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基于网络药理学探究苏黄泻浊丸抗肾间质纤维化及其调控铁死亡的作用机制
1
作者
肖竞
李莲花
+5 位作者
闫晓明
王立范
于卓
刘娜
张佩青
陈明
《中医临床研究》
2024年第13期1-12,共12页
目的:基于网络药理学探究苏黄泻浊丸治疗肾间质纤维化(Renal Interstitial Fibrosis,RIF)及调控铁死亡的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、STRING、OMIM、Gene Cards、DisGeNet等筛选苏黄泻浊丸的中药活性成...
目的:基于网络药理学探究苏黄泻浊丸治疗肾间质纤维化(Renal Interstitial Fibrosis,RIF)及调控铁死亡的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、STRING、OMIM、Gene Cards、DisGeNet等筛选苏黄泻浊丸的中药活性成分及RIF关联靶标,借助Cytoscape 3.6.0软件构建苏黄泻浊丸活性成分-RIF靶标网络,结合STRING数据库构建方药与RIF关联靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用FerrDb数据库获取铁死亡调控基因,最终获取公共靶标基因,构建苏黄泻浊丸活性成分-RIF、铁死亡共同靶标网络,结合STRING数据库构建共同靶蛋白相互作用网络;利用DAVID数据库进行KEGG通路富集分析。结果:筛选出药物活性成分102个,与RIF关联的靶基因177个,经基因本体论(GO)、KEGG分析,苏黄泻浊丸治疗RIF的生物过程与RNA聚合酶Ⅱ促进转录的正调控、转录因子活性、序列特异性DNA结合等有关,通过调节脂质与动脉粥样硬化、白细胞介素(Interleukin,IL)-17信号通路、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、辅助性T细胞17(T Helper Cells 17,Th17)细胞分化、细胞衰老发挥作用。调控铁死亡共同基因有34个,可能参与IL-17信号通路、缺氧诱导因子-1(Hypoxia Inducible Factor-1,HIF-1)信号通路、ErbB信号通路、脂质代谢、Th17细胞分化、C型凝集素受体信号通路、TNF信号通路等。结论:本研究预测了苏黄泻浊丸治疗RIF及其调控铁死亡的主要化合物、靶标及通路,为后续深入研究苏黄泻浊丸治疗RIF的作用机制提供理论参考。
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关键词
网络药理学
肾间质纤维化
铁死亡
作用机制
苏黄泻浊丸
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职称材料
题名
基于网络药理学探究苏黄泻浊丸抗肾间质纤维化及其调控铁死亡的作用机制
1
作者
肖竞
李莲花
闫晓明
王立范
于卓
刘娜
张佩青
陈明
机构
黑龙江省中医药科学院
出处
《中医临床研究》
2024年第13期1-12,共12页
基金
黑龙江省自然科学基金项目(LH2021H070)
全国名老中医药专家学术经验继承工作指导教师首批省级学术经验继承人项目
第二批省级中医临床优秀人才项目(黑中医药教函[2022]28号)。
文摘
目的:基于网络药理学探究苏黄泻浊丸治疗肾间质纤维化(Renal Interstitial Fibrosis,RIF)及调控铁死亡的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、STRING、OMIM、Gene Cards、DisGeNet等筛选苏黄泻浊丸的中药活性成分及RIF关联靶标,借助Cytoscape 3.6.0软件构建苏黄泻浊丸活性成分-RIF靶标网络,结合STRING数据库构建方药与RIF关联靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用FerrDb数据库获取铁死亡调控基因,最终获取公共靶标基因,构建苏黄泻浊丸活性成分-RIF、铁死亡共同靶标网络,结合STRING数据库构建共同靶蛋白相互作用网络;利用DAVID数据库进行KEGG通路富集分析。结果:筛选出药物活性成分102个,与RIF关联的靶基因177个,经基因本体论(GO)、KEGG分析,苏黄泻浊丸治疗RIF的生物过程与RNA聚合酶Ⅱ促进转录的正调控、转录因子活性、序列特异性DNA结合等有关,通过调节脂质与动脉粥样硬化、白细胞介素(Interleukin,IL)-17信号通路、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、辅助性T细胞17(T Helper Cells 17,Th17)细胞分化、细胞衰老发挥作用。调控铁死亡共同基因有34个,可能参与IL-17信号通路、缺氧诱导因子-1(Hypoxia Inducible Factor-1,HIF-1)信号通路、ErbB信号通路、脂质代谢、Th17细胞分化、C型凝集素受体信号通路、TNF信号通路等。结论:本研究预测了苏黄泻浊丸治疗RIF及其调控铁死亡的主要化合物、靶标及通路,为后续深入研究苏黄泻浊丸治疗RIF的作用机制提供理论参考。
关键词
网络药理学
肾间质纤维化
铁死亡
作用机制
苏黄泻浊丸
Keywords
Network pharmacology
Renal interstitial fibrosis
Ferroptosis
Mechanism of action
suhuang xiezhuo wan
分类号
R256.5 [医药卫生—中医内科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学探究苏黄泻浊丸抗肾间质纤维化及其调控铁死亡的作用机制
肖竞
李莲花
闫晓明
王立范
于卓
刘娜
张佩青
陈明
《中医临床研究》
2024
0
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