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基于刺突蛋白(S)和核衣壳蛋白(N)的冠状病毒进化关系分析
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作者 任青燕 陆子鑫 +2 位作者 涂盈颖 韦力 乔芬 《丽水学院学报》 2023年第5期35-44,共10页
冠状病毒在系统分类上属冠状病毒科(Coronaviridae)冠状病毒属(Coronavirus),是一种具有球形颗粒和包膜结构的单链RNA病毒。从2003年在中国暴发的重症急性呼吸综合征(SARSCoV),到2012年在沙特出现的中东呼吸综合征(MERS-CoV),再到2019... 冠状病毒在系统分类上属冠状病毒科(Coronaviridae)冠状病毒属(Coronavirus),是一种具有球形颗粒和包膜结构的单链RNA病毒。从2003年在中国暴发的重症急性呼吸综合征(SARSCoV),到2012年在沙特出现的中东呼吸综合征(MERS-CoV),再到2019年开始报道的新型冠状病毒感染(2019-nCoV),21世纪冠状病毒已经3次严重危害到人类的健康。对冠状病毒的序列特征与进化关系进行分析对病毒的起源与防控具有重要意义。本研究从GenBank数据库中筛选到30条冠状病毒刺突蛋白(S)、核衣壳蛋白(N)的蛋白序列,用邻接法构建进化树,分析冠状病毒进化关系,并对蛋白保守基序进行了分析。结果显示:2019-nCoV与从云南省的中菊头蝠中检测到的冠状病毒分离株RaTG13进化关系最近,并且与SARS-CoV具有较近的亲缘关系,与其他哺乳类和禽类动物感染的冠状病毒遗传进化关系较远。同时发现,相比S蛋白,N蛋白更适合用于构建冠状病毒进化树。保守基序分析表明:N蛋白中,选择的30个蛋白中有9个只含有2个保守元件,21个成员含有3个保守元件,保守元件在蛋白中的分布相对均匀;S蛋白中,选择的30个蛋白均含有3个保守元件,且集中在C端。本研究结果将为冠状病毒的进化关系及防治措施提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 冠状病毒 进化关系 S蛋白 n蛋白 新型冠状病毒感染
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糖尿病大鼠肾组织中miR-21和SnoN表达的变化 被引量:5
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作者 刘玲伶 刘丽荣 +5 位作者 王圆圆 石明隽 肖瑛 张莹莹 张小欢 郭兵 《基础医学与临床》 CSCD 2017年第1期32-37,共6页
目的探讨糖尿病(DM)大鼠肾组织中微小核糖核酸-21(miR-21)和核转录共抑制因子(SnoN)在肾纤维化过程中的表达变化及其可能机制。方法用链脲佐菌素复制DM大鼠模型,并设对照组(NC),每组n=8。10周后处死大鼠,观察肾组织形态变化;免疫组织化... 目的探讨糖尿病(DM)大鼠肾组织中微小核糖核酸-21(miR-21)和核转录共抑制因子(SnoN)在肾纤维化过程中的表达变化及其可能机制。方法用链脲佐菌素复制DM大鼠模型,并设对照组(NC),每组n=8。10周后处死大鼠,观察肾组织形态变化;免疫组织化学染色、Western blot及RT-q PCR检测miR-21、SnoN、转化生长因子-β1(TGF-β1)、Smad3、p-Smad3(Ser423/425)、E钙黏蛋白(E-cadherin)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)、纤维连接蛋白(FN)、胶原蛋白Ⅰ(collagenⅠ)和胶原蛋白Ⅲ(collagenⅢ)的表达。结果与对照组相比,DM组肾组织p-Smad3(Ser423/425)、TGF-β1和α-SMA蛋白表达增加(P<0.05),SnoN、E-cadherin蛋白表达减少(P<0.05),但SnoN mRNA和miR-21表达明显上调(P<0.05),并伴有collagenⅠ、collagenⅢ和FN在间质沉积增多。结论 TGF-β1可能上调miR-21表达,抑制SnoN翻译水平的表达,促进DN的纤维化病变。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 Snon蛋白 p-Smad3(Ser423/425)蛋白 MIR-21
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SnoN和Smad2/3信号蛋白与糖尿病大鼠肾小管-间质纤维化的关系 被引量:3
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作者 刘瑞霞 郭兵 +4 位作者 肖瑛 石明隽 王圆圆 李晓颖 张国忠 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2010年第9期944-951,共8页
