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聚合酶链式反应结合Southern杂交检测外源DNA转化根癌农杆菌
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作者 金勇丰 张上隆 张耀洲 《生物技术》 CAS CSCD 1997年第6期11-12,29,共3页
本文介绍检测外源DNA转化粮癌农杆菌的新方法,将PCR结合Southern杂交进行检测,与直接进行菌落杂交和点杂交相比。更为灵敏省时。
关键词 转化 根癌农杆菌 southern杂交 聚合酶链反应
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PCR-SSOP并Southern杂交检测实验室筛选耐氧氟沙星结核分枝杆菌的研究
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作者 张健源 王甦民 +7 位作者 李传友 田苗 张旭霞 赵冰 李卫民 赵雁林 邱云青 马玙 《结核病与胸部肿瘤》 2004年第3期212-216,共5页
目的 探讨PCR-SSCP并Southern杂交检测耐氧氟沙星(OFLX)结核分枝杆菌的可行性,并探索结核分枝杆菌对OFLX敏感与耐药的界限。方法 ①体外诱导筛选耐OFLX的自然突变株,并检测OFLX对这些耐药株的最低抑菌浓度(MIC)和最低杀菌浓度(MBC);... 目的 探讨PCR-SSCP并Southern杂交检测耐氧氟沙星(OFLX)结核分枝杆菌的可行性,并探索结核分枝杆菌对OFLX敏感与耐药的界限。方法 ①体外诱导筛选耐OFLX的自然突变株,并检测OFLX对这些耐药株的最低抑菌浓度(MIC)和最低杀菌浓度(MBC);②扩增结核分枝杆菌的gyrA基因(包括H37Rv、H37Ra、临床分离的OFLX敏感株及体外诱导筛选的耐OFLX的菌株)并对此扩增产物进行单链构象多态性(SSCP)分析及Southern杂交,以判定应用该技术的效果。结果经PCR-SSCP及Southern杂交检测,85株体外诱导的自然耐OFLX菌株,均检测到gyrA基因突变。研究发现.在OFLX 10μg/ml这一点上,明显地存在着一个耐OFLX结核分枝杆菌对OFLX敏感与耐药并存的交叉区。结论PCR-SSCP合并Southern杂交可清晰地区分OFLN敏感与耐药株。本研究结果显示,以10μg/ml为界作,为判别耐OFLX的标准是适宜的。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 southern杂交 体外诱导 氧氟沙星 耐药株 PCR-SSCP 筛选 MBC 敏感株 PCR-SSOP
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RT-PCR/Southern杂交方法检测肝癌患者外周血AFP mRNA 被引量:4
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作者 智慧 詹俊 +3 位作者 邓庆丽 黄志清 周雨迁 黄志明 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2001年第4期324-327,共4页
目的 寻找一种敏感的方法以检外外周血中的肝癌细胞。方法 分离原发性肝癌患者以及肝硬化、急慢性肝炎、肝转移癌、肝脏良性肿瘤患者和健康志愿者的外周血单个核细胞 ,提取单个核细胞的总RAN ,进行RT -PCR/Southern杂交检测AFPmRNA。... 目的 寻找一种敏感的方法以检外外周血中的肝癌细胞。方法 分离原发性肝癌患者以及肝硬化、急慢性肝炎、肝转移癌、肝脏良性肿瘤患者和健康志愿者的外周血单个核细胞 ,提取单个核细胞的总RAN ,进行RT -PCR/Southern杂交检测AFPmRNA。结果 原发性肝癌患者外周血AFPmRAN的检出率为 41.4% ,其检出率与肿瘤大小以及TNM分期有关 ,对照组均为阴性。结论 肝癌患者外周血中的AFPmRNA可以作为肝癌细胞的血液微小转移的标志物。 展开更多
关键词 肝细胞癌 微小转移 AFP MRNA 逆转录聚合酶链式反应 southern杂交
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非同位素PCR及Southern印迹杂交分析检测脆性X综合征FMR-1基因突变 被引量:8
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作者 李红 肖丽娟 韩冰 《中国优生与遗传杂志》 2005年第4期16-18,共3页
目的 建立一种非同位素的检测脆性X综合征智力缺陷基因(FMR - 1)突变的方法。方法 采用PCR技术结合Southern印迹杂交技术对FMR - 1基因进行分析,进而确定其突变类型。结果 共对190例样本进行了检测,其中2例为女性前突变携带者,1例为... 目的 建立一种非同位素的检测脆性X综合征智力缺陷基因(FMR - 1)突变的方法。方法 采用PCR技术结合Southern印迹杂交技术对FMR - 1基因进行分析,进而确定其突变类型。结果 共对190例样本进行了检测,其中2例为女性前突变携带者,1例为女性全突变患者。结论 非同位素PCR方法可以简便、安全、可靠地检测FMR - 1基因中(CGG)n重复拷贝数,可作为临床上对脆性X综合征的筛查的首选方法;而非同位素Southern印迹杂交可对结果不确定者进一步进行检测。 展开更多
