用PCR-SSCP银染方法检测人原发性胃癌APC基因点突变

在PCR基础上建立了APC基因10个片段的SSCP检测体系,对影响SSCP的各种条件进行了探讨,发现主要的影响因素是电泳温度和凝胶浓度。用SSCP银染法检测人胃癌组织中APC基因的点突变,在20例中,5例有异常电泳条带(25%),表明在相应的DNA片段中发生了突变。5例突变均位于第15号外显子,其中2例位于第4号片段(密码子998-1141);3例位于第6号片段(密码子1260-1410)。研究结果表明,APC基因突变和胃癌的发生有关。PCR-SSCP银染法快速、简便,特别适用于对大样本基因点突变的检测。

毛细管电泳法检测胃癌APC基因第十一外显子的杂合缺失

采用聚合酶链反应(PCR)扩增了胃癌及癌旁正常组织中APC基因易发生杂合缺失的第十一外显子的部分碱基序列,扩增样品分别经96℃变性和RsaⅠ酶切处理,以毛细管电泳(CE)-单链构象多态性(SS-CP)、CE-限制性片段长度多态性(RFLP)、聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)-SSCP对其杂合缺失情况进行检测。PAGE凝胶浓度为15%。CE检测条件:以3.0%聚环氧乙烷(PEO)为筛分介质,1×TBE(pH 8.2)为电泳缓冲液,分离电压15 kV,温度15℃,结合激光诱导荧光(λex=488 nm,λem=520 nm)检测。不同方法的检出率由高到低分别为:CE-SSCP(30%)>PAGE-SSCP(25%)>CE-RFLP(20%)。并证实了APC基因易发生杂合缺失在胃癌组织中的突变率高于10%,且CE-SSCP方法较PAGE-SSCP和CE-RFLP的检出率高。CE-SSCP检测方法具有快速、灵敏度高等优点,可为建立简便可靠的胃癌临床早期诊断方法奠定基础。

新疆哈萨克族食管癌APC抑癌基因等位基因杂合缺失和点突变研究

目的：探讨抑癌基因在哈萨克族（简称哈族）食管癌发生、发展中的作用，阐明哈族食管癌高发的机理，从分子水平提供依据。方法：应用ＰＣＲ技术并配合限制性片段长度多态性（ＲＦＬＰ）分析和银染的单链构象多态性（ＳＳＣＰ）分析法对４１ 例新疆地区原发性食管癌及正常组织中家族性结肠腺瘤样息肉易感基因（ＡＰＣ）第１１ 外显子杂合缺失（ＬＯＨ）及点突变进行检测。结果：３１ 例信息个体中１３ 例显示杂合缺失，杂合缺失率为４１．９％ ，其中哈族的杂合缺失率为５０．０％ （７／１４），而汉族的杂合缺失率为３５．３％ （６／１７）。点突变率为２４．４％ （１０／４１），其中哈族食管癌的点突变率为３０．０％ （６／２０），汉族食管癌的点突变率为１９．０％ （４／２１）。结论：ＡＰＣ抑癌基因第１１ 外显子的ＬＯＨ 存在于食管癌的各个临床分期，ＬＯＨ不是癌症发生的结果，可能是癌症发生的早期因素，且与食管癌的恶性程度有关。

PTEN基因在膀胱癌组织中的表达和突变

目的检测抑癌基因PTEN在膀胱癌组织中的表达和突变情况。方法分别应用免疫组化和聚合酶链反应-单链构象多态性分析(PCR-SSCP)技术对62例膀胱癌及18例膀胱良性病变组织(对照组)中PTEN的表达及其第1和第7个外显子的突变情况进行检测。结果在62例膀胱癌组织中,PTEN表达的阳性率为53.2%,而对照组全部为阳性表达;62例膀胱癌组织中,第7外显子突变率为25.8%,第1外显子未发现突变,在对照组织中,未发现有指示突变的异常带型;膀胱癌PTEN的突变率可能与肿瘤的病理学分级有关。结论PTEN基因突变所致表达障碍可能在膀胱癌的发生、发展中有着重要的作用。

