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Detection of bacterial DNA from cholesterol gallstones by nested primers polymerase chain reaction 被引量:6
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作者 WU Xiao Ting 1, XIAO Lu Jia 2, LI Xing Quan 3 and LI Jie Shou 1 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1998年第3期54-57,共4页
DetectionofbacterialDNAfromcholesterolgalstonesbynestedprimerspolymerasechainreactionWUXiaoTing1,XIAOLuJi... DetectionofbacterialDNAfromcholesterolgalstonesbynestedprimerspolymerasechainreactionWUXiaoTing1,XIAOLuJia2,LIXingQuan3an... 展开更多
关键词 cholelithiasis/microbiology PROPIONIBACTERIUM acnes staphylococcus aureus DNA BACTERIAL polymerase chain reaction
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Surveillance of Antibiotic Resistant Staphylococcus aureus in Agricultural Production Chain of Mongolia
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作者 Tumuruu Gantsetseg Jargalsaikhan Enkhtuya +2 位作者 Tundev Odgerel Ochirpurev Ariuntuya Sodnom Lkhagvasuren 《Journal of Agricultural Science and Technology(B)》 2015年第10期701-713,共13页
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Potentiating activity of rhein in targeting of resistance genes in methicillin-resistant Staphylococcus aureus 被引量:2
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作者 Ryong Gong Dae Young Lee +4 位作者 Jae Won Lee Doo Jin Choi Geum-Soog Kim Sang Hyuk Lee Young-Seob Lee 《Asian Pacific Journal of Tropical Medicine》 SCIE CAS 2019年第1期14-18,共5页
Objective: To investigate the synergistic effect between rhein(RHE) and oxacillin against Staphylococcus aureus(MRSA) at the gene level. Method: A minimum inhibitory concentration and checkerboard dilution test were c... Objective: To investigate the synergistic effect between rhein(RHE) and oxacillin against Staphylococcus aureus(MRSA) at the gene level. Method: A minimum inhibitory concentration and checkerboard dilution test were conducted to evaluate antibacterial activity. Reverse transcriptase polymerase chain reaction was conducted to investigate the gene expressions. Results: RHE exhibited a minimum inhibitory concentration of 62.5-250.0 μg/mL against various MRSA strains and the reference strain, respectively. As revealed by the checkerboard assay, a combination of RHE and oxacillin exhibited synergistic or partially synergistic effects against MRSA strains. RHE decreased the expressions of mecA/blaZ in a dose-dependent manner. RHE also decreased the expressions of the regulator genes mecI/blaI and mecR1/blaR1. Conclusions: We suggest that RHE affects the activity of mecR1/blaR1, which is located in the cell membrane of MRSA and results in the suppression of mecA/mecI/mecR1 and blaZ/blaI/blaR1 gene expressions. 展开更多
