乳腺癌患者血浆循环DNA中Sox17基因甲基化检测的临床意义

背景与目的:在乳腺癌发生、发展过程中,甲基化异常是导致抑癌基因失活的重要机制,是一种可用于肿瘤诊断及预后判断、有价值的生物标志物。本研究旨在通过检测乳腺癌组织及其相应的血浆循环DNA中Sox17基因的甲基化状况,探讨其在乳腺癌早期诊断和预后判断方面的应用价值。方法:采用甲基化特异性聚合酶链反应(methylation specific-PCR,MSP)法,对86例乳腺癌组织、36例乳腺良性肿瘤的癌旁正常组织及其配对的血浆循环DNA中Sox17基因启动子甲基化进行检测,并结合乳腺癌的主要临床病理特性进行分析。结果:86例乳腺癌组织中Sox17基因启动子的甲基化率为77.9%(67/86),与其相应血浆循环DNA中Sox17基因启动子的甲基化率为61.6%(53/86),36例癌旁正常乳腺组织及血浆中均未检测到Sox17基因异常甲基化。患者血浆循环DNA中Sox17基因启动子的甲基化与肿瘤组织中该基因的甲基化显著相关(r=0.502,P=0.000)。在乳腺癌组织标本中Sox17基因甲基化率与患者肿瘤分期(χ2=6.18,P=0.041)、淋巴结转移(χ2=13.54,P=0.001)显著相关,在血浆标本中,Sox17基因甲基化率与患者肿瘤分期(χ2=27.06,P=0.000)、肿瘤大小(χ2=9.65,P=0.007)及淋巴结转移(χ2=20.80,P=0.000)显著相关,与患者年龄、组织学分级及ER、PR、HER-2/neu等指标差异无统计学意义(P>0.05)。结论:Sox17基因启动子甲基化在乳腺癌的发生、发展中起着重要作用,可能与乳腺癌的预后相关。血浆中Sox17基因甲基化,是一个有潜在应用价值的生物标志物。

Sox17基因甲基化状态与贲门腺癌发生发展关系研究

目的:检测贲门腺癌(gastric cardia adenocarcinoma,GCA)组织中Wnt通路相关因子Sox17基因的甲基化状态及mRNA表达情况,探讨其与贲门腺癌发生的关系。方法:应用甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)及RT-PCR的方法检测126例贲门腺癌及相应癌旁非肿瘤组织中Sox17基因的甲基化状态及mRNA表达情况。结果:在126例贲门腺癌组织中,Sox17基因的甲基率为86.5%(109/126),明显高于癌旁非肿瘤组织(P<0.001);癌组织中Sox17基因的甲基化率与贲门腺癌的TNM分期及淋巴结转移均无关;癌组织中该基因mRNA的阳性表达率为58.7%(74/126),明显低于癌旁非肿瘤组织(P<0.001)。其mRNA阳性表达率与该基因的甲基化状态呈明显负相关(P<0.01)。结论:Sox17基因在贲门腺癌中呈高甲基化状态。

西伯利亚鲟Sox17基因cDNA全长的克隆及其表达分析

采用RACE技术获得西伯利亚鲟(Acipenser baerii)Sox17基因cDNA全长,序列分析表明,西伯利亚鲟Sox17基因cDNA全长2 671 bp,包括588 bp的5'端非翻译区,901 bp的3'端非翻译区和编码393个氨基酸残基的1 183 bp开放阅读框。氨基酸序列比对显示,该基因具较高的保守性,与塞内加尔多鳍鱼(Polypterus senegalus)的相似度最高为72%。系统进化分析表明,西伯利亚鲟与塞内加尔多鳍鱼聚为一支,且支持率为95%。以延伸因子efla(elongation factor 1-alpha)作为内参基因,对Sox17基因在西伯利亚鲟各组织的相对表达量进行分析,发现Sox17基因在不同组织中均有表达,但表达具有明显的组织差异性。在脑中表达量最高,而在肾、血液、眼、肠和胸鳍5个组织中表达量均较低。同时,Sox17基因在西伯利亚鲟不同发育时期均有表达,但表达具有一定的时间差异性。在宽神经板期的表达量高,相当于表达量最低点11日龄仔鱼的167倍。本研究为量化西伯利亚鲟胚胎发育分化过程中相关基因提供了参照工具,同时可为今后深入研究西伯利亚鲟Sox17在胚胎发育过程中的作用提供基础参考资料。

SOX17基因多态性和中国汉族人群颅内动脉瘤的相关性研究

目的探讨分析SOX17基因多态性和中国汉族人群颅内动脉瘤(IA)的相关性。方法选择2018年1月至2019年8月台州市立医院收治的颅内动脉瘤患者161例作为IA组,选择同期在台州市立医院健康体检的健康志愿者150名作为对照组。采集两组受试者外周静脉血,通过PCR-荧光探针法检测SOX17基因各位点基因型,分析SOX17基因各位点基因多态性与颅内动脉瘤的相关性。结果两组受试者rs9298506、rs1072737位点基因型分布差异有统计学意义(P<0.05)。IA患者破裂组与未破裂组患者SOX17基因rs9298506位点基因型、rs1072737位点基因型及等位基因分布差异有统计学意义(P<0.001),其中破裂组患者A等位基因分布显著低于未破裂组,G等位基因分布显著高于未破裂组(P<0.05)。结论SOX17基因rs9298506及rs1072737位点多态性与中国汉族人群颅内动脉瘤发生及动脉瘤的破裂有关,其中rs9298506位点A基因是汉族人群颅内动脉瘤的保护性因素,而rs1072737位点G等位基因是汉族人群颅内动脉瘤的危险因素。

胃癌组织中Sox7、Sox17基因甲基化及临床意义

[目的]检测胃癌组织及相应癌旁组织中Sox7、Sox17基因的甲基化状态,探讨其与胃癌发生的关系及对预后的影响。[方法]应用甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)、RT-PCR方法检测96例胃癌及相应癌旁组织中Sox7、Sox17基因的甲基化状态及m RNA表达情况。[结果 ]在96例胃癌组织标本中,Sox7、Sox17基因的甲基化率分别为49.0%(47/96)、78.1%(75/96),均明显高于癌旁非肿瘤组织(P<0.01);癌组织中Sox7、Sox17m RNA阳性表达率分别为30.2%(29/96)、14.6%(14/96),均明显低于癌旁非肿瘤组织(P<0.01)。Sox7、Sox17基因的甲基化率均与该基因的m RNA表达密切相关(P<0.01);癌组织中Sox7、Sox17基因的甲基化状态与胃癌患者的病理分级、临床分期及淋巴结转移均无关,但两基因共同甲基化率与淋巴结转移相关。对96例胃癌患者进行随访,失访率为10.4%。Sox7基因甲基化组与非甲基化组的5年累积生存率分别为23.4%和46.9%,Sox17基因甲基化组与非甲基化组的5年累积生存率分别为30.6%和52.4%,而Sox7、Sox17基因共同甲基化组与非共同甲基化组的5年累积生存率分别为13.9%和48.3%。[结论 ]胃癌患者中Sox7、Sox17基因甲基化状态与胃癌患者的生存相关。