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番茄SlDP1基因的克隆、生物信息学及表达特性分析
被引量:
2
1
作者
杜利欣
胡宗利
+1 位作者
张建苓
陈国平
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期68-74,共7页
DP基因属于DP/E2F转录因子家族,其编码的蛋白是E2F蛋白的二聚化分子伴侣,可能参与调控细胞周期、DNA复制、生长、分化、凋亡等多种细胞进程。根据SGN数据库登录的番茄序列,通过RT-PCR方法从野生型番茄中克隆了一个DP基因,命名为SlDP1。...
DP基因属于DP/E2F转录因子家族,其编码的蛋白是E2F蛋白的二聚化分子伴侣,可能参与调控细胞周期、DNA复制、生长、分化、凋亡等多种细胞进程。根据SGN数据库登录的番茄序列,通过RT-PCR方法从野生型番茄中克隆了一个DP基因,命名为SlDP1。生物信息学预测,SlDP1蛋白定位于细胞核,具有保守的DNA结合域、二聚化区域和C-末端及多个磷酸化位点。蛋白质二级结构预测SlDP1蛋白含51.50%的环状结构,34.55%的α螺旋和2.66%的β折叠。荧光定量PCR分析外源激素对野生型番茄SlDP1基因表达量的影响,发现该基因受外源性乙烯前体ACC的诱导。对环境因子应答的RT-PCR结果表明,在伤害和盐处理的叶中该基因表达不受诱导,而盐处理的根中该基因表达量提高。SlDP1基因表达模式分析表明,该基因在根、花、萼片及成熟时期果实中表达量较高。这些结果为进一步研究SlDP1基因在番茄生长发育过程的功能奠定了基础。
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关键词
sldp1
基因
生物信息学分析研究
表达模式
激素处理
非生物环境胁迫
下载PDF
职称材料
题名
番茄SlDP1基因的克隆、生物信息学及表达特性分析
被引量:
2
1
作者
杜利欣
胡宗利
张建苓
陈国平
机构
重庆大学生物工程学院
出处
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期68-74,共7页
基金
重庆市自然科学基金(CSTC
2011BB1068)
中央高校基本科研业务项目(CDJXS11230010)
文摘
DP基因属于DP/E2F转录因子家族,其编码的蛋白是E2F蛋白的二聚化分子伴侣,可能参与调控细胞周期、DNA复制、生长、分化、凋亡等多种细胞进程。根据SGN数据库登录的番茄序列,通过RT-PCR方法从野生型番茄中克隆了一个DP基因,命名为SlDP1。生物信息学预测,SlDP1蛋白定位于细胞核,具有保守的DNA结合域、二聚化区域和C-末端及多个磷酸化位点。蛋白质二级结构预测SlDP1蛋白含51.50%的环状结构,34.55%的α螺旋和2.66%的β折叠。荧光定量PCR分析外源激素对野生型番茄SlDP1基因表达量的影响,发现该基因受外源性乙烯前体ACC的诱导。对环境因子应答的RT-PCR结果表明,在伤害和盐处理的叶中该基因表达不受诱导,而盐处理的根中该基因表达量提高。SlDP1基因表达模式分析表明,该基因在根、花、萼片及成熟时期果实中表达量较高。这些结果为进一步研究SlDP1基因在番茄生长发育过程的功能奠定了基础。
关键词
sldp1
基因
生物信息学分析研究
表达模式
激素处理
非生物环境胁迫
Keywords
sldp1 gene
bioinformatics
expression pattern
hormone
abiotic environment stress
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
番茄SlDP1基因的克隆、生物信息学及表达特性分析
杜利欣
胡宗利
张建苓
陈国平
《植物研究》
CAS
CSCD
北大核心
2014
2
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