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深海链霉菌SCSIO 1071中聚酮合酶基因簇Cluster 46编码产物探究
1
作者
孙倩楠
张会鹏
+3 位作者
侯路宽
肖菲
李花月
李文利
《中国海洋药物》
CAS
CSCD
2022年第3期25-33,共9页
目的 对南海深海来源链霉菌Streptomyces olivaceus SCSIO 1071中新颖I型聚酮合酶基因簇Cluster46及其编码产物进行探究。方法 通过生物信息学手段对基因簇Cluster 46的基因组成进行分析;采用PCRtargeting策略构建聚酮合酶基因orf27和L...
目的 对南海深海来源链霉菌Streptomyces olivaceus SCSIO 1071中新颖I型聚酮合酶基因簇Cluster46及其编码产物进行探究。方法 通过生物信息学手段对基因簇Cluster 46的基因组成进行分析;采用PCRtargeting策略构建聚酮合酶基因orf27和LuxR家族转录调控基因orf46双交换阻断突变株;通过高效液相色谱法(HPLC)分析野生株和突变株发酵产物的差异,检测粗提物对3株多重耐药(multiple drug resistant,MDR)菌Staphylococcus aureus CCARM 3090、Enterococcus faecalis CCARM 5172、Enterococcus faecium CCARM 5203的抑菌活性。结果 得到了Δorf27和Δorf46双交换阻断突变株;HPLC分析结果表明,相比较野生株,Δorf27和Δorf46突变株中化合物峰1~10不再产生;突变株发酵液粗提物对3株MDR菌抑菌活性较野生株明显降低;液相色谱-质谱(LC-MS)数据和紫外(UV)数据表明化合物峰1~10可能为dixiamycins类化合物。结论 orf27和orf46的阻断间接影响了具有抗MDR菌活性的化合物峰1~10的产生,为挖掘S. olivaceus SCSIO 1071中新颖活性次级代谢产物奠定了基础。
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关键词
深海链霉菌
streptomyces
olivaceus
SCSIO
1071
聚酮合酶生物合成基因簇
多重耐药菌
原文传递
题名
深海链霉菌SCSIO 1071中聚酮合酶基因簇Cluster 46编码产物探究
1
作者
孙倩楠
张会鹏
侯路宽
肖菲
李花月
李文利
机构
中国海洋大学海洋药物教育部重点实验室
出处
《中国海洋药物》
CAS
CSCD
2022年第3期25-33,共9页
基金
国家自然科学基金项目(U1706206)
国家重点研发计划项目(2019YFC0312501)资助。
文摘
目的 对南海深海来源链霉菌Streptomyces olivaceus SCSIO 1071中新颖I型聚酮合酶基因簇Cluster46及其编码产物进行探究。方法 通过生物信息学手段对基因簇Cluster 46的基因组成进行分析;采用PCRtargeting策略构建聚酮合酶基因orf27和LuxR家族转录调控基因orf46双交换阻断突变株;通过高效液相色谱法(HPLC)分析野生株和突变株发酵产物的差异,检测粗提物对3株多重耐药(multiple drug resistant,MDR)菌Staphylococcus aureus CCARM 3090、Enterococcus faecalis CCARM 5172、Enterococcus faecium CCARM 5203的抑菌活性。结果 得到了Δorf27和Δorf46双交换阻断突变株;HPLC分析结果表明,相比较野生株,Δorf27和Δorf46突变株中化合物峰1~10不再产生;突变株发酵液粗提物对3株MDR菌抑菌活性较野生株明显降低;液相色谱-质谱(LC-MS)数据和紫外(UV)数据表明化合物峰1~10可能为dixiamycins类化合物。结论 orf27和orf46的阻断间接影响了具有抗MDR菌活性的化合物峰1~10的产生,为挖掘S. olivaceus SCSIO 1071中新颖活性次级代谢产物奠定了基础。
关键词
深海链霉菌
streptomyces
olivaceus
SCSIO
1071
聚酮合酶生物合成基因簇
多重耐药菌
Keywords
deep-sea derived
streptomyces
streptomyces olivaceus
SCSIO 1071
polyketide synthase biosynthesis gene cluster
multiple drug resistant bacteria
分类号
R931 [医药卫生—生药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
深海链霉菌SCSIO 1071中聚酮合酶基因簇Cluster 46编码产物探究
孙倩楠
张会鹏
侯路宽
肖菲
李花月
李文利
《中国海洋药物》
CAS
CSCD
2022
0
原文传递
已选择
0
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参考文献
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