关键词 Antimicrobials Mechanism of action staphylococcus aureus polymerase chain reaction
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Tuf m RNA rather than 16S r RNA is associated with culturable Staphylococcus aureus
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作者 Anne JM Loonen Petra FG Wolffs +4 位作者 Maikel de Bresser Maurice Habraken Cathrien A Bruggeman Mirjam HA Hermans Adriaan JC van den Brule 《World Journal of Clinical Infectious Diseases》 2015年第4期86-93,共8页
AIM: To study the presence of various nucleic acids targets of Staphylococcus aureus(S. aureus) during bacterial growth and antibiotic induced killing in relation to viability.METHODS: S. aureus was cultured to log ph... AIM: To study the presence of various nucleic acids targets of Staphylococcus aureus(S. aureus) during bacterial growth and antibiotic induced killing in relation to viability.METHODS: S. aureus was cultured to log phase and spiked in Todd Hewitt(TH) broth and whole blood of healthy human volunteers. Viability of S. aureus after flucloxacillin treatment(0, 1, 3 and 6 d) was assessed by culture on bloodagar plates. DNA and RNA were isolated from 200 μL. c DNA synthesis was performed by using random primers. The presence of S. aureus DNA, r RNA, and m RNA were determined by real-time polymerase chain reaction of the 16 S r DNA and tuf gene(elongation factor Tu).RESULTS: S. aureus spiked in TH broth without antibiotics grew from day 0-6 and DNA(tuf and 16S), and 16 S r RNA remained detectable during this whole period. During flucloxacillin treatment S. aureus lost viability from day 3 onwards, while the 16 S r RNA-gene and its RNA transcripts remained detectable. DNA andr RNA can be detected in flucloxacillin treated S. aureus cultures that do not further contain culturable bacteria.However, tuf m RNA became undetectable from day 3onwards. Tuf m RNA can only be detected from samples with culturable bacteria. When spiking S. aureus in whole blood instead of broth no bacterial growth was seen, neither in the absence nor in the presence of flucloxacillin. Accordingly, no increase in DNA and RNA levels of both 16 S r DNA and the tuf gene were detected. CONCLUSION: Tuf m RNA expression is associated with culturable S. aureus and might be used to monitor antibiotic effects. 展开更多
