花生COP1基因的克隆及表达特征分析

为了探究花生中COP1基因的序列及表达特征,本研究从花生中克隆获得2个COP1基因,分别命名为AhyCOP1a和AhyCOP1b,以此为基础进行了相关分析。结果显示,AhyCOP1a和AhyCOP1b分别长2103 bp和2049 bp,均含有13个外显子和12个内含子。聚类结果显示AhyCOP1a和AhyCOP1b与双子叶作物的COP1基因聚成一类,且分别与AduCOP1和AipCOP1亲缘关系最近,表明AhyCOP1a和AhyCOP1b的进化分别始于花生野生种Ar⁃achis duranensis和A.ipaensis。此外,AhyCOP1a和AhyCOP1b分别有6个和7个WD40重复基序。各类物种的COP1基因在N端相似度较低,在C端WD40结构域部分相似性较高,表明WD40结构域是COP1基因的主要核心功能区域。组织表达结果显示,AhyCOP1a和AhyCOP1b在地上部的表达显著高于地下部,花中最高,其次为叶和茎。但AhyCOP1a在地下组织的表达量在显著高于AhyCOP1b,暗示AhyCOP1a在地下组织发育过程中的作用更大。此外还发现光照可以促进花生COP1基因的表达,表明花生中COP1基因的表达受光照显著影响。总之,本研究结果初步明确了花生中COP1基因的序列及表达特征,为后续深入探究COP1基因的分子功能奠定了基础。

发展型学习任务群中“表达与交流”的共性特征及不同要求

实用性阅读与交流、文学阅读与创意表达、思辨性阅读与表达是新课标设置的三个发展型学习任务群,它们在语文课程架构中处于承上启下的关键位置。就“表达与交流”这一语文实践活动而言,三大发展型学习任务群具有课程内容统整化、目标要求层级化、涉及文类精细化等共同特征,与新课标注重结构性、整体性、阶段性、实践性的指导思想相符。但细细研究,发展型学习任务群中“表达与交流”活动的价值、旨归是有明显区别的,或注重实用,或指向审美,或强调思辨。其相同之处源于三者的课程理念、导向一致,不同之处在于各自的功能、定位有别。教学既要关注相同之处,又要因群施策,靶向发力。这样,才能充分发挥发展型学习任务群中“表达与交流”实践活动提升学生语文核心素养的应有作用。

东方蜜蜂微孢子虫腺苷酸激酶的生物信息学与基因表达特征

本研究旨在解析东方蜜蜂微孢子虫Nosema ceranae的腺苷酸激酶(Adenylat kinase,ADK)NcADK的理化性质和分子特性,并检测NcADK基因在东方蜜蜂微孢子虫侵染意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica工蜂过程中的表达特征,以期丰富NcADK相关信息,并为进一步的功能研究提供依据。利用相关生物信息学软件预测和分析NcADK的理化性质、信号肽、磷酸化位点、二级结构和三级结构。使用MEME软件和Batch CD-Search工具分别预测东方蜜蜂微孢子虫和其它7种微孢子ADK蛋白的保守基序和保守结构域。通过Mega 11.0软件基于ADK氨基酸序列构建进化树。采用RT-qPCR检测东方蜜蜂微孢子虫侵染过程中NcADK的相对表达量。结果表明,NcADK的CDS含有540个核苷酸,可编码179个氨基酸;NcADK的分子量约为20.66 kDa,分子式为C903H1488N258O278S8,脂肪系数为100.61,平均亲水系数为-0.502,等电点为6.83,含29个负电荷氨基酸和29个正电荷氨基酸;NcADK可同时定位于细胞质、线粒体、细胞核、囊泡和过氧化物酶体;NcADK含20个磷酸化位点,不含典型的信号肽;NcADK含88个α-螺旋,24条延长链,17个β-转角,50个无规则卷曲,与模板A0A0F9WEU7.1.A之间的序列同源性为100%;在东方蜜蜂微孢子虫、东方赤孢子虫Hamiltosporidium tvaerminnensis、肠脑炎微孢子虫Encephalitozoon intestinalis、按蚊微孢子虫Anncaliia algerae和角膜条孢虫Vittaforma corneae ADK中均鉴定到1个相同的结构域和5个相同的保守基序;东方蜜蜂微孢子虫与蜜蜂微孢子虫Nosema apis的ADK在进化树上聚为一支。相较于接种后1 d(1 day post inoculation,1 dpi),NcADK的表达量在2 dpi上调但无显著差异(P>0.05),在3 dpi和4 dpi均显著上调(P>0.05)。研究结果明确了NcADK的理化性质和分子特性,并揭示NcADK是潜在的亲水性蛋白和胞内蛋白,不同微孢子虫的ADK具有较强的保守性,东方蜜蜂微孢子虫及其姐妹种蜜蜂微孢子虫的ADK具有高同源性,NcADK在3 dpi和4 dpi被激活表达。

