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应用优化的双向电泳技术建立纤维堆囊菌So0157-2蛋白质组数据库(英文)
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作者 张鹏翼 李越中 +3 位作者 吴志红 刘红 徐培培 熊娟 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第1期86-94,共9页
堆囊菌丰富的次级代谢产物是新药的重要来源,而蛋白质组学分析是研究代谢调控的有效方法.然而堆囊菌含有大量的胞外多糖以及黏液,干扰了蛋白质组学分析中蛋白质的溶解度、分辨率及重现性.为了高通量地筛选Sorangium cellulosumSo0157-2... 堆囊菌丰富的次级代谢产物是新药的重要来源,而蛋白质组学分析是研究代谢调控的有效方法.然而堆囊菌含有大量的胞外多糖以及黏液,干扰了蛋白质组学分析中蛋白质的溶解度、分辨率及重现性.为了高通量地筛选Sorangium cellulosumSo0157-2表达的特异性蛋白,实验优化了S.cellulosum So0157-2双向电泳方法.首先,S.cellulosum So0157-2蛋白在裂解液中有更好的溶解度.pH 3~10非线性胶条和1 mg的蛋白上样量适用于第一向等电聚焦,分别提高了蛋白质点的分辨率和低丰度蛋白质的表达.15%SDS-PAGE改善了S.cellulosum So0157-2蛋白分离的分辨率和重现性.最终,通过优化的双向电泳方法获得了S.cellulosum So0157-2在M26培养基中培养3天的全蛋白质表达谱,并检测到552个蛋白质点.进而对表达蛋白通过MALDI-TOF-MS进行质谱鉴定,其中474个蛋白质得到鉴定,鉴定率85.9%.得到鉴定的蛋白质包括细胞结构和功能组分,以及细胞代谢合成酶类,其中8个蛋白质与糖类的转化和代谢相关,这有助于糖基化埃博霉素A的深入研究.该优化方法为进一步建立纤维堆囊菌So0157-2在各种培养条件下的蛋白质组表达数据库打下基础. 展开更多
关键词 双向电泳 纤维堆囊菌so0157-2 优化 蛋白质组
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粘细菌Sorangium cellulosum So0157-2产生的两个埃博霉素类化合物(英文) 被引量:3
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作者 赵林 赵宝兵 +2 位作者 鲁春华 李越中 沈月毛 《中国天然药物》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2010年第4期298-300,共3页
目的:对粘细菌Sorangium cellulosum So0157-2的化学成分进行研究。方法:通过色谱层析对提取物进行分离纯化,并通过波谱解析(一维、二维的核磁共振谱和质谱)确定了化合物的结构。结果:分别鉴定为seco-epothiloneA(1)和1-methyl-seco-epo... 目的:对粘细菌Sorangium cellulosum So0157-2的化学成分进行研究。方法:通过色谱层析对提取物进行分离纯化,并通过波谱解析(一维、二维的核磁共振谱和质谱)确定了化合物的结构。结果:分别鉴定为seco-epothiloneA(1)和1-methyl-seco-epothiloneA(2)。结论:化合物1和2都是首次从该菌株中分离得到。其中1是首次分离得到的新天然产物。 展开更多
关键词 Sorangium cellulosum so0157-2 埃博霉素 NMR
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Four natural epothilone derivatives isolated from Sorangium cellulosum strain So0157-2 被引量:1
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作者 鲁春华 赵林 +1 位作者 李越中 沈月毛 《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》 CAS CSCD 2013年第1期28-31,共4页
Four natural epothilone analogues, including two 14-membered epothilones L (1), L1 (2) and two epoxide opened epothilones A (3) and B (4), were isolated from the extract of fermentation adsorber resin of Soran... Four natural epothilone analogues, including two 14-membered epothilones L (1), L1 (2) and two epoxide opened epothilones A (3) and B (4), were isolated from the extract of fermentation adsorber resin of Sorangium cellulosum strain So0157-2. Their structures were elucidated on the basis of comprehensive NMR and MS data. They are all isolated from the wild type S. cellulosum strain So0157-2 as natural products for the first time. 展开更多
关键词 14-Membered epothilones Epoxide opened epothilone Sorangium cellulosum strain so0157-2
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