关键词 BLOODSTREAM infection staphylococcus aureus Viability mRNA polymerase chain reaction Sepsis Molecular diagnostics Blood
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用Taqman MGB探针研究中国人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性 被引量:2
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作者 庾蕾 庄志雄 +2 位作者 谢富焕 黄海雄 叶小明 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期51-54,62,共5页
目的了解中国人群肿瘤坏死因子α(thetumournecrosisfactorα,TNF-α)基因启动子区多态性。方法随机选取20名深圳地区汉族健康体检者,采用两对引物PCR扩增TNF-α基因启动子区(-1389nt~+125nt),对PCR产物进行序列分析,寻找单核苷酸多态... 目的了解中国人群肿瘤坏死因子α(thetumournecrosisfactorα,TNF-α)基因启动子区多态性。方法随机选取20名深圳地区汉族健康体检者,采用两对引物PCR扩增TNF-α基因启动子区(-1389nt~+125nt),对PCR产物进行序列分析,寻找单核苷酸多态性位点(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)。采用TaqmanMGB探针建立了-857nt(C/T)位点的实时定量PCR(thereal-timePCR)分型方法,并对中国汉族、壮族、布依族,水族及苗族群体共1108份样本进行了基因分型。结果在启动子区(-1322nt~+67nt),发现6个SNP位点,即-885(A/G)、-863(C/A)、-646(G/A)、-648(G/A)、-568(G/C)和-857(C/T),其中位点-646nt(G→A)为新发现SNP。-885、-648及-568nt位点碱基虽然与Genbank不同,但测序的20个个体基因分型相同。中国人群-857nt(C/T)位点基因型频率分别为0.79(CC),0.19(CT)和0.02(TT),中国汉族、壮族、布依族,水族及苗族群体间无显著性差异。中国人群-857T等位基因频率为0.116,与文献报道的韩国人群相同,但比日本人群低。结论中国人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性可能较保守。采用TaqmanMGB探针实时定量PCR技术对SNPs进行基因分型简便、快速及准确,易于自动化,为大规模的疾病相关性研究提供了有效的工具。 展开更多
关键词 多态性 肿瘤坏死因子Α 单核苷酸多态性 实时定量PCR taqman MGB探针
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TaqMan荧光探针技术检测不同血清型B群链球菌的方法建立及评价 被引量:2
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作者 江凡 王飞玲 +3 位作者 刘小月 路瑞静 周喜友 邹建话 《国际检验医学杂志》 CAS 2018年第4期438-442,共5页
目的建立基于TaqMan荧光探针技术,对不同血清型B群链球菌(GBS)鉴定的分子方法,为后续研究多重荧光探针技术检测不同血清型GBS奠定基础。方法根据不同血清型荚膜多糖(CPS)序列的差异设计引物和探针,用实时荧光定量PCR扩增CPS序列,建立不... 目的建立基于TaqMan荧光探针技术,对不同血清型B群链球菌(GBS)鉴定的分子方法,为后续研究多重荧光探针技术检测不同血清型GBS奠定基础。方法根据不同血清型荚膜多糖(CPS)序列的差异设计引物和探针,用实时荧光定量PCR扩增CPS序列,建立不同血清型的GBS分型方法,从灵敏度、特异度及临床分离株检测等方面对该方法进行评价,并与胶乳凝集试验结果比较。结果同一血清型GBS的DNA的对数浓度与循环阈值(Ct)呈良好的线性相关,该方法的检测下限均为1pg/μL,一种探针只能检测对应血清型的GBS。10株标准菌株的TaqMan荧光探针技术检测结果与胶乳凝集试验结果一致。结论 TaqMan荧光探针技术是一种简单、快速、具有较高灵敏度和特异度的检测GBS血清型的方法,对临床分离株的分型优于乳胶凝集试验。 展开更多
关键词 taqman荧光探针 实时荧光定量聚合酶链反应 B群链球菌
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TaqMan实时荧光定量RT-PCR检测甲型肝炎减毒活疫苗病毒含量的研究 被引量:3
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作者 夏青娟 徐晓霞 +3 位作者 李树林 岳立广 龚士卿 刘令九 《微生物学免疫学进展》 2013年第5期14-17,共4页
目的:建立一种快速定量检测甲型肝炎减毒活疫苗病毒含量的实时荧光定量RT-PCR方法。方法对Gen-Bank中登陆的甲型肝炎减毒活疫苗株( L-A-1)和其他甲型肝炎病毒基因组全序列比较分析,根据其高度保守的5′端非编码区设计针对甲型肝炎... 目的:建立一种快速定量检测甲型肝炎减毒活疫苗病毒含量的实时荧光定量RT-PCR方法。方法对Gen-Bank中登陆的甲型肝炎减毒活疫苗株( L-A-1)和其他甲型肝炎病毒基因组全序列比较分析,根据其高度保守的5′端非编码区设计针对甲型肝炎减毒活疫苗株特异性引物与探针,对荧光定量RT-PCR反应条件进行优化,检测该方法的特异性和灵敏性,并对甲型肝炎减毒活疫苗病毒含量进行定量检测。结果该方法对甲型肝炎减毒活疫苗株高度特异,扩增片段为207 bp,不与其他肠道病毒发生非特异性反应。在104 CCID50/管~10-1 CCID50/管之间有良好的扩增曲线,检测的灵敏度可达0.1CCID50~0.01CCID50,比普通RT-PCR高100倍。结论该方法具有快速、灵敏、特异、重复性好等优点,可应用于甲型肝炎减毒活疫苗生产过程中病毒含量滴度测定及指导疫苗成品的配制。 展开更多