老年陪护机器人的人格化类童特征情感表达研究

目的 在面向医养结合的智慧养老服务模式下,研究用户对老年陪护机器人情感表达的感知结果和形态偏好,以减少用户的使用障碍和对机器人的不信任感。方法 采用文献分析的方法,对老年陪护机器人CareBot提出6种类童特征的情感表达设计原则,通过与机器人的互动实验研究,对调查问卷结果进行统计学分析,形成可视化的数据报告来深入探讨用户对机器人的评估结果。结果 参与者能较好识别其中3种情感表达(热情的、冷漠的和惊讶的),参与者的年龄与熟悉儿童或智能产品的程度对评估结果有明显影响。同时,机器人具有大眼睛表情、可爱动作和儿童声音的类童特征形态,对老年人更具亲和力。而情感表达原则中“表情”“表情与声音的组合”适用性和一致性较高。结论 适当的类童特征可以增强机器人的情感表达能力,增加机器人正面情感表达、减少负面情感表达的设计,有助于提高养老服务机器人的接受度。

赤眼鳟LGP2序列结构、组织表达及与MDA5互作特征

为探究赤眼鳟遗传学和生理学实验室蛋白2(laboratory of genetics and physiology 2,LGP2)的功能特征及抗草鱼呼肠孤病毒(grass carp reovirus,GCRV)育种参考潜力,实验克隆获得了2940 bp的赤眼鳟lgp2(Sclgp2)全长cDNA和721 bp的5′端上游序列。Sclgp2 cDNA编码680个氨基酸,包含DEXDc(DExD/H-box helicase domain)、HELICc(helicase superfamily C-terminal domain)和CTD(C-terminal regulatory domain)结构域;其5′端上游序列含有MafB(muscle aponeurosis fibromatosis B)和IRF3(interferon regulatory factor 3)等转录因子结合位点。不同物种LGP2的功能结构域、磷酸化修饰位点数具有相似性,同时也存在结构域排布位置及序列的差异。赤眼鳟和草鱼lgp2 cDNA序列比较初步发现2个位于RNA结合功能区的GCRV抗性关联位点。系统进化分析显示,赤眼鳟LGP2先与草鱼、鲫和青鱼聚在一起,再与鲤科鱼类等聚为一大支。荧光定量表达分析显示,赤眼鳟脾脏中sclgp2表达水平显著高于其他组织,肌肉、心脏中表达量次之,而肠中表达量最低。GCRV感染后,肝脏中ifn1表达水平在24~72 h显著下降,其他组织sclgp2和ifn1表达水平未有显著变化。相关性分析结果显示,赤眼鳟肌肉sclgp2与ifn1表达水平呈极显著正相关(0.999)。酵母双杂交互作检测发现,赤眼鳟LGP2与MDA5存在弱相互作用,而其DEXDc(1~201 aa)、HELICc(390~476 aa)以及CTD(553~668 aa)结构域与MDA5无互作。该研究成功获得了sclgp2全长cDNA及5′端上游序列,明确了其序列结构、免疫表达及与MDA5的互作特征,为赤眼鳟LGP2免疫功能属性研究奠定了基础,并为草鱼抗GCRV育种提供了参考。

