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马铃薯StCDPKs基因家族成员鉴定与表达分析
被引量:
4
1
作者
洪旭升
李世贵
+3 位作者
杨江伟
罗红玉
张宁
司怀军
《甘肃农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期73-83,共11页
【目的】通过对马铃薯StCDPKs基因家族成员的鉴定与表达模式分析,初步阐明该基因家族在马铃薯胁迫响应中的功能.【方法】用隐马尔科夫模型鉴定马铃薯StCDPKs基因家族成员,MEGA6.0构建StCDPKs蛋白序列的系统进化树,qRT-PCR分析StCDPKs基...
【目的】通过对马铃薯StCDPKs基因家族成员的鉴定与表达模式分析,初步阐明该基因家族在马铃薯胁迫响应中的功能.【方法】用隐马尔科夫模型鉴定马铃薯StCDPKs基因家族成员,MEGA6.0构建StCDPKs蛋白序列的系统进化树,qRT-PCR分析StCDPKs基因在组织特异性和盐胁迫下的表达情况.【结果】本研究共鉴定出27个马铃薯StCDPKs基因家族成员,它们均包含CDPKs蛋白钙离子结合域最保守的结构域EF-hand;其中StCDPK2/421/22/25基因在马铃薯不同组织中表达差异显著,StCDPK8/10/11/18/22基因在盐胁迫下表达量明显升高.【结论】共鉴定获得27个马铃薯StCDPKs基因家族成员,其中StCDPK8/10/11/18/22基因与马铃薯响应盐胁迫相关,研究结果可为进一步阐明马铃薯StCDPKs基因的功能提供基础.
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关键词
马铃薯
stcdpk基因
基因
鉴定
盐胁迫
表达分析
下载PDF
职称材料
题名
马铃薯StCDPKs基因家族成员鉴定与表达分析
被引量:
4
1
作者
洪旭升
李世贵
杨江伟
罗红玉
张宁
司怀军
机构
甘肃农业大学生命科学技术学院
甘肃农业大学农学院
甘肃省干旱生境作物学省部共建国家重点实验室培育基地
出处
《甘肃农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期73-83,共11页
基金
国家自然科学基金项目(31660416)
甘肃省现代农业马铃薯产业技术体系项目(GARS-03-P1).
文摘
【目的】通过对马铃薯StCDPKs基因家族成员的鉴定与表达模式分析,初步阐明该基因家族在马铃薯胁迫响应中的功能.【方法】用隐马尔科夫模型鉴定马铃薯StCDPKs基因家族成员,MEGA6.0构建StCDPKs蛋白序列的系统进化树,qRT-PCR分析StCDPKs基因在组织特异性和盐胁迫下的表达情况.【结果】本研究共鉴定出27个马铃薯StCDPKs基因家族成员,它们均包含CDPKs蛋白钙离子结合域最保守的结构域EF-hand;其中StCDPK2/421/22/25基因在马铃薯不同组织中表达差异显著,StCDPK8/10/11/18/22基因在盐胁迫下表达量明显升高.【结论】共鉴定获得27个马铃薯StCDPKs基因家族成员,其中StCDPK8/10/11/18/22基因与马铃薯响应盐胁迫相关,研究结果可为进一步阐明马铃薯StCDPKs基因的功能提供基础.
关键词
马铃薯
stcdpk基因
基因
鉴定
盐胁迫
表达分析
Keywords
potato
stcdpk
s
genetic identification
salt stress
expression analysis
分类号
S532 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马铃薯StCDPKs基因家族成员鉴定与表达分析
洪旭升
李世贵
杨江伟
罗红玉
张宁
司怀军
《甘肃农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
4
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