Material basis and pharmacodynamic mechanism of YangshenDingzhi granules in the intervention of viral pneumonia:Based on serum pharmacochemistry and network pharmacology

Background:YangshenDingzhi granules(YSDZ)are clinically effective in preventing and treating COVID-19.The present study elucidates the underlying mechanism of YSDZ intervention in viral pneumonia by employing serum pharmacochemistry and network pharmacology.Methods:The chemical constituents of YSDZ in the blood were examined using ultraperformance liquid chromatography-quadrupole/orbitrap high-resolution mass spectrometry(UPLC-Q-Exactive Orbitrap MS).Potential protein targets were obtained from the SwissTargetPrediction database,and the target genes associated with viral pneumonia were identified using GeneCards,DisGeNET,and Online Mendelian Inheritance in Man(OMIM)databases.The intersection of blood component-related targets and disease-related targets was determined using Venny 2.1.Protein-protein interaction networks were constructed using the STRING database.The Metascape database was employed to perform enrichment analyses of Gene Ontology(GO)functions and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)signaling pathways for the targets,while the Cytoscape 3.9.1 software was utilized to construct drug-component-disease-target-pathway networks.Further,in vitro and in vivo experiments were performed to establish the therapeutic effectiveness of YSDZ against viral pneumonia.Results:Fifteen compounds and 124 targets linked to viral pneumonia were detected in serum.Among these,MAPK1,MAPK3,AKT1,EGFR,and TNF play significant roles.In vitro tests revealed that the medicated serum suppressed the replication of H1N1,RSV,and SARS-CoV-2 replicon.Further,in vivo testing analysis shows that YSDZ decreases the viral load in the lungs of mice infected with RSV and H1N1.Conclusion:The chemical constituents of YSDZ in the blood may elicit therapeutic effects against viral pneumonia by targeting multiple proteins and pathways.

Research Status of Serum Pharmacology and Serum Pharmacochemistry of Traditional Chinese Medicine

Serum pharmacochemistry of traditional Chinese medicine has become a more accurate and rapidly developing reasonable way to analyze the effective material basis of traditional Chinese medicine in recent years. Through this method, we can select very complex Chinese medicine components and clarify the effective substances consistent with the main functions, and then separate and purify effective ingredients in traditional Chinese medicine, so as to explain the material basis of the drug effect and prove the rationality and principle of action of Chinese medicine compounds. It can show the multi-component and multi-target characteristic of traditional Chinese medicine, and after analyzing the migrating components of serum, we can explore the direct effective substances that act on the patient’s body, so as to accelerate and accurately complete the in-depth study of the effective substances of Chinese medicine.

Integrated network pharmacology and metabolomics to explore the mechanisms of Shenzao dripping pill against chronic myocardial ischemia

Background:Shenzao dripping pill(SZDP)is empirically prescribed for treating cardiac diseases.Nevertheless,there is a lack of comprehensive knowledge regarding the underlying mechanisms contributing to its therapeutic effects.The objective of this study is to investigate the underlying mechanism of SZDP against chronic myocardial ischemia(CMI)in a rat model.Methods:In this study,we utilized electrocardiographic and echocardiographic detection along with pathological tissue analysis to evaluate the efficacy of SZDP.The integration of network pharmacology and metabolomics was conducted to investigate the mechanisms.Molecular docking and molecular dynamics simulations were used to validate the binding energy between the compounds of SZDP and the associated targets.Results:The results showed that SZDP was able to improve T wave voltage,reverse CMI abnormalities in ejection fraction and fractional shortening,and restore histopathological heart damage.Metabolomics results indicated that disturbances of metabolic profile in CMI rats were partly corrected after SZDP administration,mainly affecting purine metabolism.13-Docosenamide may be the potential metabolic biomarker of the therapeutic application of SZDP for CMI.Integrating network pharmacology and metabolomics,thiopurine S-methyltransferase(TPMT),xanthine dehydrogenase/oxidase(XDH),bifunctional purine biosynthesis protein ATIC(ATIC),and cytochrome p4501A1(CYP1A1)were identified as possible targets of SZDP to exert therapeutic effects by enhancing the metabolic levels of L-Tryptophan,Deoxyribose 1-phosphate and Phosphoribosyl formamidocarboxamide.Conclusion:SZDP has a therapeutic effect on CMI by regulating metabolite levels,acting on the targets of TMPT,XDH,ATIC,and CYP1A1,and reducing cardiomyocyte injury and myocardial fibrosis.