内皮素3、黑色素瘤优先表达抗原表达水平与子宫内膜癌临床特征及预后的关系

目的探究内皮素3(EDN3)、黑色素瘤优先表达抗原(PRAME)表达水平与子宫内膜癌临床特征及预后的关系。方法选取郑州大学第二附属医院2018年9月至2020年9月收治的80例子宫内膜癌患者为研究对象,在术中收集癌组织和癌旁组织;采用定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)和免疫组化法检测EDN3、PRAME表达;EDN3、PRAME与子宫内膜癌患者预后的关系采用Kaplan-Meier生存曲线分析;子宫内膜癌患者预后的影响因素采用COX回归分析。绘制受试者操作特征曲线分析EDN3、PRAME对子宫内膜癌预后不良的预测价值。结果子宫内膜癌组织EDN3信使核糖核酸(mRNA)表达水平和阳性表达率显著低于癌旁组织(P<0.05),PRAME mRNA表达水平和阳性表达率显著高于癌旁组织(P<0.05)。子宫内膜癌组织中EDN3、PRAME表达与国际妇产科联盟(International Federation of Gynecology and Obstetrics,FIGO)分期、分化程度、淋巴结转移有关(P<0.05)。EDN3阳性患者生存率高于阴性患者(P<0.05);PRAME阳性患者生存率低于阴性患者(P<0.05)。预后不良组患者EDN3 mRNA表达水平显著低于预后良好组,PRAME mRNA表达水平显著高于预后良好组(P<0.05)。根据受试者操作特征曲线得知,EDN3和PRAME二者联合预测子宫内膜癌预后不良优于各自单独预测(Z_(联合vsEDN3)=2.667、Z_(联合vsPRAME)=2.682,P<0.05)。多因素COX回归分析结果显示,PRAME、FIGO分期、分化程度、淋巴结转移是影响子宫内膜癌患者预后的危险因素(P<0.05),EDN3是保护因素(P<0.05)。结论子宫内膜癌组织中EDN3表达显著降低,PRAME表达显著升高,二者与临床特征及预后密切相关。

乳腺癌组织中bFGF、Ki-67及ADAM15表达情况及与其临床病理特征的相关性分析

目的 探讨乳腺癌组织中碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)、Ki-67及去整合素金属蛋白酶15(ADAM15)表达情况及其与临床病理特征的关系。方法 选取87例乳腺癌患者作为研究对象,均行手术治疗,采集肿瘤标本及癌旁标本行免疫组化染色检查,比较肿瘤组织及癌旁组织内bFGF、Ki-67及ADAM15表达情况,并分析bFGF、Ki-67及ADAM15表达与其临床病理特征的关系。结果 肿瘤组织内bFGF、Ki-67及ADAM15阳性率高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05);bFGF阳性组肿瘤Ⅲ~Ⅳ期、有淋巴结转移、肿瘤直径≥3 cm占比高于bFGF阴性组,差异有统计学意义(P<0.05);Ki-67阳性组肿瘤Ⅲ~Ⅳ期、有淋巴结转移、肿瘤直径≥3 cm占比高于Ki-67阴性组,差异有统计学意义(P<0.05);ADAM15阳性组肿瘤Ⅲ~Ⅳ期、有淋巴结转移、肿瘤直径≥3 cm占比高于ADAM15阴性组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 bFGF、Ki-67及ADAM15在乳腺癌组织内存在较高阳性表达,且与肿瘤分期、淋巴结转移及肿瘤直径存在密切关系,或可作为完善乳腺癌治疗方案的新靶点。

