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滇牡丹遗传多样性的ISSR分析 被引量:64
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作者 杨淑达 施苏华 +1 位作者 龚洵 周仁超 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期105-111,共7页
应用ISSR标记对中国西南地区特有植物滇牡丹 (Paeoniadelavayi)的遗传多样性进行了研究。从 100个引物中筛选出 10个用于正式扩增,在取自 16个自然居群和 1个迁地保护居群的 511个个体中,检测到 92个多态位点。在居群水平上,多态位点百... 应用ISSR标记对中国西南地区特有植物滇牡丹 (Paeoniadelavayi)的遗传多样性进行了研究。从 100个引物中筛选出 10个用于正式扩增,在取自 16个自然居群和 1个迁地保护居群的 511个个体中,检测到 92个多态位点。在居群水平上,多态位点百分率(PPB)为 44. 61%,Nei′s基因多样性指数 (H)和Shannon信息指数 (I)分别为0. 1657和 0. 2448。在物种水平上,多态位点百分率 (PPB)为 79. 31%,Nei′s基因多样性指数 (H)和Shannon信息指数(I)分别为 0. 2947和 0. 4355。居群间的遗传分化系数 (GST)达 0. 4349。结果表明:滇牡丹遗传多样性水平较高,居群间遗传分化较大。结合以前的研究结果,对滇牡丹的现状进行评估的结果显示,滇牡丹并不濒危。 展开更多
关键词 遗传多样性 滇牡丹 IssR分析 shannon信息指数 多样性指数 中国西南地区 IssR标记 多态位点 遗传分化系数 特有植物 迁地保护 自然居群 研究结果 百分率 s基因 水平 引物 物种
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狼尾草属优质牧草SRAP遗传多样性分析与指纹图谱构建 被引量:8
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作者 石秀兰 陈平 +2 位作者 于得水 韩瑞宏 刘萍 《广东农业科学》 CAS 2018年第10期55-60,共6页
为探讨狼尾草属优质牧草的遗传多样性,利用SRAP分子标记方法,对13份狼尾草属优质牧草种质进行遗传多样性分析,并构建了DNA指纹图谱,结果表明:(1)从72对SRAP引物中筛选出16对引物进行PCR扩增,共扩增出278条带,其中有218条具有多态性,平... 为探讨狼尾草属优质牧草的遗传多样性,利用SRAP分子标记方法,对13份狼尾草属优质牧草种质进行遗传多样性分析,并构建了DNA指纹图谱,结果表明:(1)从72对SRAP引物中筛选出16对引物进行PCR扩增,共扩增出278条带,其中有218条具有多态性,平均多态率为78.42%。(2)Shannon信息指数(I)和Nei's基因多样性指数(H)平均值分别为0.5017、0.3306,说明13份供试品种(系)具有较为丰富的遗传多样性。(3)利用UPGMA构建13份狼尾草种质资源的聚类图,在遗传相似系数为0.86处可将13份狼尾草品种(系)分为5类。(4)13个狼尾草品种(系)间存在较大的遗传差异,遗传距离在0.0206~0.9740之间。(5)利用1对引物扩增的17个多态性位点构建了狼尾草13个品种(系)的DNA指纹图谱,能有效区分13个品种(系)。 展开更多
关键词 狼尾草种质资源 sRAP 遗传多样性 shannon信息指数 DNA指纹图谱 聚类分析
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生态旅游型乡村的乡土景观植物遗传多样性
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作者 冯致 姚志 +10 位作者 孙全 李萌 吴秀忠 陈大华 蒋龙 范开放 唐建路 李锴 米小琴 于咏 王义强 《中国生态农业学报(中英文)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期1896-1908,共13页