Deciphering the molecular mechanisms of Simiaowan in the treatment of hyperuricemia: in vivo and in silico approaches

Background:Simiaowan(SMW),a well-known traditional Chinese medicine,has been employed to treat hyperuricemia(HUA)and gout for centuries.However,the bioactive components and underlying mechanisms have not been elucidated.The objective of this study was to identify the active components and potential mechanisms of SMW by integrating pharmacological experimentation,serum pharmacochemistry,network pharmacology and molecular docking.Methods:HUA rats modelling by high-fat/high-sugar diet and potassium oxonate/adenine oral administration were used to evaluate the pharmacodynamic effects of SMW.UPLC-Q-Exactive-MS/MS was employed to detect the bioactive components present in SMW-containing serum.Network pharmacology and molecular docking were utilized to elucidate the potential targets and underlying mechanisms.Results:SMW effectively ameliorated HUA rats via the inhibition of uric acid(UA)production,promotion of UA excretion,improvement of lipid and glucose metabolic abnormalities,antioxidant,anti-inflammatory and anti-insulin resistance effects.A total of 73 compounds detected in SMW-containing serum were identified as potential active components,with alkaloids,flavonoids,organic acids,and terpenoids emerging as the primary active ingredients.Totally 203 corresponding targets were obtained as SMW anti-HUA/gout targets,which mainly participated in apoptosis,insulin resistance,TNF,PI3K-Akt,HIF-1,NF-κB,MAPK,IL-17 and TLR signaling pathways.Molecular docking indicated that active compounds(e.g.berberine,phellodendrine,quercetin,formononetin,ferulic acid)had superior binding abilities to the key targets(e.g.solute carrier family 22 member 12(URAT1),solute carrier family 22 member 6(OAT1),ATP-binding cassette sub-family G member 2(ABCG2),solute carrier family 2,facilitated glucose transporter member 9(GLUT9),xanthine dehydrogenase/oxidase(XDH),transcription factor p65(RELA),toll-like receptor 4(TLR4),prostaglandin G/H synthase 2(PTGS2),caspase-3(CASP3),insulin(INS)).Conclusion:SMW exerted regulatory influence over the disease network of HUA and gout through a multiplicity of components,targets,and pathways.Alkaloids,flavonoids,organic acids,and terpenoids were the primary active components,exerting anti-HUA/gout effects via antioxidant,anti-inflammatory,anti-insulin resistance,anti-apoptosis,inhibition of UA production,and promotion of UA excretion.This study revealed the active components and molecular mechanisms of SMW,providing insights into the development of natural products derived from SMW.

半夏泻心汤含药血清对胃癌细胞增殖影响的时效及量效关系研究

采用中药血清药理学方法,观察半夏泻心汤(Banxiaxiexin Decoction,BXD)含药血清对不同胃癌细胞体外增殖的影响,并探讨用于胃癌细胞药效观察的BXD含药血清制备条件。将BXD高、中、低灌胃后30、60、90、120、150 min采血,制备含药血清。根据灌胃剂量和采血时间对MGC803、MKN45、AGS和HGC27细胞分别设5%~50%含药血清组,采用CCK8检测不同灌胃剂量、不同采血时间、不同体积分数的BXD含药血清对胃癌细胞抑制增殖的作用。实验结果显示,与其他时间点相比,BXD含药血清均在采血时间120 min时对胃癌细胞的抑制增殖作用最强;与BXD低剂量组相比,BXD中剂量组对胃癌细胞的抑制增殖作用强,且与BXD高剂量组无显著性差异。BXD中剂量组灌胃120 min后采血的含药血清按照5%~50%的10个浓度梯度,分析对不同胃癌细胞的抑制作用其IC 50值均为20%。不同灌胃剂量、不同采血时间和不同体积分数的含药血清对不同胃癌细胞的抑制作用,均显示BXD中剂量组,采血时间120 min和20%的体积分数对胃癌细胞的抑制作用最强。由此,BXD中剂量组灌胃,采血时间120 min,体积分数为20%的含药血清对胃癌细胞的药效作用最好。

