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千里光脂肪醛脱羰基酶(CER1蛋白)的保守基序(CSM)与功能结构域分析
被引量:
4
1
作者
汤贤春
钱倩
+2 位作者
罗才林
王蕾
钱刚
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2016年第5期395-400,共6页
基于已构建的千里光全长c DNA文库,克隆其脂肪醛脱羰基酶基因(Gen Bank No.:KT895253),并进一步分析该基因所编码蛋白质(CER1蛋白)的氨基酸保守基元序列(conserved sequence motif,CSM)和蛋白质功能结构域的关系。蛋白质一级结构分析发...
基于已构建的千里光全长c DNA文库,克隆其脂肪醛脱羰基酶基因(Gen Bank No.:KT895253),并进一步分析该基因所编码蛋白质(CER1蛋白)的氨基酸保守基元序列(conserved sequence motif,CSM)和蛋白质功能结构域的关系。蛋白质一级结构分析发现,千里光CER1蛋白由623个氨基酸残基组成;进化树和序列比对结果提示SH-片段和LH-片段这两个富含His的保守基元序列在不同物种中表现出高度保守性;3-D结构预测结果表明,高等植物CER1蛋白水合状态下具有高效的底物结合能力和脂肪醛脱羰基的催化效率。因此,根据脂肪醛脱羰基酶氨基酸保守基序对蛋白质功能域的决定作用,推测CER1蛋白的保守结构域是形成底物结合部位和酶催化活性中心的结构基础。
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关键词
千里光
角质层蜡质
脂肪醛脱羰基酶(CER1蛋白)
保守基元序列(CSM)
蛋白质
3-
d
结构
下载PDF
职称材料
千里光热激蛋白90-3(Hsp90-3)的生物信息学与功能分析
被引量:
2
2
作者
平军娇
张珍
+2 位作者
蔡振锋
汤贤春
钱刚
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期385-393,共9页
Hsp90是真核细胞重要的一类分子伴侣,与植物的生长发育、抗逆性、信号转导及生物进化等功能密切相关。为了深入理解高等植物Hsp90结构与功能的关系,该研究从千里光(Senecio scandens)全长cDNA文库中分离到Hsp90-3基因。序列分析结果表明...
Hsp90是真核细胞重要的一类分子伴侣,与植物的生长发育、抗逆性、信号转导及生物进化等功能密切相关。为了深入理解高等植物Hsp90结构与功能的关系,该研究从千里光(Senecio scandens)全长cDNA文库中分离到Hsp90-3基因。序列分析结果表明,该基因编码699个氨基酸的多肽,与拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtHsp90-3(登录号:NP_200412.1)的同源性最高,为93.71%;预测蛋白质的分子量为79.78 kD,理论等电点为5.08。信号序列分析结果发现,该蛋白主要定位于细胞的细胞核、过氧化物酶体、叶绿体类囊体膜及叶绿体基质中,提示作为分子伴侣,高等植物Hsp90-3参与细胞内膜系统蛋白质的转运。结构与功能分析发现,该蛋白有3个结构域及1个连接区,推测Hsp90-3在真核细胞的信号转导、转录调控及胁迫表达等过程中发挥重要功能。
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关键词
千里光
Hsp90-3基因
结构预测
序列分析
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职称材料
千里光β-葡萄糖苷酶基因(ScBG1)的序列特征与表达分析
3
作者
钱倩
钱秋博言
+3 位作者
唐加
李林
徐德林
钱刚
《中药材》
CAS
北大核心
2017年第9期2036-2041,共6页
目的:探讨千里光β-葡萄糖苷酶(β-glucosidase,BG)基因(ScBG1)的序列特征及表达与抗菌性状的关系。方法:利用生物信息学软件分析千里光BG蛋白的序列特征、结构域,通过实时荧光定量PCR法(qRT-PCR)检测ScBG1基因在不同抗菌性状的亲本及...
目的:探讨千里光β-葡萄糖苷酶(β-glucosidase,BG)基因(ScBG1)的序列特征及表达与抗菌性状的关系。方法:利用生物信息学软件分析千里光BG蛋白的序列特征、结构域,通过实时荧光定量PCR法(qRT-PCR)检测ScBG1基因在不同抗菌性状的亲本及其杂交F1代的转录累积水平。结果:千里光BG蛋白一级结构由459个氨基酸残基构成,C端保守基元序列是该蛋白的功能结构域;亚细胞定位分析结果显示BG蛋白分布于细胞质膜、线粒体膜和线粒体膜间腔;ScBG1基因转录累积水平与抗菌性状呈正相关。结论:千里光β-葡萄糖苷酶催化产物参与抗菌性状的次生代谢信号传导网络,其抗菌生理功能表现为核基因组与线粒体基因组共同控制的数量性状。
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关键词
千里光
Β-葡萄糖苷酶基因
生物信息学
正反交
实时荧光定量PCR
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职称材料
题名
千里光脂肪醛脱羰基酶(CER1蛋白)的保守基序(CSM)与功能结构域分析
被引量:
4
1
作者
汤贤春
钱倩
罗才林
王蕾
钱刚
机构
遵义医学院细胞生物学教研室
遵义医学院临床医学系
出处
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2016年第5期395-400,共6页
基金
国家自然科学基金(31560087)
贵州省优秀科技教育人才省长基金(黔省专合字2008-61号)
遵义医学院大学生创新项目([2015]5021)
文摘
基于已构建的千里光全长c DNA文库,克隆其脂肪醛脱羰基酶基因(Gen Bank No.:KT895253),并进一步分析该基因所编码蛋白质(CER1蛋白)的氨基酸保守基元序列(conserved sequence motif,CSM)和蛋白质功能结构域的关系。蛋白质一级结构分析发现,千里光CER1蛋白由623个氨基酸残基组成;进化树和序列比对结果提示SH-片段和LH-片段这两个富含His的保守基元序列在不同物种中表现出高度保守性;3-D结构预测结果表明,高等植物CER1蛋白水合状态下具有高效的底物结合能力和脂肪醛脱羰基的催化效率。因此,根据脂肪醛脱羰基酶氨基酸保守基序对蛋白质功能域的决定作用,推测CER1蛋白的保守结构域是形成底物结合部位和酶催化活性中心的结构基础。
关键词
千里光
角质层蜡质
脂肪醛脱羰基酶(CER1蛋白)
保守基元序列(CSM)
蛋白质
3-
d
结构
Keywords
senecio
scandens
Buch
.-ham
.
