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川西獐牙菜SmC4H基因的生物信息学分析和表达分析
1
作者
胡月
赵舒媛
+7 位作者
张亚美
贾榕
惠探月
凌春燕
赵丽丽
王艳
王勇
向蓓蓓
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024年第8期2528-2536,共9页
由Sm C4H基因编码的肉桂酸-4-羟基化酶是川西獐牙菜苯丙烷途径的关键酶。本研究从川西獐牙菜的转录组数据中获得了SmC4H基因的全长cDNA序列,通过RT-PCR进行该基因的克隆鉴定,利用生物信息学软件对该基因进行预测分析,并通过RT-qPCR检测...
由Sm C4H基因编码的肉桂酸-4-羟基化酶是川西獐牙菜苯丙烷途径的关键酶。本研究从川西獐牙菜的转录组数据中获得了SmC4H基因的全长cDNA序列,通过RT-PCR进行该基因的克隆鉴定,利用生物信息学软件对该基因进行预测分析,并通过RT-qPCR检测该基因的组织表达差异和不同胁迫处理条件下的表达情况。生物信息学分析结果显示SmC4H基因c DNA全长1 518 bp,编码505个氨基酸,相对分子质量为51.83 kD,为亲水性较强的不稳定蛋白,二级结构由47.52%α-螺旋、14.06%延伸链、4.95%β-转角和33.47%无规则卷曲构成,预测该蛋白可能不具有跨膜结构,不含有信号肽,属于p450超家族。SmC4H蛋白的相似性与其他植物的C4H蛋白较高,其中与美女樱(Glandularia×hybrida)的相似性最高。RT-qPCR结果显示,SmC4H基因在根、茎、花、叶中均有表达,表达量根>茎>花>叶,硝普钠(SNP)、赤霉素(GA3)和脱落(ABA)在一定程度上能使SmC4H基因的表达上调。此结果为进一步研究该基因在川西獐牙菜苯丙烷途径中的功能和通过基因工程手段提高呫吨酮化合物产量奠定了基础。
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关键词
川西獐牙菜
肉桂酸-4-羟基化酶
基因克隆
生物信息学分析
表达分析
原文传递
川西獐牙菜中抗炎活性组分提取纯化工艺研究
2
作者
毕齐茂
郝小慧
+4 位作者
刘莉莹
贾雯靖
陶吉红
毕宏涛
赵晓辉
《中华中医药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期4357-4362,共6页
目的:建立川西獐牙菜中环烯醚萜苷抗炎活性组分快速高效的提取纯化工艺。方法:以獐牙菜苦苷、龙胆苦苷、獐牙菜苷3种环烯醚萜苷为研究对象,采用响应面法和Box-Behnken优化提取工艺参数。筛选大孔树脂柱填料,对环烯醚萜苷组分进行纯化富...
目的:建立川西獐牙菜中环烯醚萜苷抗炎活性组分快速高效的提取纯化工艺。方法:以獐牙菜苦苷、龙胆苦苷、獐牙菜苷3种环烯醚萜苷为研究对象,采用响应面法和Box-Behnken优化提取工艺参数。筛选大孔树脂柱填料,对环烯醚萜苷组分进行纯化富集,并进行体外抗炎活性研究。结果:最优提取工艺参数为:提取次数2次,提取时间60 min,液料比46 mL/g,乙醇浓度73%,提取温度50℃;在该条件下3种环烯醚萜苷的得率为0.47%。筛选得到DM301大孔树脂柱富集纯化环烯醚萜苷类化合物,富集的组分中环烯醚萜苷总含量可达62.30%。结论:建立了川西獐牙菜环烯醚萜苷活性组分的最佳提取和分离纯化工艺,提高了活性组分中环烯醚萜苷含量和药材利用率。
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关键词
川西獐牙菜
高效液相色谱
环烯醚萜苷
响应面
工艺优化
原文传递
川西獐牙菜抑菌活性部位的制备及其谱效关系的分析
3
作者
孙兆泉
乔茂旺
+2 位作者
李彩云
陈海娟
尚军
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期387-391,共5页
目的制备川西獐牙菜的抑菌活性部位并建立其HPLC谱效关系指纹图谱。方法采用三相萃取法制备川西獐牙菜的活性部位,体系1用乙腈-二氯甲烷-石油醚-水(5:1:5:5)、体系2用乙腈-乙酸乙酯-石油醚-水(1:1:2:1)萃取;通过牛津杯法测定各部位的抑...
