丹参转录因子SmbHLH93的克隆及表达模式分析

目的克隆丹参碱性螺旋-环-螺旋(b HLH)类转录因子SmbHLH93,并初步探究该基因的功能。方法采用PCR和RT-PCR技术分别从DNA和c DNA水平克隆得到了SmbHLH93基因,进一步通过BD Walking获得了该基因的5’启动子区。生物信息学分析SmbHLH93蛋白的理化性质、结构特点和系统进化关系。结合启动子区分析软件和q PCR,研究SmbHLH93在丹参不同部位和环境诱导下的表达模式。结果获得SmbHLH93基因序列954 bp和5’启动子区1 583 bp,其中开放阅读框(ORF)657 bp,有3个内含子和4个外显子,编码218个氨基酸,含有b HLH和ACT_UUR-ACR-like结构域,无跨膜区域,可能定位于细胞核。表达模式分析结果显示该基因的表达量在根中最高,茎中最低,且随着花的形成逐渐降低。光和低温诱导SmbHLH93的高表达,而水杨酸(SA)抑制其表达。结论克隆得到丹参b HLH类转录因子新成员SmbHLH93,初步预测其参与了丹参花的发育过程和丹参次生代谢途径的调控。