乡村景观植物是生态旅游型乡村营建中的关键因素,研究乡村景观植物遗传多样性,揭示其群体内遗传变异的丰富度和遗传结构的稳定性,为乡村生态景观营建和生物多样性维护提供重要理论依据,对美丽乡村建设具有重要意义。本文以两个生态旅游... 乡村景观植物是生态旅游型乡村营建中的关键因素,研究乡村景观植物遗传多样性,揭示其群体内遗传变异的丰富度和遗传结构的稳定性,为乡村生态景观营建和生物多样性维护提供重要理论依据,对美丽乡村建设具有重要意义。本文以两个生态旅游型乡村为研究对象,选取了8个乡土景观物种,采集了整体村域的植物样品,对表型性状进行了测量并开展了ISSR-PCR试验:通过表型性状和分子标记遗传多样性检测分析,计算植物表型Shan-non指数和Nei’s基因多样性指数等,揭示乡土景观植物在不同区域的遗传多样性水平。研究结果表明:基于表型性状聚类分析划分出5类枫香、6类福建青冈、4类青冈、16类榉树、7类香椿、10类马兰、5类野菊和6类蓬蘽的品系资源。8个乡土景观植物的表型变异系数为0.23~0.58,Shannon指数为1.51~6.74。8种植物在整体村域、人工区域和自然区域的Nei’s基因多样性指数分别为0.240~0.536、0.244~0.540和0.193~0.367,多态性位点百分率范围为45.00%~100.00%,等位基因数范围为1.45~2.00,有效等位基因数范围为1.30~1.64。讨论分析表明,8个乡土景观植物的表型(Shannon指数)和分子(Nei’s基因多样性指数)遗传多样性水平总体高于多种景观植物的平均水平,遗传变异丰富;部分乡土植物总体遗传多样性高,但自然区域和人工区域的遗传多样性水平有所差异。在乡村景观建设中应关注乡土景观植物群体的遗传多样性水平的变化,采取相应措施提高群体的遗传多态性和基因分布均匀度,维护乡土景观植物遗传多样性水平,保证乡村生态景观的稳定性和长效性。 展开更多
关键词 生态旅游型乡村 乡土景观植物 遗传多样性 表型shannon指数 Nei’s基因多样性指数
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黄颡鱼RAPD标记及其遗传多样性的初步分析 被引量:53
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作者 宋平 潘云峰 +3 位作者 向筑 胡珈瑞 胡隐昌 蔡从利 《武汉大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2001年第2期233-237,共5页
以雌、雄黄颡鱼 DNA池为模板 ,从 42 2个引物中筛选出 6 1个 RAPD反应重复性好、带型清晰明亮的引物 ,这些引物可用于黄颡鱼的分子标记或鉴定 .采用 10~ 11个引物先后对两批黄颡鱼 (简称群体 A和群体 B)进行群体 RAPD多样性分析 .在群... 以雌、雄黄颡鱼 DNA池为模板 ,从 42 2个引物中筛选出 6 1个 RAPD反应重复性好、带型清晰明亮的引物 ,这些引物可用于黄颡鱼的分子标记或鉴定 .采用 10~ 11个引物先后对两批黄颡鱼 (简称群体 A和群体 B)进行群体 RAPD多样性分析 .在群体 A(2 1尾 )中共检测到 95个位点 ,其中 2 7个为多态位点占总位点数2 8.42 % ,其群体 Nei& L i氏遗传相似率为 90 .6 7% ,Shannon信息指数为 0 .0 918比特 ;在群体 B中共检出 46个位点 ,其中多态位点 12个占 2 6 .0 9% ,其群体 Nei& L i氏遗传相似率为 93.2 7% ,Shannon信息指数为 0 .0 6 70比特 . 展开更多
关键词 黄颡鱼 RAPD标记 遗传多样性 shannon信息指数 遗传标记 遗传相似率
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壮药战骨种质资源遗传多样性ISSR分析 被引量:7
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作者 熊忠臣 史艳财 +3 位作者 漆小雪 邹蓉 蒋运生 韦记青 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期2040-2044,共5页
目的对壮药战骨种质资源的遗传多样性进行研究。方法采用ISSR分子标记技术分析9个战骨种群的遗传多样性。结果 13条引物共检测到73个位点,其中65个位点具有多态性,多态位点百分率(PPL)为89.04%。战骨总的Nei’s基因多样度指数(H)为0.226... 目的对壮药战骨种质资源的遗传多样性进行研究。方法采用ISSR分子标记技术分析9个战骨种群的遗传多样性。结果 13条引物共检测到73个位点,其中65个位点具有多态性,多态位点百分率(PPL)为89.04%。战骨总的Nei’s基因多样度指数(H)为0.226 5,Shannon’s多样性信息指数(I)为0.357 2,各种群的平均H、I为0.147 6、0.221 9。种群间基因分化系数(Gst)为0.348 4,基因流(Nm)为0.935 1。9个种群可聚类划分为2个大种群组。结论战骨种群遗传多样性为中等偏低水平;战骨种群的遗传变异主要存在于种群内;战骨的生物学特性和分布区域的片段化是导致种群间出现一定的遗传分化和种群遗传多样性较低的主要原因。 展开更多
关键词 战骨 种质资源 遗传多样性 Nei’s基因多样指数 shannon’s多样性信息指数 IssR
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蒲公英遗传多样性的ISSR分析 被引量:7
