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内蒙古小花棘豆遗传多样性的ISSR分析 被引量:19
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作者 卢萍 赵萌莉 +2 位作者 韩国栋 曹雪松 张丽 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期1102-1107,共6页
应用ISSR分子标记对内蒙古西部地区小花棘豆(Oxytropis glabra DC.)6个地理种群进行了遗传多样性研究.结果表明:小花棘豆具有较高的遗传多样性;14个引物共扩增出327个位点,物种水平上Nei's基因多样性指数为0.1972,Shannon多样性指数... 应用ISSR分子标记对内蒙古西部地区小花棘豆(Oxytropis glabra DC.)6个地理种群进行了遗传多样性研究.结果表明:小花棘豆具有较高的遗传多样性;14个引物共扩增出327个位点,物种水平上Nei's基因多样性指数为0.1972,Shannon多样性指数为0.3287;种内总基因多样性为0.1976,种群内基因多样性为0.1653,83.67%的遗传变异存在于种群内,16.33%的遗传变异存在于种群间,种群间的遗传分化系数为0.1633,基因流为2.5613,6个种群间有一定遗传分化,但遗传漂变不会引起遗传分化.UPGMA遗传距离聚类结果表明,生态地理条件相似的种群优先聚集. 展开更多
关键词 小花棘豆 ISSR 遗传多样性 PCR Nei指数 shannon指数
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不同油葵品种对盐碱地根际土壤酶活性及微生物群落功能多样性的影响 被引量:37
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作者 张旭龙 马淼 +3 位作者 吴振振 张志政 高睿 石灵玉 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期1659-1666,共8页
通过盆栽试验,研究了新葵4号、新葵6号、新葵10号和美国矮大头4个油葵品种对盐碱地土壤理化、酶活性和微生物群落功能多样性的影响,以期筛选出更适宜改善盐碱地土壤质量的油葵品种。结果表明,种植新葵6号对降低盐碱地根际土壤pH值、提... 通过盆栽试验,研究了新葵4号、新葵6号、新葵10号和美国矮大头4个油葵品种对盐碱地土壤理化、酶活性和微生物群落功能多样性的影响,以期筛选出更适宜改善盐碱地土壤质量的油葵品种。结果表明,种植新葵6号对降低盐碱地根际土壤pH值、提高土壤全氮含量和蔗糖酶活性的效果最为显著,新葵4号对提高根际土壤碱解氮、速效磷、速效钾含量以及脲酶和磷酸酶活性的效果最为显著;种植这4个品种的油葵均能显著(72 h,P<0.05)提高盐碱地根际土壤微生物对31种碳源的平均利用率(Average well color development,AWCD),并呈现如下规律:新葵4号>新葵6号>美国矮大头>新葵10号>CK。种植这4个油葵品种均不同程度地提高了盐碱地根际土壤微生物群落的Shannon多样性指数(H)、Shannon优势度指数(D)和碳源利用丰富度指数(S),并呈现出相似的规律:新葵4号根际土的微生物多样性指数最大,而CK的最小,且显著高于CK。主成分分析表明,种植油葵改善了盐碱地根际土壤微生物的群落组成;碳水化合物、氨基酸、羧酸类化合物和聚合物是盐碱地土壤微生物利用的主要碳源。因此,在盐碱地中种植油葵可提高相关土壤理化性质和酶的活性,改善微生物功能多样性,优化盐碱地微生物的群落结构,尤其是种植新葵4号对盐碱地的改良效果最为显著。 展开更多
关键词 油葵 土壤酶活 BIOLOG 盐碱地 shannon多样性指数
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城市化对本土植物多样性的影响——以廊坊市为例 被引量:19
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作者 彭羽 刘雪华 +2 位作者 薛达元 邵小明 姜炎彬 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期723-729,共7页