中药逆转肝纤维化的分子机制

肝纤维化是许多慢性肝病进展为肝硬化的中间环节,虽然目前尚未研发出能被广泛接受和有效的化学或生物制剂来逆转肝纤维化,但其在中药治疗方面已取得了巨大的进步。本文对不同草药提取物、单味中药、中成药逆转肝纤维化的分子机制进行了阐述,包括抑制肝脏炎症、抗脂质过氧化损伤、抑制肝星状细胞活化和增殖、调节促纤维化因子的合成和分泌、调节合成和细胞外基质的降解等5个方面,以期为未来治疗肝纤维化提供更精准的选择。

Serum containing Tongqiaohuoxue decoction suppresses glutamate-induced PC12 cell injury

Glutamate application is an established method of inducing PC12 cell injury. PC12 cells were cultured with serum containing Tongqiaohuoxue decoction consisting of moschus, Carthamus tinctonus, Rhizoma chuanxiong, Semen pruni persicae, and Radix Paeoniae Rubra. After 24 hours of co-cultivation, glutamate （12.5 mM） was added to the culture medium. We found that serum containing Tongqiaohuoxue decoction prevented the increase in reactive oxygen species, and the decreases in superoxide dismutase and Na＋-K＋-ATPase activity, induced by glutamate. It also reduced the concentration of malondialdehyde, enhanced the mitochondrial transmembrane potential, inhibited the elevation of cellular calcium, and decreased phosphorylation of calmodulin-dependent protein kinase I1. Thus, serum containing Tongqiaohuoxue decoction had protective effects on cell proliferation and membrane permeability in glutamate-injured PC12 cells.

阿托伐他汀对脑血管狭窄疗效分析及TCD诊断作用研究

目的探讨阿托伐他汀对大脑中动脉狭窄患者的治疗效果以及TCD在诊断中的应用价值。方法回顾性分析2015年12月至2017年1月我院神经内科因缺血性脑血管疾病收治的193例患者的临床资料,其中经CTA检查及结合临床症状确诊的脑血管狭窄患者128例。依据脑血管狭窄治疗用药不同分为观察组(57例)和对照组(71例)。对照组给予脑血管狭窄常规治疗,观察组在此基础上给予阿托伐他汀钙20 mg每晚1次。检测治疗前后患者血脂水平,TCD辅助检查两组患者MCA狭窄情况及血流速度。结果治疗后,两组患者的TC、TG和LDL水平均明显下降(P<0.05),且观察组TC、TG和LDL显著低于对照组(P<0.05)。观察组MCA狭窄好转率显著高于对照组(χ~2=4.174,P=0.041),病程进展率显著低于对照组(χ~2=4.140,P=0.042),两组患者病情稳定率差异无统计学意义(χ~2=0.543,P=0.461)。TCD检查确诊MCA狭窄的特异度为79.7%,敏感度为81.5%,尤其对于中、重度狭窄,敏感度更高,为94.5%。结论阿托伐他汀药物在一定程度上可逆转或稳定MCA狭窄,减少缺血性脑卒中事件的发生;TCD可有效辅助诊断,判断恢复情况。

基于血清药物化学和网络药理学研究双虎肿痛宁酊剂抗炎镇痛的药效物质和作用机制

目的 基于超高效液相-四极杆飞行时间串联质谱联用技术(UPLC-Q-TOF-MS/MS)方法定性鉴定双虎肿痛宁酊剂的入血药效成分,并结合网络药理学探究其抗炎镇痛的潜在作用机制。方法 通过对比含药血清、空白血清的色谱图,并结合PubChem、HMDB、MassBank数据库二级谱图及对照品裂解信息,分析鉴定双虎肿痛宁酊剂的入血成分。借助相关数据库对入血成分、疾病进行靶点收集筛选,运用Cytoscape软件进行网络可视化处理;对共有靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 在给药血清中初步鉴定出阿魏酸、新乌头碱、次乌头碱、4-羟基肉桂酸、甲芬那酸5个原形成分;涉及白细胞介素-17(IL-17)、肿瘤坏死因子(TNF)等信号通路,改善、调节疼痛和炎症反应等过程,发挥药理作用。结论 本实验通过结合UPLC-Q-TOF-MS/MS和网络药理学的方法明确了双虎肿痛宁酊剂的入血成分,初步阐明了双虎肿痛宁酊剂抗炎镇痛的作用机制,为临床应用提供了参考。

