开更多
关键词 肝疾病 常染色体显性多囊肝 诊断 sec63基因 全外显子组测序 杂合缺失
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一个Ⅱ型先天性红细胞生成异常性贫血家系的僦3B基因型及表型分析 被引量:3
15
作者 李栋梁 李博伦 +4 位作者 瞿姗姗 曹玮 杨娅平 马印图 侯天文 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期874-878,共5页
目的对1个Ⅱ型先天性红细胞生成异常性贫血(congenital dyserythropojetic anemia,CDA)家系进行致病基因的突变及表型分析。方法应用目标序列捕获高通量二代测序技术对1例CDAⅡ型患者SEC23B基因的外显子及侧翼区进行测序,在确定先... 目的对1个Ⅱ型先天性红细胞生成异常性贫血(congenital dyserythropojetic anemia,CDA)家系进行致病基因的突变及表型分析。方法应用目标序列捕获高通量二代测序技术对1例CDAⅡ型患者SEC23B基因的外显子及侧翼区进行测序,在确定先证者的致病基因型后,应用Sanger测序法进行验证,同时检测患者直系亲属的基因型,并用Mutation Taster与PolyPhen-2软件预测突变对蛋白功能的影响,用SWISS-MODEL软件对蛋白结构进行模拟分析。结果先证者SEC23B基因存在罕见的复合杂合错义突变C.1727T〉C(P.F576S)和C.1831C〉T(P.R611W),导致该基因的第576位氨基酸由苯丙氨酸变为丝氨酸,第611位由精氨酸变为色氨酸。Sanger测序证实了上述双重突变。先证者之姐检出C.1727T〉C杂合突变,父亲及儿子均检出C.1831C〉T杂合突变。此外,在先证者中检出一血色病相关基因HFE的杂合突变c.211C〉T(p.R71X),导致71位的精氨酸变为终止密码子,其父亲未检出此突变。上述3种突变的蛋白功能预测均为有害,分子模拟显示其改变了SEC23B蛋白的三维构象。先证者在脾脏切除后贫血有所好转,在祛铁治疗后铁蛋白有所下降。结论SEC23B基因c.1727T〉C与c.1831C〉T复合杂合突变很可能是该cDAⅡ型家系的分子发病原因,此基因型与临床表型密切相关。 展开更多
关键词 sec23B基因 突变 贫血 先天性红细胞生成异常性 目标序列捕获 二代测序
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Genome-wide identification of the Sec-dependent secretory protease genes in Erwinia amylovora and analysis of their expression during infection of immature pear fruit 被引量:3
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作者 Wang-bin ZHANG Hai-lin YAN +4 位作者 Zong-cai ZHU Chao ZHANG Pei-xiu DU Wen-jun ZHAO Wei-min LI 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2020年第9期716-726,共11页
The general secretory(Sec)pathway represents a common mechanism by which bacteria secrete proteins,including virulence factors,into the extracytoplasmic milieu.However,there is little information about this system,as ... The general secretory(Sec)pathway represents a common mechanism by which bacteria secrete proteins,including virulence factors,into the extracytoplasmic milieu.However,there is little information about this system,as well as its associated secretory proteins,in relation to the fire blight pathogen Erwinia amylovora.In this study,data mining revealed that E.amylovora harbors all of the essential components of the Sec system.Based on this information,we identified putative Sec-dependent secretory proteases in E.amylovora on a genome-wide scale.Using the programs SignalP,LipoP,and Phobius,a total of 15 putative proteases were predicted to contain the N-terminal signal peptides(SPs)that might link them to the Sec-dependent pathway.The activities of the predicted SPs were further ttvreaaalicsdyeta otgepelda nsuesmsi inicng cprarenoa psEeesrtdcy h.s eiTrgirncaihfniicsa carcniotplltiyi-obwnahasle enad nEaa.ll kyaaslmiensye lo spvhohorowas epwdh atasht aaust sete h(deP theoo xipAnr)o ecgsueslinaotene f iuofms i1 om1 na tosufyr steth epe em1 a t5 rh s,ae txs tcuroagcngfyeitrsomtipnelagd s ttmhhieecii rr pperoox---xL?tential roles in plant infection.The results of this study support the suggestion that E.amylovora might employ the Sec system to secrete a suite of proteases to enable successful infection of plants,and shed new light on the interaction of E.amylovora with host plants. 展开更多
关键词 Erwinia amylovora sec-dependent pathway PROTEASE Gene expression Plant infection
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