虽然城市化对生物多样性影响的研究在发达国家是一个重要的研究领域,但是在发展中国家这方面的研究不多。通过案例研究,分析本土植物多样性沿着城市化梯度的变化,及其与生境土壤因子的关系。在廊坊市,中国北部一个快速城市化的地区,沿... 虽然城市化对生物多样性影响的研究在发达国家是一个重要的研究领域,但是在发展中国家这方面的研究不多。通过案例研究,分析本土植物多样性沿着城市化梯度的变化,及其与生境土壤因子的关系。在廊坊市,中国北部一个快速城市化的地区,沿着中心城区、城区、郊区、远郊区城市化梯度,每个梯度选取6个样地进行本土植物多样性调查,记录种类数、多样性和种类组成,并分析了多样性指数。与远郊区相比,中心城区失去了88%的物种,物种多样性下降了78%,城区物种多属于禾本科、藜科等耐践踏、耐土壤紧实度的物种。远郊区的本土植物属于45个科,科数大于城区物种。相似性指数表明,城区和郊区大部分物种相同,但是远郊区差异较大。DCCA分析表明,土壤总氮、有机质含量是影响物种城市化分布的主要因素。城市化促进了物种分布的匀质化。 展开更多
关键词 城市化 本土植物多样性 shannon指数 相似性指数 土壤特征
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外来入侵植物紫茎泽兰对植物多样性的影响 被引量:58
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作者 丁晖 徐海根 刘志磊 《生态与农村环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期29-32,75,共5页
采用样方法调查了云南省和四川省5个受紫茎泽兰入侵的样地中草本植物和灌木的种类和数量,分析了其物种丰富度指数、多样性指数和均匀度指数。结果表明,5个样地采得本地植物87种,其中常见本地植物32种,隶属19科31属。紫茎泽兰入侵造成5... 采用样方法调查了云南省和四川省5个受紫茎泽兰入侵的样地中草本植物和灌木的种类和数量,分析了其物种丰富度指数、多样性指数和均匀度指数。结果表明,5个样地采得本地植物87种,其中常见本地植物32种,隶属19科31属。紫茎泽兰入侵造成5种生境条件下物种丰富度指数下降显著或极显著。除样地d外,其他样地紫茎泽兰入侵的样方Simpson多样性指数和Shannon-Wiener多样性指数下降显著或极显著。而紫茎泽兰入侵对Pielou均匀度指数的影响则没有表现出明显的规律。不同生境条件下,植物群落的季节变化有所不同,以一年生草本植物为主的群落,其多样性指数和均匀度指数下降趋势较以多年生草本植物和灌木为主的群落更为明显。 展开更多
关键词 外来入侵植物 紫茎泽兰 物种丰富度指数 Simpson多样性指数 shannon—Wiener多样性指数 Pielou均匀度指数
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内蒙古扁蓿豆遗传多样性的ISSR分析 被引量:9
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作者 李鸿雁 李志勇 +2 位作者 王小丽 师文贵 邢建军 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期52-56,共5页
应用ISSR分子标记对分布于内蒙古不同地区的扁蓿豆(Medicago ruthenica)8个地理种群进行了遗传多样性研究.结果表明:扁蓿豆具有较高的遗传多样性;15个引物共扩增出363个位点,物种水平上Nei s基因多样性指数为0.198 9,Shannon多样性指数... 应用ISSR分子标记对分布于内蒙古不同地区的扁蓿豆(Medicago ruthenica)8个地理种群进行了遗传多样性研究.结果表明:扁蓿豆具有较高的遗传多样性;15个引物共扩增出363个位点,物种水平上Nei s基因多样性指数为0.198 9,Shannon多样性指数为0.303 7;种内总基因多样性为0.308 6,种群内基因多样性为0.198 9,64.45%的遗传变异存在于种群内,35.55%的遗传变异存在于种群间,种群间的遗传分化系数为0.355 5,基因流为0.906 4,8个种群间基因交流较少,遗传分化较强.UPGMA遗传距离聚类结果表明,生态地理条件相似的种群优先聚集. 展开更多
关键词 扁蓿豆 ISSR 遗传多样性 Neis指数 shannon指数
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高寒草甸植物群落中物种多样性与生产力关系研究 被引量:31