目的制备川西獐牙菜的抑菌活性部位并建立其HPLC谱效关系指纹图谱。方法采用三相萃取法制备川西獐牙菜的活性部位,体系1用乙腈-二氯甲烷-石油醚-水(5:1:5:5)、体系2用乙腈-乙酸乙酯-石油醚-水(1:1:2:1)萃取;通过牛津杯法测定各部位的抑菌活性,采用Pearson相关性分析与正交偏最小二乘判别分析研究HPLC指纹图谱的谱效关系。结果川西獐牙菜抑菌活性成分主要富集于体系1、2的中相,6个不同部位共有峰20个,其中,7、12、15、16、19、20号峰与抑菌活性呈显著正相关。结论所用方法可有效富集川西獐牙菜的活性成分,可为川西獐牙菜抑菌活性成分的制备及质量控制与评价提供参考。
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关键词
川西獐牙菜
三相萃取
抑菌活性
谱效关系
指纹图谱
相关性分析
活性筛选
质量控制
原文传递
川西獐牙菜及其提取物质量标准研究
4
作者
宋婷
赵晓辉
+2 位作者
刘增根
周国英
陈晨
《中华中医药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期5485-5488,共4页
目的:完善川西獐牙菜药材及其提取物的质量标准。方法:参照2020年版《中华人民共和国药典》四部相关方法,测定川西獐牙菜药材及其提取物中獐牙菜苦苷、龙胆苦苷、獐牙菜苷的含量,分别采用薄层色谱法和高效液相色谱法进行定性鉴别和含量...
目的:完善川西獐牙菜药材及其提取物的质量标准。方法:参照2020年版《中华人民共和国药典》四部相关方法,测定川西獐牙菜药材及其提取物中獐牙菜苦苷、龙胆苦苷、獐牙菜苷的含量,分别采用薄层色谱法和高效液相色谱法进行定性鉴别和含量测定研究。结果:川西獐牙菜药材及其提取物中芒果苷在紫外光灯(254 nm)下检视,能得到较好的分离,荧光斑点清晰;川西獐牙菜药材及其提取物的含量测定结果显示獐牙菜苦苷、龙胆苦苷、獐牙菜苷线性关系良好,精密度、稳定性、重复性的RSD值均<5%。结论:本研究建立的标准具有较好的专属性和准确性,可用于川西獐牙菜药材及其提取物的质量控制。
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关键词
川西獐牙菜
环烯醚萜苷
质量标准
液相色谱
薄层色谱
原文传递
题名
川西獐牙菜SmC4H基因的生物信息学分析和表达分析
1
作者
胡月
赵舒媛
张亚美
贾榕
惠探月
凌春燕
赵丽丽
王艳
王勇
向蓓蓓
机构
天津中医药大学中药学院
天津中医药大学制药工程学院
南开大学生命科学学院
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024年第8期2528-2536,共9页
基金
国家自然科学基金项目(82074120)
国家级大学生创新训练项目(202010063006)
天津中医药大学研究生科研创新项目(YJSKC-20201024)共同资助。
文摘
由Sm C4H基因编码的肉桂酸-4-羟基化酶是川西獐牙菜苯丙烷途径的关键酶。本研究从川西獐牙菜的转录组数据中获得了SmC4H基因的全长cDNA序列,通过RT-PCR进行该基因的克隆鉴定,利用生物信息学软件对该基因进行预测分析,并通过RT-qPCR检测该基因的组织表达差异和不同胁迫处理条件下的表达情况。生物信息学分析结果显示SmC4H基因c DNA全长1 518 bp,编码505个氨基酸,相对分子质量为51.83 kD,为亲水性较强的不稳定蛋白,二级结构由47.52%α-螺旋、14.06%延伸链、4.95%β-转角和33.47%无规则卷曲构成,预测该蛋白可能不具有跨膜结构,不含有信号肽,属于p450超家族。SmC4H蛋白的相似性与其他植物的C4H蛋白较高,其中与美女樱(Glandularia×hybrida)的相似性最高。RT-qPCR结果显示,SmC4H基因在根、茎、花、叶中均有表达,表达量根>茎>花>叶,硝普钠(SNP)、赤霉素(GA3)和脱落(ABA)在一定程度上能使SmC4H基因的表达上调。此结果为进一步研究该基因在川西獐牙菜苯丙烷途径中的功能和通过基因工程手段提高呫吨酮化合物产量奠定了基础。
关键词
川西獐牙菜
肉桂酸-4-羟基化酶
基因克隆
生物信息学分析
表达分析
Keywords
swertia mussoti franch
Cinnamic acid 4-hydroxylase
Gene cloning
Bioinformatic analysis
Expression analysis
分类号
S567.239 [农业科学—中草药栽培]
原文传递
题名
川西獐牙菜中抗炎活性组分提取纯化工艺研究
2
作者
毕齐茂
郝小慧
刘莉莹
贾雯靖
陶吉红
毕宏涛
赵晓辉
机构
青海师范大学
陕西唐王天洋制药有限公司
中国科学院西北高原生物研究所
出处
《中华中医药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期4357-4362,共6页
基金
中国科学院重点部署项目(No.ZDRW-ZS-2020-2-1)。
文摘
目的:建立川西獐牙菜中环烯醚萜苷抗炎活性组分快速高效的提取纯化工艺。方法:以獐牙菜苦苷、龙胆苦苷、獐牙菜苷3种环烯醚萜苷为研究对象,采用响应面法和Box-Behnken优化提取工艺参数。筛选大孔树脂柱填料,对环烯醚萜苷组分进行纯化富集,并进行体外抗炎活性研究。结果:最优提取工艺参数为:提取次数2次,提取时间60 min,液料比46 mL/g,乙醇浓度73%,提取温度50℃;在该条件下3种环烯醚萜苷的得率为0.47%。筛选得到DM301大孔树脂柱富集纯化环烯醚萜苷类化合物,富集的组分中环烯醚萜苷总含量可达62.30%。结论:建立了川西獐牙菜环烯醚萜苷活性组分的最佳提取和分离纯化工艺,提高了活性组分中环烯醚萜苷含量和药材利用率。
关键词
川西獐牙菜
高效液相色谱
环烯醚萜苷
响应面
工艺优化
Keywords
swertia mussoti franch
.