HER-2低表达与HER-2阴性早期乳腺癌临床与病理特征及NACT效果对比

目的 探讨人表皮生长因子受体-2(HER-2)低表达与HER-2阴性早期乳腺癌临床与病理特征及新辅助化疗(NACT)效果的差异性。方法 收集2018年1月—2022年7月于我院行NACT及手术治疗的137例早期乳腺癌患者的临床资料行回顾性分析,根据化疗前HER-2状态分为HER-2低表达组(HER2-low组,n=94)和HER-2阴性组(HER2-zero组,n=43),并进一步依据激素受体状态(HR+/-)分为HR+/HER2-low组(n=74)、HR+/HER2-zero组(n=28)、HR-/HER2-low组(n=20)、HR-/HER2-zero组(n=15)四个亚组;对比分析两组及亚组间的年龄、BMI、月经状态、分子亚型、组织学分级,TNM分期、化疗方案和周期、手术方式,NACT前后雌孕激素受体和Ki-67状态,NACT后靶病灶客观缓解率和腋窝淋巴结缩小比例,术后腋窝淋巴结病理状态和病理M&P分级,组间及亚组间pCR率等。结果 HER2-low组患病率显著高于HER2-zero组(P<0.05);HER2-low组与HER2-zero组一般资料差异无统计学意义(P>0.05);HER2-low组雌激素受体阳性率和Ki-67<35%的比例显著高于HER2-zero组,而在靶病灶客观缓解率(ORR)和HR-亚组中的pCR率显著降低,同时对比发现HR-/HER2-low亚组具有较高的组织学分级和较低的Ki-67<35%状态,差异均有统计学意义(P<0.05);HER2-low组与HER2-zero组在腋窝淋巴结缩小比例、术后腋窝淋巴结病理状态及组间pCR率等其他预后指标方面差异无统计学意义(P>0.05)。结论 HER-2低表达较HER-2阴性早期乳腺癌患病率高,且具有较高的雌激素受体阳性率和较低的Ki-67状态,缩瘤效果较差,并在激素受体阴性亚组中的pCR率显著降低,同时发现低pCR率与较高的组织学等级和较低的Ki-67状态相关。

乳腺浸润性癌中CD147和PHH3的表达与临床病理特征的关系

目的观察浸润性乳腺癌中CD147蛋白的定量表达和PHH3阳性细胞数目,分析二者与多个临床病理特征的关系及相关性。方法选取80例乳腺原发浸润性癌手术切除标本为研究对象,29例正常乳腺组织作为对照组,采用免疫组织化学SP法检测CD147和PHH3的表达,用IPP6.0图像分析软件对CD147蛋白表达进行定量测试,计数PHH3阳性个数和有丝分裂指数,分析浸润性乳腺癌中CD147和PHH3的表达与临床病理特征的关系,用Spearman法分析二者之间的相关性。结果CD147主要定位于乳腺癌细胞胞膜或膜浆,PHH3主要定位于浸润性乳腺癌有丝分裂的细胞核内,二者在浸润性乳腺癌组织中的定量表达和阳性数目均显著高于正常乳腺组织(P=0.000)。80例浸润性乳腺癌中,CD147蛋白定量表达在肿瘤直径较大、WHO分级较高、淋巴结有转移、TNMⅢ-Ⅳ期、雌激素受体(estrogen receptor,ER)阴性、Her-2基因无扩增阳性强度较高(P均<0.05);PHH3阳性数目和有丝分裂指数在肿瘤直径较大、WHO分级较高、淋巴结有转移状况及TNM分期Ⅲ-Ⅳ期(P_(均)<0.05)。CD147蛋白表达越高,PHH3阳性数目相应越多,有丝分裂指数越高,Spearman分析显示CD147分别与PHH3阳性数目和有丝分裂指数呈显著正相关(r=0.950,r=0.706,P=0.000)。结论浸润性乳腺癌中CD147和PHH3高表达,与肿瘤的发生发展有关,二者呈正相关,检测乳腺癌中CD147蛋白定量表达、PHH3阳性数目和有丝分裂指数有助于侵袭和转移的判断,为乳腺癌临床病理诊断提供了参考价值。