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作者 覃光莲 杜国祯 +3 位作者 李自珍 杨广运 马建云 娘毛加 《植物生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第z1期57-62,共6页
通过对高寒草甸植物群落中物种多样性 (Shannon多样性指数 )与生产力 (地上生物量 )的关系的研究表明 :多样性与生产力的总体关系呈对数线性增加关系 ,随着观测时间和环境条件 (生境 )的改变 ,多样性与生产力的关系会发生一些变化 ,这... 通过对高寒草甸植物群落中物种多样性 (Shannon多样性指数 )与生产力 (地上生物量 )的关系的研究表明 :多样性与生产力的总体关系呈对数线性增加关系 ,随着观测时间和环境条件 (生境 )的改变 ,多样性与生产力的关系会发生一些变化 ,这是因为当观测时间和环境条件不同时 ,物种丰富度和物种构成以及其它的生物或非生物条件发生了相应的变化 ,而它们对多样性和生产力各自造成的影响是非同步性的 (这种非同步实际上就是物种在时间和空间生态位上的分化 ) ;而可能由于高寒草甸生态系统的生长季较短 ,环境条件的改变比观测时间改变对多样性与生产力关系造成的影响更显著。观测时间和环境条件的不同可能是造成许多实验研究中得不到一个一致的多样性与生产力关系的主要原因。此外 ,通过对各种多样性指标进行综合分析可以对多样性与生产力的关系有一个更加全面的了解 。 展开更多
关键词 生物多样性 shannon指数 生产力 高寒草甸
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以湖南和湖北大豆[Glycine max(L.)Merr.]为例分析影响遗传多样性评价的因素 被引量:15
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作者 关媛 鄂文弟 +5 位作者 王丽侠 关荣霞 刘章雄 常汝镇 曲延英 邱丽娟 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期461-468,共8页
以不同来源大豆种质为材料进行基因组SSR分析,探讨大豆遗传多样性研究方法,旨在为科学评价大豆种质资源提供参考。当取样比例相同时,湖北大豆的遗传丰富度显著高于湖南大豆,但两省大豆遗传多样性指数之间没有显著差异。当取样量相同时,... 以不同来源大豆种质为材料进行基因组SSR分析,探讨大豆遗传多样性研究方法,旨在为科学评价大豆种质资源提供参考。当取样比例相同时,湖北大豆的遗传丰富度显著高于湖南大豆,但两省大豆遗传多样性指数之间没有显著差异。当取样量相同时,利用随机取样法比较,湖南大豆的遗传多样性显著高于湖北,而利用聚类取样比较,两省大豆的遗传多样性没有显著差异。在遗传多样性指数相同情况下,湖北大豆的遗传丰富度显著高于湖南大豆。取样数与三个遗传多样性评价参数(等位变异数、Shannon指数、He)之间均达到显著和极显著相关。以湖南大豆为例,估算出在大豆SSR遗传多样性分析中,至少需要50-60个样本,即占总体9.0%-10.8%的取样比例,才能代表总体的遗传变异。提出在评价大豆遗传多样性时,应用大豆样本数对其遗传多样性指数计算公式进行修正,建议将Shannon指数计算公式改为H=-lnN∑PilnPi(N为样本数)。根据修正公式分析,结果表明,湖北大豆的遗传多样性高于湖南大豆。 展开更多
关键词 大豆 遗传多样性 SSR标记 shannon指数 期望杂合度 等位变异数 取样量
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滇牡丹遗传多样性的ISSR分析 被引量:64
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作者 杨淑达 施苏华 +1 位作者 龚洵 周仁超 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期105-111,共7页