目的观察核转录共抑制因子SnoN和Smad2/3信号蛋白在糖尿病(DM)大鼠肾组织中的动态表达,并初步探讨它们与糖尿病肾病(DN)肾小管-间质纤维化的关系。方法尾静脉注射链脲佐菌素(STZ)复制DM大鼠模型,随机分为DM2、4、8、12、16和24周组,每... 目的观察核转录共抑制因子SnoN和Smad2/3信号蛋白在糖尿病(DM)大鼠肾组织中的动态表达,并初步探讨它们与糖尿病肾病(DN)肾小管-间质纤维化的关系。方法尾静脉注射链脲佐菌素(STZ)复制DM大鼠模型,随机分为DM2、4、8、12、16和24周组,每组均设鼠龄匹配的正常对照组(n=6)。免疫组化及Western blot法检测肾组织SnoN、转化生长因子β1(TGF-β1)、Smad2/3、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)、纤连蛋白(FN)的蛋白表达;RT-PCR检测SnoN的mRNA;生化方法测血糖、血肌酐及24 h尿蛋白量。结果DM4周起,肾组织中SnoN蛋白表达明显减少(P<0.01),DM各组SnoN的mRNA表达无变化;TGF-β1、Smad2/3及FN的蛋白表达随DM病程进展逐渐增多;DM12周始,肾小管上皮细胞可见α-SMA阳性表达。结论SnoN蛋白表达减少与TGF-β1/Smad信号通路共同参与了DN的发生发展过程。 展开更多
关键词 SnOn TGF-Β1 SMAD2/3 糖尿病肾病 大鼠
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新型冠状病毒N蛋白优势表位区段抗原的克隆表达及其诊断价值初步评价 被引量:4
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作者 王坤 张玲 +7 位作者 王超男 陈远哲 范占科 李垚 刘念 冯晓燕 付强 张贺秋 《生物技术通讯》 CAS 2020年第6期670-674,共5页
目的:制备高活性新型冠状病毒N蛋白的优势表位区段抗原,并初步评价该抗原在新型冠状病毒肺炎诊断中的应用价值。方法:利用生物学软件分析N蛋白的B细胞表位分布,选取含有优势表位的抗原区段,然后用分子生物学技术进行克隆表达获得纯化抗... 目的:制备高活性新型冠状病毒N蛋白的优势表位区段抗原,并初步评价该抗原在新型冠状病毒肺炎诊断中的应用价值。方法:利用生物学软件分析N蛋白的B细胞表位分布,选取含有优势表位的抗原区段,然后用分子生物学技术进行克隆表达获得纯化抗原,ELISA初步评价该优势表位区段抗原的检测性能。结果:经过分析筛选确定15~215 aa为优势表位抗原区段,并获得了高效表达抗原。经过Biocore结合实验,确定优势表位区段抗原NP15-215可以与新型冠状病毒肺炎患者血清样本发生特异性抗原抗体反应。基于该抗原建立的IgM和IgG间接ELISA方法,对临床样本的检测灵敏度分别为60.87%、95.65%,特异性分别为90%、100%。NP-IgM检测的AUC值为0.797,NPIgG检测的AUC值为0.998。结论:优势表位区段抗原NP15-215可用于NP抗体检测,利用该抗原建立的NP-IgM/IgG间接ELISA检测方法可以很好地区分新型冠状病毒肺炎患者和健康者。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 n蛋白 优势表位区段抗原 诊断
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基于比色荧光纳米球的新冠病毒N蛋白侧向层析检测 被引量:1
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作者 张翼华 张志凌 《分析科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期265-270,共6页
新型冠状病毒传播速率快,且能导致严重呼吸综合征,危及生命安全。及时检测该病毒尤为重要。目前的检测手段各有优势,但仍需进一步提高。本文制备了一种比色荧光纳米球用于新冠病毒核衣壳蛋白(N protein)的侧向层析检测。该纳米球内有多... 新型冠状病毒传播速率快,且能导致严重呼吸综合征,危及生命安全。及时检测该病毒尤为重要。目前的检测手段各有优势,但仍需进一步提高。本文制备了一种比色荧光纳米球用于新冠病毒核衣壳蛋白(N protein)的侧向层析检测。该纳米球内有多个量子点可用于荧光定量检测,外有多个金纳米粒子用于比色定性检测。荧光检测限可达2.1 nmol/L。该方法重现性和特异性好,具有较强抗干扰能力。本研究为新冠病毒的快速检测提供了一种新方法。 展开更多
关键词 荧光球 纳米金 试纸条 新冠病毒 核衣壳蛋白
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GLYX-13 pretreatment ameliorates long-term isoflurane exposure-induced cognitive impairment in mice 被引量:4