ex
d.
don
cuticular wax
fatty-al
d
ehy
d
e
d
ecarbonylase (CER1protein)
conserve
d
sequence motif (CSM)
three-
d
imensional (3-
d
) structure of protein
分类号
Q949.783.5 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
千里光热激蛋白90-3(Hsp90-3)的生物信息学与功能分析
被引量:
2
2
作者
平军娇
张珍
蔡振锋
汤贤春
钱刚
机构
遵义医学院细胞生物学与遗传学教研室
中山市第三人民医院
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期385-393,共9页
基金
贵州省优秀科技教育人才省长基金项目(黔省专合字2008-61号)
文摘
Hsp90是真核细胞重要的一类分子伴侣,与植物的生长发育、抗逆性、信号转导及生物进化等功能密切相关。为了深入理解高等植物Hsp90结构与功能的关系,该研究从千里光(Senecio scandens)全长cDNA文库中分离到Hsp90-3基因。序列分析结果表明,该基因编码699个氨基酸的多肽,与拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtHsp90-3(登录号:NP_200412.1)的同源性最高,为93.71%;预测蛋白质的分子量为79.78 kD,理论等电点为5.08。信号序列分析结果发现,该蛋白主要定位于细胞的细胞核、过氧化物酶体、叶绿体类囊体膜及叶绿体基质中,提示作为分子伴侣,高等植物Hsp90-3参与细胞内膜系统蛋白质的转运。结构与功能分析发现,该蛋白有3个结构域及1个连接区,推测Hsp90-3在真核细胞的信号转导、转录调控及胁迫表达等过程中发挥重要功能。
关键词
千里光
Hsp90-3基因
结构预测
序列分析
Keywords
senecio
scandens
Buch.
-ham.
ex
d.
don
Hsp90-3 gene
Structure pre
d
iction
Sequence analysis
分类号
Q7 [生物学—分子生物学]
Q943 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
千里光β-葡萄糖苷酶基因(ScBG1)的序列特征与表达分析
3
作者
钱倩
钱秋博言
唐加
李林
徐德林
钱刚
机构
遵义医学院临床医学系
黔南民族医学高等专科学校
遵义医学院医学细胞生物学教研室
出处
《中药材》
CAS
北大核心
2017年第9期2036-2041,共6页
基金
国家自然科学基金(31560087)
贵州省大学生创新创业训练计划项目(201610661016)
遵义医学院大学生创新项目([2015]5021)
文摘
目的:探讨千里光β-葡萄糖苷酶(β-glucosidase,BG)基因(ScBG1)的序列特征及表达与抗菌性状的关系。方法:利用生物信息学软件分析千里光BG蛋白的序列特征、结构域,通过实时荧光定量PCR法(qRT-PCR)检测ScBG1基因在不同抗菌性状的亲本及其杂交F1代的转录累积水平。结果:千里光BG蛋白一级结构由459个氨基酸残基构成,C端保守基元序列是该蛋白的功能结构域;亚细胞定位分析结果显示BG蛋白分布于细胞质膜、线粒体膜和线粒体膜间腔;ScBG1基因转录累积水平与抗菌性状呈正相关。结论:千里光β-葡萄糖苷酶催化产物参与抗菌性状的次生代谢信号传导网络,其抗菌生理功能表现为核基因组与线粒体基因组共同控制的数量性状。
关键词
千里光
Β-葡萄糖苷酶基因
生物信息学
正反交
实时荧光定量PCR
Keywords
senecio
scandens
Buch.
-ham.
ex
d.
don
β-Glucosi
d
ase gene( ScBG1 )
Bioinformatics
Reciprocal crosses
Quantitative real-time PCR(qRT-PCR)
分类号
R282.71 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
千里光脂肪醛脱羰基酶(CER1蛋白)的保守基序(CSM)与功能结构域分析
汤贤春
钱倩
罗才林
王蕾
钱刚
《生命科学研究》
CAS
CSCD
2016
4
下载PDF
职称材料
2
千里光热激蛋白90-3(Hsp90-3)的生物信息学与功能分析
平军娇
张珍
蔡振锋
汤贤春
钱刚
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
2
下载PDF
职称材料
3
千里光β-葡萄糖苷酶基因(ScBG1)的序列特征与表达分析
钱倩
钱秋博言
唐加
李林
徐德林
钱刚
《中药材》
CAS
北大核心
2017
0
下载PDF
职称材料
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