关键词 甲肝病毒 实时荧光定量RT—PCR taqman探针
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利用正交设计优化脑膜炎奈瑟氏菌Taqman-MGB探针检测反应体系
8
作者 杨艳 刘衡川 +2 位作者 叶运莉 苏红卫 汪川 《现代预防医学》 CAS 北大核心 2008年第8期1541-1544,共4页
[目的]建立Taqman-MGB探针检测脑膜炎奈瑟氏菌的最佳反应体系,探讨影响Taqman-MGB探针检测的多个因素。[方法]利用正交设计,从Buffer、TaqDNA聚合酶、引物、Mg2+、探针、dNTP6种因素对实时荧光PCR体系进行优化,在此基础上,进一步细调,... [目的]建立Taqman-MGB探针检测脑膜炎奈瑟氏菌的最佳反应体系,探讨影响Taqman-MGB探针检测的多个因素。[方法]利用正交设计,从Buffer、TaqDNA聚合酶、引物、Mg2+、探针、dNTP6种因素对实时荧光PCR体系进行优化,在此基础上,进一步细调,寻求实时荧光PCR反应的最佳反应体系。[结果]正交试验结果表明,最佳反应体系为(50μl):Mg2+7.0mmol/L,引物0.6μmol/L,dNTP300μmol/L,TaqDNA聚合酶2.0U,探针0.1μmol/L,Buffer1.5×。[结论]Mg2+是影响实时荧光PCR的重要因素;所得体系反应稳定,正交法实验设计高效、快捷,科学性强,值得推广。 展开更多
关键词 脑膜炎奈瑟氏菌 taqman-MGB探针 正交设计 实时PCR 条件优化
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Community-acquired pneumonia:The importance of the early detection of drug-resistant organisms
9
作者 Sai Doppalapudi Muhammad Adrish 《World Journal of Critical Care Medicine》 2024年第2期11-14,共4页
Pneumonia is a disease associated with significant healthcare burden with over 1.5 million hospitalizations annually and is the eighth leading cause of death in the United States.While community-acquired pneumonia(CAP... Pneumonia is a disease associated with significant healthcare burden with over 1.5 million hospitalizations annually and is the eighth leading cause of death in the United States.While community-acquired pneumonia(CAP)is generally considered an acute time-limited illness,it is associated with high long-term mortality,with nearly one-third of patients requiring hospitalization dying within one year.An increasing trend of detecting multidrug-resistant(MDR)organisms causing CAP has been observed,especially in the Western world.In this editorial,we discuss about a publication by Jatteppanavar et al which reported that a case of a MDR organism was the culprit in developing pneumonia,bacteremia,and infective endocarditis that led to the patient’s death.The early detection of these resistant organisms helps improve patient outcomes.Significant advances have been made in the biotechnological and research space,but preventive measures,diagnostic techniques,and treatment strategies need to be developed. 展开更多
关键词 Methicillin-resistant staphylococcus aureus polymerase chain reaction Antibiotic resistance Bacterial colonization Infective endocarditis