关键词 非同位素PCR southern印迹杂交分析 检测 脆性X综合征 FMR-1基因 突变
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Southern杂交方法用于近交系小鼠H-2基因检测 被引量:1
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作者 马丽颖 刘双环 +1 位作者 岳秉飞 贺争鸣 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 2008年第1期62-64,共3页
目的建立一种简便、快捷、准确的检测方法用于近交系小鼠的遗传检测。方法根据近交系小鼠的H-2基因序列设计相应的探针,并标记生物素,利用微孔板Southern杂交技术,使探针与模板DNA杂交,再加入亲和素标记的辣根过氧化物酶进行酶显色反应... 目的建立一种简便、快捷、准确的检测方法用于近交系小鼠的遗传检测。方法根据近交系小鼠的H-2基因序列设计相应的探针,并标记生物素,利用微孔板Southern杂交技术,使探针与模板DNA杂交,再加入亲和素标记的辣根过氧化物酶进行酶显色反应,通过酶标仪检测杂交结果,以确定近交系小鼠的基因型。结果57BL/6和C57BL/10为H-2b型;DBA/2和Scid为H-2d型;615和C3H为H-2k型;NCPC/2、TA1、TA2和T739均为H-2b型。结论通过Southern杂交检测可以确定近交系小鼠的基因型。该检测方法简便、易行,检测结果客观,可以应用于近交系小鼠的遗传检测。 展开更多
关键词 southern杂交 H-2基因 近交系 小鼠
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基于适配体-杂交链式反应比色检测生鲜牛乳中四环素类抗生素
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作者 刘长勇 卢春霞 +3 位作者 兰国伟 王娟 唐宗贵 陈霞 《理化检验(化学分册)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期371-377,共7页
)以特异性识别四环素类抗生素(TCs)的广谱型适配体为识别元件,结合杂交链式反应(HCR)信号放大策略,提出了一种TCs多残留比色检测方法,并优化了检测条件和进行了方法学考察。取40 nmol·L^(-1)生物素化检测探针(bio-DP)溶液加入到包... )以特异性识别四环素类抗生素(TCs)的广谱型适配体为识别元件,结合杂交链式反应(HCR)信号放大策略,提出了一种TCs多残留比色检测方法,并优化了检测条件和进行了方法学考察。取40 nmol·L^(-1)生物素化检测探针(bio-DP)溶液加入到包被有亲和素的酶标板中,室温孵育后加入牛血清白蛋白(BSA)溶液,封闭反应1 h。加入生鲜牛乳样品稀释液,室温孵育20 min,如果样品中含有TCs,TCs与bio-DP的适配体序列结合,其发夹结构被打开。加入200 nmol·L^(-1)生物素化发夹DNA1(bio-H1)溶液和200 nmol·L^(-1)生物素化发夹DNA2(bio-H2)溶液,室温下进行HCR 40 min,从而形成具有多个重复单元的双链DNA(dsDNA)纳米线。加入辣根过氧化物酶(HRP)标记链霉亲和素(SA-HRP),室温孵育标记dsDNA。加入显色剂[含3,3′,5,5′-四甲基联苯胺(TMB)],HRP催化TMB生成蓝色物质,显色5~8 min后终止反应,在酶标仪中于450 nm测量上述体系的吸光度。结果显示,bio-DP对四环素、土霉素、金霉素和多西环素具有高特异性,和卡那霉素、庆大霉素、氨苄青霉素、泰乐菌素、磺胺嘧啶和恩诺沙星等抗生素无交叉反应。四环素、土霉素、金霉素和多西环素的质量浓度总和在0.8~100μg·L^(-1)内与对应的吸光度总和呈线性关系,检出限(3s/k)为0.18μg·L^(-1)。对生鲜牛乳样品进行加标回收试验,TCs回收率为86.4%~106%,测定值的相对标准偏差(n=3)为2.5%~7.1%。方法应用于生鲜牛乳样品的分析,检测结果与国家标准方法GB 31658.6-2021差异不显著(P>0.05),检出的TCs总量也均未超标(GB 31650-2019)。与文献报道的其他方法相比,上述方法兼具简单、快速、检出限低、准确度高等优点,适用于食品中四环素类抗生素多残留的快速检测。 展开更多
关键词 四环素类抗生素 适配体 杂交链式反应 比色检测
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应用Southern印迹杂交法检测转移基因在宿主细胞中的整合 被引量:1
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作者 阳小卫 王玮 +1 位作者 夏学鸣 陈子兴 《苏州医学院学报》 2001年第2期114-116,共3页
