基于组合探针识别的大规模细菌分类16 S rRNA基因芯片设计(英文)

随着16SrRNA序列资源的不断丰富,以及寡核苷酸微阵列基因芯片技术的不断进步,检测复杂微生物菌落中的微生物种群构成成为可能.现有的序列特异性探针设计算法缺乏足够的覆盖度、灵活性以及效率,不能满足大规模细菌检测基因芯片的设计要求.很多组特异性探针设计算法的思路多局限于针对某个目标序列组设计唯一的组特异性探针.在很多应用场合,设计单个探针检测组内所有目标序列的目标是很难达到的.因此,设计多个探针通过组合方式进行检测是很有必要的.每个探针能特异性地检测组内一部分目标序列,通过组合就能提高覆盖率.然而,在所有可能的探针组合中找到一个优化的探针组合是很耗时的.提出了一个可行的基于相对熵和遗传算法的组合探针设计算法.

用于识别不同细胞蛋白质组的噬菌体抗体芯片

将4个鼠源噬菌体抗体克隆和1个人源噬菌体抗体克隆偶联到羧基终止的硅片表面,制成分析型模型芯片.挑选健康人体淋巴细胞为正常细胞的代表,HeLa细胞为肿瘤细胞的代表,提取细胞的全部蛋白质并用荧光染料Cy3标记,与制成的分析芯片反应,得到了不同的结合图谱.实验结果表明,以噬菌体抗体为分子感受器的分析芯片可用于识别不同细胞的蛋白质组.

电能计量芯片组AT73C500和AT73C501及其应用

介绍了ATMEL公司的电能计量专用芯片组AT73C500和AT73C501,该组套片能够对有功功率、无功功率、视在功率、电压、电流、频率、功率因数等多种电网参数进行测量,并具有速度快、精度高的特性,是设计多功能电表的较为理想的芯片。文中还给出了该组套片和单片机的接口电路,该电路在实际中得到了使用。

GPS接收机专用芯片组技术发展

在总结国外现有的完整GPS接收机专用芯片组最新情况的基础上,结合典型的芯片产品,阐述了GPS接收机专用芯片组从分立式器件到片上系统、再到单片式接收机的技术发展过程、现状和趋势。

龙芯处理器服务器芯片组的适配与实现

针对龙芯中央处理器(CPU)无对应高性能服务器芯片组的现状,设计开发了一种为龙芯CPU筛选芯片组的架构,并实现了一种龙芯CPU和芯片组适配的方法.提出了采用现场可编程门阵列(FPGA)串联在龙芯CPU和即将适配的多组芯片组之间的架构.借助于此架构,设计实现了在CPU和芯片组之间待处理物理信号线的连接方法,设计了两者之间上下电时序配合的调试方法,设计实现了规避两者信号协议差异的方法.借助该架构和这些方法能够实现同时筛选多款芯片组的目的,避免了以前需要设计多款主板进行适配的情况,节省了重复研发主板的成本;找到了可以适配龙芯CPU的高性能服务器芯片组;其芯片组规格参数和性能高于目前龙芯CPU所用的芯片组,开拓了其在服务器领域的应用.

基因芯片技术和蛋白质组技术在神经科学中的应用及其研究进展

基因芯片技术和蛋白质组技术是最近发展起来的高通量技术 ,二者的出现使同时分析神经系统的大量基因的表达和基因产物蛋白质及其相互作用网络成为可能。它们在神经科学中的应用为了解脑功能提供了前所未有的机会。一个典型的基因芯片实验包括 :芯片的准备或购买、靶DNA和探针的准备或标记、标记探针与靶DNA的杂交、芯片扫描和影象信息的数据分析。蛋白质组技术较为复杂 ,包括蛋白质分离、鉴定和信息分析三方面的内容。其中 ,分离技术多种多样。若分离技术以二维电泳为基础 ,则该实验通常由以下步骤组成 :蛋白质样品的准备、电泳分离、染胶、分离蛋白点的切除、蛋白质的酶解 (常用胰蛋白酶 )、质谱分析 (鉴定 )和数据的信息处理。本文综述这两项技术的内容和实验步骤 ,然后着重叙述它们在神经科学中的应用 ,讨论其优缺点和面临的挑战 。

曙光5000芯片组系统级功能验证平台

曙光5000芯片组是曙光5000计算单元中的系统控制器,它通过HT接口连接两颗CPU并提供高速网络通信能力。为了确保曙光5000芯片组的功能正确性,我们为其设计了系统级功能验证平台SVP。SVP采用分层结构对系统进行建模,通过对本地计算单元的系统软件行为、硬件平台功能以及远程计算单元的网络行为进行模拟,提供了接近真实系统的验证环境。在曙光5000芯片组的验证过程中,SVP发现并排除了逻辑设计中的大多数功能错误,通过并行验证加速了验证覆盖率的收敛过程。

多电子元件及芯片组布局的热分析

针对电子线路板上多电子元件及芯片组的不同布局所产生的热场分布问题,分析了分布元件的热产生、热传导、对流和辐射过程,采用有限元理论分析方法和ANSYS软件,对线路板上多芯片组件的热场分布进行仿真.结果表明:电子元件的不同布局将导致线路板热点的温度存在差别,在有限空间内合理布置元件可明显降低设备的热失效率.