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Allglo探针与TaqMan探针荧光定量RT-PCR检测猴免疫缺陷病毒的比较 被引量:1
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作者 吴胜男 谢延峥 +1 位作者 刘翠华 何金洋 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1496-1501,共6页
目的比较Allglo探针和TaqMan探针荧光定量RT-PCR检测SIV的灵敏度下限和重复性。方法把SIV标准品进行梯度稀释成6个浓度,每个浓度同时提取12个标本进行批内差异分析,每个标本提取12次进行批间差异分析之后进行逆转录并用TaqMan探针和All... 目的比较Allglo探针和TaqMan探针荧光定量RT-PCR检测SIV的灵敏度下限和重复性。方法把SIV标准品进行梯度稀释成6个浓度,每个浓度同时提取12个标本进行批内差异分析,每个标本提取12次进行批间差异分析之后进行逆转录并用TaqMan探针和Allglo探针进行定量PCR检测。批内差异分析者每个标本同时进行逆转录和上机检测,批间差异分析者分12次进行逆转录和检测,对这两种探针的PCR结果利用ABI7300定量PCR仪所携带的软件和相关的统计学方法进行分析。结果 TaqMan探针和Allglo探针法检测SIV标准品的灵敏度下限均为50 copies/m L。重复性结果显示:批内结果差异分析显示Allglo探针法最大变异系数为0.63%,最小变异系数为0.33%,TaqMan探针法最大变异系数为1.33%,最小变异系数为0.2%;批间结果差异分析显示Allglo探针法最大变异系数为1.77%,最小变异系数为0.95%,TaqMan探针法最大变异系数为1.86%,最小变异系数为1.03%。结论在荧光定量RT-PCR法检测猴免疫缺陷病毒中,Allglo探针法可能优于TaqMan探针法。 展开更多
关键词 Allglo探针 taqman探针 猴免疫缺陷病毒 实时荧光定量PCR
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实时荧光定量聚合酶链反应突触后密度蛋白93基因TaqMan探针的制备 被引量:1
11
作者 缪爱芳 陈梦玲 +3 位作者 沈爱国 严美娟 高尚锋 程纯 《南通大学学报(医学版)》 2006年第3期157-159,共3页
目的:制备实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)突触后密度蛋白93(PSD93)基因TaqM an探针以进一步研究PSD93表达情况。方法:采用RT-PCR法,从生后1天的SD大鼠大脑组织mRNA中扩增PSD93基因部分CDS区片段,克隆入T载体,筛选阳性克隆、酶切鉴定... 目的:制备实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)突触后密度蛋白93(PSD93)基因TaqM an探针以进一步研究PSD93表达情况。方法:采用RT-PCR法,从生后1天的SD大鼠大脑组织mRNA中扩增PSD93基因部分CDS区片段,克隆入T载体,筛选阳性克隆、酶切鉴定及序列测定,采用TaqM an探针,以重组质粒为模板绘制标准曲线。结果:RT-PCR法扩增出一特异产物与预期长度113bp相符,DNA序列测序的结果与GenBank提供的已知序列(RNU50717)比较,所克隆的PSD93基因片段与其中的113bp完全相同,与PSD93基因100%同源。以重组质粒为模板绘制标准曲线,相关系数r大于0.99,反应效率为0.95,各点变异系数小于20%。结论:采用RT-PCR和T载体技术成功获得FQ-PCR PSD93基因TaqM an探针。 展开更多
关键词 聚合酶链反应 实时荧光定量 taqman探针 突触后密度蛋白93 大鼠
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TaqMan-MGB探针荧光定量聚合酶链式反应法检测酸奶制品中动物双歧杆菌BB-12 被引量:1
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作者 赵一苹 郭益文 +5 位作者 刘龙飞 胡德宝 李新 张林林 丁向彬 郭宏 《食品安全质量检测学报》 CAS 北大核心 2021年第24期9362-9370,共9页
目的建立一种TaqMan-小沟结合物(minor groove binder,MGB)探针荧光定量聚合酶链式反应法检测酸奶制品中动物双歧杆菌BB-12的分析方法。方法设计动物双歧杆菌BB-12的16SrRNA序列的MGB探针,利用荧光定量聚合酶链式反应(polymerase chain ... 目的建立一种TaqMan-小沟结合物(minor groove binder,MGB)探针荧光定量聚合酶链式反应法检测酸奶制品中动物双歧杆菌BB-12的分析方法。方法设计动物双歧杆菌BB-12的16SrRNA序列的MGB探针,利用荧光定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)技术,构建目标序列的过表达载体,提取质粒进行标准曲线的绘制,最后进行市售酸奶样品检测,定量酸奶中BB-12菌株的数量。结果所有载体标准品均产生显著的荧光增幅,循环阈值(cycle threshold, Ct)介于16~20之间;而以其他酸奶制品添加菌及大肠杆菌样品DNA为模板则无荧光扩增信号。在检测灵敏度方面,BB-12载体可被稳定检出的质量浓度低至0.0000584 ng/μL, Ct值平均数为28.73,即检测灵敏度低至为0.05 pg。绘制的标准曲线线性良好,扩增效率E为0.39,判定系数R^(2)=0.9999。市售酸奶样品检测特异性好、灵敏度高、定量结果准确。结论本研究建立的TaqMan-MGB探针荧光定量PCR检测法可实现在酸奶中对BB-12菌种的检测及定量。 展开更多