应用ISSR标记对中国西南地区特有植物滇牡丹 (Paeoniadelavayi)的遗传多样性进行了研究。从 100个引物中筛选出 10个用于正式扩增,在取自 16个自然居群和 1个迁地保护居群的 511个个体中,检测到 92个多态位点。在居群水平上,多态位点百... 应用ISSR标记对中国西南地区特有植物滇牡丹 (Paeoniadelavayi)的遗传多样性进行了研究。从 100个引物中筛选出 10个用于正式扩增,在取自 16个自然居群和 1个迁地保护居群的 511个个体中,检测到 92个多态位点。在居群水平上,多态位点百分率(PPB)为 44. 61%,Nei′s基因多样性指数 (H)和Shannon信息指数 (I)分别为0. 1657和 0. 2448。在物种水平上,多态位点百分率 (PPB)为 79. 31%,Nei′s基因多样性指数 (H)和Shannon信息指数(I)分别为 0. 2947和 0. 4355。居群间的遗传分化系数 (GST)达 0. 4349。结果表明:滇牡丹遗传多样性水平较高,居群间遗传分化较大。结合以前的研究结果,对滇牡丹的现状进行评估的结果显示,滇牡丹并不濒危。 展开更多
关键词 遗传多样性 滇牡丹 ISSR分析 shannon信息指数 多样性指数 中国西南地区 ISSR标记 多态位点 遗传分化系数 特有植物 迁地保护 自然居群 研究结果 百分率 s基因 水平 引物 物种
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土壤多样性的概念及其争议 被引量:16
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作者 陈杰 张学雷 +1 位作者 龚子同 王军 《地球科学进展》 CAS CSCD 2001年第2期189-193,共5页
介绍了 Ibánez等提出并发展的土壤多样性概念及其计量方法论 ,简要阐述了利用土壤多样性方法分析全球尺度的土壤空间变异和分布规律的尝试 ,进而概括了知名土壤学家和生态学家对土壤多样性及其计量方法论所提出的建设性意见和不... 介绍了 Ibánez等提出并发展的土壤多样性概念及其计量方法论 ,简要阐述了利用土壤多样性方法分析全球尺度的土壤空间变异和分布规律的尝试 ,进而概括了知名土壤学家和生态学家对土壤多样性及其计量方法论所提出的建设性意见和不同观点 ,最后讨论了土壤多样性在土壤学及其他相关学科的应用前景。 展开更多
关键词 土壤多样性 分布 空间变异 丰富度 均匀指数 shannon指数
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黄颡鱼RAPD标记及其遗传多样性的初步分析 被引量:53
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作者 宋平 潘云峰 +3 位作者 向筑 胡珈瑞 胡隐昌 蔡从利 《武汉大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2001年第2期233-237,共5页
以雌、雄黄颡鱼 DNA池为模板 ,从 42 2个引物中筛选出 6 1个 RAPD反应重复性好、带型清晰明亮的引物 ,这些引物可用于黄颡鱼的分子标记或鉴定 .采用 10~ 11个引物先后对两批黄颡鱼 (简称群体 A和群体 B)进行群体 RAPD多样性分析 .在群... 以雌、雄黄颡鱼 DNA池为模板 ,从 42 2个引物中筛选出 6 1个 RAPD反应重复性好、带型清晰明亮的引物 ,这些引物可用于黄颡鱼的分子标记或鉴定 .采用 10~ 11个引物先后对两批黄颡鱼 (简称群体 A和群体 B)进行群体 RAPD多样性分析 .在群体 A(2 1尾 )中共检测到 95个位点 ,其中 2 7个为多态位点占总位点数2 8.42 % ,其群体 Nei& L i氏遗传相似率为 90 .6 7% ,Shannon信息指数为 0 .0 918比特 ;在群体 B中共检出 46个位点 ,其中多态位点 12个占 2 6 .0 9% ,其群体 Nei& L i氏遗传相似率为 93.2 7% ,Shannon信息指数为 0 .0 6 70比特 . 展开更多
关键词 黄颡鱼 RAPD标记 遗传多样性 shannon信息指数 遗传标记 遗传相似率
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金钱槭和云南金钱槭遗传多样性比较研究 被引量:17
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作者 李珊 钱增强 +1 位作者 蔡宇良 赵桂仿 《植物生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期785-792,共8页