目的 应用Southern印迹杂交法 (Southernblot)证实转移基因整合至宿主细胞基因组DNA。方法 酚氯仿法提取基因转导的PA317/AIM及K5 6 2 /AIM细胞基因组DNA ,以聚合酶链反应 (PCR)扩增转移基因片段 ;随机引物法标记3 2 P -DNA探针 ,与经... 目的 应用Southern印迹杂交法 (Southernblot)证实转移基因整合至宿主细胞基因组DNA。方法 酚氯仿法提取基因转导的PA317/AIM及K5 6 2 /AIM细胞基因组DNA ,以聚合酶链反应 (PCR)扩增转移基因片段 ;随机引物法标记3 2 P -DNA探针 ,与经BamHI酶切、琼脂糖凝胶电泳、转移至尼龙膜的基因组DNA进行Southern杂交反应 ,检测转移基因的整合。结果 PCR反应和Southernblot分析证实转移基因存在于受体细胞基因组DNA中。结论 Southern印迹杂交法证实转移基因稳定整合至逆转录病毒生产细胞PA317/AIM及靶细胞K5 6 2 /AIM中。 展开更多
关键词 southern印迹杂交 聚合酶链反应 转移基因 基因组 肿瘤 基因治疗 宿主细胞
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RT-PCR/Southern杂交法检测穹窿海马伞切割大鼠海马Brn-4 mRNA的表达变化
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作者 董传明 秦建兵 +3 位作者 金国华 王磊 朱蕙霞 田美玲 《南通大学学报(医学版)》 2007年第6期465-467,470,共4页
目的:探讨切割穹窿海马伞大鼠海马与正常海马内Brn-4 mRNA表达的差异。方法:42只SD大鼠随机分成正常对照组和切割穹窿海马伞后1、3、7、14、21及28d组。取各组大鼠的海马组织,提取总RNA,采用RT-PCR/Southern杂交方法分析穹窿海马伞切割... 目的:探讨切割穹窿海马伞大鼠海马与正常海马内Brn-4 mRNA表达的差异。方法:42只SD大鼠随机分成正常对照组和切割穹窿海马伞后1、3、7、14、21及28d组。取各组大鼠的海马组织,提取总RNA,采用RT-PCR/Southern杂交方法分析穹窿海马伞切割后海马内Brn-4 mRNA的表达变化。结果:海马内Brn-4 mRNA的表达量在切割后第3d开始升高,14d达到最高水平,随后下降,28d左右恢复至正常水平。结论:切割穹窿海马伞后海马内Brn-4mRNA表达明显上调,可能与促进海马内移植的或自体的神经干细胞向神经元分化有关。 展开更多
关键词 穹窿海马伞切割 海马 Brn-4 逆转录聚合酶链反应 southern杂交 大鼠
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基于改进的Southern杂交法检测古树木端粒长度的研究
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作者 门璟煜 郑广顺 +6 位作者 孙丽春 孙玉萍 杨颖 于婷乔 刘海洋 陈玉珍 卢存福 《中国农学通报》 2018年第13期24-30,共7页
研究旨在利用DNA印迹法测量端粒长度从而预测植物的年龄,但木本植物体内富含黄酮类、酚类、多糖、萜类等次生代谢物质,严重影响了提取的基因组DNA产量和质量,以及后续的酶切及杂交实验结果。笔者以北京颐和园5种古树为实验材料,在传统C... 研究旨在利用DNA印迹法测量端粒长度从而预测植物的年龄,但木本植物体内富含黄酮类、酚类、多糖、萜类等次生代谢物质,严重影响了提取的基因组DNA产量和质量,以及后续的酶切及杂交实验结果。笔者以北京颐和园5种古树为实验材料,在传统CTAB法提取DNA基础上,不同树种分别添加2%~6%PVP,可有效去除次生代谢物质对DNA的干扰,可被限制性内切酶HinfⅠ酶切完全。同时,对DNA印迹法的其他实验参数如DNA量、曝光时间进行了优化,并进行了3种不同年龄古树端粒长度测定,结果显示古树的平均端粒长度要高于幼树,本研究建立的实验方法为多年生林木特别是古树端粒长度、树龄检测与寿命预测等提供了参考。 展开更多
关键词 古树 端粒长度 southern杂交 PVP
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尿液基细胞荧光原位杂交检测对膀胱尿路上皮癌的诊断价值
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作者 黄永进 刘志彬 +2 位作者 董格红 车宣言 张勇 《现代泌尿外科杂志》 CAS 2024年第6期505-509,共5页