关键词 taqman-MGB探针荧光定量聚合酶链反应 动物双歧杆菌BB-12 酸奶制品 定量检测
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RAPID MOLECULAR DETECTION OF METHICILLIN -RESISTANT S.AUREUS IN THE INTENSIVE CARE UNIT
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作者 熊咏民 《Academic Journal of Xi'an Jiaotong University》 2000年第2期132-134,共3页
[1]Daniel JG, James RU, Cynthia A G, et al. Multiplex PCR for identification of methicillin-resistant staphylo-cocci in the clinical laboratory [J]. J Clin Microbiol,1994,32(7):1768[2]Chambers HF ,Sachdeva M. Bind... [1]Daniel JG, James RU, Cynthia A G, et al. Multiplex PCR for identification of methicillin-resistant staphylo-cocci in the clinical laboratory [J]. J Clin Microbiol,1994,32(7):1768[2]Chambers HF ,Sachdeva M. Binding of β-lactam antibi-otics to penicillin-binding proteins in methicillin-resis-tant staphylococcus aureus [J]. J Infect Dis, 1990,161:1170[3]Towner KJ,Talbot DC,Curran R, et al. Development and evaluation of a PCR-based immunoassay for the rapid detection of methicillin-resistant staphylococcus aureus[J]. J Med Microbiol, 1998,47 :607[4]Murakami KW, Minamide KW,Nakamura E, et al. I-dentification of methicillin-resistant strains of staphylo-cocci by polymerase chain reaction[J]. J Clin Microbiol,1991,29:2240[5]Hulimann-Dalel RL,Ryffel C, Kayser F H, et al. Sur-vey of the methicillin resistant -associated genes mecA,mecRI-mecI,and femA-femB in clinical isolates of me-thicillin-resistant Staphylococcus aureus[J]. Antimicrob Agents Chemother, 1992,36: 2617[6]Kopp U,Roos M ,Weck J, et al. Staphylococcal peptido-glycan interpeptide bridge biosynthesis: a novel anti-staphylococcal target[J]? Microb Drug Resist, 1996,2:29[7]Rychlik W, Spencer WJ,Rhoads R E. Optimization of the annealing temperature for DNA amplification in vitro [J]. Nucleic Acids Res, 1990,18 : 展开更多
关键词 polymerase chain reaction(PCR) GENE staphylococcus aureus cross infection
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PCR方法快速检测食品中的金黄色葡萄球菌 被引量:31
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作者 田静 计融 +2 位作者 杨军 李业鹏 刘秀梅 《卫生研究》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期183-186,共4页
目的建立聚合酶链反应(PCR)方法快速检测牛奶、冰淇淋及肉中的金黄色葡萄球菌(金葡菌)。方法针对金葡菌耐热核酸酶基因(nuc)、纤维蛋白原结合蛋白基因(ClfA)设计并合成2对引物进行PCR扩增,特异的检测金葡菌,并对52株金葡菌和31株非金葡... 目的建立聚合酶链反应(PCR)方法快速检测牛奶、冰淇淋及肉中的金黄色葡萄球菌(金葡菌)。方法针对金葡菌耐热核酸酶基因(nuc)、纤维蛋白原结合蛋白基因(ClfA)设计并合成2对引物进行PCR扩增,特异的检测金葡菌,并对52株金葡菌和31株非金葡菌进行扩增,验证方法的特异性。在牛奶、冰淇淋及肉中人工污染不同菌量,增菌培养,在不同时间段提取DNA进行PCR扩增,确定该方法在食品中的检出限。结果nuc、ClfA两对引物对金葡菌的检出均有很好的特异性,在3种食品中的检出限均为10cfu/g(ml),全部检测可在24h完成。结论建立了适用于牛奶、冰淇淋及肉中的金葡菌检测的快速、灵敏、特异的PCR方法。 展开更多
