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Determination of the Content of Total Alkaloids in Different Solvent Extracts from Climbing Groundsel Herb Produced in Guizhou Province and Their Antibacterial Activity 被引量:3
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作者 饶海 周镁 +2 位作者 秦拴梅 黄秀平 覃容贵 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2013年第10期1417-1420,1428,共5页
[Objective] This study aimed to compare the contents of total alkaloids in different solvent extracts from climbing groundsel herb produced in Guizhou Province and their antibacterial activity. [Method] The content of... [Objective] This study aimed to compare the contents of total alkaloids in different solvent extracts from climbing groundsel herb produced in Guizhou Province and their antibacterial activity. [Method] The content of total alkaloids was measured by UV spectrophotometry, and Oxford cups were used to investigate the antibacterial activity of each solvent extract. [Result] There was a good linear correlation between the absorbance measured by the UV spectrophotometer and the content of total al- kaloids within the concentration of 0.011 0-0.054 8 mg/ml at 207 nm, and the re- gression equation was Y=23.654X+0.021, R=0. 999 7 and the average recovery rate was 99.2%. The contents of total alkaloids in 60% ethanol extract, 95% ethanol and water ethanol were 38.71, 52.25 and 60.50 mg/g, respectively. The 60% ethanol ex- tract had strong antibacterial activity against Streptococcus pneumoniae, Staphylo- coccus aureus and Escherichia coil; the water extractive had stronger antibacterial activity against Escherichia colr, 95% ethanol extract had weak antibacterial activity, with no inhibition of Pseudomonas aeruginosa. [Conclusion] This method is accurate, simple, with good repeatability, which can be used for the determination of alkaloids content of the climbing groundsel herb; there is no positive correlation between the content of total alkaloids in different solvent extracts of climbing groundsel herb and their antibacterial activity. 展开更多
关键词 Climbing groundsel herb senecio scandens buch.-ham Total alkaloids Ultraviolet spectrophotometry Antibacterial activity
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千里光脂肪醛脱羰基酶(CER1蛋白)的保守基序(CSM)与功能结构域分析 被引量:4
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作者 汤贤春 钱倩 +2 位作者 罗才林 王蕾 钱刚 《生命科学研究》 CAS CSCD 2016年第5期395-400,共6页
基于已构建的千里光全长c DNA文库,克隆其脂肪醛脱羰基酶基因(Gen Bank No.:KT895253),并进一步分析该基因所编码蛋白质(CER1蛋白)的氨基酸保守基元序列(conserved sequence motif,CSM)和蛋白质功能结构域的关系。蛋白质一级结构分析发... 基于已构建的千里光全长c DNA文库,克隆其脂肪醛脱羰基酶基因(Gen Bank No.:KT895253),并进一步分析该基因所编码蛋白质(CER1蛋白)的氨基酸保守基元序列(conserved sequence motif,CSM)和蛋白质功能结构域的关系。蛋白质一级结构分析发现,千里光CER1蛋白由623个氨基酸残基组成;进化树和序列比对结果提示SH-片段和LH-片段这两个富含His的保守基元序列在不同物种中表现出高度保守性;3-D结构预测结果表明,高等植物CER1蛋白水合状态下具有高效的底物结合能力和脂肪醛脱羰基的催化效率。因此,根据脂肪醛脱羰基酶氨基酸保守基序对蛋白质功能域的决定作用,推测CER1蛋白的保守结构域是形成底物结合部位和酶催化活性中心的结构基础。 展开更多
关键词 千里光 角质层蜡质 脂肪醛脱羰基酶(CER1蛋白) 保守基元序列(CSM) 蛋白质 3-d 结构
