目的评估珠海迪尔Smart MS 5020型基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)系统及其2630种数据库(以下简称Smart MS 5020系统)对临床微生物的鉴定能力。方法共纳入2016—2020年浙江大学医学院附属第二医院留存的临床分离菌株913...目的评估珠海迪尔Smart MS 5020型基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)系统及其2630种数据库(以下简称Smart MS 5020系统)对临床微生物的鉴定能力。方法共纳入2016—2020年浙江大学医学院附属第二医院留存的临床分离菌株913株,覆盖18个属52个种或复合群。采用直接涂抹法进行鉴定,比对仪器为德国布鲁克Biotyper MS系统及其DB2969数据库(以下简称Biotyper MS),对于两台质谱仪不一致的鉴定结果,采用16S rRNA扩增测序作为判定的金标准。针对复合群(鲍曼不动杆菌复合群、阴沟肠杆菌复合群以及肺炎克雷伯菌复合群),采用二代测序的鉴定结果作为金标准,统计学方法采用卡方检验。选取13株室内质控菌株作为重复性评估的检测样本,每株菌在Smart MS 5020系统上平行检测3次,判断其鉴定结果的一致性。结果对913株临床菌株,Biotyper MS系统种水平鉴定准确率为100%(913/913,95%CI:99.48%~99.58%),Smart MS 5020系统种水平鉴定准确率为99.78%(911/913,95%CI:99.12%~99.20%),2株表皮葡萄球菌鉴定为柯氏葡萄球菌;在临床微生物的鉴定能力方面,2种方法差异无统计学意义(P>0.05)。重复性评估结果显示,Smart MS 5020系统对13株室内质控菌株的鉴定结果完全一致。结论Smart MS 5020系统对临床常见微生物有很好的鉴定能力,包括复合群的鉴定能准确鉴定到复合群,对一些难区分菌如嗜血杆菌、链球菌等均能准确鉴定,但对复合群内具体种的细分能力有限,需要结合分子生物学、血清学或其他补充实验来准确鉴定。展开更多
文摘目的评估珠海迪尔Smart MS 5020型基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)系统及其2630种数据库(以下简称Smart MS 5020系统)对临床微生物的鉴定能力。方法共纳入2016—2020年浙江大学医学院附属第二医院留存的临床分离菌株913株,覆盖18个属52个种或复合群。采用直接涂抹法进行鉴定,比对仪器为德国布鲁克Biotyper MS系统及其DB2969数据库(以下简称Biotyper MS),对于两台质谱仪不一致的鉴定结果,采用16S rRNA扩增测序作为判定的金标准。针对复合群(鲍曼不动杆菌复合群、阴沟肠杆菌复合群以及肺炎克雷伯菌复合群),采用二代测序的鉴定结果作为金标准,统计学方法采用卡方检验。选取13株室内质控菌株作为重复性评估的检测样本,每株菌在Smart MS 5020系统上平行检测3次,判断其鉴定结果的一致性。结果对913株临床菌株,Biotyper MS系统种水平鉴定准确率为100%(913/913,95%CI:99.48%~99.58%),Smart MS 5020系统种水平鉴定准确率为99.78%(911/913,95%CI:99.12%~99.20%),2株表皮葡萄球菌鉴定为柯氏葡萄球菌;在临床微生物的鉴定能力方面,2种方法差异无统计学意义(P>0.05)。重复性评估结果显示,Smart MS 5020系统对13株室内质控菌株的鉴定结果完全一致。结论Smart MS 5020系统对临床常见微生物有很好的鉴定能力,包括复合群的鉴定能准确鉴定到复合群,对一些难区分菌如嗜血杆菌、链球菌等均能准确鉴定,但对复合群内具体种的细分能力有限,需要结合分子生物学、血清学或其他补充实验来准确鉴定。
