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题名μ阿片受体三维结构模建与芬太尼类似物分子对接研究
被引量:3
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作者
王磊
胡文祥
刘小利
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机构
首都师范大学化学系
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出处
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期746-750,共5页
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文摘
本文通过牛视紫质蛋白质晶体结构使用Composer模建程序进行了人类μ阿片受体的同源模建,预测了μ阿片受体的二级结构,用Ramachandran图和ProTable验证模型的可靠性。得到的模型91%的氨基酸残基位于最佳区域,7个疏水区域表明有7个跨膜区与模型一致。并使用Surflex-Dock程序进行一系列芬太尼类似物分子与μ阿片受体的对接研究进而研究了其作用机制。活性位点主要包括ILE109,ASP112,TYR113,MET116,HIS262,TYR291。这些氨基酸残基都是芬太尼类似物与μ阿片受体的相互作用的主要残基。对接打分较高的分子均为与活性位点结合较好的分子,由此可对μ阿片受体有更深入的了解从而为设计出活性更高的芬太尼类化合物提供依据。
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关键词
同源模建
surflex对接
芬太尼类似物
Μ阿片受体
COMPOSER
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Keywords
homologous modeling, surflex docking, fentanyl analogs,μ-opioid receptor, composer
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分类号
TQ464.7
[化学工程—制药化工]
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