食管癌与p53突变和人乳头状肉瘤病毒感染

目的探讨p53基因突变与人乳头状肉瘤病毒16(HPV16)感染在食管癌发病中的作用及相互关系。方法应用病例-病例研究方法进行分析,采用聚合酶链反应(PCR)、单链构像多态性(SSCP)、测序等分子生物学技术对110例食管癌组织标本中p53基因的突变与HPV16感染进行了检测。结果110例食管癌组织标本p53基因突变率为49.1%,其中外显exon5-6,exon7,exon8-9的突变率分别为19.1%,27.3%,17.2%。食管癌组织HPV16的检出率为49.1%。吸烟患者p53基因突变率(61.4%)明显高于非吸烟患者p53基因突变率(48.2%),差异有统计学意义;淋巴结转移患者p53基因突变率(65.2%)明显高于无淋巴结转移患者p53基因突变率(37.5%);HPV16阳性者中,p53突变率是40.7%,HPV16阴性者仅为57.1%,两者差异无统计学意义。结论HPV16感染可能是食管癌高发区的危险因素;p53基因突变与吸烟、淋巴结转移有明显相关性;HPV16感染和p53基因突变可能是2个独立的事件。

PCR-LIS-SSCP检测大肠癌PTEN基因的点突变

目的 探讨PTEN基因突变在大肠癌发病机理中的作用。方法 应用聚合酶链反应 -低离子强度 -单链构象多态性技术 ,对大肠癌及正常大肠石蜡包埋组织中PTEN的第 7、第 8个外显子进行点突变检测。结果 在 60例大肠癌组织中 ,第 7个外显子SSCP带型异常的有 2 8例 ,阳性率为 46.7% (χ2 =5 .0 81,P <0 .0 5 ) ,第 8个外显子未见阳性带。在 10例正常大肠组织中 ,2个外显子均未见异常SSCP带型。结论 大肠癌组织中PTEN的第 7个外显子点突变的发生率高 。

毛细管电泳法检测肺癌p53基因第七外显子的突变

p53基因点突变在肺癌的发生过程中起重要作用,检测基因点突变的方法学研究将有助于临床准确诊断肺癌。本实验用PCR扩增包含249位密码子的肺癌及癌旁正常组织p53基因第七外显子,扩增样品分别经96℃变性和HaeⅢ酶切处理,以CE-SSCP、CE-RFLP、PAGE-SSCP和PAGE-RFLP对其突变情况进行检测,并从上样量、时间、检出限和检出率4个方面进行比较。PAGE凝胶浓度为15%;CE筛分介质PEO浓度3.0%,pH8.2,电压15kV,温度15℃,λex=488nm,λem=520nm荧光检测。检出率由高到低分别为:CE-SS-CP>PAGE-SSCP>CE-RFLP>PAGE-RFLP。CE-SSCP可作为大规模肺癌早期诊断的简便可靠的方法。

毛细管电泳联合激光诱导荧光技术检测结直肠癌hMLH1基因突变

目的 建立毛细管电泳 (CE)联合激光诱导荧光检测 (LIF)技术 ,分析单链构象多态性 (SSCP) ,检测人结直肠癌hMLH1基因点突变的方法。方法 PCR扩增 4 2例散发性结直肠癌患者与 2 0例健康志愿者外周血基因组DNAhMLH1基因 12外显子 ,采用CE LIF进行SSCP分析 ,对异常片段进行测序鉴定 ;研究不同筛分介质 (线性聚丙烯酰胺LPA)浓度、分离温度与分离电压对CE行为的影响。结果 4 2例患者中有 4例 (9.5 2 % )突变 ,CE测序证实为T115 1A的杂合子点突变 ;2 0例健康志愿者未发现突变。较高浓度的LPA(4 %～ 6 % ) ,2 0℃分离温度与 9kV分离电压有助于单链DNA峰分离。结论 调整适宜的LPA浓度、分离温度与分离电压可提高CE分析SSCP的效率 ,应用CE LIF技术SSCP分析检测hMLH1基因点突变快速、高效、重复性好 。

结直肠癌组织中K-ras基因突变的毛细管电泳检测

通过对PCR扩增的76例结直肠癌组织及癌旁正常组织DNA基因组共152个样本纯化变性后,采用毛细管电泳-激光诱导荧光检测(CE-LIF)结合单链构象多态性(SSCP)分析方法检测了人结直肠癌组织及癌旁正常组织中K-ras基因第12/13位密码子突变。所检测的76例结直肠癌患者中有30例患者存在基因突变,并对异常片段进行测序验证,测序证实以碱基G→A点突变为主。结果表明所建立的CE-LIF技术结合SSCP分析检测K-ras基因突变的方法高效、快速、灵敏、准确,适合于临床上大样本结直肠癌中K-ras基因突变分析,对选择抗结直肠癌药物有一定的指导作用。