鳜Shh基因分子特征和时空表达规律及其对肌肉生长的调控

研究从鳜(Siniperca chuatsi)基因组中获得Shh(Sonic hedgehog)基因序列,对该基因编码的蛋白质和同源进化特征进行了分析。鳜Shh基因的开放阅读框(ORF)为1242 bp,编码413个氨基酸,分子量为46.01 kD,等电点(pI)为6.57,脂溶系数为82.83,亲水性平均系数为−0.292,拥有一个跨膜区,被推定为亲水性膜结合蛋白。Shh蛋白具有两个结构域,即Hh-N和Hh-C结构域。鳜Shh蛋白与自身所属的鲈形目鱼类Shh蛋白同源性较高。通过实时荧光定量PCR技术检测了鳜Shh基因的时空表达水平。结果显示:Shh的表达量在神经胚期表达显著上调,并在胚胎发育中后阶段保持较高水平。Shh在鳜不同组织中存在一定的表达差异,在脑、肠道中表达量较高,而在红肌、白肌等组织中表达量相对较低。通过环巴胺(Cyclopamine)处理鳜胚胎来抑制Shh信号通路的实验表明,Shh信号通路被抑制后,Pax3、Pax7、Myomaker、生肌调节因子及肌球蛋白重、轻链等基因的表达均显著降低,推测Shh参与调控鳜肌细胞的早期分化和发育过程。研究将有助于从分子水平了解Shh信号调控鱼类发育的分子机理,为鱼类发育生物学以及健康养殖提供参考依据。

鳙IGFBP1分子特征及基因表达模式研究

从鳙(Hypophthalmichthys nobilis)基因组中获得胰岛素样生长因子结合蛋白1(IGFBP1,insulin-like growth factor binding protein 1)基因序列,并对其蛋白质理化和进化特征以及基因表达模式进行分析。鳙IGFBP1开放阅读框(ORF)为789 bp,编码262个氨基酸,蛋白分子量为28139.23 u,等电点(pI)为7.42,具有1个信号肽但不具有跨膜结构,推测其为亲水性分泌蛋白。鳙IGFBP1蛋白具有两个保守的IB和TY结构域,与鲤形目鱼类IGFBP1有较高的序列同源性。鳙IGFBP1的基因时空表达分析结果显示:体节期表达量显著上调,出膜后表达水平迅速下降;成鱼肝脏中的表达量最高,皮肤、肠、性腺等组织也有一定的表达,其余组织的表达量较低。对群体中具有显著生长差异的个体进行IGFBP1表达分析,结果显示在极大个体与极小个体的肝脏组织中具有极显著性差异(P<0.01),提示该基因在鳙快速生长中发挥了正调控作用。研究结果对鳙生长调控分子机制研究及遗传改良研究具体理论和潜在应用价值。

非洲猪瘟病毒O174L蛋白的真核表达载体构建及分子特征分析

为分析非洲猪瘟病毒O174L基因,通过同源重组方式将O174L基因连接至p RK5M-C-2×Strep载体,构建重组质粒,经PCR扩增和测序鉴定正确后,将重组质粒转染至猪小肠上皮细胞系(porcine intestinal columnar epithelial cells,IPEC-J2)中,通过免疫荧光和Western blot检测O174L蛋白的表达情况。PCR及测序结果显示,p RK5M-C-2×Strep-O174L重组质粒构建成功。免疫荧光和Western blot检测结果显示,O174L蛋白能够在IPEC-J2细胞中稳定表达。生物信息学分析结果显示,基于O174L基因和B646L(p72)基因序列构建各分离毒株的2个系统发育树间排列高度相似。来自中国的16株分离株中,O174L基因序列的相似性高达96.76%~100.00%。其中,与中国爆发的其他Ⅱ型分离株相比,China/2018/Anhui XCGQ在O174L蛋白的第67、75及110位氨基酸存在差异,GZ201801在第110位氨基酸存在差异。Ⅰ型分离株SD/DY-I/2021和HeN/ZZ-P1/2021的O174L蛋白的氨基酸序列分别在第13、73、93、95、113和114位上与其他中国Ⅱ型分离株存在差异。O174L蛋白为稳定的亲水蛋白,没有信号肽和跨膜区;其二级结构由α螺旋、β折叠和无规则卷曲组成,三级结构预测结果与二级结构预测相符。以上结果为深入研究ASFV O174L蛋白与宿主间的相互作用和遗传进化提供了基础。

