黔东南小香羊与贵州原有其它山羊品种的线粒体DNA多态性比较

用Bam HⅠ、BglⅠ、BglⅡ、DraⅠ、EcoRⅠ、EcoRⅤ、HindⅢ、KpnⅠ、PstⅠ、PvuⅡ、SacⅠ、SalⅠ、Sm aⅠ、StuⅠ、XhoⅠ15 种识别6 碱基的限制性内切酶对黔东南小香羊和贵州原有3 个地方山羊品种的93 只个体的m tDNA 进行分析表明, Bam HⅠ、HindⅢ和SalⅠ3 种酶表现多态性; 共检出18 种限制性多态型,归纳得到3 种单倍型, 以单倍型Ⅰ和Ⅱ为基本单倍型。根据此2 种基本单倍型在所比较各品种中的不同分布比例, 以及遗传距离分析和品种间的聚类关系, 表明黔东南小香羊的群体遗传构成与贵州省原有其它3 个山羊品种不同, 从而为进一步确认其为一独立的品种提供了必要的分子生物学依据。

贵州小香羊MSTN基因内含子2和外显子3的多态性

为贵州小香羊选育及进一步研究MSTN基因与贵州小香羊生长性状的相关性提供理论依据,采用PCR-RFLP方法对67只贵州小香羊MSTN基因内含子2和外显子3进行了多态性分析。结果表明,所扩增内含子2中存在Bsp1286I酶切多态位点,杂合型(AB)为优势基因型,无纯合野生型(AA)和纯合突变型(BB);所扩增内含子2和外显子3中存在BstBI酶切多态位点,杂合型(CD)为优势基因型,纯合野生型(CC)和纯合突变型(DD)为非优势基因型,D等位基因为优势基因,且含有2个TatI正常酶切位点,但不存在多态性,不存在BsmFI酶切位点。

贵州小香羊ESR基因外显子1和4的多态性

为贵州小香羊的产羔数标记辅助选择提供科学依据,利用PCR-SSCP分析了贵州小香羊雌激素受体(estrogen receptor,ESR)基因外显子1和4的多态性。结果表明:贵州小香羊ESR基因外显子1和4的SSCP均呈现一种带型,命名为AA基因型(野生型),不存在多态性。贵州小香羊ESR基因外显子1和4序列的保守性高,该基因序列与贵州小香羊繁殖力的相关性有待进一步研究。

贵州小香羊FSHβ基因第2外显子SSCP多态性分析

为寻找与贵州小香羊繁殖力相关的分子标记提供基础数据,采用单链构象多态(SSCP)方法对在生殖中起重要作用的FSHβ基因外显子2的序列进行多态性检测,并对具有SSCP多态性的DNA片段进行测序分析。结果表明,在该特异性扩增产物中存在基因多态性,在94bp处检测到1个多态位点,该位点发生了G→A突变,出现3种基因型(AA、AB和BB)并导致编码的氨基酸由丙氨酸变为苏氨酸,A等位基因频率为62.3%,B等位基因频率为37.7%。

贵州小香羊FSH-β基因部分序列的RFLP多态性

为寻找与小香羊繁殖力相关的分子标记提供基础数据和科学依据,以贵州小香羊为试验材料,颈静脉采血后,提取血液全基因组DNA,根据NCBI Gene Bank山羊FSH-β基因序列(S64745.1)设计引物,采用限制性内切酶片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)方法对FSH-β基因内含子1与内含子2的序列进行多态性检测。结果表明:在两段特异性扩增产物中存在限制性酶切位点,不存在RFLP多态性。

贵州小香羊GH基因5'端侧翼区多态性与生长性能的关系

为贵州小香羊品种遗传资源的保护和进一步开发利用提供科学依据,利用单链构型多态性(SSCP)技术对贵州小香羊GH基因5’端侧翼区多态性进行筛选,并分析其与生长性能指标的关系。结果表明:贵州小香羊GH基因5’端侧翼区第60位、372位发现C→T的突变,均产生3种基因型,其中,第60位突变产生AA型、AB型和BB型,AA型为优势基因型,A等位基因为优势等位基因,且各生长性能指标(体重、体长、体高、胸围、管围)呈现AA基因型>AB基因型>BB基因型,但差异不显著(P>0.05);而第372位突变产生CD型、CC型和DD型,其中CD型为优势基因型,各基因型群体间的各项生长性能指标均没有显著差异(P>0.05)。GH基因5’端侧翼区存在多样性,但该多态性对贵州小香羊生长性能的影响甚微。

利用mtDNA Cytb基因探讨黔东南小香羊系统地位

黔东南小香羊和贵州白山羊之间的遗传关系一直存在争议,为此,对黔东南小香羊16个个体和贵州白山羊13个个体细胞色素b基因全序列进行了测定,通过遗传多样性和系统发育分析,探讨黔东南小香羊系统地位。结果表明:在2个贵州山羊群体中共观察到8种单倍型,2种单倍型共享,其中,贵州白山羊有7种单倍型,黔东南小香羊有3种单倍型;黔东南小香羊单倍型多样性(Hd)为0.625,核苷酸多样性(Pi)为0.00189,贵州白山羊的Hd和Pi分别为0.923和0.00324,贵州白山羊遗传多样性比黔东南小香羊丰富。结合从GenBank中检索获得的野生山羊、岩羊、绵羊细胞色素b基因序列构建分子系统发生树,结果显示,黔东南小香羊和贵州白山羊与胃石山羊亲缘关系最近,与我国野生岩羊亲缘关系较远。

黔东南小香羊GDF9基因遗传变异分析

采用直接测序法检测GDF9基因在黔东南小香羊群体中的单核苷酸多态性。结果表明:在GDF9基因外显子2的550位碱基处发生了突变(A→C)并导致组氨酸突变为脯氨酸;试验检测到AA型、Aa型和aa型3种基因型;A等位基因频率为0.666 7,a等位基因频率为0.333 4。

贵州小香羊生长激素基因的PCR-RFLP多态性分析

为给贵州小香羊品种遗传资源的合理开发利用及进一步选育提供科学依据,同时为更全面地了解其种质特性提供基础资料,利用PCR-RFLP技术对67只贵州小香羊生长激素基因外显子1到内含子2序列、外显子3到外显子5序列分别进行HaeⅢ和FokⅠ内切酶酶切位点多态性检测。结果表明,所扩增的生长激素基因外显子1到内含子2序列存在HaeⅢ酶切位点多态性,并表现为2种基因型AA和AB,基因频率分别为0.73和0.27,等位基因A的频率(0.87)高于等位基因B(0.13);外显子3到外显子5序列中未检测到FokⅠ酶切位点多态性。