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作者 Huan Liu Xiang-Dan Gong +3 位作者 Xin Zhao Yue Qian Xiao-Ping Gu Tian-Jiao Xia 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2020年第1期128-135,共8页
Accumulating evidence indicates that inhalation anesthetics induce or increase the risk of cognitive impairment. GLYX-13(rapastinel) acts on the glycine site of N-methyl-D-aspartate receptors(NMDARs) and has been ... Accumulating evidence indicates that inhalation anesthetics induce or increase the risk of cognitive impairment. GLYX-13(rapastinel) acts on the glycine site of N-methyl-D-aspartate receptors(NMDARs) and has been shown to enhance hippocampus-dependent learning and memory function. However, the mechanisms by which GLYX-13 affects learning and memory function are still unclear. In this study, we investigated these mechanisms in a mouse model of long-term anesthesia exposure. Mice were intravenously administered 1 mg/kg GLYX-13 at 2 hours before isoflurane exposure(1.5% for 6 hours). Cognitive function was assessed using the contextual fear conditioning test and the novel object recognition test. The mRNA expression and phosphorylated protein levels of NMDAR pathway components, N-methyl-D-aspartate receptor subunit 2B(NR2B)-Ca2+/calmodulin dependent protein kinase II(CaMKII)-cyclic adenosine monophosphate response element binding protein(CREB), in the hippocampus were evaluated by quantitative RT-PCR and western blot assay. Pretreatment with GLYX-13 ameliorated isoflurane exposure-induced cognitive impairment and restored NR2B, CaMKII and CREB mRNA and phosphorylated protein levels. Intracerebroventricular injection of KN93, a selective CaMKII inhibitor, significantly diminished the effect of GLYX-13 on cognitive function and NR2B, CaMKII and CREB levels in the hippocampus. Taken together, our findings suggest that GLYX-13 pretreatment alleviates isoflurane-induced cognitive dysfunction by protecting against perturbation of the NR2B/CaMKII/CREB signaling pathway in the hippocampus. Therefore, GLYX-13 may have therapeutic potential for the treatment of anesthesia-induced cognitive dysfunction. This study was approved by the Experimental Animal Ethics Committee of Drum Tower Hospital affiliated to the Medical College of Nanjing University, China(approval No. 20171102) on November 20, 2017. 展开更多