目的探讨尿液基细胞学(LBC)靶向的荧光原位杂交(FISH)对膀胱尿路上皮癌(BUC)的诊断价值。方法回顾性收集2020年10月—2022年10月于首都医科大学附属北京天坛医院泌尿外科行膀胱镜检查的128例患者的临床资料。所有患者在行膀胱镜检查前... 目的探讨尿液基细胞学(LBC)靶向的荧光原位杂交(FISH)对膀胱尿路上皮癌(BUC)的诊断价值。方法回顾性收集2020年10月—2022年10月于首都医科大学附属北京天坛医院泌尿外科行膀胱镜检查的128例患者的临床资料。所有患者在行膀胱镜检查前进行尿核基质蛋白22(NMP22)检测、尿LBC检测与尿LBC靶向的FISH检测,以术后病理结果为标准,分析3种检查方法的灵敏度和特异度。结果NMP22、尿LBC与LBC靶向的FISH的灵敏度分别为61.11%、79.17%、82.46%,特异度分别为57.14%、73.21%、86.67%;NMP22、尿LBC的灵敏度在检测高级别BUC时优于低级别,差异有统计学意义(P=0.01,P=0.03);3种方法对肌层浸润性膀胱癌与非肌层浸润性膀胱癌检测的灵敏度比较,差异无统计学意义(P≥0.05)。结论尿LBC靶向的FISH对BUC诊断的灵敏度和特异度较高,尤其是对于低级别BUC,可以作为BUC早期筛查、诊断的重要方法。 展开更多
关键词 膀胱尿路上皮癌 荧光原位杂交 尿核基质蛋白22 尿液基细胞学检测
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象雄半细毛羊、藏系绵羊杂交F1代与其父本、母本品种的屠宰检测研究
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作者 罗布确 索朗杰布 +2 位作者 罗布占堆 萨珍 索南措姆 《现代畜牧科技》 2024年第8期37-39,共3页
该研究旨在比较象雄半细毛羊与藏系绵羊杂交F1代与其父本、母本品种在屠宰性能方面的差异,通过系统的屠宰检测,评估各品种在屠宰率、胴体重量和肉质等关键指标上的表现。结果表明,杂交F1代在一些关键屠宰性能指标上展现出了优于或等同... 该研究旨在比较象雄半细毛羊与藏系绵羊杂交F1代与其父本、母本品种在屠宰性能方面的差异,通过系统的屠宰检测,评估各品种在屠宰率、胴体重量和肉质等关键指标上的表现。结果表明,杂交F1代在一些关键屠宰性能指标上展现出了优于或等同于其父本、母本品种的表现,尤其在肉质方面表现出潜在的改良优势。该项研究不仅为肉用羊的品种改良提供了试验依据,也为满足市场对高质量羊肉的需求提供良好途径。 展开更多
关键词 半细毛羊 杂交 父本 母本 检测
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PCR-荧光法与PCR-膜杂交法在检测HPV-DNA中的比较分析
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作者 吴艳婷 《中文科技期刊数据库(文摘版)医药卫生》 2024年第2期0044-0046,共3页
分析PCR-荧光法与PCR-膜杂交法在检测HPV-DNA中的比较。方法 选取HPV-DNA检测的女性患者114例,时间为2020年7月-2022年7月。所有患者在明确细胞学诊断的基础上,分别采用PCR-荧光法和PCR膜杂交法检测HPV-DNA,比较各组HPV-DNA阳性率。结果... 分析PCR-荧光法与PCR-膜杂交法在检测HPV-DNA中的比较。方法 选取HPV-DNA检测的女性患者114例,时间为2020年7月-2022年7月。所有患者在明确细胞学诊断的基础上,分别采用PCR-荧光法和PCR膜杂交法检测HPV-DNA,比较各组HPV-DNA阳性率。结果 细胞学诊断结果显示,所选114例患者中,85例细胞正常,29例细胞异常。其中15例为ASC-H,12例为低级别鳞状上皮增生,1例为 HSIL,1例为 HSIL。、SCC(宫颈鳞癌)1例。HPV-DNA检测结果显示,细胞正常组与细胞异常组相比,用PCR-荧光染色及PCR-膜杂交方法对大肠癌的检出率,经统计学处理,均有统计学意义, P<0.05。PCR-荧光和PCR-膜杂交分别为12.94%和28.24%,二者相比,有显著差异,P<0.05。细胞异常组中,PCR-荧光和PCR-膜杂交分别为93。10%和96 5%,P>0.05。结论 在HPV-DNA检测当中,PCR核酸扩增检测技术的灵敏度、特异度都比较高。其中PCR-荧光法在临床筛查诊疗当中应用价值更高,PCR-膜杂交法在非高危性HPV检测及科研方面优势更明显。临床上对于HPV诊断可采取细胞学检查与HPV-DNA检测联合应用的方法,可以使准确性大大提高,为临床提供充分依据。 展开更多
关键词 PCR-荧光法 PCR-膜杂交 HPV-DNA检测
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近江牡蛎Hsc70蛋白基因cDNA片段的克隆及Southern杂交和RT-PCR分析 被引量:12
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作者 张其中 吴信忠 +1 位作者 高劲松 潘金培 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第5期708-712,共5页