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作者 李喜凤 邱天宝 +4 位作者 张红梅 胡春月 胡利欣 郑楠楠 唐露 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期2025-2029,共5页
目的分析蒲公英的遗传多样性。方法采用ISSR分子标记对21个居群蒲公英遗传多样性进行分析,用软件Popgen32分析Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I),采用NTSYS 2.10e软件进行聚类分析和主坐标分析。结果 16条ISSR引物共扩增出16... 目的分析蒲公英的遗传多样性。方法采用ISSR分子标记对21个居群蒲公英遗传多样性进行分析,用软件Popgen32分析Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I),采用NTSYS 2.10e软件进行聚类分析和主坐标分析。结果 16条ISSR引物共扩增出166条条带,其中多态性条带152条,平均多态性百分率为90.4%,平均H为0.286 5,平均I为0.437 0;遗传距离和遗传一致度分别为0.156 2~0.590 2和0.554 2~0.855 4;UPMGA法进行聚类分析显示,聚类结果与地理来源有较强的一致性,可以看出来源于同一地区的蒲公英种质聚在一起,呈现出一定的地域性分布规律。结论采用ISSR分析蒲公英遗传多样性,蒲公英表现出丰富的多态性,表明可以用ISSR标记技术对蒲公英进行分子水平的遗传多样性分析。 展开更多
关键词 蒲公英 IssR 聚类分析 遗传多样性 Nei’s基因多样性指数(H) shannon信息指数(I)
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我国黄花蒿天然群体遗传多样性的SRAP分析 被引量:7
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作者 陈大霞 彭锐 +2 位作者 李隆云 崔广林 吴叶宽 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1591-1595,共5页
目的研究我国黄花蒿天然群体种质资源的遗传多样性,并对其进行SRAP分析。方法采用SRAP分子标记技术,以我国天然群体主要分布区域的60份黄花蒿种质资源为试验材料,运用Popgene version 1.31软件和Treeconw软件计算相关参数,UPGMA方法聚类... 目的研究我国黄花蒿天然群体种质资源的遗传多样性,并对其进行SRAP分析。方法采用SRAP分子标记技术,以我国天然群体主要分布区域的60份黄花蒿种质资源为试验材料,运用Popgene version 1.31软件和Treeconw软件计算相关参数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系树状图。结果 24对SRAP引物组合扩增出232条带,多态性比率(PPB)为81.47%。SRAP标记的Nei’s基因多样性(H)为0.190 5,Shannon’s信息指数(I)为0.300 0。青蒿素量高的4个地区之间,多态位点百分率在50.00%~61.21%,平均为55.82%,SRAP标记的H值为0.155 7~0.179 3,I值为0.237 9~0.276 6;SRAP检测不同材料间遗传相似系数为0.643 2~0.872 7,平均为0.754 7。结论 SRAP标记能有效地揭示我国野生黄花蒿丰富的遗传多样性,为黄花蒿新品种选育提供了物质基础。 展开更多
关键词 黄花蒿 sRAP 遗传多样性 Nei’s基因多样性(H) shannon’s信息指数(I)
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新疆荒地阿魏遗传多样性的ISSR分析 被引量:4
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作者 阚萌萌 王恒 +3 位作者 康东建 余风华 谭勇 朱芸 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期2100-2104,共5页
目的研究新疆荒地阿魏Ferula syreitschikowii种质资源的亲缘关系及遗传多样性。方法以96份新疆荒地阿魏种质资源为材料,从33条ISSR引物中筛选出条带清晰、多态性好的引物15条,进行ISSR分子标记分析。结果共扩增获得292条完整、清晰的谱... 目的研究新疆荒地阿魏Ferula syreitschikowii种质资源的亲缘关系及遗传多样性。方法以96份新疆荒地阿魏种质资源为材料,从33条ISSR引物中筛选出条带清晰、多态性好的引物15条,进行ISSR分子标记分析。结果共扩增获得292条完整、清晰的谱带,其中多态性条带为289条,多态位点比率为99.01%,表明新疆荒地阿魏种质资源多态性较高,具有较高的遗传多样性。经相关统计软件计算结果分析,平均有效等位基因数为1.725 6,平均Nei’s基因多样性指数为0.404 8,平均Shannon’s信息指数为0.587 9,遗传相似性系数为0.500 0~0.828 7。UPGMA聚类结果显示96份材料分为2个类群13个亚类,能够将不同来源的种质资源区分开来。结论从分子水平上揭示了新疆荒地阿魏地理分布与种质资源间的亲缘关系及较高的遗传多样性,为荒地阿魏品种鉴定提供相关依据。 展开更多