关键词 Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase II cognitive impairment contextual fear conditioning cyclic adenosine monophosphate response element binding protein GLYX-13 ISOFLURAnE n-methyl-D-aspartate receptor novel object recognition rapastinel
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核转录共抑制因子、转化生长因子β1、Smad4在重度宫腔粘连内膜组织中表达及临床意义 被引量:6
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作者 杨博萍 郭建新 +3 位作者 王昊 袁艺萍 池余刚 李力 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第17期1667-1672,共6页
目的探讨核转录共抑制因子(ski-related novel protein N,SnoN)在宫腔粘连(intrauterine adhesions,IUA)发病中的作用,及其与转化生长因子β1(transforming growth factor-β1,TGF-β1)、Smad4关系。方法收集重度宫腔粘连(sIUA组)和宫... 目的探讨核转录共抑制因子(ski-related novel protein N,SnoN)在宫腔粘连(intrauterine adhesions,IUA)发病中的作用,及其与转化生长因子β1(transforming growth factor-β1,TGF-β1)、Smad4关系。方法收集重度宫腔粘连(sIUA组)和宫腔无病变的子宫纵隔患者(对照组)宫内膜组织各20例,通过免疫组化、Western blot、RT-qPCR检测子宫内膜组织中SnoN、TGF-β1、Smad4的表达水平,并应用Spearman等级相关分析SnoN、TGF-β1、Smad4之间的相关性,探讨其与宫腔粘连发病的关系。结果sIUA组患者宫内膜组织中TGF-β1、Smad4表达水平明显高于对照组(P<0.01),而SnoN表达水平明显低于对照组(P<0.01)。在重度宫腔粘连宫内膜组织中,TGF-β1与Smad4的蛋白表达水平呈正相关(r=0.4689,P<0.05),而TGF-β1与SnoN的蛋白水平呈负相关(r=-0.4835,P<0.05)。结论SnoN可能通过TGF-β1/Smad4信号通路参与宫腔粘连的发病。 展开更多
关键词 核转录共抑制因子 转化生长因子β1/Smad4 重度宫腔粘连
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硫辛酰胺对高糖条件下肾小管上皮细胞氧化应激及转化生长因子β激活酶1和核转录共抑制因子蛋白表达的影响 被引量:6
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作者 毛彦稳 张小欢 +3 位作者 刘慧铭 王圆圆 汤磊 郭兵 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2019年第19期2993-2997,3003,共6页
目的通过观察高糖环境下给予硫辛酰胺(dl alpha lipoamide,ALM)干预后对细胞氧化应激水平、转化生长因子β激活激酶1(TAK1)及核转录共抑制因子(SnoN)蛋白表达的影响,探讨ALM减轻高糖诱导诱导的肾小管纤维化病变的可能机制。方法将体外... 目的通过观察高糖环境下给予硫辛酰胺(dl alpha lipoamide,ALM)干预后对细胞氧化应激水平、转化生长因子β激活激酶1(TAK1)及核转录共抑制因子(SnoN)蛋白表达的影响,探讨ALM减轻高糖诱导诱导的肾小管纤维化病变的可能机制。方法将体外培养的肾小管上皮细胞(NRK 52E)分为3组:正常糖培养组(NG)、高糖组培养组(HG)、高糖培养条件下加入ALM刺激组(ALM);采用细胞免疫荧光及Western Blot技术,进行细胞鉴定;氧化应激试剂盒检测体外培养的各组肾小管上皮细胞(NRK 52E cells)氧化应激水平;Western Blot技术检测高糖环境下NRK 52E细胞中,硫辛酰胺对TAK1、SnoN蛋白表达的影响;流式细胞技术和Western Blot技术检测ALM对大鼠肾小管上皮细胞纤维化过程的抑制作用。