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千里光肌动蛋白基因(Actin)的生物信息学及功能分析 被引量:2
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作者 张珍 平军娇 +2 位作者 蔡振锋 汤贤春 钱刚 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期591-595,共5页
肌动蛋白(Actin)是广泛存在于高等植物中的组成型表达蛋白质,与细胞分裂、细胞运动、细胞信号转导等功能密切相关。为明确肌动蛋白性质与功能的关系,本研究从千里光全长cDNA文库中分离得到Actin基因。序列分析结果表明:该基因长度为1 48... 肌动蛋白(Actin)是广泛存在于高等植物中的组成型表达蛋白质,与细胞分裂、细胞运动、细胞信号转导等功能密切相关。为明确肌动蛋白性质与功能的关系,本研究从千里光全长cDNA文库中分离得到Actin基因。序列分析结果表明:该基因长度为1 481 bp,编码360个氨基酸残基的多肽,与甘草Actin基因编码的氨基酸序列(GenBank登录号:ABW71681.1)的同源性最高,达96%;预测蛋白质的分子量为40.02 kDa,理论等电点为5.85;结构分析发现,螺旋结构和无规则卷曲构成Actin二级结构的主要组分;三级结构预测发现,Actin具有4个结构域;蛋白系统发生树发现,与甘草和鹰嘴豆的亲缘关系较近。本研究认为,高等植物Actin可能参与基因的转录调控,其氨基酸突变位点未对功能结构域产生影响。 展开更多
关键词 千里光 ACTIN基因 序列分析 结构预测
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千里光热激蛋白90-3(Hsp90-3)的生物信息学与功能分析 被引量:2
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作者 平军娇 张珍 +2 位作者 蔡振锋 汤贤春 钱刚 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期385-393,共9页
Hsp90是真核细胞重要的一类分子伴侣,与植物的生长发育、抗逆性、信号转导及生物进化等功能密切相关。为了深入理解高等植物Hsp90结构与功能的关系,该研究从千里光(Senecio scandens)全长cDNA文库中分离到Hsp90-3基因。序列分析结果表明... Hsp90是真核细胞重要的一类分子伴侣,与植物的生长发育、抗逆性、信号转导及生物进化等功能密切相关。为了深入理解高等植物Hsp90结构与功能的关系,该研究从千里光(Senecio scandens)全长cDNA文库中分离到Hsp90-3基因。序列分析结果表明,该基因编码699个氨基酸的多肽,与拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtHsp90-3(登录号:NP_200412.1)的同源性最高,为93.71%;预测蛋白质的分子量为79.78 kD,理论等电点为5.08。信号序列分析结果发现,该蛋白主要定位于细胞的细胞核、过氧化物酶体、叶绿体类囊体膜及叶绿体基质中,提示作为分子伴侣,高等植物Hsp90-3参与细胞内膜系统蛋白质的转运。结构与功能分析发现,该蛋白有3个结构域及1个连接区,推测Hsp90-3在真核细胞的信号转导、转录调控及胁迫表达等过程中发挥重要功能。 展开更多
关键词 千里光 Hsp90-3基因 结构预测 序列分析
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千里光β-葡萄糖苷酶基因(ScBG1)的序列特征与表达分析
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作者 钱倩 钱秋博言 +3 位作者 唐加 李林 徐德林 钱刚 《中药材》 CAS 北大核心 2017年第9期2036-2041,共6页
目的:探讨千里光β-葡萄糖苷酶(β-glucosidase,BG)基因(ScBG1)的序列特征及表达与抗菌性状的关系。方法:利用生物信息学软件分析千里光BG蛋白的序列特征、结构域,通过实时荧光定量PCR法(qRT-PCR)检测ScBG1基因在不同抗菌性状的亲本及... 目的:探讨千里光β-葡萄糖苷酶(β-glucosidase,BG)基因(ScBG1)的序列特征及表达与抗菌性状的关系。方法:利用生物信息学软件分析千里光BG蛋白的序列特征、结构域,通过实时荧光定量PCR法(qRT-PCR)检测ScBG1基因在不同抗菌性状的亲本及其杂交F1代的转录累积水平。结果:千里光BG蛋白一级结构由459个氨基酸残基构成,C端保守基元序列是该蛋白的功能结构域;亚细胞定位分析结果显示BG蛋白分布于细胞质膜、线粒体膜和线粒体膜间腔;ScBG1基因转录累积水平与抗菌性状呈正相关。结论:千里光β-葡萄糖苷酶催化产物参与抗菌性状的次生代谢信号传导网络,其抗菌生理功能表现为核基因组与线粒体基因组共同控制的数量性状。 展开更多
关键词 千里光 Β-葡萄糖苷酶基因 生物信息学 正反交 实时荧光定量PCR
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千里光苯丙氨酸解氨酶基因克隆与系统进化分析 被引量:1
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作者 李林 左青青 +4 位作者 谢欣 刘朝波 陈立 张俊 钱刚 《遵义医科大学学报》 2020年第3期305-309,共5页
目的对具有良好抗菌性的千里光进行pal基因克隆,进行序列结构与系统进化分析,揭示该酶生物学功能与进化地位。方法以千里光转录组数据库中分离得到pal基因核酸序列设计引物,PCR扩增全长验证,运用SignalP、MEGA等系列生物信息学软件进行... 目的对具有良好抗菌性的千里光进行pal基因克隆,进行序列结构与系统进化分析,揭示该酶生物学功能与进化地位。方法以千里光转录组数据库中分离得到pal基因核酸序列设计引物,PCR扩增全长验证,运用SignalP、MEGA等系列生物信息学软件进行核酸序列信息、氨基酸结构特征与系统进化分析。结果克隆获得长度为2159 bp的核酸序列,ORF分析表明该基因编码708个氨基酸,无信号肽,是非跨膜蛋白。与近缘物种pal基因blast分析表明其氨基酸序列与黑心菊、雪莲等相似度达92.22%,具有相同的活性位点和保守结构域。系统进化树分析表明,千里光与菊科植物青蒿、雪莲归于一个亚支,表明3种植物pal在进化上具有较近的亲缘关系。结论千里光pal基因序列结构与其他14种PAL酶家族成员相似度高,在进化上与菊科植物较近。 展开更多
关键词 千里光 生物信息学分析 苯丙氨酸裂解酶(PAL) 进化分析
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