关键词 聚合酶链反应 金黄色葡萄球菌 食品 微生物
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单增李斯特菌和金黄色葡萄球菌双重荧光定量PCR检测方法建立 被引量:20
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作者 邵美丽 董鑫 +2 位作者 赵燕丽 孔保华 刘思国 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第16期169-172,共4页
根据GenBank公布的单增李斯特菌的hlyA基因序列和金黄色葡萄球菌的nuc基因序列各设计一对引物和一条探针,建立基于TaqMan探针的单增李斯特菌和金黄色葡萄球菌双重荧光定量聚合酶链式反应(PCR)检测方法。该方法对所有目标菌株均产生特异... 根据GenBank公布的单增李斯特菌的hlyA基因序列和金黄色葡萄球菌的nuc基因序列各设计一对引物和一条探针,建立基于TaqMan探针的单增李斯特菌和金黄色葡萄球菌双重荧光定量聚合酶链式反应(PCR)检测方法。该方法对所有目标菌株均产生特异性扩增曲线,其他非目标菌均不产生扩增曲线,具有较强的特异性。且该法对阳性重组质粒pMD18-hlyA和pMD18-nuc同时定量扩增的敏感度分别为19.5拷贝/μL和18.7拷贝/μL。同步检测人工染菌肉样中单增李斯特菌和金黄色葡萄球菌的最低检出限均为102CFU/g。 展开更多
关键词 taqman探针 单增李斯特菌hlyA基因 金黄色葡萄球菌nuc基因 荧光定量聚合酶链式反应
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全国多中心细菌耐药监测网中血流感染相关金黄色葡萄球菌的分子流行病学研究 被引量:27
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作者 毛镭篥 肖盟 +2 位作者 王贺 赵颖 徐英春 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期120-125,共6页
目的首次研究全国多中心血流感染相关金黄色葡萄球菌(金葡菌)的分子流行病学特征。方法全国17省市34所医院共149株血流感染相关的金葡菌,分析杀白细胞毒素(pvl)基因,多位点序列分型(MLST)和spa分型(编码葡萄球菌A蛋白)及甲氧西林耐药金... 目的首次研究全国多中心血流感染相关金黄色葡萄球菌(金葡菌)的分子流行病学特征。方法全国17省市34所医院共149株血流感染相关的金葡菌,分析杀白细胞毒素(pvl)基因,多位点序列分型(MLST)和spa分型(编码葡萄球菌A蛋白)及甲氧西林耐药金葡菌(MRSA)琼脂稀释法的药敏结果。结果受试菌计有71株MRSA和78株甲氧西林敏感金葡菌(MSSA)。pvl阳性株为11株,MRSA只占1株。MLST显示有23种不同的序列型(ST)结果,MRSA含6种ST分型,主要型别为ST239及ST5;MSSA有20种ST分型,但是各型别比例均不超过15%。spa分型共45种型别,MRSA含8种型别,优势型别为t030和t037;MSSA有38种型别,优势型别为t091和t189。MRSA对常用抗菌药物耐药率依次为环丙沙星91.18%,左氧氟沙星91.18%,红霉素76.47%,莫西沙星73.53%,克林霉素70.59%,利福平58.82%,甲氧苄啶-磺胺甲口恶唑17.65%;对利奈唑胺、万古霉素、去甲万古霉素、替考拉宁、替加环素等药物均100%敏感。结论血流感染相关MRSA传播的优势型别为ST239-t037和ST239-t030,并对多种抗菌药物存在不同程度耐药,需加强细菌耐药性监测。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 Panton-Valentine杀白细胞素基因 多位点序列分型 葡萄球菌A蛋白分型 多重聚合酶链反应 药敏试验
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速冻食品中沙门氏菌和金黄色葡萄球菌多重PCR检测方法的建立与应用 被引量:18
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作者 滕要辉 索标 +2 位作者 艾志录 谢新华 潘治利 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第8期140-144,共5页
为实现速冻食品中沙门氏菌(Salmonella spp.)和金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的多重聚合酶链式反应(PCR)检测,首先优化多重PCR扩增的反应条件,比较基因组DNA提取方法,结果表明:退火温度采用60℃、各引物浓度200nmol/L及扩增循... 为实现速冻食品中沙门氏菌(Salmonella spp.)和金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的多重聚合酶链式反应(PCR)检测,首先优化多重PCR扩增的反应条件,比较基因组DNA提取方法,结果表明:退火温度采用60℃、各引物浓度200nmol/L及扩增循环35次,本多重PCR检测技术可以有效地将沙门氏菌和金黄色葡萄球菌同时检出,检测特异性为100%。3种DNA提取方法中试剂盒法纯度最高,检出限分别是31、26DNA copies/reaction。经过在人工污染致病菌的速冻水饺中应用试验后,该多重PCR方法经过4h的增菌培养即可从速冻水饺中同时检测出起始菌落数低至100CFU/g的沙门氏菌和金黄色葡萄球菌。 展开更多
