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茄子Ⅳ型查尔酮异构酶基因SmCHI2的克隆与分析
1
作者
周露
崔群香
+6 位作者
刘同金
班秋妍
袁颖辉
宁坤
范俊俊
张‧敏
沈慧玲
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第7期1475-1481,共7页
【目的】探究茄子花青素合成通路中关键酶SmCHI2的蛋白特性和表达特性,为完善茄子花青素生物合成途径和品质育种提供一定的理论基础。【方法】通过同源克隆获得茄子SmCHI2基因全长序列,利用在线分析工具对其蛋白理化性质进行预测,利用Cl...
【目的】探究茄子花青素合成通路中关键酶SmCHI2的蛋白特性和表达特性,为完善茄子花青素生物合成途径和品质育种提供一定的理论基础。【方法】通过同源克隆获得茄子SmCHI2基因全长序列,利用在线分析工具对其蛋白理化性质进行预测,利用ClustalX 1.7、GeneDoc 2.7.0和Mega 6.0软件进行蛋白序列比对和系统进化树分析,利用qRT-PCR分析SmCHI2基因的表达模式。【结果】SmCHI2基因编码区全长633 bp,编码210个氨基酸。蛋白理化性质分析显示SmCHI2蛋白分子量为23.98 kDa,理论等电点为4.81,且为不稳定的亲水性蛋白。二级和三级结构预测显示SmCHI2蛋白结构主要包括α-螺旋、随机卷曲、延伸链和β-转角。多序列比对表明SmCHI2与LcCHI(枸杞AIC33515.1)、LrCHI(黑枸杞AQZ26680.1)、CaCHI2(辣椒XP_016573438.1)和StCHI3(马铃薯XP_006365329.1)等Ⅳ型CHI蛋白具有相同的活性和识别位点,且在系统进化树中属于同一分支。亚细胞定位结果显示,SmCHI2蛋白在细胞核、细胞膜和细胞质中均有分布。表达分析显示,SmCHI2基因主要在紫色组织中表达,且在白色果皮中表达量显著低于紫色果皮。【结论】茄子中Ⅳ型CHI蛋白SmCHI2正调控茄子花青素的生物合成。
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关键词
茄子
smchi2
基因
克隆
生物信息学分析
表达特征
花青素
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职称材料
题名
茄子Ⅳ型查尔酮异构酶基因SmCHI2的克隆与分析
1
作者
周露
崔群香
刘同金
班秋妍
袁颖辉
宁坤
范俊俊
张‧敏
沈慧玲
机构
金陵科技学院园艺园林学院
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第7期1475-1481,共7页
基金
金陵科技学院高层次人才科研启动项目(jit-b-202053)
江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目[JBGS(2021)074]
江苏省农业自主创新项目[CX(21)3028]。
文摘
【目的】探究茄子花青素合成通路中关键酶SmCHI2的蛋白特性和表达特性,为完善茄子花青素生物合成途径和品质育种提供一定的理论基础。【方法】通过同源克隆获得茄子SmCHI2基因全长序列,利用在线分析工具对其蛋白理化性质进行预测,利用ClustalX 1.7、GeneDoc 2.7.0和Mega 6.0软件进行蛋白序列比对和系统进化树分析,利用qRT-PCR分析SmCHI2基因的表达模式。【结果】SmCHI2基因编码区全长633 bp,编码210个氨基酸。蛋白理化性质分析显示SmCHI2蛋白分子量为23.98 kDa,理论等电点为4.81,且为不稳定的亲水性蛋白。二级和三级结构预测显示SmCHI2蛋白结构主要包括α-螺旋、随机卷曲、延伸链和β-转角。多序列比对表明SmCHI2与LcCHI(枸杞AIC33515.1)、LrCHI(黑枸杞AQZ26680.1)、CaCHI2(辣椒XP_016573438.1)和StCHI3(马铃薯XP_006365329.1)等Ⅳ型CHI蛋白具有相同的活性和识别位点,且在系统进化树中属于同一分支。亚细胞定位结果显示,SmCHI2蛋白在细胞核、细胞膜和细胞质中均有分布。表达分析显示,SmCHI2基因主要在紫色组织中表达,且在白色果皮中表达量显著低于紫色果皮。【结论】茄子中Ⅳ型CHI蛋白SmCHI2正调控茄子花青素的生物合成。
关键词
茄子
smchi2
基因
克隆
生物信息学分析
表达特征
花青素
Keywords
Eggplant
smchi2 gene
Cloning
Bioinformatics analysis
Expression characteristics
Anthocyanin
分类号
S641.10 [农业科学—蔬菜学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
茄子Ⅳ型查尔酮异构酶基因SmCHI2的克隆与分析
周露
崔群香
刘同金
班秋妍
袁颖辉
宁坤
范俊俊
张‧敏
沈慧玲
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2023
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