关键词 荒地阿魏 IssR 遗传多样性 亲缘关系 shannon’s信息指数 有效等位基因数
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短葶山麦冬遗传多样性SRAP标记研究 被引量:4
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作者 张君毅 陈瑞凤 许金榜 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期774-778,共5页
目的对短葶山麦冬进行遗传多样性分析。方法利用SRAP分子标记技术对47份短葶山麦冬材料进行遗传多样性分析。结果 15对引物共扩增出323条多态性带,平均多态位点百分率为88.47%。平均引物多态信息量(PIC)为0.90。Nei’s基因多样性指数(H)... 目的对短葶山麦冬进行遗传多样性分析。方法利用SRAP分子标记技术对47份短葶山麦冬材料进行遗传多样性分析。结果 15对引物共扩增出323条多态性带,平均多态位点百分率为88.47%。平均引物多态信息量(PIC)为0.90。Nei’s基因多样性指数(H)为0.197 7,Shannon’s信息指数(I)为0.319 0。遗传分化系数(Gst)为0.252 8。UPGMA聚类表明遗传相似系数为0.59~0.99。结论短葶山麦冬遗传多样性水平较高,遗传变异主要在居群内。 展开更多
关键词 相关序列扩增多态性(sRAP) 短葶山麦冬 遗传多样性 shannon’s信息指数(I) 遗传分化系数(Gst)
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紫娟茶自然杂交后代的ISSR分析 被引量:3
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作者 邹瑞 张玥 +2 位作者 杨自云 蓝增全 吴田 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2020年第1期87-91,共5页
【目的】为了明确紫娟茶自然杂交后的种子所萌发的实生苗与紫娟母株的遗传差异.【方法】采用28个ISSR引物对15份紫娟茶实生苗和紫娟原种基因组DNA进行PCR扩增,并采用紫外分光光度计法检测它们的花青素含量.[结果]16份紫娟茶共扩增出92条... 【目的】为了明确紫娟茶自然杂交后的种子所萌发的实生苗与紫娟母株的遗传差异.【方法】采用28个ISSR引物对15份紫娟茶实生苗和紫娟原种基因组DNA进行PCR扩增,并采用紫外分光光度计法检测它们的花青素含量.[结果]16份紫娟茶共扩增出92条DNA条带,其中多态性条带72条,占78.3%,基因多样性指数(H)为0.31,Shannon信息指数(I)为0.45,遗传相似范围在0.53~0.79之间,平均为0.66;聚类分析发现,在0.66水平上16份紫娟茶样可分为3组,SS14的遗传相似水平与紫娟原种最高,其花青素含量与紫娟原种最接近.【结论】紫娟茶的实生苗在经ISSR鉴定、花青素含量测量,且遗传相似水平较高的前提下,可以用于构建种质群;后续在利用紫娟实生苗时,可使用区分度较高的ISSR引物855进行筛选. 展开更多
关键词 茶树 实生苗 遗传多样性 shannon信息指数 花青素含量
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栽培太子参的遗传多样性与质量分析 被引量:25
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作者 肖承鸿 周涛 +4 位作者 江维克 艾强 杨昌贵 熊厚溪 廖明武 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1319-1325,共7页
目的对栽培太子参的遗传多样性与药材质量进行综合评价,为合理利用太子参种质资源及优良品种选育提供理论依据。方法采用ISSR分子标记分析太子参12个栽培种源的遗传多样性,HPLC法测定各种源药材中太子参环肽B的量。结果 10条ISSR引物扩... 目的对栽培太子参的遗传多样性与药材质量进行综合评价,为合理利用太子参种质资源及优良品种选育提供理论依据。方法采用ISSR分子标记分析太子参12个栽培种源的遗传多样性,HPLC法测定各种源药材中太子参环肽B的量。结果 10条ISSR引物扩增出82条带,其中多态性条带73条,多态位点百分率(PPL)为89.02%。Nei’s遗传多样性指数(H)平均值为0.257 9,Shannon’s多态性指数(I)平均值为0.388 4,遗传分化系数(Gst)为0.274 1,种源间基因流(Nm)为1.323 8。基于遗传一致度,12个种源可聚为3类。12个种源间及种源内个体中的太子参环肽B量差异明显,种源4的变异系数(9.51%)较小,且太子参环肽B量(0.049 4%)明显高于其他种源。结论栽培太子参各产地间的换种及其生物学特性是其遗传多样性水平丰富的主要原因;综合考虑遗传多样性水平和太子参环肽B的量,种源3和4种质较为优良,可作为太子参种质资源保存及品种选育的对象。 展开更多