金钱槭属(Dipteronia)是我国特有少种属,属下仅金钱槭(D.sinensis)和云南金钱槭(D.dyeriana)两种。该文用RAPD标记揭示了金钱槭的遗传多样性和遗传结构,并与云南金钱槭的RAPD研究结果进行了比较。同时,对两物种遗传距离与地理距离的相... 金钱槭属(Dipteronia)是我国特有少种属,属下仅金钱槭(D.sinensis)和云南金钱槭(D.dyeriana)两种。该文用RAPD标记揭示了金钱槭的遗传多样性和遗传结构,并与云南金钱槭的RAPD研究结果进行了比较。同时,对两物种遗传距离与地理距离的相关性进行了分析,结果有助于阐释该属植物遗传变异的产生机制。研究显示,18条随机引物在17个金钱槭居群(226个个体)中检测到128个扩增位点,物种水平的多态位点比率为92.97%,在4个云南金钱槭居群(45个个体)中则检测到103个扩增位点,物种水平的多态位点比率为81.55%,金钱槭的多态位点比率高于云南金钱槭。相似性系数值、Shannon多样性指数和Nei基因多样性指数分析反映了与多态位点比率相一致的结果。AMOVA(Analysisofmolecularvariance)分析结果显示,金钱槭居群内、居群间的遗传变异分别占总变异量的56.89%和43.11%。云南金钱槭居群内、居群间的遗传变异分别占总变异量的57.86%和42.14%。Shannon多样性指数、Nei基因多样性指数的分析结果与AMOVA分析结果趋势相同。上述特征值揭示,金钱槭和云南金钱槭居群间的遗传分化均已达到较高水平,推测居群间低水平的基因流可能是导致上述现象产生的原因之一。遗传距离与地理距离的相关分析结果显示,金钱槭居群间的遗传距离与经度差异存在极显著水平的相关性(p<0.01),云南金钱槭居群间的遗传距离与地理隔离则无显著相关关系。说明在大尺度上遗传距离与地理距离相关而在小范围内则无上述关系,该结果可能与位于不同分布区内的物种所承受的生境选择压力不同有关。建议在对该属植物进行就地保护时,应设立多个保护点,保护自然居群及其周围生境;在迁地保护时,应通过加大居群间种子和幼苗的交换,人为创造基因交流和重组的条件,保存该属植物的遗传多样性。 展开更多
关键词 金钱槭 云南金钱槭 RAPD 遗传多样性 比较研究 shannon多样性指数 自然居群 遗传距离 遗传变异 显著水平
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天然蚬壳花椒种群遗传多样性的ISSR标记分析 被引量:8
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作者 李猛 王平 +2 位作者 孙吉康 周涛 费明亮 《中药材》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2159-2163,共5页
目的:对采自中国西南4省共12个天然蚬壳花椒种群进行遗传多样性分析。方法:采用ISSR分子标记技术,从100条引物中筛选出8条条带扩增稳定、清晰可见和多态性条带明显的引物用于后续实验。结果:8条引物共扩增出150个条带,147个多态性条... 目的:对采自中国西南4省共12个天然蚬壳花椒种群进行遗传多样性分析。方法:采用ISSR分子标记技术,从100条引物中筛选出8条条带扩增稳定、清晰可见和多态性条带明显的引物用于后续实验。结果:8条引物共扩增出150个条带,147个多态性条带,多态性条带百分率(PPB)为98.0%,各种群的PPB值为26.0%~62.0%。种内Shannon指数(Hsp)为0.4175,种群内Shannon指数(Hpop)为0.1328~0.3267。分子方差分析(AMOVA)显示,种群间与种群内的变异数分别是总遗传变异数的47.98%和52.02%。结论:天然蚬壳花椒在物种和种群水平上均具有较高的遗传多样性,天然蚬壳花椒种群间(内)存在着高度的遗传分化。本研究为蚬壳花椒的遗传多样性分析奠定了理论基础。 展开更多
关键词 蚬壳花椒 ISSR分子标记 shannon指数 遗传多样性
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新疆桑属植物栽培居群的遗传多样性研究 被引量:10
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作者 付大煦 张辉 +3 位作者 苏雪 陈学林 孙坤 陈家宽 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期376-381,共6页
