不同日龄非洲鸵鸟空肠微生物宏基因组学检测

采用宏基因组学技术对7日龄组、30日龄组、60日龄组和180日龄组非洲鸵鸟(Struthio camelus)空肠中的微生物进行测序和分析,共获得1 211 981个优化序列以及定义了13 830个OTU,平均每个样本获得154个OTU。结果显示,7日龄组和60日龄组肠道微生物丰富度较高,且组成较相似,30日龄组和180日龄组肠道微生物丰富度较低,菌群组成也与其他日龄有较大差异;门水平上,变形菌门(Proteobacteria)是各日龄空肠微生物中的优势菌门,厚壁菌门(Firmicutes)为第二优势菌门,且随着年龄增长变形菌门的相对丰度呈上升趋势,而厚壁菌门相对丰度呈下降趋势;属水平上,7日龄、30日龄、60日龄和180日龄时的优势菌属分别为不动杆菌属(Acinetobacter)、大肠埃希氏菌-志贺菌属(EscherichiaShigella)、不动杆菌属和假单胞菌属(Pseudomonas);功能预测结果显示,7日龄和30日龄肠道微生物的功能基因在代谢疾病及细菌性疾病等方面的富集程度显著高于60日龄,整体上各日龄微生物的功能基因均在代谢相关的途径上有较高的富集程度。综上可知,在非洲鸵鸟发育的不同阶段,其空肠中微生物的组成结构及功能均存在差异。

非洲鸵鸟粪便中大肠杆菌的分离与鉴定

为探讨非洲鸵鸟(Struthio camelus)腹泻是否与大肠杆菌有关,以9羽非洲鸵鸟粪便为研究对象,将纯化培养后的细菌进行革兰氏染色、细菌形态学鉴定、生化鉴定。结果表明,2~9号菌株在麦康凯培养基生长为红色、湿润的圆形菌落,1号菌株在麦康凯培养基生长为白色透明、湿润的圆形菌落;革兰氏染色均为阴性,镜检均为红色杆菌;9株菌株均能发酵葡萄糖、甘露醇、阿拉伯糖、麦芽糖,大部分菌株能分解山梨醇、乳糖、鼠李糖、蔗糖、棉子糖,1株菌不能发酵乳糖且在麦康凯培养基上呈白色透明菌落,所有菌株均不能利用硫化氢、枸橼酸盐,所有菌株VP试验、尿素反应均为阴性,所有菌株MR试验、吲哚试验均为阳性,9株被检菌株均为大肠杆菌。

非洲鸵鸟源乳酸菌的生物学特性研究

为微生态制剂的制备提供候选菌株,对非洲鸵鸟(Struthio camelus)粪便中3株乳酸菌的生长特性、产酸性能以及耐酸、耐胆盐、耐药性进行研究。结果表明,非洲鸵鸟粪便中分离的3株乳酸菌(M1、M2、M3)培养6 h后进入对数生长期,14 h后达到稳定期,24 h后菌液pH稳定在4.92。3株乳酸菌间互相比较,M1有较好的耐酸性,M2、M3有较高的耐胆盐能力。3株乳酸菌对链霉素、卡那霉素、庆大霉素中度敏感,对四环素、氧氟沙星耐药。3株菌株具有很好的生物学特性,可应用于动物微生态制剂中。