鸡皮刺螨羧酸酯酶2基因克隆、序列分析及其表达特征研究

【目的】克隆鸡皮刺螨(Dermanyssus gallinae)羧酸酯酶2(CarE2)基因CDS区序列并进行生物信息学分析,同时检测其在鸡皮刺螨中的表达特征,以探究CarE2基因在鸡皮刺螨代谢抗性形成及发展中的作用。【方法】试验选择50只成年鸡皮刺螨雌螨,利用PCR扩增CarE2基因CDS区序列并测序,对其编码氨基酸序列进行多序列比对及系统进化树构建,通过生物信息学在线软件预测CarE2蛋白的理化性质及结构功能,并采用实时荧光定量PCR检测CarE2基因在鸡皮刺螨不同发育阶段及不同抗性品系中的表达模式,同时分析高效氯氰菊酯对鸡皮刺螨敏感品系和高效氯氰菊酯抗性品系中CarE2基因的诱导效应。【结果】鸡皮刺螨CarE2基因CDS区序列全长1665 bp,编码554个氨基酸。多序列比对结果显示,CarE2基因氨基酸序列具有高度保守的催化三联体(Ser-Glu-His)和五肽基序(Gly-X-Ser-X-Gly)。系统进化树结果表明,鸡皮刺螨CarE2与黑腹果蝇亲缘关系相近,共同划分为表皮酯酶分支。生物信息学分析结果显示,CarE2蛋白属于稳定的亲水蛋白,存在信号肽切割位点,且具有糖基化位点和多个磷酸化修饰位点,但不具有跨膜结构;CarE2蛋白二级结构以无规则卷曲为主,三级结构预测结果与二级结构一致。实时荧光定量PCR检测结果显示,CarE2基因在鸡皮刺螨若螨时期表达量最高,显著高于其他时期(P<0.05),成螨期表达量次之,在卵和幼螨时期的表达量相对较低;鸡皮刺螨高效氯氰菊酯抗性品系中CarE2基因的相对表达量是敏感品系的2.78倍;经高效氯氰菊酯胁迫处理后,鸡皮刺螨敏感品系中CarE2基因表达量与对照组相比差异不显著(P>0.05),而高效氯氰菊酯抗性品系中CarE2基因表达量与对照组相比显著升高(P<0.05)。【结论】本研究成功克隆鸡皮刺螨CarE2基因CDS区序列,其在鸡皮刺螨各发育阶段均有表达,且在高效氯氰菊酯抗性品系中过量表达。经高效氯氰菊酯处理后CarE2基因表达量显著上调,推测CarE2基因参与鸡皮刺螨对高效氯氰菊酯的羧酸酯酶解毒代谢抗性。

新外来中药辣木叶对虚热及虚寒证候模型生物学表达特征的影响

目的:研究辣木叶对虚热证、虚寒证小鼠生物学表达特征的影响。方法:昆明种雄性小鼠分为空白组、虚热模型组、虚热西洋参组、虚热辣木叶(高、中、低剂量)组、虚寒模型组、虚寒人参组、虚寒辣木叶(高、中、低剂量)组。分别采用灌胃甲状腺素片溶液、氢化可的松溶液制备虚热模型、虚寒模型。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测各组小鼠血清中环腺苷酸(cAMP)、环鸟苷酸(cGMP)、cAMP/cGMP、3,5,3′-三碘甲腺原氨酸(T_(3))、甲状腺素(T_(4))、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-1β(IL-1β)指标的含量。结果:与虚热模型组比较,虚热西洋参组cAMP、cAMP/cGMP、T_(3)、T_(4)含量显著降低,IL-6、IL-1β显著下降;虚热辣木叶组cAMP、cAMP/cGMP、T_(3)、T_(4)含量显著降低,IL-6、IL-1β显著下降。与虚寒模型组比较,虚寒人参组cAMP、cAMP/cGMP、T_(3)、T_(4)含量显著升高;IL-6、IL-1β显著下降;虚寒辣木叶组cAMP、cAMP/cGMP含量无明显变化,T_(3)、T_(4)含量显著降低,IL-6、IL-1β显著下降。结论:研究发现辣木叶与西洋参作用相似,药性寒凉;与人参作用相反。在免疫因子水平上,辣木叶具有双向调节作用,可能受物质基础中不同活性成分的影响,对虚寒、虚热小鼠模型都有免疫调节作用。但结合环核苷酸代谢水平、激素水平考虑,其具备“偏寒”或“凉”的药性,符合药性理论分析辣木叶寒凉药性的结论。