应用RAPD分子标记对新疆不同地区栽培的桑属植物2种3个分类群共11个居群进行了遗传多样性研究.结果表明,新疆桑属栽培植物中虽然存在较为丰富的遗传多样性,多态位点比率 PPB 为87.39%,Shannon多样性指数为0.3997,但在栽培居群内的遗传... 应用RAPD分子标记对新疆不同地区栽培的桑属植物2种3个分类群共11个居群进行了遗传多样性研究.结果表明,新疆桑属栽培植物中虽然存在较为丰富的遗传多样性,多态位点比率 PPB 为87.39%,Shannon多样性指数为0.3997,但在栽培居群内的遗传变异水平相对较低;在不同居群间遗传变异水平存在很大差异,各居群的多态位点比率 PPB 为4.5%至45.95%,Shannon多样性指数为0.0312至0.2339;白桑 MorusalbaL. 及其变种鞑靼桑 MorusalbaL.var.tatarica 居群内的遗传变异水平远高于黑桑种 Morusnigra .新疆桑属植物栽培居群内较低的遗传变异水平与其采用扦插等无性繁殖方式有关.分析全部的遗传变异显示,11个栽培居群之间的基因分化系数 Gst 为0.3541,其中桑及其变种9个居群间的基因分化系数为0.4597,黑桑种2个居群间的基因分化系数为0.4728.AMOVA分析表明,在全部遗传变异中,黑桑种和白桑种2个物种之间的遗传变异占59.16%,居群间遗传变异为17.46%.遗传距离和聚类分析也表明,黑桑种和白桑种及其变种鞑靼桑之间存在很大的遗传分化. 展开更多
关键词 遗传变异 居群 栽培 桑属植物 遗传多样性 桑种 变种 shannon多样性指数 分类群 物种
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内蒙古西部地区砂珍棘豆(Oxytropis racemosa Turcz.)遗传多样性分析 被引量:5
14
作者 卢萍 赵萌莉 +3 位作者 韩国栋 曹珍 陈曦 王中南 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期160-165,共6页
用ISSR分子标记对内蒙古西部地区砂珍棘豆(Oxytropis racemosa Turcz)3个不同生境的地理种群进行了种群遗传多样性分析.结果表明砂珍棘豆种群具有较高的遗传多样性,14个ISSR引物扩增出284条带,Shannon多样性指数I=0.3630,Nei′s多样性指... 用ISSR分子标记对内蒙古西部地区砂珍棘豆(Oxytropis racemosa Turcz)3个不同生境的地理种群进行了种群遗传多样性分析.结果表明砂珍棘豆种群具有较高的遗传多样性,14个ISSR引物扩增出284条带,Shannon多样性指数I=0.3630,Nei′s多样性指数H=0.2234,物种总基因多样性(HT)为0.2236,种群内基因多样性(Hs)为0.2085,大部分遗传变异(93.27%)存在于种群内,6.73%的遗传变异存在于种群间.遗传分化系数(Gst)为0.0673,基因流(Nm)为6.9318,说明种群间有很强的基因交流,遗传漂变不会引起遗传分化.UPGMA遗传距离聚类结果表明,3个地理种群中,乌审旗和伊金霍洛种群先聚在一起,然后与鄂托克种群聚在一起,遗传距离与地理距离相关, 展开更多
关键词 砂珍棘豆 ISSR 遗传多样性 Nei指数 shannon指数
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森林生态系统物种多样性保育价值评估方法 被引量:34
15
作者 王兵 宋庆丰 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期155-160,共6页
生物多样性保育是当前国际生物学研究和实践的重要领域,目前计算生物多样价值均是人为因素占主导地位,不能确切反映实际价值。本文研究了基于Shannon-Wiener指数、增加濒危指数修正和增加特有种指数再次修正的3种对森林生态系统物种多... 生物多样性保育是当前国际生物学研究和实践的重要领域,目前计算生物多样价值均是人为因素占主导地位,不能确切反映实际价值。本文研究了基于Shannon-Wiener指数、增加濒危指数修正和增加特有种指数再次修正的3种对森林生态系统物种多样性保育价值评估方法,并以云南省第7次森林资源清查数据对3种方法进行了论证,结果表明增加特有种指数再次修正的方法能够科学合理地反映出物种多样性保育价值。 展开更多
关键词 物种多样性 保育价值 shannon.Wiener指数 濒危指数 特有种指数
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狼尾草属优质牧草SRAP遗传多样性分析与指纹图谱构建 被引量:8