结果所培养细胞为肾小管上皮细胞并对高糖刺激敏感;高糖条件下给予ALM干预后,T SOD活性增强,MDA水平减少,且TAK1、p TAK1(Thr184/187)及CollagenⅢ蛋白表达水平减少,SnoN及钙黏蛋白(E cadherin)蛋白水平的表达上调。结论高糖环境下给予ALM干预后,肾小管上皮细胞的氧化应激水平降低,伴随TAK1的表达减少和SnoN蛋白表达增加,从而抑制肾小管上皮细胞向间质细胞转分化的发生及细胞外基质沉积,最终延缓肾小管上皮细胞纤维化的发生发展。 展开更多
关键词 硫辛酰胺 氧化应激 转化生长因子β激活激酶1 核转录共抑制因子 肾脏纤维化
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硫辛酸对糖尿病肾脏疾病大鼠肾脏组织氧化应激和SnoN蛋白表达影响的研究 被引量:4
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作者 周建文 毛彦娜 +3 位作者 刘炜 李彦格 管玉洁 田亮 《中国糖尿病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期132-136,共5页
目的探讨硫辛酸(ALA)对DKD大鼠肾脏的氧化应激和SnoN蛋白表达的影响。方法 24只SD大鼠随机分为正常对照组(NC)、糖尿病组(T1DM)和ALA干预组(ALA),每组各8只,T1DM组和ALA组建立T1DM模型,模型建立成功2周后,ALA组给予ALA灌胃,NC组与T1DM... 目的探讨硫辛酸(ALA)对DKD大鼠肾脏的氧化应激和SnoN蛋白表达的影响。方法 24只SD大鼠随机分为正常对照组(NC)、糖尿病组(T1DM)和ALA干预组(ALA),每组各8只,T1DM组和ALA组建立T1DM模型,模型建立成功2周后,ALA组给予ALA灌胃,NC组与T1DM组予同剂量生理盐水灌胃,于实验8周后处死大鼠,检测相应生化指标和氧化应激水平;Masson染色观察肾脏组织形态结构和阳性染色变化;RT-qPCR检测SnoN mRNA的表达;Western blot检测大鼠肾脏组织中SnoN、Smad泛素化调节因子2(Smurf2)蛋白表达水平;免疫共沉淀法检测SnoN泛素化降解程度。结果与NC组比较,T1DM组FPG[(5. 58±1. 02)vs(26. 78±1. 63)mmol/L]、Scr[(13. 75±1. 66)vs(34. 00±2. 78)μmol/L]、24 h尿蛋白(24 h UAlb)[(2. 99±0. 45)vs(20. 74±1. 07)mg/24 h]、丙二醛(MDA)含量[(2. 16±0. 19)vs(5. 82±0. 89)nmol/mg]、SnoN mRNA水平[(1. 00±0. 28)vs(3. 33±0. 29)]、Smurf2蛋白水平[(0. 42±0. 08)vs(1. 79±0. 27)]及SnoN泛素化降解升高(P<0. 05),总超氧化物歧化酶(T-SOD)活性[(88. 53±9. 76)vs(33. 41±7. 11)U/mg]、过氧化氢酶(CAT)活性[(34. 60±4. 51)vs(14. 36±2. 29)U/mg]、SnoN蛋白表达水平[(2. 64±0. 53)vs(0. 35±0. 11)]降低(P<0. 05),且T1DM组伴肾脏病变发生。与T1DM组比较,ALA组FPG[(26. 78±1. 63)vs(26. 63±2. 45)mmol/L,P>0. 05]差异无统计学意义,Scr[(34. 00±2. 78)vs(22. 57±1. 57)μmol/L]、24 h UAlb[(20. 74±1. 07)vs(15. 95±0. 56)mg/24 h]、MDA[(5. 82±0. 89)vs(3. 39±0. 38)nmol/mg]、Smurf2蛋白水平[(1. 79±0. 27)vs(1. 09±0. 17)]及SnoN泛素化降解降低(P<0. 05),T-SOD活性[(33. 41±7. 11)vs(50. 99±7. 52)U/mg]、CAT活性[(14. 36±2. 29)vs(27. 30±3. 17)U/mg]、SnoN蛋白水平[(0. 35±0. 11)vs(1. 04±0. 13)]升高(P<0. 05),SnoN mRNA水平[(3. 33±0. 29)vs(3. 13±0. 20)]差异无统计学意义(P>0. 05),且ALA组伴肾脏病变减轻。结论 ALA通过增强T1DM大鼠肾脏的抗氧化能力,减少Smurf2所介导SnoN的泛素化,恢复SnoN蛋白的表达,对DKD大鼠肾脏起保护作用。 展开更多
关键词 糖尿病肾脏疾病 硫辛酸 氧化应激 SnOn
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