牛胚胎角芽组织基因表达特征分析

[目的] 通过基因表达特征的分析,揭示在形成牛胚胎角芽组织中起关键作用的基因和通路,从而更深入地了解角芽发育过程中的分子机制。[方法] 基于牛胚胎角芽组织、额部皮肤组织、脑、心脏、肾、肝脏、肺、瘤胃、骨骼肌、脾脏的转录组测序数据,利用主成分分析(PCA)、差异表达基因分析和基因富集分析来解析角芽组织的基因表达特征。 [结果] 多组织基因表达比较鉴定到810个角芽组织特异高表达基因。主成分分析表明牛胚胎角芽组织与额部皮肤组织的基因表达模式最为相似,但存在1695个显著上调基因(校正p<=0.05), 这些基因功能富集到与神经和骨发育相关的通路。[结论] 从多组织比较、角芽组织和额部皮肤的差异比较两个方面分别鉴定了角芽组织的基因表达特征,角芽组织特异高表达基因富集到骨、神经和皮肤发育相关通路,暗示着角芽组织发育涉及多组织协同,具有复杂的调控机制。

基于特征表达和模型预测的主动学习

为解决当前的主动学习算法在采样时通常忽略样本特征表达信息的问题,提出一个基于样本特征表达和模型预测的主动学习模型。针对主动学习算法在模型训练早期阶段引起的冷启动问题,提出一个标注集初始化算法。利用聚类技术提取样本特征表达信息,通过分类器得到样本的模型预测信息,致力于使初始标注集的样本分布尽可能接近原始数据集的分布。实验结果表明,该模型分类准确率优于多个主动学习基线算法,该算法能够有效缓解模型的冷启动问题。

山药DoWRKY40基因表达特征分析及互作蛋白筛选

【目的】WRKY作为植物特异型转录因子,参与植物生长发育过程。克隆山药DoWRKY40基因,分析其表达模式,通过酵母双杂交技术筛选与DoWRKY40互作的蛋白,探究WRKY40在山药膨大过程中的调控机制。【方法】以‘大和长芋’山药为材料克隆DoWRKY40基因,并进行生物信息学分析、表达模式分析、亚细胞定位,构建山药块茎不同发育时期酵母文库,筛选与DoWRKY40互作蛋白。【结果】DoWRKY40的开放阅读框长为927 bp。DoWRKY40蛋白属于WRKY家族的第II组,含有一个典型的WRKY转录因子保守结构域,定位于细胞核。与几内亚薯蓣亲缘关系较近。DoWRKY40基因在山药块茎生长发育的120 d表达量最高,且在叶、茎和块茎中均有表达,具有组织特异性。山药cDNA文库的库容量为1.484×10^(8);pGBKT7-WRKY40诱饵载体无自激活活性。酵母双杂交法从山药文库中筛选到4类与DoWRKY40相互作用的蛋白,分别参与植物生长发育、细胞周期调节与细胞扩增、信号转导及环境胁迫应答等。【结论】克隆得到DoWRKY40基因,其响应山药的生长发育过程,筛选到的4类互作蛋白表明其在山药细胞膨大及信号转导中起调控作用。