优化溃结方对溃疡性结肠炎气滞血瘀模型大鼠的影响及其作用机制研究

背景经验方优化溃结方能有效提高溃疡性结肠炎(UC)患者生活质量,促进肠黏膜愈合和临床缓解,但其作用机制尚不完全明确。目的探讨优化溃结方对UC气滞血瘀模型大鼠的影响及其作用机制。方法2023年9—10月,选取SPF级雄性SD大鼠70只并采用随机数字表法将其随机分为正常组、模型组、柳氮磺胺吡啶组、低剂量组、标准剂量组、益气组、活血组,每组10只。采用三硝基苯磺酸(TNBS)/乙醇二次致炎法结合束缚法建立UC气滞血瘀模型。正常组大鼠在造模时使用0.9%氯化钠溶液灌肠,并与其他组大鼠进行同步抓取、固定,在造模成功后给予等体积水灌胃,1次/d,共灌胃14次;模型组大鼠在造模成功后给予等体积水灌胃,1次/d,共灌胃14次;柳氮磺胺吡啶组、低剂量组、标准剂量组、益气组、活血组大鼠分别在造模成功后给予柳氮磺胺吡啶药液0.54 g/kg灌胃、低剂量优化溃结方药液0.837 g/kg、标准剂量优化溃结方药液1.674 g/kg灌胃、黄芪药液1.8 g/kg、红花药液0.9 g/kg,均为1次/d,均灌胃14次。采用高精度透射电镜观察7组大鼠干预后结肠组织超微结构变化,并比较7组大鼠干预后结肠组织趋化因子受体4(CXCR4)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、转化生长因子激酶1(TAK1)表达水平。结果低剂量组、标准剂量组大鼠干预后结肠组织超微结构趋于正常。模型组大鼠干预后结肠组织CXCR4、VEGFA、TAK1蛋白灰度比值、mRNA相对表达量高于正常;柳氮磺胺吡啶组、低剂量组、标准剂量组、益气组、活血组大鼠干预后结肠组织CXCR4、VEGFA、TAK1蛋白灰度比值、mRNA相对表达量低于模型组(P<0.05);标准剂量组大鼠干预后结肠组织CXCR4、VEGFA、TAK1蛋白灰度比值低于柳氮磺胺吡啶组,活血组大鼠干预后结肠组织VEGFA、TAK1 mRNA相对表达量低于柳氮磺胺吡啶组(P<0.05)。结论优化溃结方及其益气、活血组分可有效降低UC气滞血瘀模型大鼠结肠组织CXCR4、VEGFA、TAK1表达水平,其治疗作用可能是益气组分、活血组分通过协同调节结肠组织中CXCR4、VEGFA、TAK1表达水平而实现。

芍药甘草汤缓急止痛有效部位筛选及其入血成分分析

目的研究芍药甘草汤缓急止痛的药效物质基础。方法通过大鼠离体肠张力实验考察芍药甘草汤全方、芍药甘草汤乙酸乙酯萃取物及其大孔树脂流出部位和大孔树脂90%乙醇洗脱部位(给药质量浓度按生药量计均为13.44 g/mL)的解痉效果。通过小鼠醋酸扭体实验评价大孔树脂流出部位和大孔树脂90%乙醇洗脱部位(给药剂量以生药量计均为2.4 g/kg)的止痛效果,并检测小鼠血清中肿瘤坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素1β(IL-1β)、前列腺素E(2 PGE2)、环氧合酶2(COX-2)水平。采用高效液相色谱-飞行时间质谱技术对灌胃大孔树脂90%乙醇洗脱部位后的小鼠血清进行原型成分及代谢产物鉴定。结果大鼠体外实验中,以大孔树脂90%乙醇洗脱部位的解痉效果最好,其小肠张力抑制率显著高于大孔树脂流出部位(P<0.05),且与芍药甘草汤全方比较差异无统计学意义(P>0.05)。小鼠醋酸扭体实验中,与模型组比较,大孔树脂90%乙醇洗脱部位组小鼠的扭体次数显著减少(P<0.05),扭体潜伏期显著延长(P<0.05),且小鼠血清中COX-2、IL-1β、PGE2、TNF-α水平均显著降低(P<0.05)。从血清中共鉴定出包括芍药苷、甘草酸等在内的10种原型成分和包括羟基化甘草苷、葡萄糖醛酸化甘草素等在内的22种代谢产物。结论芍药甘草汤缓急止痛的有效部位为乙酸乙酯萃取物的大孔树脂90%乙醇洗脱部位,甘草酸、芍药苷等10种成分可能是其药效物质基础。