In order to elucidate the molecular mechanisms of the oyster (Crassostrea ariakensis) against adverse stimulating factors, we cloned and sequenced a partial cDNA encoding a 70 kDa heat shock cognate protein (Hsc70) fr... In order to elucidate the molecular mechanisms of the oyster (Crassostrea ariakensis) against adverse stimulating factors, we cloned and sequenced a partial cDNA encoding a 70 kDa heat shock cognate protein (Hsc70) from the oyster. The live oysters were obtained from Chengcun, Yangxi County, Guangdong Province, China. Various tissues, including mantle, gills, adductor muscle, heart and blood cells, were respectively collected from 5 untreated live oysters or treated ones at 36℃ for 1 5 hours, and immediately frozen in liquid nitrogen except for the blood cells which were suspended with Trizol Reagent after centrifugation ( 12 000 r/min for 30 s) and stored at -20℃. Total RNA was isolated using Trizol Reagent according to the manufacture’s instructions. The first strand cDNA was synthesized using reverse transcriptase Superscript Ⅱ according to the manufacture’s instructions. The primers were designed from a conserved region of C. gigas Hsc70 cDNA sequence (GeneBank accession No. AF144646). The polymerase chain reaction (PCR) was performed for 30 cycles with denaturation at 94℃ for 30 s, annealing at 49℃ for 40 s, and elongation at 72℃ for 30 s. The product was cloned to pGEM T easy vector and sequenced. It is 509 base pairs (bp) and possesses 94% identity with the cDNA encoding C. gigas Hsc70 using Blastn. This homology was strongly confirmed by amino acid sequence comparison using the Blastx (99%). The 509 bp fragment was labeled with α 32 pdCTP and a random primer DNA labeling kit and employed as a probe to perform Southern blotting, the result demonstrated that the cDNA came from a partial mRNA transcript of C. ariakensis genomic DNA gene. The polymerase chain reaction (PCR) was carried out to investigate the expression of Hsc70, Using the cDNAs of several tissues, such as gills (heat shocked), mantle, adductor muscle (heat shocked), heart, blood cells (one sample with heat shock for 1 5 hours at 36℃ and another without any stimulus). The PCR results revealed that Hsc70 transcripts could be detected in all the tissues analyzed and greatly increased in the tissues with heat shock. The results showed that the Hsc70 is ubiquitously and constitutively expressed but can be stimulated by heat shock. All the facts above firmly established that the cloned cDNA fragment was a part of the cDNA encoding a Hsc70 protein in the oyster C. ariakensis . 展开更多
