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国内C4基因型EV-A71结构蛋白VP1区第98和145位点分子进化特征的分析
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作者 王浩 韦欢欢 +2 位作者 陈飞 黄京京 朱俊萍 《微生物学免疫学进展》 CAS 2023年第5期1-10,共10页
目的 分析国内C4基因型肠道病毒A71型(enterovirus A71,EV-A71)结构蛋白VP1区第98和145位点的分子进化特征。方法 构建国内C4型EV-A71 VP1序列数据库,采用选择压力位点分析、易突变位点熵值分析、氨基酸多样性分析3种方法分析国内C4基因... 目的 分析国内C4基因型肠道病毒A71型(enterovirus A71,EV-A71)结构蛋白VP1区第98和145位点的分子进化特征。方法 构建国内C4型EV-A71 VP1序列数据库,采用选择压力位点分析、易突变位点熵值分析、氨基酸多样性分析3种方法分析国内C4基因型EV-A71不同进化分支的结构蛋白VP1区第98和145位点分子进化的特征,并结合手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)暴发前后及临床轻重症信息进行分析。结果 国内C4基因型EV-A71流行进化过程,发生了从C4b到C4a-1,再到C4a-2三个进化分支的优势替换,且不同进化分支VP1的选择压力位点不同。VP1区第98和145位点是国内C4型EV-A71进化过程中发生改变的关键氨基酸位点,与病毒毒力和传播特征紧密相关。VP1区第98和145位点氨基酸组合类型主要包括98E145E(EE)占89.24%、98K145E(KE)占6.78%、98E145G(EG)占1.76%、98E145Q(EQ)占1.66%。其中,EE为最常见类型,而KE型与临床重症发生显著相关(P<0.001)。结论 国内EV-A71优势流行毒株仍为C4a-2基因型,结构蛋白VP1区第98和145位点可能是重要的病毒毒力相关位点。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒A71型 结构蛋白vp1区第98145位点 分子进化 病毒毒力相关位点 氨基酸多样性
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