鸭坦布苏病毒XZ-2012株的分离鉴定与基因变异分析

[目的]2012年10月徐州地区某鸭场的樱桃谷种鸭突然发生产蛋下降,疑似鸭坦布苏病毒病。为了确诊病因,本试验进行了剖检与病原的分离鉴定。[方法]将病料匀浆处理后尿囊腔接种SPF鸡胚,分离病毒,接种BHK细胞培养,应用RT-PCR扩增病毒全基因,测序并进行基因进化分析。[结果]分离到一株鸭坦布苏病毒,命名为DTMUV XZ-2012株。该病毒株能适应鸡胚,无血凝活性,在BHK-21细胞上第5代的病毒滴度为5×104PFU·m L-1。测序结果表明该病毒株基因组全长为10 990 nt,编码的多聚蛋白含3 426个氨基酸。DTMUV XZ-2012株与BYD株、YY5株和JS_2010株等分离株的全基因同源性为98.5%~99.3%。与最早分离的BYD株等相比,XZ-2012株的基因变异主要分布于E基因、NS1基因、NS2基因和NS5基因,提示该病毒在自然界的流行存在一定的免疫压力。[结论]本试验成功分离鉴定了一株鸭坦布苏病毒,为鸭坦布苏病毒候选疫苗株的筛选及病毒分子流行病学研究提供了参考信息。

诺如病毒GⅡ.4亚型新变异株全基因组序列的研究

目的分析诺如病毒GⅡ.4亚型新变异株的全基因组序列,了解其变异特点。方法从264例患者腹泻物中提取RNA并进行cDNA合成,对阳性样本进行PCR鉴定,扩增片段进行测序。对测序结果显示为诺如病毒序列的进行全基因组测序并分析。结果分离到新的悉尼2012GⅡ.4变异株的类似株(荆州2013GⅡ.4株),全基因组序列测定发现新分离株出现了较大的变异,包括VP1基因高变区(P2区)的突变。结论悉尼2012GⅡ.4变异株的类似株已传播到中国,GⅡ.4变异株VP1进化较快。提醒应密切关注诺如病毒在中国的传播和进化情况,以助于疫苗的开发和治疗性单抗的制备。

诺如病毒新型GII.4流行株Sydney_2012在上海地区的检出和鉴定

为了解上海地区诺如病毒相关急性胃肠炎疫情的流行病学特点及流行株基因型的演化情况，2012年3月至2013年2月，收集上海市两处哨点医院成人急性胃肠炎粪便样本进行诺如病毒的分子检测并对其基因特征进行系统分析。在502份样本中，GI群共检出19例，检出率3．78％，呈现低位流行、全年散发的状态，无明显的季节分布；GII群检出86例，检出率17．13％，在10～12月出现高位流行，并发现中老年人群GII群诺如病毒检出率显著高于青年个体（Pd0．05）。同时首次于2012年9月在上海地区检出新型GII．4变异株Sydney-2012，证实是该变异株引发了2012年秋冬季诺如病毒急性胃肠炎的高位流行。序列分析表明该变异株为GII．e型开放阅读框（Openreadingframe，ORF）1与GII．4型ORF2的重组体，目前已成为本地区的优势流行株。研究发现，2012年上海地区出现GII．4新型变异株Sydney_2012，并引发秋冬季诺如病毒急性胃肠炎的高位流行。

吉林省2012～2013年<5岁婴幼儿中检出诺如病毒GⅡ.4Sydney(悉尼)2012变异株

目的了解吉林省2012~2013年诺如病毒（Norovirus,NV）流行型别及感染状况。方法收集长春市儿童医院2012~2013年〈5岁住院腹泻患儿的粪便标本,采用逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR）检测粪便标本中的NV,阳性标本进行核苷酸序列测定,构建系统进化树进行分析。结果检测粪便标本共770份,NV阳性139份,总阳性率为18.1%,其中2012年总阳性率为18.6%（72/387）,2013年总阳性率为17.5%（67/383）,〈2岁婴幼儿感染占总标本数的97.1%,全部为基因Ⅱ组（GenogroupⅡ,GⅡ）。PCR产物进行序列测定,取得测序结果的共97份,其中GⅡ.4型53份,占54.6%;GⅡ.3型41份,占42.3%;GⅡ.13型2份,占2.1%;GⅡ.6型1份,占1.0%。2012年检出GⅡ.4 Sydney（悉尼）2012变异株2份,占2012年阳性总数的4.9%;2013年检出26份,占2013年阳性总数的46.4%。结论吉林省存在多种NV基因型的感染,2013年流行优势株为GⅡ.4 Sydney2012变异株。

诺如病毒GⅡ．4型变异株感染流行的研究进展

诺如病毒是一种在全球范围广泛分布并引起急性感染性胃肠炎的病原体。美国每年约有1．79亿例急性胃肠炎感染者，其中超过50％（36％-59％）为感染诺如病毒所致；每年因诺如病毒感染导致住院病例可达70000例，其中死亡800例，带来医疗负担高达2．84亿美元。

2012-2013年广州市5起胃肠炎暴发中诺如病毒的分子流行病学特征

目的 了解2012年12月至2013年1月期间我国广州5起胃肠炎暴发诺如病毒的分子流行病学特征.方法 收集2012年12月至2013年1月广州市5起胃肠炎暴发（A-E）共274份粪便标本和流行病学资料,利用RT-PCR方法对诺如病毒进行检测,对扩增产物进行序列测定.用Clustal X 1.83和MEGA 5.05生物软件对诺如病毒序列进行序列比对和系统进化分析.用SPSS17.0软件进行统计分析.结果 诺如病毒的总阳性率为20.07％（55/274）,其中,A高校诺如病毒阳性率为8.70％（2/23）、B幼儿园为36.36％（8/22）、C高校为36.07％（22/61）、D社区卫生中心为100％（5/5）、E高校为11.04％（18/163）,60岁及以上年龄组诺如病毒阳性率为100％（6/6）,10-19岁年龄组为47.37％（9/19）,9岁及以下年龄组为36.36％（8/22）.系统进化分析表明33份成功分型的阳性标本均为诺如病毒GⅡ.4型新变异株Sydney 2012感染.结论 诺如病毒是引起广州市急性胃肠炎暴发的主要病原之一,GⅡ.4型新变异株Sydney 2012是当年流行的优势毒株.