Her-2低表达乳腺癌临床病理特征及生存状况分析

目的分析人表皮生长因子受体-2(human epidermal growth factor receptor-2,Her-2)低表达与Her-2阴性乳腺癌的临床病理特征及生存状况。方法回顾性收集2013年4月~2022年11月就诊于新疆医科大学第一附属医院的327例定义为Her-2阴性或低表达乳腺癌患者的临床病理和预后生存资料,依据Her-2状态分为Her-2低表达组(n=217)和Her-2阴性组(n=110)。比较两组患者的临床病理特征、治疗后复发转移情况、病死率、总生存期和无疾病进展生存期等,并依据激素受体(hormone receptor,HR)状态分为HR+和HR-队列,比较两种队列下Her-2阴性或低表达乳腺癌患者的无疾病进展生存期。结果Her-2低表达乳腺癌临床中占比高,多合并雌激素受体(estrogen receptor,ER)阳性,表现为Luminal型,病理预后分期多为Ⅰ期,且ki-67低表达;而Her-2阴性乳腺癌多合并ER阴性,表现为三阴性型,病理预后分期多为Ⅲ期,ki-67高表达,并在治疗后出现更多的脑转移和(或)其他脏器转移,差异有统计学意义(P<0.05)。但两组患者在病死率、总生存期、组间及两种队列间无疾病进展生存期方面比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论Her-2低表达与Her-2阴性乳腺癌之间存在肿瘤异质性,Her-2低表达乳腺癌具有ER阳性率高,ki-67低表达,病理预后分期较早等优势,且治疗后脑转移和(或)其他脏器转移率较低,但尚未转换为显著的生存获益。

动态安全智能评估中故障位置特征表达的电气坐标距离保持

电力系统动态安全性与故障位置密切相关,故障位置特征的准确表达是构建数据驱动动态安全评估模型的关键。该文基于电气坐标形式的故障位置特征表达方法,提出故障位置特征严格距离保持概念,构建计及故障位置特征距离保持的动态安全评估模型。首先,证明全维电气坐标在切比雪夫距离度量下满足严格距离保持要求。然后,分析切比雪夫距离度量下电气坐标的距离保持能力与电气坐标维数间的关系。最后,基于K近邻算法构建计及电气坐标距离保持能力的暂态稳定极限切除时间评估模型。以某省级电网为例,验证故障位置电气坐标距离保持能力对动态安全评估精度的贡献。

蠋蝽组织蛋白酶基因鉴定及表达特征分析

组织蛋白酶在昆虫的消化、发育与变态中起重要作用,是捕食性蝽唾液(毒液)中普遍存在的成分,但其生理功能尚不清楚。本文利用同源比对的方法从蠋蝽Arma custos基因组中鉴定出组织蛋白酶基因,使用生物信息学软件分析其序列特征和进化关系,采用RT-PCR技术分析它们在成虫不同组织中的表达特征。结果表明,蠋蝽基因组中有37个组织蛋白酶基因,根据结构域分为组织蛋白酶B(AcCAB1-4)、组织蛋白酶D(AcCAD1-13)和组织蛋白酶L(AcCAL1-20)。多序列比对及结构域预测结果表明,组织蛋白酶B和组织蛋白酶L均含有Peptidase_C1结构域、保守的酶催化位点(谷氨酰胺、半胱氨酸、组氨酸和天冬酰胺)以及1个由半胱氨酸残基(C)和组氨酸残基(H)构成的催化二联体,而组织蛋白酶D中存在保守Asp结构域和2个保守的酶催化位点(天冬氨酸)。RT-PCR结果显示,除AcCAL7和AcCAB2外,其余33个组织蛋白酶基因均在肠道中表达,且绝大多数表现特异性或高表达。AcCAL2、AcCAL5-7、AcCAL9等20个组织蛋白酶基因在唾液腺中表达,且AcCAL2仅在主腺后叶和副腺表达,AcCAL7仅在主腺前叶表达,AcCAD13仅在主腺后叶表达,AcCAB2仅在主腺前叶和主腺后叶表达。这些结果表明,多数组织蛋白酶基因在蠋蝽口外消化和肠道消化中发挥消化功能。