HPLC
Iridoid glycosides
Response surface method
Process optimization
分类号
R28 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
川西獐牙菜抑菌活性部位的制备及其谱效关系的分析
3
作者
孙兆泉
乔茂旺
李彩云
陈海娟
尚军
机构
青海师范大学生命科学学院
高原科学与可持续发展研究院
出处
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期387-391,共5页
基金
青海省科技厅国际合作项目(2021-HZ-805)
青海省“昆仑英才·高端创新创业人才”项目(2020)。
文摘
目的制备川西獐牙菜的抑菌活性部位并建立其HPLC谱效关系指纹图谱。方法采用三相萃取法制备川西獐牙菜的活性部位,体系1用乙腈-二氯甲烷-石油醚-水(5:1:5:5)、体系2用乙腈-乙酸乙酯-石油醚-水(1:1:2:1)萃取;通过牛津杯法测定各部位的抑菌活性,采用Pearson相关性分析与正交偏最小二乘判别分析研究HPLC指纹图谱的谱效关系。结果川西獐牙菜抑菌活性成分主要富集于体系1、2的中相,6个不同部位共有峰20个,其中,7、12、15、16、19、20号峰与抑菌活性呈显著正相关。结论所用方法可有效富集川西獐牙菜的活性成分,可为川西獐牙菜抑菌活性成分的制备及质量控制与评价提供参考。
关键词
川西獐牙菜
三相萃取
抑菌活性
谱效关系
指纹图谱
相关性分析
活性筛选
质量控制
Keywords
swertia mussoti franch
Three-phase extraction
Antibacterial activity
Spectrum-effect relationship
Fingerprint
Correlation analysis
Activity screening
Quality control
分类号
R96 [医药卫生—药理学]
原文传递
题名
川西獐牙菜及其提取物质量标准研究
4
作者
宋婷
赵晓辉
刘增根
周国英
陈晨
机构
中国科学院西北高原生物研究所
出处
《中华中医药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期5485-5488,共4页
基金
中国科学院重点部署项目(No.ZDRW-ZS-2020-2)
青海科技成果转化专项项目(No.2021-SF-149)
+1 种基金
青海省“昆仑英才·高端创新创业人才”项目
中国科学院“西部之光”重点项目。
文摘
目的:完善川西獐牙菜药材及其提取物的质量标准。方法:参照2020年版《中华人民共和国药典》四部相关方法,测定川西獐牙菜药材及其提取物中獐牙菜苦苷、龙胆苦苷、獐牙菜苷的含量,分别采用薄层色谱法和高效液相色谱法进行定性鉴别和含量测定研究。结果:川西獐牙菜药材及其提取物中芒果苷在紫外光灯(254 nm)下检视,能得到较好的分离,荧光斑点清晰;川西獐牙菜药材及其提取物的含量测定结果显示獐牙菜苦苷、龙胆苦苷、獐牙菜苷线性关系良好,精密度、稳定性、重复性的RSD值均<5%。结论:本研究建立的标准具有较好的专属性和准确性,可用于川西獐牙菜药材及其提取物的质量控制。
关键词
川西獐牙菜
环烯醚萜苷
质量标准
液相色谱
薄层色谱
Keywords
swertia mussoti franch
.
Iridoid
Quality standard
HPLC
Thin layer chromatography
分类号
R284.1 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
川西獐牙菜SmC4H基因的生物信息学分析和表达分析
胡月
赵舒媛
张亚美
贾榕
惠探月
凌春燕
赵丽丽
王艳
王勇
向蓓蓓
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024
0
原文传递
2
川西獐牙菜中抗炎活性组分提取纯化工艺研究
毕齐茂
郝小慧
刘莉莹
贾雯靖
陶吉红
毕宏涛
赵晓辉
《中华中医药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
原文传递
3
川西獐牙菜抑菌活性部位的制备及其谱效关系的分析
孙兆泉
乔茂旺
李彩云
陈海娟
尚军
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
原文传递
4
川西獐牙菜及其提取物质量标准研究
宋婷
赵晓辉
刘增根
周国英
陈晨
《中华中医药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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