p53基因突变及染色体倍性与大肠癌转移之间关系初探

目的研究大肠癌转移与ｐ５３基因突变及染色体倍性之间的关系。方法采用特异合成引物对ｐ５３基因的有关外显子进行ＰＣＲ扩增，结合单链构象多态性（ＳＳＣＰ）和银染技术，检测１５例大肠癌手术标本ｐ５３基因的突变；使用流式细胞仪（ＦＡＣＳ）分析其染色体的倍性。结果８例有转移灶大肠癌病人中７例表现有ｐ５３基因的突变，而７例未转移大肠癌病人只显示３例有ｐ５３基因的突变。异倍体的９例病人中７例有ｐ５３基因突变，二倍体的６例病人中有３例有ｐ５３基因突变。

nm23-H1基因突变及异常表达与大肠癌转移相关性的研究

目的 :探讨nm2 3 H1基因突变及异常表达与大肠癌转移之间的关系。方法 :(1)收集 63例中国人大肠癌组织及癌旁组织 ,酚 氯仿 异戊醇法提取基因组DNA ,同时收集整理患者的临床和病理资料 ;(2 )应用PCR扩增nm2 3 H1基因全部编码序列第 2～ 5位外显子后 ,经SSCP法初步筛查基因突变并对异常带型样本进行DNA测序分析 ;(3 )应用流式细胞仪检测 14对大肠癌组织及癌旁组织nm2 3 H1蛋白的表达情况。结果 :nm2 3 H1基因第 2～ 4位外显子在 63例大肠癌组织中 (其中 2 0例标本有淋巴结转移 )未发现异常突变 ;仅有 15例大肠癌组织nm2 3 H1基因第 5外显子序列存在突变 ,其第 3 60位碱基发生T C置换 (同义突变 ) ;nm2 3 H1基因蛋白在大肠粘膜组织中有表达 ,在部分大肠癌组织中的表达比其癌旁粘膜组织低 ,并与肿瘤转移有相关性。结论 :nm2 3 H1基因突变在大肠癌组织中为小概率事件 ,大肠癌病理类型、有无转移与nm2 3 H1基因突变无明显相关性 ;nm2 3 H1基因蛋白水平的表达下降与大肠癌的转移有相关性。

应用PCR-SSCP银染技术分析胃癌p53基因的点突变

目的 分析胃癌中p5 3基因第 5～ 8外显子点突变的发生及其意义。方法 应用聚合酶链反应 单链构象多态性分析(PCR SSCP)和银染技术 ,对 40例胃良性疾病和 3 0例胃癌标本中 p5 3基因第 5～ 8外显子的点突变情况进行检测。 结果 40例胃良性疾病均无点突变发生 ,3 0例胃癌中有 12例发生 p5 3基因的点突变 ,突变率为 40 .0 0 % (12 /3 0 )。 结论 p5 3基因突变与胃癌的发生密切相关 ;PCR SSCP银染技术不仅灵敏安全 ,而且简便、快速、重复性好 。

毛细管电泳-单链构象多态分析检测胃癌中p16基因突变

目的:建立快速高效检测胃癌患者胃癌组织及癌旁正常组织中p16基因突变的方法。方法:采用PCR扩增p16基因第二外显子易发生突变片段,扩增样品纯化后经95℃变性;以毛细管电泳(CE)分析法结合单链构象多态性(SSCP)对60例胃癌患者p16基因突变情况进行分析。结果:分析结果表明只有3例低分化腺癌患者存在基因突变,测序表明p16基因第二外显子碱基序列AGAC发生碱基A丢失。结论:p16基因突变可能导致胃癌的发生,但不起主导作用;CE-SSCP分析方法具有快速、灵敏、准确的特点,可用于胃癌组织中p16基因的突变分析。

肺癌K-ras基因点突变的研究

目的 :探讨肺癌发生的分子遗传学机理 ,了解肺癌中K ras基因的突变情况。方法 :采用聚合酶链式反应一单链构象多态性 (PCR SSCP)结合银染技术 ,对 3 2例肺癌组织及其相应的癌旁组织中K ras基因第 12、13、61位密码子的突变情况进行检测。结果 :肺癌组织中K ras基因总突变率为 2 5 % ( 8/3 2 ) ,其中腺癌突变率为 40 % ( 4 /10 ) ,鳞癌突变率为 2 3 % ( 3 /13 ) ,大细胞肺癌突变率为 3 3 % ( 1/3 )。小细胞癌突变率为 0 ( 0 /6) ,相应的癌旁组织突变率为 3 1% ( 1/3 2 )。结论 :K ras基因突变与肺癌发生发展有关。

