特殊氢方法预测丙氨酸-α-四肽构象稳定性

使用B3LYP/6-31G*方法优化得到了丙氨酸-α-四肽分子的48个稳定构象.定义了丙氨酸-α-多肽中的特殊氢原子,对构象中与特殊氢原子有关的主要非键相互作用进行分析,提出了使用与特殊氢原子有关的非键相互作用来预测多肽构象的相对稳定性,并将之称为特殊氢方法.基于丙氨酸-α-二肽分子的5个构象和三肽分子的7个构象,确定了特殊氢方法中的与特殊氢原子有关的非键相互作用参数.利用特殊氢方法预测丙氨酸-α-四肽分子的48个构象的相对稳定性,与B3LYP/6-31G*方法的相对能量比较,得到了满意的结果.特殊氢方法得到的相对能量(Y)和B3LYP/6-31G*方法得到的相对能量(X)的线性相关方程为Y=0.9296X+2.2041,相关系数R=0.9532,标准偏差为3.0kJ/mol,偏差绝对值≤4.18kJ/mol的构象占87.5%.

快速确定丙氨酸-α-多肽构象稳定性的新方法

使用 B3 LYP/6-3 1 G* 方法优化得到了丙氨酸二肽和三肽分子的 2 3个稳定构象 .定义了丙氨酸多肽中的特殊氢原子 .对构象中与特殊氢原子有关的主要弱相互作用进行了分析 ,提出了一种快速确定多肽构象稳定性的新方法 .确定了相应的弱相互作用参数 .将新方法应用于三肽分子构象相对稳定性的预测 ,得到了满意的结果 .

特殊氢原子与丙氨酸二肽构象稳定性的理论研究

使用B3LYP/6 31G 方法,优化得到了丙氨酸二肽分子的6个稳定构象.从特殊氢原子之间的相互作用及其所形成氢键环和五元环的结构特点,探讨了影响二肽构象稳定性的因素,并估算了相关弱相互作用的能量.

丙氨酸-α-五肽构象稳定性的快速预测

定义了丙氨酸-α-多肽中的特殊氢原子,对构象中与特殊氢原子有关的主要非键作用进行分析,提出使用与特殊氢原子有关的主要非键作用预测多肽构象稳定性,并将之称为特殊氢方法.基于丙氨酸-α-二肽和三肽分子共12个构象,我们确定了与特殊氢原子有关的7个非键作用参数.利用特殊氢方法定量预测丙氨酸-α-五肽分子65个低能构象的相对稳定性,与B3LYP/6-31G*方法比较,得到了满意的结果.

丙氨酸甘氨酸混合三、四肽构象稳定性的快速预测

使用特殊氢方法预测丙氨酸甘氨酸混合三肽和四肽分子共111个构象的相对稳定性,并与B3LYP/6-31G*方法的相对能量比较,得到了满意的结果.在所有111个构象中,特殊氢方法相对能量与B3LYP/6-31G*方法相对能量偏差绝对值大于2.0 kcal/mol的只有3个,偏差在1.0-2.0 kcal/mol之间的有18个,其余均小于1.0 kcal/mol.本文结果表明特殊氢原子在决定多肽构象稳定性方面的内秉重要性.

One Electron Atom in Special Relativity with de Sitter Space-Time Symmetry(Ⅱ): ——Higher Order Contributions

This is a follow of previous work entitled "One Electron Atom in Special Relativity with de Sitter SpaceTime Symmetry" [Commun. Theor. Phys. 57(2012) 930]. In this paper, we consider the higher order calculations and contributions in the previous framework to solve one electron atoms in de Sitter invariant relativistic quantum mechanics. The next-to-leading-order calculations in 1/R2-expansions show that the fine-structure constant α is variant with cosmologic time going by in the de Sitter invariant special relativistic quantum mechanics with standard FRW cosmologic model.

基于狭义相对论的氢原子基态能量分析

基于狭义相对论的基本观点,在Bohr-Sommerfeld量子理论的基础上研究了氢原子的基态能量,得到了一个计算氢原子基态能量的公式。结果表明,计算推导出的氢原子基态能量与氢原子的狄拉克精细结构基态能量符合得非常好,研究结果对人们进一步认识氢原子的内部结构具有重要的意义。