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作者 石秀兰 陈平 +2 位作者 于得水 韩瑞宏 刘萍 《广东农业科学》 CAS 2018年第10期55-60,共6页
为探讨狼尾草属优质牧草的遗传多样性,利用SRAP分子标记方法,对13份狼尾草属优质牧草种质进行遗传多样性分析,并构建了DNA指纹图谱,结果表明:(1)从72对SRAP引物中筛选出16对引物进行PCR扩增,共扩增出278条带,其中有218条具有多态性,平... 为探讨狼尾草属优质牧草的遗传多样性,利用SRAP分子标记方法,对13份狼尾草属优质牧草种质进行遗传多样性分析,并构建了DNA指纹图谱,结果表明:(1)从72对SRAP引物中筛选出16对引物进行PCR扩增,共扩增出278条带,其中有218条具有多态性,平均多态率为78.42%。(2)Shannon信息指数(I)和Nei's基因多样性指数(H)平均值分别为0.5017、0.3306,说明13份供试品种(系)具有较为丰富的遗传多样性。(3)利用UPGMA构建13份狼尾草种质资源的聚类图,在遗传相似系数为0.86处可将13份狼尾草品种(系)分为5类。(4)13个狼尾草品种(系)间存在较大的遗传差异,遗传距离在0.0206~0.9740之间。(5)利用1对引物扩增的17个多态性位点构建了狼尾草13个品种(系)的DNA指纹图谱,能有效区分13个品种(系)。 展开更多
关键词 狼尾草种质资源 SRAP 遗传多样性 shannon信息指数 DNA指纹图谱 聚类分析
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西林水牛群体的RAPD遗传多样性分析 被引量:3
17
作者 陈集成 蒋钦扬 +1 位作者 陈宝剑 韦英明 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2270-2273,共4页
【目的】了解西林水牛群体的遗传变异和遗传结构,为其辅助标记育种、遗传资源保护及利用提供参考依据。【方法】从广西西林县的8个乡(镇)采集184份西林水牛血样,采用优化后的RAPD技术检测其多态性DNA,统计多态性条带数,并应用Popgene3... 【目的】了解西林水牛群体的遗传变异和遗传结构,为其辅助标记育种、遗传资源保护及利用提供参考依据。【方法】从广西西林县的8个乡(镇)采集184份西林水牛血样,采用优化后的RAPD技术检测其多态性DNA,统计多态性条带数,并应用Popgene32软件对西林水牛群体的有效等位基因数、Nei氏基因多样性指数及Shannon多样性指数进行分析。【结果】从18条RAPD引物中筛选出8条扩增产物稳定、条带清晰可辨的引物,扩增出的DNA片段分子量为100-1000 bp;从184个样本中共扩增出4968个多态性条带,平均每条引物可扩增出621个多态性条带,多态性频率达60.0%-100.0%,平均为89.7%。西林水牛群体的平均有效等位基因数为1.6745,平均Nei氏基因多样度指数为0.3583,平均Shannon多样性指数为0.5510。【结论】西林水牛群体的遗传变异、遗传分化及遗传多样性均较高,但选育程度较低,育种潜力较大,有待进一步保种和开发利用。 展开更多
关键词 西林水牛 RAPD 多态性条带 有效等位基因数 Nei氏基因多样性指数 shannon多样性指数
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BAF中不同高度海绵铁填料表面物种多样性分析 被引量:5
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作者 万琼 吴仪 +4 位作者 王信 吴英海 魏东洋 贺涛 姜琦 《环境工程技术学报》 CAS 2018年第2期161-168,共8页
主要通过目的片段的聚合酶链式反应(polymeraes chain reaction,PCR)扩增、Illumina高通量测序以及生物信息分析对曝气生物滤池(BAF)反应器中不同高度的海绵铁填料表面微生物丰度和多样性进行分析和研究。结果表明:Ctrl(原水样)以及反... 主要通过目的片段的聚合酶链式反应(polymeraes chain reaction,PCR)扩增、Illumina高通量测序以及生物信息分析对曝气生物滤池(BAF)反应器中不同高度的海绵铁填料表面微生物丰度和多样性进行分析和研究。