关键词 速冻食品 多重聚合酶链式反应 检测 沙门氏菌 金黄色葡萄球菌
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新型多重聚合酶链反应对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌SCCmec基因的分型研究 被引量:13
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作者 李囡 范红 +5 位作者 陆小军 张磊 谢轶 王军 应斌武 陈慧莉 《现代检验医学杂志》 CAS 2008年第1期32-35,共4页
目的用一种新型的多重聚合酶链反应(PCR)方法对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的葡萄球菌盒式染色体(SCCmec)基因进行分型研究,以了解该地区流行株的主要型别。方法收集136株经MicroScan Walkaway-40微生物鉴定和药敏系统鉴定的MRSA;... 目的用一种新型的多重聚合酶链反应(PCR)方法对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的葡萄球菌盒式染色体(SCCmec)基因进行分型研究,以了解该地区流行株的主要型别。方法收集136株经MicroScan Walkaway-40微生物鉴定和药敏系统鉴定的MRSA;头孢西丁纸片扩散法和mecA,femB基因复合扩增法进行确证试验;用新型多重PCR方法对确证的MRSA进行SCCmec基因分型。结果 127株被确证为MRSA;SCCmec分型显示,125株为SCCmecⅢ型,与以往报道相同;其余两株均为SCCmecⅣa,结合病例资料判定该两株菌为社区获得性MRSA。结论该研究中的MRSA主要携带SCCmecⅢ型基因,携带SCCmecⅣa型基因的社区获得性MRSA为该地区首次报道;新型多重PCR方法是适用于临床实验室进行MRSA SCCmec分型研究的更为简单有效的方法。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 甲氧西林 耐药性 聚合酶链反应
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食品中金黄色葡萄球菌的PCR检测 被引量:8
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作者 王韶 刘桂华 +3 位作者 乔凤 史杰萍 方丽 李波 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期933-936,共4页
目的:建立检测食品中金黄色葡萄球菌的PCR方法并将PCR方法与传统方法进行比较,评价PCR方法的检测效果。方法:采用PCR方法特异性扩增金黄色葡萄球菌的耐热核酸酶编码基因(nuc基因),分别采用PCR方法和国家标准规定的方法检测180份吉林省... 目的:建立检测食品中金黄色葡萄球菌的PCR方法并将PCR方法与传统方法进行比较,评价PCR方法的检测效果。方法:采用PCR方法特异性扩增金黄色葡萄球菌的耐热核酸酶编码基因(nuc基因),分别采用PCR方法和国家标准规定的方法检测180份吉林省各地区的抽检食品样品。结果:所检金黄色葡萄球菌在422bp处出现nuc基因目的片段;食品样品传统方法检出阳性42份,PCR方法检出45份,PCR检测方法与国标法检出阳性率比较,差异无显著性(P>0·05)。结论:PCR方法检测食品中金黄色葡萄球菌较传统方法更快速和简便,且具有较高的特异性和敏感性,可作为食品中金黄色葡萄球菌快速检测的手段。 展开更多
关键词 食品 葡萄球菌 金黄色 聚合酶链反应/方法 核糖核酸酶类 葡萄球菌感染/诊断
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应用双重Real-time PCR同步定量检测食品中的副溶血性弧菌及金黄色葡萄球菌 被引量:16
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作者 蒋鲁岩 蔡潭溪 +2 位作者 邵景东 徐邦兴 陈溥言 《中国食品卫生杂志》 2006年第3期205-209,共5页
为同时测定食品中的副溶血性弧菌和金黄色葡萄球菌,建立了基于TaqMan探针的双重Real timePCR方法。针对副溶血性弧菌的gyrB基因序列和金黄色葡萄球菌coa基因序列分别设计引物和TaqMan探针,建立双重Real timePCR检测体系,制作校正曲线,... 为同时测定食品中的副溶血性弧菌和金黄色葡萄球菌,建立了基于TaqMan探针的双重Real timePCR方法。针对副溶血性弧菌的gyrB基因序列和金黄色葡萄球菌coa基因序列分别设计引物和TaqMan探针,建立双重Real timePCR检测体系,制作校正曲线,同步定量检测副溶血性弧菌和金黄色葡萄球菌。建立的双重Real timePCR方法对2种细菌菌液的检测敏感度均低于10CFU PCR反应体系,相关系数均为1.00,整个试验可在2h内完成。建立的方法可用于食品中副溶血性弧菌和金黄色葡萄球菌的快速、同步、定量检测。 展开更多
关键词 弧菌 副溶血性 葡萄球菌 金黄色 聚合酶链反应 taqman 探针
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