基于癌症基因图谱数据库分析SNRPEP2在肝细胞癌中的表达及其临床意义

目的利用癌症基因图谱(TCGA)数据库探讨小核糖核蛋白多肽E假基因2(SNRPEP2)在肝细胞癌(HCC)中的表达及其临床意义。方法从TCGA数据库下载374例HCC组织样本和50例癌旁组织样本的转录组测序数据和临床资料,采用生物信息学方法,分析SNRPEP2在HCC中的表达水平及其与临床病理特征和预后的关系,运用Cox回归分析影响患者预后的危险因素并构建Nomogram预测模型,通过绘制ROC曲线评估SNRPEP2在HCC诊断中的效能。结果HCC组织中SNRPEP2表达水平明显高于癌旁正常组织(P<0.01)。HCC中SNRPEP2高表达与肿瘤的组织学分级(OR=2.539,P<0.01)、血清甲胎蛋白水平(OR=2.966,P<0.01)、血管浸润(OR=1.658,P<0.05)和邻近肝组织炎症(OR=1.703,P<0.05)均有关,且SNRPEP2高表达患者的总生存期(OS)、疾病特异性生存期(DSS)和无进展间隔期(PFI)均低于低表达患者(均P<0.05)。多因素Cox回归分析显示SNRPEP2表达水平是影响HCC患者OS的独立危险因素(HR=1.970,P<0.01)。ROC曲线分析显示SNRPEP2表达水平对于诊断HCC、T_(1)期、M_(0)期、病理分期I期,评估OS、DSS及PFI均具有良好的效能(均AUC>0.50)。结论SNRPEP2高表达是HCC预后不良的独立危险因素且具有良好的诊断效能,有成为HCC诊断和预后判断标志物的潜在应用价值。