Sp110基因5’-UTRrs11679983SNP与肺结核易感相关性研究

[目的]探讨Sp110基因5’-UTR rs11679983位点单核苷酸多态性对重庆籍汉族人群肺结核易感性的影响。[方法]采用病例-对照研究,选择100名初治涂阳肺结核患者和106名非结核病对照,运用ASA-PCR技术检测研究对象的基因型,比较Sp110基因5’-UTR rs11679983位点基因型频率及等位基因频率分布。[结果]Sp110基因5’-UTR rs11679983位点A/A、A/G、G/G基因型频率在病例组分别为21.00%、56.00%、23.00%;对照组分别为41.51%、54.72%、3.77%,两组间基因型分布差异有统计学意义(χ2=18.11,P﹤0.001)。Logistic回归分析显示rs11679983A/G与肺结核相关(OR=2.84,95%CI:1.76～4.59,P﹤0.001)。[结论]Sp110基因rs11679983位点基因多态与肺结核易感性相关。

Sp110基因与肺结核易感相关性研究

目的:研究Sp110基因rs1135791r、s722555r、s116799831r、s3948464位点基因多态性与重庆市汉族人群肺结核发病的关系。方法:采用病例对照研究设计,检测rs1135791r、s722555r、s116799831r、s3948464位点SNP多态性,用SAS软件进行显著性检验。结果:(1)Sp110基因rs1135791 CT基因型r、s722555 GG基因型r、s116799831 GG基因型r、s3948464 CC基因型在病例组的频率明显高于对照组;(2)病例组rs1135791 C等位基因r、s722555 G等位基因r、s116799831 G等位基因r、s3948464C等位基因频率都高于对照组,差异有统计学意义。结论:rs1135791 C/Tr、s722555 A/Gr、s116799831 A/Gr、s3948464 C/T可能是重庆市汉族人群肺结核易患的危险因素。

宜宾地区汉族人群Sp110基因多态性与肺结核易感性的相关性

目的探讨宜宾地区汉族人群Sp110基因多态性与肺结核易感性的相关性。方法选择2011年1月—2012年12月按病例对照研究设计选取112例肺结核患者和140例健康人作为研究对象,比较两组的一般资料,测定其Sp110基因2个SNP位点(rs11679983、rs3948464)的基因型,探索其与肺结核易感性的相关性。结果 (1)观察组和对照组吸烟史(49.1%vs33.6%)和家族结核病史(23.2%vs 9.3%)差异有统计学意义(P<0.05);(2)观察组rs11679983 G等位基因频率(51.8%vs33.6%)、rs3948464 C等位基因频率(92.9%vs 81.4%)高于对照组(P<0.05),其OR分别为2.13和2.97;(3)两组患者rs11679983和rs3948464的基因型分布不一致(P<0.05)。结论 Sp110基因的rs11679983A/G和rs3948464C/T位点多态性可能是该地区汉族人群肺结核易感性的影响因素。

SP110基因过表达慢病毒载体的构建与包装

目的构建核体蛋白SP110基因过表达慢病毒载体,并进行慢病毒包装,为研究SP110在结核病中的作用机制奠定基础。方法利用PCR技术获得SP110基因序列并将其插入到慢病毒穿梭质粒LV5中,获得重组慢病毒质粒V-SP110,经酶切鉴定及DNA测序鉴定后,用RNAi-Mate将重组质粒和慢病毒包装质粒系统(pGag/Pol、pRev、pVSV-G)包装成重组慢病毒颗粒,共转染293T细胞,包装产生慢病毒。通过荧光显微镜或FACS计数荧光细胞,结合稀释倍数计算病毒滴度。结果酶切鉴定结果显示产生约1650 bp的片段,片段大小与SP110基因cDNA大小一致。DNA测序比对测序结果与预期SP110基因序列完全一致,说明SP110基因正确插入载体中,成功构建了SP110基因过表达载体。经293T细胞包装后,成功获得病毒滴度为1.0×10^8 TU/mL的重组慢病毒LV5-SP110。结论SP110基因过表达慢病毒载体构建与包装成功完成,为进一步探讨SP110基因在结核病发生发展中的作用提供工具。