蛋白质芯片在蛋白质组学研究中的作用

蛋白质芯片是以高度并行性、高通量、微型化和自动化为特点的蛋白质组检测技术。本文综述了蛋白质芯片在蛋白质组学研究中的多种作用,包括普通蛋白质芯片在微量蛋白质分离、蛋白质与蛋白质之间以及蛋白质与其他小分子间相互作用和蛋白质定量检测方面的作用,普通蛋白质芯片通过与质谱技术、生物传感器技术的结合而拓展其应用范围,以及蛋白质组芯片、活性的蛋白质芯片在蛋白质组学研究中应用的进展。

面向NoC多核芯片组的任务映射算法

片上网络(Network On Chip,NoC)是一种高效的片上互连技术。由于NoC的数据通讯具有并发、分离的特性,因此可以方便的在板级集成多块NoC多核芯片协同工作,构成NoC多核芯片组,快速提供更强大的处理能力。板级通讯的数据链路带宽远小于芯片内的带宽,因此必须尽力减小芯片间的数据通讯量。针对这一问题,提出一种面向NoC多核芯片组的任务映射算法。实验表明,该算法可以使芯片间的数据通讯量比初始映射降低24%,能显著提高系统性能。

膜芯片检测A组轮状病毒的初步研究

建立表面带正电荷的尼龙膜为基片的基因芯片,采用RT-semi-nestedPCR方法,对A组轮状病毒RNA实现高度扩增,并通过5'端带地高辛标记的上游引物实现扩增产物的标记。通过同膜芯片上探针的杂交和免疫显色,实现对A组轮状病毒的检测。结果表明,膜芯片对探针的固定效果、杂交吸脱和检测结果可靠,空白对照和阴性对照均为阴性,探针均显示为阳性信号,并且信号强弱与探针浓度关系不大,而主要与探针本身同互补链的结合相关。以上结果说明已经初步建立了快速检测A组轮状病毒的膜基因芯片检测技术。

SELDI蛋白质芯片技术在蛋白质组学中的应用

本文介绍了SELDI(Suface-enhanced Laser Desorption/Ionization)蛋白质芯片技术的工作原理,讨论了不同类型的蛋白质芯片在蛋白质组学中的应用。

2.4GHz DSSS收发器芯片组RFW302原理与应用

RFW302芯片组由RFW24、RFW488C、RFW488R三块芯片构成。该芯片组符合美国联邦通信委员会(FCC)(part 15.247)和欧洲电信标准协会(ETSI) (300 328)的技术规范;工作频率为2.4GHz,数据速率最高可达3.2Mb/s,输出功率达+0dBm (峰值),接收灵敏度为-77dBm,室内有效距离约20m。

SELDI蛋白质芯片技术在肿瘤蛋白质组学研究中的应用

SELDI蛋白质芯片技术是结合色谱学 层析原理和SELDI TOF MS技术制成的新一代生物芯片 ,是目前肿瘤蛋白质组学研究的重要工具之一。它的优点是能洞察肿瘤细胞、组织和生物体蛋白质含量的细微变化 ,且能精确分析某一特定蛋白质的理化性质。作者就SELDI蛋白质芯片联合二维电泳、激光捕获显微切割等技术在肿瘤蛋白质组学研究中所应采取的策略 ,SELDI蛋白质芯片在肿瘤蛋白质组学研究中的临床应用如筛选肿瘤标志蛋白、预测肿瘤转移和预后等作一综述。

蛋白质芯片及其在蛋白质组研究中的应用

对在蛋白质组研究中发挥巨大作用的新技术蛋白质芯片的基本组成、特点、使用方法及应用等方面做了简要介绍 ,并展望了今后的发展前景。由于蛋白质芯片的超微量、全自动化的高通量筛选功能的优点 。

两种PCR方法对检测A组轮状病毒膜芯片杂交结果的影响

A组轮状病毒(rotavirus,RV)是导致全世界婴幼儿腹泻的最主要病原,危害巨大。拟用RT-巢式PCR技术对A组RV的保守序列进行高度扩增,通过同本室自制的膜芯片杂交,实现对该病毒的检测。分别采用对称PCR和不对称PCR扩增,均可得到扩增的目的片段。对称式扩增产物杂交结果不理想。而不对称式扩增得到了大量待检单链产物,同膜芯片杂交获得了理想的杂交结果。显著地提高了对A组RV杂交检测的灵敏度。表明不对称式PCR扩增是一种制备用于芯片杂交大量单链产物的理想方法,尤其是针对富含AT的核酸检测区域。