关键词 近江牡蛎 Hsc70蛋白基因 CDNA片段 克隆 southern杂交 RT-PCR分析
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地高辛标记探针Southern印迹杂交技术要点及改进 被引量:7
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作者 刘立鸿 许璐 +2 位作者 汪凯 张富春 马正海 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第3期57-59,共3页
Southern印迹杂交技术是检测特定DNA片段的常规方法之一,其操作程序繁琐,对基因组DNA的提取、纯化、酶切等均有较高要求,要获得理想杂交结果需要反复摸索。总结地高辛标记探针Southern印迹杂交的技术要点,并结合具体操作提出改良方案。
关键词 地高辛 southern杂交 改进 技术要点
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一种简捷的Southern印迹杂交方法 被引量:8
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作者 朱华晨 许新萍 李宝健 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期128-130,共3页
在综合前人方法的基础上,发展了一种简捷、灵敏、廉价、效果可靠的Southern印迹杂交方案。使用0 4mol LNaOH溶液将琼脂糖凝胶上的DNA在变性的同时转移到尼龙膜上,晾干膜后无需固定就可以直接用于杂交。预杂交液和杂交液选用Church缓冲系... 在综合前人方法的基础上,发展了一种简捷、灵敏、廉价、效果可靠的Southern印迹杂交方案。使用0 4mol LNaOH溶液将琼脂糖凝胶上的DNA在变性的同时转移到尼龙膜上,晾干膜后无需固定就可以直接用于杂交。预杂交液和杂交液选用Church缓冲系统,该缓冲系统中仅需10g LBSA作为封闭剂即可。整个洗膜过程可简化为一种溶液、2~3次洗涤。碱变性及转移后的尼龙膜,也可以用于地高辛(DIG)等非放射性检测系统,并可耐多轮杂交和洗脱。本方法可适用于包括高等植物基因组在内的多种生物材料的DNA检测。 展开更多
关键词 southern印迹 DNA 杂交 植物基因组
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DNA芯片制作原理及其杂交信号检测方法 被引量:33
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作者 张天浩 张春平 +1 位作者 张光寅 陈瑞阳 《生物工程进展》 CAS CSCD 2000年第2期64-68,共5页
文章讨论了DNA芯片的制作原理和杂交信号的检测方法。依其结构 ,DNA芯片可分为两种形式 ,DNA阵列和寡核苷酸微芯片。DNA芯片的制作方法主要有光导原位合成法和自动化点样法。DNA芯片与标记的探针或DNA样品杂交 ,并通过探测杂交信号谱型... 文章讨论了DNA芯片的制作原理和杂交信号的检测方法。依其结构 ,DNA芯片可分为两种形式 ,DNA阵列和寡核苷酸微芯片。DNA芯片的制作方法主要有光导原位合成法和自动化点样法。DNA芯片与标记的探针或DNA样品杂交 ,并通过探测杂交信号谱型来实现DNA序列或基因表达的分析。适应于DNA芯片的发展 ,同时出现了许多新型的杂交信号检测方法。主要有激光荧光扫描显微镜、激光扫描共焦显微镜、结合使用CCD相机的荧光显微镜、光纤生物传感器、化学发生法、光激发磷光物质存储屏法、光散射法等。 展开更多
关键词 DNA芯片 分子杂交 信号检测 制作原理 杂交信号
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华山新麦草特异重复序列的筛选、克隆及Southern杂交分析 被引量:5
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作者 陈林刚 武军 +5 位作者 赵继新 刘淑会 杨群慧 杜万里 庞玉辉 陈新宏 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期23-28,共6页
为了寻找华山新麦草特异重复序列,以华山新麦草、栽培一粒小麦、栽培二粒小麦、野生一粒小麦、野生二粒小麦、圆锥小麦、阿拉拉特小麦、茹科夫斯基小麦、斯卑尔脱小麦、普通小麦"中国春"(CS)为材料,利用200条RAPD引物筛选出11条华... 为了寻找华山新麦草特异重复序列,以华山新麦草、栽培一粒小麦、栽培二粒小麦、野生一粒小麦、野生二粒小麦、圆锥小麦、阿拉拉特小麦、茹科夫斯基小麦、斯卑尔脱小麦、普通小麦"中国春"(CS)为材料,利用200条RAPD引物筛选出11条华山新麦草特异条带(命名为RHS1-RHS11),并对这些条带进行回收、克隆、测序。将序列在NCBI数据库中进行比对,其中RHS1、RHS2、RHS3、RHS4、RHS6、RHS8、RHS9在NCBI数据库中未发现与其同源的序列。RHS5、RHS7、RHS10、RHS11在NCBI数据库中有相似序列,其最高覆盖度和最高相似性分别为:83%和100%、99%和85%、49%和100%、19%和83%。通过Southern blotting进行序列特异性检测,RHS1、RHS2、RHS4、RHS6和RHS9等5个克隆在10种材料中都没有杂交信号;RHS7、RHS10和RHS11在华山新麦草及其他9种材料中都有弥散分布的杂交信号;RHS3、RHS5和RHS8只在华山新麦草中有杂交信号的序列。这些结果说明RHS3、RHS5、RHS8为华山新麦草基因组特异重复序列。 展开更多