促甲状腺激素受体胞内环基因突变与乳头状甲状腺癌发病的相关性研究

目的探讨乳头状甲状腺癌的发病与促甲状腺激素受体(TSHR)基因突变的相关性。方法采用巢氏-多聚酶联反应-单链构象多态性分析(NEST-PCR-SSCP)和DNA测序方法,对65例乳头状甲状腺癌和44例正常甲状腺组织TSHR3个胞内环基因进行检测。结果NEST-PCR-SSCP检测乳头状甲状腺癌促甲状腺激素受体(TSHR)3个胞内环未发现明显带型异常;DNA测序后,检测的第3胞内环2例对照组织和3例甲状腺癌组织TSHR2000位点碱基均由C→T,使得所编码的601位氨基酸由组氨酸(CAT)→酪氨酸(TAT)(His→Tyr),余胞内环未发现基因突变。结论乳头状甲状腺癌TSHR3个胞内环未发现基因突变,提示乳头状甲状腺癌发病与TSHR胞内环基因突变无关;5例标本601位氨基酸均为酪氨酸,考虑中国人TSHR基因可能与国外人群存在差异,TSHR2000位点碱基存在基因多态性。

散发性结直肠癌PTEN基因突变与微卫星改变间的关系

背景与目的:研究散发性结直肠癌(Sporadiccolorectalcancer,SCRC)组织中抑癌基因PTEN突变高发区外显子5、7和8的突变与人类结直肠癌基因不稳定性间的关系,以进一步研究结直肠癌的分子遗传学发病机制。材料与方法:采用聚合酶链反应(PCR)、PCR结合单链构象多态性(PCR-SSCP)技术对68例散发性结直肠癌患者的癌组织及其癌旁组织的PTEN基因第5、7和第8外显子突变情况和结直肠癌高度敏感的微卫星检测位点Bat25、Bat40及D18S21的改变情况进行检测分析。结果:微卫星改变阳性个体组中PTEN基因突变发生率为28.57%(4/14),与微卫星改变阴性个体组中PTEN基因突变发生率相比较,差异有统计学意义χ2=8.06,P<0.01,。结论:PTEN基因的突变在微卫星不稳定性结直肠癌的发生发展中产生一定的作用。

毛细管电泳在检测大肠癌hMLH1基因突变中的应用

目的:建立应用毛细管电泳(CE)联合激光诱导荧光检测(LIF)技术分析单链构象多态性(SSCP)检测人大肠癌hMLH1基因点突变的方法。方法:以PCR法扩增42例散发性大肠癌病人与20名健康志愿者的外周血基因组DNAhMLH1基因第12外显子,采用CELIF法进行SSCP分析,对异常片段用CE直接测序鉴定;研究不同筛分介质(线性聚丙烯酰胺LPA)浓度、分离温度和分离电压对CE行为的影响。结果:42例散发性大肠癌hMLH1基因第12外显子经CESSCP分析发现4例(9.52%)有突变,CE测序证实为T1151A的杂合子点突变,20名健康志愿者未发现突变。较高浓度的LPA(4%～6%)、较低分离温度(20℃)和较高分离电压(9kV)有助于单链DNA峰分离。结论:调整适宜的LPA浓度、分离温度和分离电压可提高CE分析SSCP的效率。应用CELIF技术SSCP分析检测hMLH1基因点突变过程快速、高效、重复性好,适合临床大样本筛查,有望成为检测基因突变的新方法。

肺癌p53基因突变的临床意义

目的：研究肺癌ｐ５３基因突变的临床意义。方法：运用聚合酶链反应（ＰＣＲ）—单链构象多态性分析方法（ＳＳＣＰ），检测原发性肺癌的ｐ５３基因的第５～８外显子点突变。结果：８例肺良性疾病均无点突变发生，４０例肺癌中１９例（４７．５％）有点突变发生，点突变发生与临床分期和淋巴结累及状态相关（Ｐ＜０．０２）。

PCR-SSCP法检测人胃癌组织中Rhobtb2基因突变的研究

目的观察Rhobtb2基因在人胃癌组织中的突变情况,探讨Rhobtb2基因突变与胃癌发生的关系。方法采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法对58例胃癌组织以及癌旁正常组织的Rhobtb2基因进行突变检测,采集1例正常人抗凝血作为正常对照。结果58例胃癌组织中发现1例位于外显子5的错义突变。结论胃癌组织中存在Rhobtb2基因突变,其突变可能与胃癌的发生有关。

肺癌p53基因表达和突变的研究

目的 :探讨肺癌p53基因表达和突变的临床意义。方法 :采用流式细胞术、聚合酶链反应及单链构象多态技术对 2 3例肺癌p53基因表达和突变进行了研究。结果 :p53基因表达的阳性率为4 3 5% ,p53基因突变率为 39 2 % ;p53基因表达与突变基本一致且倾向分布于中低分化的病例 ,而与临床分期及组织学类型的关系不明显。结论 :p53基因的异常在肺癌的发生过程中可能属早期事件 。