基于网络药理学的甘草附子汤治疗类风湿关节炎的作用机制

目的通过网络药理学探讨甘草附子汤治疗类风湿关节炎(RA)的作用机制。方法采用网络药理学方法,构建药物-靶点-疾病网络,进行富集分析,研究药物对靶点的作用、靶点的功能与疾病的相关关系,探讨甘草附子汤治疗RA涉及靶点和主要成分。结果从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中筛选出有效成分127个,得到49个甘草附子汤治疗RA潜在靶点,建立“药物-靶点-疾病”网络,得到135节点,473条边。筛选出Degree值较高的槲皮素、山柰酚、柚皮素等10个活性成分,以及白细胞介素(IL)-6、表皮生长因子受体(EGFR)、IL-1β、TP53、过氧化物酶体增生激活受体(PPARG)等30个Degree值较高的靶点。结论甘草附子汤治疗RA主要与脂多糖反应、血管调节和血管反应、脂质与动脉粥样硬化、糖尿病晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路和辅助性T细胞(Th17)细胞分化等信号通路有关,为扩大甘草附子汤的临床应用提供理论依据。

中药活性成分调控糖代谢抗胆管癌的分子机制

胆管癌是一种高度异质性的肿瘤,其发病隐匿、病情凶险、恶性程度高、预后极差。葡萄糖是胆管癌增殖和转移的主要能量来源,胆管癌细胞在快速增殖过程中其糖代谢途径会被重新编辑,产生大量能量以满足自身需求。中医药在胆管癌治疗中具有独特优势,中药活性成分已被证明可以通过调控糖代谢抑制胆管癌的发生和发展。本文对胆管癌中的糖代谢特点和中药活性成分调控糖代谢抗胆管癌进行综述,为胆管癌的治疗提供新思路。

基于网络药理学结合UHPLC-MS/MS探讨清感童饮的抗炎作用

目的 基于血清药理学和网络药理学探究清感童饮的体外抗炎作用。方法 采用血清药理学评价方法,验证清感童饮含药血清对脂多糖(LPS)诱导的小鼠巨噬细胞(RAW264.7)释放一氧化氮(NO)、细胞坏死因子α(TNF-α)、白细胞介素6(IL-6)的影响。利用液质联用(UHPLC-MS/MS)技术对清感童饮指标性成分进行含量测定,并根据这些成分进行网络药理学分析,对清感童饮有效成分发挥抗炎作用的潜在靶点及作用通路进行预测。结果 细胞实验证明清感童饮可明显降低NO、TNF-α、IL-6水平(P<0.05,P<0.01,P<0.001)。清感童饮中含量较高的成分为连翘酯苷A、牛蒡苷、绿原酸、野黄芩苷、没食子酸、迷迭香酸、芍药内酯苷、连翘苷。清感童饮中17个活性成分与炎症的交集靶点共215个,主要涉及ALB、VEGFA、IL-6、TNF-α等31个核心靶点,调节AGE-RAGE、PI3K-Akt、MAPK信号通路等多种通路发挥抗炎作用。结论 清感童饮具有多成分-多靶点发挥抗炎作用的特点。

新风胶囊对类风湿关节炎疗效机制的研究现状

新风胶囊(XFC)是一种用于治疗类风湿关节炎(RA)的中药复方制剂,临床研究已证实XFC对RA的治疗有其独特疗效。该文从药学研究、质量控制、药代动力学、药效学、毒理学、临床观察和机制等方面阐述XFC的研究概况,旨在加深对该药的认识,为研究人员和临床医生提供有价值的依据。

