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斜纹夜蛾核多角体病毒Splt75基因的生物信息学分析
1
作者
李赛男
吕怡娜
+1 位作者
甘田
刘文华
《生物化工》
2020年第5期1-5,17,共6页
斜纹夜蛾核多角体病毒(Spodoptera litura multicapsid nucleopolyhedrovirus,SpltMNPV)ORF75(Splt75)是杆状病毒核心基因。通过PCR方法、克隆、测序技术和生物信息学分析工具对Splt75基因及其编码蛋白Splt75进行了研究。结果表明,PCR...
斜纹夜蛾核多角体病毒(Spodoptera litura multicapsid nucleopolyhedrovirus,SpltMNPV)ORF75(Splt75)是杆状病毒核心基因。通过PCR方法、克隆、测序技术和生物信息学分析工具对Splt75基因及其编码蛋白Splt75进行了研究。结果表明,PCR扩增序列大小为363 bp,与Genbank登录的SpltMNPV G2株基因组全序列(AF325155)中的ORF75基因全长序列同源性100%;Splt75基因编码120个氨基酸,编码蛋白分子量为13137.16 Da,蛋白理论等电点为7.86,是稳定的疏水蛋白,存在跨膜结构区,属于ORF78(Ac78)超家族成员;Splt75蛋白中可能含有1个cAMP和cGMP依赖的蛋白激酶磷酸化位点、1个N-糖基化位点、1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、1个N-豆蔻酰化位点、1个蛋白激酶C磷酸化位点以及1个酰胺化位点;Splt75的二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主要构成元件。Splt75基因及其编码蛋白Splt75的生物信息学分析结果为进一步研究其功能和作用机制提供了理论依据。
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关键词
斜纹夜蛾核多角体病毒
splt75
生物信息学分析
蛋白质结构
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职称材料
题名
斜纹夜蛾核多角体病毒Splt75基因的生物信息学分析
1
作者
李赛男
吕怡娜
甘田
刘文华
机构
肇庆学院生命科学学院
出处
《生物化工》
2020年第5期1-5,17,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(31501705)
广东高校省级重点平台和科研项目(2018KTSCX248)
广东省自然科学基金资助项目(2014A030313664)。
文摘
斜纹夜蛾核多角体病毒(Spodoptera litura multicapsid nucleopolyhedrovirus,SpltMNPV)ORF75(Splt75)是杆状病毒核心基因。通过PCR方法、克隆、测序技术和生物信息学分析工具对Splt75基因及其编码蛋白Splt75进行了研究。结果表明,PCR扩增序列大小为363 bp,与Genbank登录的SpltMNPV G2株基因组全序列(AF325155)中的ORF75基因全长序列同源性100%;Splt75基因编码120个氨基酸,编码蛋白分子量为13137.16 Da,蛋白理论等电点为7.86,是稳定的疏水蛋白,存在跨膜结构区,属于ORF78(Ac78)超家族成员;Splt75蛋白中可能含有1个cAMP和cGMP依赖的蛋白激酶磷酸化位点、1个N-糖基化位点、1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、1个N-豆蔻酰化位点、1个蛋白激酶C磷酸化位点以及1个酰胺化位点;Splt75的二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主要构成元件。Splt75基因及其编码蛋白Splt75的生物信息学分析结果为进一步研究其功能和作用机制提供了理论依据。
关键词
斜纹夜蛾核多角体病毒
splt75
生物信息学分析
蛋白质结构
Keywords
Spodoptera litura multicapsid nucleopolyhedrovirus
splt75 gene
Bioinformatics analysis
Protein structure
分类号
S482.39 [农业科学—农药学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
斜纹夜蛾核多角体病毒Splt75基因的生物信息学分析
李赛男
吕怡娜
甘田
刘文华
《生物化工》
2020
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