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题名赤琥珀螺线粒体全基因组测定与系统发育关系的研究
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作者
马蕊
张卫红
郭阳阳
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机构
新疆大学生命科学与技术学院
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出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期175-182,共8页
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基金
新疆维吾尔自治区科技计划(2020D01C043)。
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文摘
旨在通过高通量测序技术获得赤琥珀螺(Succinea erythrophana)线粒体基因组全序列,对其结构及组成特征进行分析,并结合NCBI数据库已公布的琥珀螺科及柄眼目物种序列,以最大似然法和贝叶斯法分别进行系统发育分析。结果显示:①赤琥珀螺线粒体基因组全长14023 bp(GenBank No.ON533899),由37个基因和一段富含AT的非编码控制区组成,有20处基因间隔,13处基因重叠。A+T平均含量为77.3%,表现出明显的AT偏向性。基因的排列顺序、结构与组成、密码子使用情况与琥珀螺科已报道种类相似。②除tRNA-Phe、tRNA-His、tRNA-Ser1、tRNA-Ser2外,其余tRNAs呈典型三叶草结构。③Ka/Ks选择压力分析显示其受到纯化选择作用。④系统发育研究揭示赤琥珀螺与同属的腐败琥珀螺(Succinea putris)亲缘关系最近,然后与同科其他物种形成姐妹群关系。
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关键词
赤琥珀螺
琥珀螺科
线粒体基因组
系统发育
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Keywords
succinea erythrophana
Succineidae
Mitochondrial genome
Phylogeny
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分类号
S917.4
[农业科学—水产科学]
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