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国内C4基因型EV-A71结构蛋白VP1区第98和145位点分子进化特征的分析
1
作者
王浩
韦欢欢
+2 位作者
陈飞
黄京京
朱俊萍
《微生物学免疫学进展》
CAS
2023年第5期1-10,共10页
目的 分析国内C4基因型肠道病毒A71型(enterovirus A71,EV-A71)结构蛋白VP1区第98和145位点的分子进化特征。方法 构建国内C4型EV-A71 VP1序列数据库,采用选择压力位点分析、易突变位点熵值分析、氨基酸多样性分析3种方法分析国内C4基因...
目的 分析国内C4基因型肠道病毒A71型(enterovirus A71,EV-A71)结构蛋白VP1区第98和145位点的分子进化特征。方法 构建国内C4型EV-A71 VP1序列数据库,采用选择压力位点分析、易突变位点熵值分析、氨基酸多样性分析3种方法分析国内C4基因型EV-A71不同进化分支的结构蛋白VP1区第98和145位点分子进化的特征,并结合手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)暴发前后及临床轻重症信息进行分析。结果 国内C4基因型EV-A71流行进化过程,发生了从C4b到C4a-1,再到C4a-2三个进化分支的优势替换,且不同进化分支VP1的选择压力位点不同。VP1区第98和145位点是国内C4型EV-A71进化过程中发生改变的关键氨基酸位点,与病毒毒力和传播特征紧密相关。VP1区第98和145位点氨基酸组合类型主要包括98E145E(EE)占89.24%、98K145E(KE)占6.78%、98E145G(EG)占1.76%、98E145Q(EQ)占1.66%。其中,EE为最常见类型,而KE型与临床重症发生显著相关(P<0.001)。结论 国内EV-A71优势流行毒株仍为C4a-2基因型,结构蛋白VP1区第98和145位点可能是重要的病毒毒力相关位点。
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关键词
手足口病
肠道病毒A71型
结构蛋白
vp1
区第
98
和
145
位点
分子进化
病毒毒力相关位点
氨基酸多样性
原文传递
题名
国内C4基因型EV-A71结构蛋白VP1区第98和145位点分子进化特征的分析
1
作者
王浩
韦欢欢
陈飞
黄京京
朱俊萍
机构
首都医科大学基础医学院病原生物学系
出处
《微生物学免疫学进展》
CAS
2023年第5期1-10,共10页
文摘
目的 分析国内C4基因型肠道病毒A71型(enterovirus A71,EV-A71)结构蛋白VP1区第98和145位点的分子进化特征。方法 构建国内C4型EV-A71 VP1序列数据库,采用选择压力位点分析、易突变位点熵值分析、氨基酸多样性分析3种方法分析国内C4基因型EV-A71不同进化分支的结构蛋白VP1区第98和145位点分子进化的特征,并结合手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)暴发前后及临床轻重症信息进行分析。结果 国内C4基因型EV-A71流行进化过程,发生了从C4b到C4a-1,再到C4a-2三个进化分支的优势替换,且不同进化分支VP1的选择压力位点不同。VP1区第98和145位点是国内C4型EV-A71进化过程中发生改变的关键氨基酸位点,与病毒毒力和传播特征紧密相关。VP1区第98和145位点氨基酸组合类型主要包括98E145E(EE)占89.24%、98K145E(KE)占6.78%、98E145G(EG)占1.76%、98E145Q(EQ)占1.66%。其中,EE为最常见类型,而KE型与临床重症发生显著相关(P<0.001)。结论 国内EV-A71优势流行毒株仍为C4a-2基因型,结构蛋白VP1区第98和145位点可能是重要的病毒毒力相关位点。
关键词
手足口病
肠道病毒A71型
结构蛋白
vp1
区第
98
和
145
位点
分子进化
病毒毒力相关位点
氨基酸多样性
Keywords
H
and
,foot
and
mouth disease
Enterovirus A71
sites 98 and 145 in structural protein vp1 region
Molecular evolution
Virulence related
sites
Am
in
o acid diversity
分类号
R37 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
国内C4基因型EV-A71结构蛋白VP1区第98和145位点分子进化特征的分析
王浩
韦欢欢
陈飞
黄京京
朱俊萍
《微生物学免疫学进展》
CAS
2023
0
原文传递
已选择
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条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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