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小麦NAC转录因子的基因克隆与序列分析
被引量:
6
1
作者
史红飞
高翔
+6 位作者
陈其皎
董剑
赵万春
李晓燕
王延鹏
臧闻
李志业
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期395-401,共7页
为了深入研究小麦中NAC家族转录因子基因,针对NAC基因家族成员,设计了覆盖其全长编码区的1对特异引物,从陕253小麦品种中克隆了2条大小分别为1 463、1549 bp的片段,命名为TaNAC2、TaNAC4(GenBank登录号为HQ872050-HQ872051)。序列分析表...
为了深入研究小麦中NAC家族转录因子基因,针对NAC基因家族成员,设计了覆盖其全长编码区的1对特异引物,从陕253小麦品种中克隆了2条大小分别为1 463、1549 bp的片段,命名为TaNAC2、TaNAC4(GenBank登录号为HQ872050-HQ872051)。序列分析表明,这2个序列包含典型NAC的完整编码序列,包括两个内含子,具有完整的开放阅读框;推导的氨基酸序列分别为383、405个,这2个基因在N-端均具有NAC基因的典型DNA结合结构域,即NAC结构域,且氨基酸序列在该结构域的A、B、C、D、E5个亚区高度保守,仅在C亚区出现一个氨基酸的差异L-M,而且在C-D区出现罕见的半胱氨酸变异,此发现对于小麦品质的研究非常重要。同时发现这2个NAC类转录因子都不含有核定位信号(NLS),但是有相关的转录调控功能区域。通过系统进化树分析,证实克隆序列属于NAC基因家族成员,并且发现的TaNAC4属于NAC转录因子家族的NAM亚组,TaNAC2属于NAC转录因子家族的CUC亚组。
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关键词
小麦
陕253
NAC转录因子
基因克隆
序列分析
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题名
小麦NAC转录因子的基因克隆与序列分析
被引量:
6
1
作者
史红飞
高翔
陈其皎
董剑
赵万春
李晓燕
王延鹏
臧闻
李志业
机构
西北农林科技大学农学院
陕西省小麦工程技术研究中心/陕西省小麦新品种培育工程研究中心
出处
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期395-401,共7页
基金
陕西省"13115"科技创新工程重大项目(2007ZDKG-OI)
现代农业产业技术体系建设专项(CARS-03)
文摘
为了深入研究小麦中NAC家族转录因子基因,针对NAC基因家族成员,设计了覆盖其全长编码区的1对特异引物,从陕253小麦品种中克隆了2条大小分别为1 463、1549 bp的片段,命名为TaNAC2、TaNAC4(GenBank登录号为HQ872050-HQ872051)。序列分析表明,这2个序列包含典型NAC的完整编码序列,包括两个内含子,具有完整的开放阅读框;推导的氨基酸序列分别为383、405个,这2个基因在N-端均具有NAC基因的典型DNA结合结构域,即NAC结构域,且氨基酸序列在该结构域的A、B、C、D、E5个亚区高度保守,仅在C亚区出现一个氨基酸的差异L-M,而且在C-D区出现罕见的半胱氨酸变异,此发现对于小麦品质的研究非常重要。同时发现这2个NAC类转录因子都不含有核定位信号(NLS),但是有相关的转录调控功能区域。通过系统进化树分析,证实克隆序列属于NAC基因家族成员,并且发现的TaNAC4属于NAC转录因子家族的NAM亚组,TaNAC2属于NAC转录因子家族的CUC亚组。
关键词
小麦
陕253
NAC转录因子
基因克隆
序列分析
Keywords
shaan253
NAC transcription factor
Gene clone
Sequence analysis
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
S336 [农业科学—作物遗传育种]
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作者
出处
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被引量
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1
小麦NAC转录因子的基因克隆与序列分析
史红飞
高翔
陈其皎
董剑
赵万春
李晓燕
王延鹏
臧闻
李志业
《麦类作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
6
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