关键词 华山新麦草 特异重复序列 克隆 southern杂交
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转基因甘蔗植株Southern杂交体系的优化 被引量:7
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作者 崔学强 张树珍 +1 位作者 沈林波 冯翠莲 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期105-109,共5页
对甘蔗Southern杂交体系的优化,旨为转基因甘蔗Southern杂交鉴定分析提供参考。以转基因甘蔗为材料,就探针不同标记方法的比较、甘蔗基因组DNA的提取、基因组DNA酶切量、酶切时间及杂交过程等方面,对地高辛标记的Southern杂交技术进行... 对甘蔗Southern杂交体系的优化,旨为转基因甘蔗Southern杂交鉴定分析提供参考。以转基因甘蔗为材料,就探针不同标记方法的比较、甘蔗基因组DNA的提取、基因组DNA酶切量、酶切时间及杂交过程等方面,对地高辛标记的Southern杂交技术进行了优化研究。结果表明,改良的CTAB法提取的甘蔗DNA能满足后期实验的要求;PCR法标记探针的效率较随机引物法标记探针的效率高,更适合用于Southern杂交;40μg的DNA在400μL酶切体系中,酶切10 h可获得良好的酶切效果;杂交温度40℃,杂交18 h,可获得清晰的杂交条带。 展开更多
关键词 甘蔗 southern杂交 地高辛 PCR法标记探针 酶切
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甜菜基因组DNA的提取及Southern杂交分析 被引量:4
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作者 侯静 马凤鸣 +2 位作者 陈胜勇 丁广洲 李彩凤 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 2008年第12期14-18,共5页
分别采用常规CTAB法和SDS法提取甜菜基因组DNA,并将提取的DNA应用于Southern杂交分析,发现基因组DNA的质量对杂交信号有非常大的影响。常规CTAB法提取的DNA产生的Southern杂交信号,仅出现在高分子质量位置;SDS法提取的DNA产生的Souther... 分别采用常规CTAB法和SDS法提取甜菜基因组DNA,并将提取的DNA应用于Southern杂交分析,发现基因组DNA的质量对杂交信号有非常大的影响。常规CTAB法提取的DNA产生的Southern杂交信号,仅出现在高分子质量位置;SDS法提取的DNA产生的Southern杂交信号,在高分子质量和低分子质量位置均出现。SDS法提取的甜菜基因组DNA适于Southern杂交分析。 展开更多
关键词 甜菜 基因组DNA 常规CTAB法 SDS法 southern杂交
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用SSR分子标记检测杂交油菜秦优7号的种子纯度 被引量:18
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作者 穆建新 李殿荣 +2 位作者 郭蔼光 王灏 赵晓萍 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期64-68,共5页
杂交油菜中的主要杂株类型是母本不育株和父本恢复株。通过对100对SSR引物筛选,获得1对可将杂交油菜秦优7号及其父母本区分开来的SSR引物SA82,扩增产物杂交种表现为父母本的互补带型,在30 g/L的琼脂糖凝胶上显带清晰稳定。通过简化油菜... 杂交油菜中的主要杂株类型是母本不育株和父本恢复株。通过对100对SSR引物筛选,获得1对可将杂交油菜秦优7号及其父母本区分开来的SSR引物SA82,扩增产物杂交种表现为父母本的互补带型,在30 g/L的琼脂糖凝胶上显带清晰稳定。通过简化油菜DNA提取方法、优化反应体系、重复使用琼脂糖凝胶等,建立了适用于杂交油菜秦优7号种子纯度检测的SSR技术系统。经对大量油菜杂交种个体进行验证,证明该方法具有很好的重复性、准确性和可靠性,同时具有快速、经济的特点,可用于杂交油菜种子纯度的实际检测。 展开更多
关键词 SSR 杂交油菜 种子纯度检测
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