基于血清药物化学和网络药理学的知母-黄柏药对盐炙前后治疗2型糖尿病药效物质基础及作用机制分析

目的基于液质联用技术对生知母-生黄柏、盐知母-盐黄柏药对水提液灌胃给药后大鼠入血成分分析,结合网络药理学预测盐炙在知母-黄柏药对治疗2型糖尿病的影响,并通过体外实验进行初步验证。方法大鼠连续灌胃给药生知母-生黄柏药对、盐知母-盐黄柏药对水提液2次,中间间隔1 h,末次给药60 min后腹主动脉取血,用甲醇沉淀蛋白法处理后复溶,采用色谱柱Shim-pack GIST C 18(4.6 mm×150 mm,5μm);流动相A相为0.1%甲酸水,B相为0.1%甲酸-乙腈;梯度洗脱,正、负离子全扫描模式,质量扫描范围m/z 100~1500。结合数据库二级谱图及文献,分析鉴定生知母-生黄柏、盐知母-盐黄柏药对的入血成分。检索2型糖尿病疾病靶点,对入血成分和疾病的交集靶点进行蛋白质互作网络分析、GO、KEGG通路富集分析,构建“入血成分-靶点”网络图,运用AutoDock软件对筛选出的核心成分和核心靶点进行分子对接验证。验证实验以HepG2细胞为实验对象,胰岛素联合高糖诱导胰岛素抵抗模型,CCK8法检验盐炙前后知母-黄柏药对对细胞增殖影响,Western blot检测PI3K-AKT信号通路相关蛋白的表达情况。结果生知母-生黄柏药对水提液大鼠血清中鉴定出15种原型成分,1个芒果苷代谢成分。盐知母-盐黄柏药对水提液大鼠血清中鉴定出17个原型成分,1个芒果苷代谢成分。盐炙后入血成分中芒果苷、小檗碱、3-异丁基戊二酸等成分含量较生品高。KEGG和GO结果显示,知母-黄柏药对治疗2型糖尿病可能与RNA聚合酶的转录调控、炎症反应、AGE-RAGE、PI3K-AKT、胰岛素抵抗等通路有关。细胞实验表明盐炙前后知母-黄柏药对可以上调p-PI3K/PI3K、p-AKT/AKT、GLUT4蛋白表达,且盐炙组效果优于生品组。结论初步阐释了知母-黄柏药对盐炙前后入血成分,阿魏酸、小檗碱、小檗红碱、芒果苷与mTOR、SIRT1、EGFR、PPARA等可能是知母-黄柏药对盐炙后增强2型糖尿病治疗效果的主要成分和靶点,其机制可能是增强了PI3K-AKT等相关通路的作用,为知母-黄柏药对盐炙前后药效物质基础研究及临床应用提供重要参考。

楮实子含药血清对成骨细胞功能的影响

目的 研究楮实子对体外培养的成骨细胞增殖、分化及其功能的影响,为楮实子在骨代谢疾病中的应用提供实验依据。方法 采用酶消化法培养大鼠成骨细胞,MTT比色法检测不同浓度(5%、10%和20%)楮实子含药血清对细胞增殖的影响,并据此选择最佳浓度进行后续实验;以AKP试剂盒检测成骨细胞AKP活性、以茜素红染色检测成骨细胞形成矿化结节数量;Western blot法检测成骨细胞功能指标基因如成骨细胞特异性转录因子(osterix,OSX)、I型胶原(collagen type I, Coll-I)、碱性磷酸酶(alkaline phosphatase, ALP)、骨桥蛋白(osteopontin, OPN)、骨保护素(osteoprotegerin, OPG)和骨钙素(osteocalcin, OCN)等蛋白的表达水平。结果 楮实子含药血清可显著促进成骨细胞增殖(P<0.01)、提高AKP分泌水平(P<0.01)、促进矿化结节形成(P <0.01),并显著上调OSX、Coll-I、ALP、OPN和OPG等成骨功能指标相关基因的蛋白表达(P<0.05)。结论 楮实子含药血清能提高成骨细胞功能,具有较好的促成骨活性。

基于网络药理学研究“黄芪-大黄-积雪草”角药治疗慢性肾功能衰竭的作用机制

目的通过网络药理学方法研究“黄芪-大黄-积雪草”治疗慢性肾功能衰竭(chronic renal failure,CRF)的核心成分、作用靶点、信息通路及作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取并筛选“黄芪-大黄-积雪草”角药的活性成分及作用靶点,CRF相关靶基因通过GeneCards、人类孟德尔遗传数据库和疾病关联数据库(GAD)数据库检索,对CRF的相关靶点及“黄芪-大黄-积雪草”角药的作用靶点取交集,其中蛋白信息转换成基因信息通过Uniprot数据库完成,绘制Venny图。将靶点导入STRING数据库制作蛋白质相互作用(PPI)网络图,通过Cytoscap3.9.1软件对PPI网络进一步分析,得到关键蛋白靶点。借助京都基因与基因组百科全书(KEGG)与注释、可视化和集成发现数据库(DAVID)数据库进行基因本体(GO)功能及KEGG信号通路富集分析。应用Cytoscape 3.9.1软件构建“黄芪-大黄-积雪草”角药治疗CRF的疾病-通路-靶点-成分-药物网络图。结果获得“黄芪-大黄-积雪草”共39种活性成分、226个靶点,其中黄芪-大黄-积雪草角药治疗CRF关键靶点82个。PPI网络图显示78个节点,互作关系269条,平均度值为6.9。GO分析共得到富集结果614个,KEGG分析得到142条信号通路,涉及晚期糖基化终未产物(AGE-RAGE)信号通路、癌症通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、白细胞介素(IL)-17信号通路、Toll样受体信号通路等。结论“黄芪-大黄-积雪草”角药可通过多种成分、多个靶点、多条信号通路治疗CRF。