结果表明:Ctrl(原水样)以及反应器中优势种群均以变形菌门(Proteobacteria)为主,拟杆菌(Bacteroidetes)次之;等级丰度分布(Rank-Abundance)曲线中Ctrl物种数量为1 193,DO1(BAF上部水样)为2 389,DO2(BAF中部水样)为2 211,DO3(BAF下部水样)为1 890,DO1的丰度和生物多样性最高,随着DO浓度的降低(或填料空间位置的下降),微生物群落丰度和多样性均逐渐下降;Chao1指数比观察到的物种(observed species)指数对物种的丰度更加敏感,测得的OTUs(operational taxonomic units)数均高出400;DO1和DO2的物种均匀度较高,DO3和Ctrl的优势菌群所占比例很高,均匀度较低。通过PCo A(principal co-ordinates analysis)可以观察到DO1和DO2的物种组成最为相似。 展开更多
关键词 海绵铁 物种多样性 高通量测序 OTUs聚类 Chao1指数 shannon指数 等级丰度分布 PCoA
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浙江天台黄润岩生植被群落结构多样性初步分析 被引量:1
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作者 陈晓玲 应求是 章丹峰 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期825-829,共5页
【目的】调查浙江天台黄润野外岩生植被群落结构的多样性,丰富该地区的植被资源,为野外岩生植物的筛选和引种提供参考依据。【方法】采用样带法进行统计,计算样带中草本层和灌木层的重要值及Shannon-Wiener指数,调查该地区岩生植被群落... 【目的】调查浙江天台黄润野外岩生植被群落结构的多样性,丰富该地区的植被资源,为野外岩生植物的筛选和引种提供参考依据。【方法】采用样带法进行统计,计算样带中草本层和灌木层的重要值及Shannon-Wiener指数,调查该地区岩生植被群落基本结构和多样性特征。【结果】黄润岩生植物的组成较为丰富,共38科44属57种,其中蕨类植物6科7属8种,物种多样性指数草本层>灌木层,草本层和灌木层的Shannon-Wiener指数之间均存在较大差异。坡度、坡向对植物的生长分布有一定影响,各样方草本层与灌木层的林间空隙比例曲线变化基本一致,草本层物种多样性指数与林间空隙比例曲线变化方向大致一致,灌木层则相反。该地区的群落优势种为白茅、垂盆草及网络崖豆藤。【结论】天台黄润岩生植被群落物种丰富,结构稳定,虎耳草、垂盆草可作为薄土岩生植物应用于岩石园中,而白茅及网络崖豆藤因需土稍多,可配合选择种植。 展开更多
关键词 岩生植被 群落 重要值 物种多样性 shannon—Wiener指数
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不同方法分析工矿复垦区不同植物根际微生物多样性的比较 被引量:6
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作者 张变华 靳东升 +2 位作者 郜春花 郜雅静 李建华 《江苏农业科学》 2019年第4期223-226,共4页
以山西古交屯兰工矿复垦区为研究对象,从不同植物种植、不同耕作制度的视角出发,将传统分析与现代技术分析相结合,分析比较工矿复垦区植物根际微生物的多样性,旨在为提高工矿区复垦的土壤质量提供理论依据。传统分析结果表明,豆科植物... 以山西古交屯兰工矿复垦区为研究对象,从不同植物种植、不同耕作制度的视角出发,将传统分析与现代技术分析相结合,分析比较工矿复垦区植物根际微生物的多样性,旨在为提高工矿区复垦的土壤质量提供理论依据。传统分析结果表明,豆科植物根际微生物细菌与放线菌的数量要高于禾本科植物,毛苕子根际细菌、放线菌数量与Shannon多样性指数均高于其他植物,在大豆—玉米—玉米轮作制度下,大豆根际细菌、放线菌数量与Shannon多样性指数高于玉米—大豆—大豆轮作制度下玉米根际的相应指标。用16S rDNA V3~V4区操作分类单元(operational taxonomic units,简称OTU)进行不同植物根际细菌α多样性分析,发现自然恢复土壤的Chao1丰富度高于种植植物的土壤,与种植植物根际土壤微生物的群落结构截然不同,连种毛苕子根际与玉米—大豆—大豆轮作制度下的玉米根际土壤具有丰度较低的相似性微生物属,大豆与苜蓿的根际微生物具有相似的亲缘性。 展开更多
关键词 工矿复垦区 植物根际 微生物多样性 shannon多样性指数
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