SP110基因rs722555和rs11679983多态性与结核病易感性的Meta分析

目的:基于Meta分析方法更全面地评价SP110基因多态性与结核病之间的关系。方法:在CBM、CNKI、维普、万方、PubMed、Web of science、EMBASE、Cochrane library等数据库中,检索2022年10月前国内外已发表的关于SP110基因SNPs与结核病易感性相关的文献,由两名研究者共同分析提取SP110基因研究较多的两个SNP位点(rs722555、rs11679983)的基本信息及数据,分别对两个SNP位点的5个模型(等位基因、杂合、纯合、显性与隐性)进行Meta分析。利用RevMan5.3软件进行效应量的合并以及Stata14.0软件进行Egger’s检验评价发表偏倚。结果:最终纳入10篇文献,其中rs722555位点包含病例组831例,对照组923例,rs11679983位点包含病例组3295例,对照组3284例。结果显示SP110基因rs722555多态性病例组与对照组间差异在统计学上无意义,5个模型即等位基因(A vs.G:OR=0.866,95%CI:0.632~1.188,P=0.372),杂合子(AG vs.GG:OR=0.74,95%CI:0.50~1.10,P=0.14),纯合子(AA vs.GG:OR=0.73,95%CI:0.38~1.41,P=0.34),显性(AA+AG vs.GG:OR=0.74,95%CI:0.47~1.17,P=0.19)与隐性(AA vs.AG+GG:OR=0.91,95%CI:0.59~1.40,P=0.66)。SP110基因rs11679983多态性病例组与对照组间差异在统计学上无意义,5个模型即等位基因(A vs.G:OR=0.89,95%CI:0.57~1.39,P=0.61),杂合(AG vs.GG:OR=1.26,95%CI:0.65~2.44,P=0.49),纯合(AA vs.GG:OR=1.12,95%CI:0.39~3.20,P=0.83),显性(AA+AG vs.GG:OR=1.13,95%CI:0.62~2.03,P=0.70)与隐性(AA vs.AG+GG:OR=0.87,95%CI:0.56~1.33,P=0.51)。结论:SP110基因SNP(rs722555与rs11679983)与结核病易感性可能不相关。

Sp110基因多态性与重庆汉族肺结核遗传易感性关联性研究

目的研究Sp110基因SNP位点多态性与重庆市汉族人群肺结核发病的关系。方法采用病例-对照研究设计,问卷调查收集肺结核相关危险因素;多种方法检测rs1135791C/T、rs722555A/G、5′-UTRrs11679983A/G、rs28930679C/T、rs9061A/G、rs1063154G/T、rs1047254A/G、rs3948464C/T位点SNP多态性,用SAS软件进行显著性检验,用MDR软件分析与肺结核易患性相关的SNP位点的交互作用。结果 (1)Sp110基因rs1135791CT基因型、rs722555GG基因型、rs11679983GG基因型、rs3948464CC基因型在病例组的频率明显高于对照组;(2)Logistic回归分析rs1135791C/T、rs722555A/G、rs11679983A/G、rs3948464C/T基因型,吸烟史、家庭中有结核病人、人均居住面积及BMI与重庆地区汉族肺结核的易患性有关;(3)Sp110基因rs722555A/G与rs1135791C/T、rs11679983A/G、rs3948464C/T3个位点有交互作用。结论 rs1135791C/T、rs722555A/G、rs11679983A/G、rs3948464C/T可能是重庆市汉族人群肺结核易患的危险因素。

SP110基因rs11679983A/G多态性与中国南方汉族肺结核易感性研究

目的探讨SP110基因rs11679983位点单核苷酸多态性与中国南方汉族人群肺结核的关联性,为临床治疗提供参考依据。方法纳入2013年1月-2014年12月医院118例肺结核患者为病例组,同期选取118名健康志愿者为对照组,运用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术检测基因型,数据采用SPSS 22.0软件进行统计分析。结果 SP110基因rs11679983 AA、AG、GG基因型在病例组和对照组的分布频率分别为0、90.7%、9.3%和0.8%、40.7%、58.5%;A、G等位基因在病例组和对照组的分布频率分别为45.3%、54.7%和21.2%、78.8%;肺结核患者中AG基因型和A等位基因频率高于健康对照人群。结论 SP110基因rs11679983位点单核苷酸多态性与中国南方汉族人群肺结核相关,AG基因型和A等位基因可能增加肺结核的易感性。

SP110基因多态性与肺结核易感性的关系

目的探讨SP110基因的单核苷酸多态性(SNP)位点与肺结核易感性的关系。方法选取58例肺结核患者(试验组)和62例健康志愿者(对照组),进行SNP分型分析,比较两组SP110基因SNP位点rs2114592和rs3948464的基因型和等位基因频率。结果 rs2114592位点的基因型有3种,两组的基因型和等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05)。rs3948464位点的基因型在两组中均为CC型,未检测到其他2种基因型。结论 SP110基因rs2114592和rs3948464位点的多态性与肺结核的易感性无关。