荆防颗粒治疗急性缺血性脑卒中作用机制的网络药理学分析

目的基于网络药理学探究荆防颗粒治疗急性缺血性脑卒中的药理机制。方法通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)数据库筛选荆防颗粒活性成分及其靶点,利用Cytoscape软件可视化分析。通过在线人类孟德尔遗传(OMIM)、GeneCards、DrugBank数据库获取急性缺血性脑卒中相关靶点。通过String平台进行蛋白质相互作用分析,构建蛋白质相互作用网络。利用Metascape数据库对关键靶点进行GO和KEGG富集分析。结果经筛选荆防颗粒有215个基因靶点,急性缺血性脑卒中有1256个基因靶点,获得二者114个交集靶点,其中15个为核心靶点(TP53、STAT3、AKT1、IL-6、TNF、ESR1、MAPK3、MAPK1、IL-1B、FN1、CCL2、EGFR、ICAM1、MAPK8、PTGS2)。GO功能条目1888个,KEGG富集通路97条,关键生物学过程有炎症、凋亡、氧化应激等。结论荆防颗粒可通过多靶点、多通路的方式治疗急性缺血性脑卒中。

小建中汤治疗脾胃虚寒型消化性溃疡作用机制的网络药理学研究及验证

目的以网络药理学研究结果为基础,对小建中汤中桂枝、甘草、生姜、大枣、白芍、饴糖6种中药开展深入研究,以期为小建中汤治疗脾胃虚寒类消化性溃疡作用机制研究提供新的依据及方向。方法基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)获取小建中汤6种中草药的相关化学成分,并在Swiss Target Prediction中搜索活性化学成分潜在靶点;通过GeneCards数据库检索消化性溃疡、十二指肠溃疡、胃溃疡靶点和脾胃虚寒型消化性溃疡主要症状靶点;筛选出疾病主要症状、疾病和药物的共同靶点;运用Cytoscape Version 3.7.2软件绘制药物-化合物-靶点网络;利用STRING数据库绘制构建蛋白质相互作用(PPI)网络分析共同靶点之间的相互作用,找出可能的关键基因;利用R软件进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,分析治疗的作用机制;运用AutoDock及Pymol对关键靶点与相应活性成分进行分子对接验证,实验验证小建中汤对靶点蛋白、白细胞介素(IL)-6表达的影响。结果分析得到小建中汤具有128个活性化学成分作用于75个脾胃虚寒型消化性溃疡靶点,其中TP53、血管内皮生长因子(VEGF)、IL-6、胱天蛋白酶3(CASP3)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、信号转导因子和转录激活因子3(STAT3)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、白蛋白(ALB)、表皮生长因子受体(EGFR)与非受体酪氨酸激酶(SRC)为核心靶点;而小建中汤治疗脾胃虚寒型消化性溃疡的核心活性成分是儿茶素、羟黄酮、芍药内苷C、拟雌内酯、草果甲素等;靶点基因主要富集于脂筏、膜微结构域、膜区、细胞小凹等细胞区域,作用于跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性、蛋白酪氨酸激酶活性、跨膜受体蛋白激酶活性、磷酸酶结合等分子功能,重要的是具有调节平滑肌细胞增殖和氧化应激反应。生物学通路则主要集中于磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-Akt信号通路、缺氧诱导因子(HIF)-1信号通路、C型凝集素受体信号通路、胃癌等通路。分子对接结果显示,筛选的主要核心成分与其对应靶蛋白具有较好的结合活性。结论小建中汤通过网络药理学预测的作用机制多成分、多靶点、多通路治疗脾胃虚寒型消化性溃疡;实验验证小建中汤可下调靶点蛋白IL-6的表达,抑制肠上皮损伤。