关键词 太子参 种质资源 遗传多样性 遗传分化系数 shannon’s多态性指数 基因流
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Microsatellite and mitochondrial DNA assessment of the genetic diversity of captive Saiga antelopes(Saiga tatarica) in China 被引量:1
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作者 ZHAO ShaSha XU ChaoQun +4 位作者 LIU Gang LIU ShuQiang ZHAO ChongXue CUI YaXiong HU DeFu 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2013年第17期2163-2167,共5页
To estimate the genetic diversity of the only captive Saiga antelope(Saiga tatarica) population in China,40 umbilical cord samples were collected and mitochondrial(control region) and nuclear(microsatellite) variabili... To estimate the genetic diversity of the only captive Saiga antelope(Saiga tatarica) population in China,40 umbilical cord samples were collected and mitochondrial(control region) and nuclear(microsatellite) variabilities were assessed.Both of the markers revealed low genetic variability(or high genetic homogeneity) within the population.The microsatellites yielded monitoring ranges of 2-6 alleles.The observed heterozygosities ranged from 0.28 to 0.83,and the expected heterozygosities were between 0.27 and 0.71.The Shannon information index(Shannon I) and Polymorphic Information Content(PIC) presented overall means of 0.87 and 0.43,respectively.The gene diversity was 0.49.We found only two haplotypes in the population,and the haplotype and nucleotide diversities were 39.1% and 1.13%,respectively.Founder events,bottlenecks and inbreeding have contributed to the low genetic variation observed in this population.Our findings revealed the extent of genetic diversity maintained in the present population and the urgency of implementing a protection plan,introducing animals from other populations to enhance saiga's genetic variation. 展开更多
关键词 遗传多样性 线粒体DNA 赛加羚羊 中国人口 微卫星 shannon信息指数 圈养 评估
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